用于核酸分析和定量的方法和系统与流程

技术特征：
1.一种对多个核酸分子进行定量的方法，包括：(a)将包含所述多个核酸分子的样品提供给包含多个隔室的装置；(b)使用流体流动单元将所述样本数字化到所述多个隔室中；(c)使包含所述样品的所述多个隔室经受足以对所述多个核酸分子进行核酸扩增反应的条件，以通过扩增所述多个核酸分子产生扩增产物；(d)在多个时间点从包含在已经历所述条件的所述多个隔室中的所述样品收集信号；和(e)处理所述信号以对所述多个核酸分子进行定量。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个隔室中的隔室具有小于或等于500微米(μm)的直径。3.根据权利要求2所述的方法，其中所述隔室的深度小于或等于500μm。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个分区包括1000到20000个分区。5.根据权利要求1所述的方法，其中使所述多个隔室经受所述条件包括对包含在所述多个隔室中的所述样品进行热循环以使其经受足以进行所述核酸扩增反应的所述条件。6.根据权利要求5所述的方法，其中收集所述信号包括在每个热循环中从所述多个隔室中的每个隔室收集信号多于一次。7.根据权利要求5所述的方法，其中所述热循环使用平板热循环仪进行。8.根据权利要求1所述的方法，其中使包含所述样品的所述多个隔室经受所述条件和收集所述信号的是并行进行的。9.根据权利要求1所述的方法，其中使包含所述样品的所述多个隔室经受所述条件和收集所述信号是顺序进行的。10.根据权利要求1所述的方法，其中所述信号的所述处理包括确定所述多个核酸分子中的第一个核酸分子在所述多个时间点上的扩增率。11.根据权利要求10所述的方法，还包括：使用所述扩增速率确定所述多个隔室中的第一隔室中的所述第一核酸分子的数量。12.根据权利要求11所述的方法，其中所述确定所述第一隔室中的所述第一核酸分子的所述数目包括将所述第一隔室中的所述第一核酸分子的扩增速率与所述多个隔室中的另一隔室中的所述第一核酸分子的另一扩增速率进行比较。13.根据权利要求1所述的方法，其中所述信号是光信号。14.根据权利要求1所述的方法，其中收集所述信号包括对所述多个隔室中的每一个进行成像以收集所述信号。15.根据权利要求1所述的方法，其中收集所述信号包括使用检测器检测两个或更多个波长的荧光发射。16.根据权利要求1所述的方法，其中处理所述信号包括确定所述多个隔室中的隔室在所述多个时间点上的光强度。17.根据权利要求16所述的方法，其中处理所述信号进一步包括使用所述光强度确定所述多个核酸分子中的核酸分子的扩增率。18.根据权利要求1所述的方法，其中收集所述信号包括同时从所述多个隔室中的每个隔室收集所述信号。
19.根据权利要求1所述的方法，其中多个隔室被屏障覆盖，并且所述样品的所述数字化包括使用所述流体流动单元跨所述屏障施加压差，以使所述多个隔室中的气体流过所述屏障到外部环境。20.一种用于分析多个核酸分子的方法，包括：(a)提供包含多个分区的装置，其中所述多个分区的至少一子集包含所述多个核酸分子，其中所述多个分区的所述至少一子集中的每个分区被配置成允许气体通过至少一个屏障从所述多个分区的所述至少一子集流向所述多个分区的所述至少一子集的外部的环境，所述屏障将所述多个分区的所述至少一子集与所述外部环境分隔开；(b)当使所述多个分区的所述至少一子集经受受控加热时，从所述多个分区的所述至少一子集收集信号；以及(c)处理在(b)中收集的所述信号，以产生指示所述多个分区的所述至少一子集中的所述多个核酸分子的至少一子集的熔点的数据。21.一种用于分析多个核酸分子的系统，包括：被配置用于接收包含多个分区的装置的支持单元，其中所述多个分区的至少一子集中的每个分区被配置成允许气体通过至少一个屏障从所述多个分区的所述至少一子集流向所述多个分区的所述至少一子集的外部的环境，所述屏障将所述多个分区的所述至少一子集与所述外部环境分隔开；被配置用于使所述多个分区的所述至少一子集经受受控加热的热单元；被配置用于从所述多个分区的至少一子集收集信号的检测器；以及可操作地耦合至所述热单元和所述检测器的一个或多个计算机处理器，其中所述一个或多个计算机处理器被单独地或共同地编程用于：(i)引导所述热单元使所述多个分区的所述至少一子集经受受控加热；(ii)当所述多个分区的所述至少一子集经受受控加热时，接收由所述检测器从所述多个分区的所述至少一子集收集的所述信号；以及(iii)处理在(ii)中收集的所述信号，以产生指示所述多个分区的所述至少一子集中的所述多个核酸分子的至少一子集的熔点的数据。

技术总结
本公开内容提供了用于扩增和定量核酸以及用于检测样品中靶标的存在或不存在的方法和系统。本文提供的方法和系统可利用包含通过透气屏障与外部环境分隔开的多个分区的装置。本文公开的某些方法涉及使多个分区中的核酸分子经受足以进行核酸扩增反应的条件。核酸分子可在多个分区中经受受控加热，以生成指示所述核酸分子的熔点的数据。述核酸分子的熔点的数据。述核酸分子的熔点的数据。


技术研发人员：安德鲁
受保护的技术使用者：康比纳提公司
技术研发日：2017.11.16
技术公布日：2022/9/13