格雷夫斯病标志微生物及其应用的制作方法

技术特征：
1.一种试剂盒，其特征在于，包括适于检测第一微生物集中的至少一种菌种的试剂，所述第一微生物集由以下菌种组成：毛螺旋菌属(parasutterella_excrementihominis)、毛螺菌(lachnospiraceae_bacterium)_5_1_63faa、屎豆属菌(faecalitalea_cylindroides)、普氏栖粪杆菌(faecalibacterium_prausnitzii)、直肠真杆菌(eubacterium_rectale)、霍氏真杆菌(eubacterium_hallii)、陪伴粪球菌(coprococcus_comes)、灵巧粪球菌(coprococcus_catus)、柔嫩梭菌(clostridium_leptum)、梭菌(clostridia_bacterium)_uc5_1_2f7、梭菌(clostridia_bacterium)uc5_1_1e11、穗状丁酸弧菌(butyrivibrio_crossotus)、伯克氏菌(burkholderiales_bacterium)_1_1_47、劳特氏菌(blautia_wexlerae)、劳特氏菌(blautia_obeum)、青春双岐杆菌(bifidobacterium_adolescentis)、丁酸弧菌(anaerostipes_hadrus)。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测第二微生物集中的至少一种菌种的试剂，所述第二微生物集由以下菌种组成：副血链球菌(streptococcus parasanguinis)、巨单胞菌(megamonas rupellensis)、迟缓埃格特菌(eggerthella lenta)、粪芽孢菌属(coprobacillus sp.)3_3_56faa。3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一微生物集中全部所述菌种的试剂。4.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第二微生物集中全部所述菌种的试剂。5.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一微生物集中的至少一种菌种，所述试剂盒用于诊断格雷夫斯病或者检测格雷夫斯病的治疗效果，所述第一微生物集由以下菌种组成：毛螺旋菌属(parasutterella_excrementihominis)、毛螺菌(lachnospiraceae_bacterium)_5_1_63faa、屎豆属菌(faecalitalea_cylindroides)、普氏栖粪杆菌(faecalibacterium_prausnitzii)、直肠真杆菌(eubacterium_rectale)、霍氏真杆菌(eubacterium_hallii)、陪伴粪球菌(coprococcus_comes)、灵巧粪球菌(coprococcus_catus)、柔嫩梭菌(clostridium_leptum)、梭菌(clostridia_bacterium)_uc5_1_2f7、梭菌(clostridia_bacterium)uc5_1_1e11、穗状丁酸弧菌(butyrivibrio_crossotus)、伯克氏菌(burkholderiales_bacterium)_1_1_47、劳特氏菌(blautia_wexlerae)、劳特氏菌(blautia_obeum)、青春双岐杆菌(bifidobacterium_adolescentis)、丁酸弧菌(anaerostipes_hadrus)。6.根据权利要求5所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测第二微生物集中的至少一种菌种，所述第二微生物集由以下菌种组成：副血链球菌(streptococcus parasanguinis)、巨单胞菌(megamonas rupellensis)、迟缓埃格特菌(eggerthella lenta)、粪芽孢菌属(coprobacillus sp.)3_3_56faa。7.一种用于预防或者治疗格雷夫斯病的药物标志微生物或者食品标志微生物，其特征在于，含有第一微生物集中的至少一种菌种，所述第一微生物集由以下菌种组成：毛螺旋菌属(parasutterella_excrementihominis)、毛螺菌(lachnospiraceae_bacterium)_5_1_63faa、屎豆属菌(faecalitalea_cylindroides)、普氏栖粪杆菌(faecalibacterium_prausnitzii)、直肠真杆菌(eubacterium_rectale)、霍氏真杆菌(eubacterium_hallii)、陪伴粪球菌(coprococcus_comes)、灵巧粪球菌(coprococcus_catus)、柔嫩梭菌
(clostridium_leptum)、梭菌(clostridia_bacterium)_uc5_1_2f7、梭菌(clostridia_bacterium)uc5_1_1e11、穗状丁酸弧菌(butyrivibrio_crossotus)、伯克氏菌(burkholderiales_bacterium)_1_1_47、劳特氏菌(blautia_wexlerae)、劳特氏菌(blautia_obeum)、青春双岐杆菌(bifidobacterium_adolescentis)、丁酸弧菌(anaerostipes_hadrus)。8.一种确定个体是否患有格雷夫斯病的方法，其特征在于，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志微生物的丰度，所述标志微生物包括第一微生物集和第二微生物集中的至少一种菌种；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有格雷夫斯病；其中，所述第一微生物集由以下菌种组成：毛螺旋菌属(parasutterella_excrementihominis)、毛螺菌(lachnospiraceae_bacterium)_5_1_63faa、屎豆属菌(faecalitalea_cylindroides)、普氏栖粪杆菌(faecalibacterium_prausnitzii)、直肠真杆菌(eubacterium_rectale)、霍氏真杆菌(eubacterium_hallii)、陪伴粪球菌(coprococcus_comes)、灵巧粪球菌(coprococcus_catus)、柔嫩梭菌(clostridium_leptum)、梭菌(clostridia_bacterium)_uc5_1_2f7、梭菌(clostridia_bacterium)uc5_1_1e11、穗状丁酸弧菌(butyrivibrio_crossotus)、伯克氏菌(burkholderiales_bacterium)_1_1_47、劳特氏菌(blautia_wexlerae)、劳特氏菌(blautia_obeum)、青春双岐杆菌(bifidobacterium_adolescentis)、丁酸弧菌(anaerostipes_hadrus)；所述第二微生物集由以下菌种组成：副血链球菌(streptococcus parasanguinis)、巨单胞菌(megamonas rupellensis)、迟缓埃格特菌(eggerthella lenta)、粪芽孢菌属(coprobacillus sp.)3_3_56faa。9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤(1)进一步包括：获得所述个体的粪便样本中的核酸测序数据；将所述测序数据与参考基因组进行比对；基于所述比对的结果，确定所述标志微生物的丰度。10.一种确定个体是否患有格雷夫斯病的装置，其特征在于，包括：丰度确定单元，用于确定所述个体的粪便样本中标志微生物的丰度，所述标志微生物包括第一微生物集和第二微生物集中的至少一种菌种；比较单元，用于将所得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有格雷夫斯病；其中，所述第一微生物集由以下菌种组成：毛螺旋菌属(parasutterella_excrementihominis)、毛螺菌(lachnospiraceae_bacterium)_5_1_63faa、屎豆属菌(faecalitalea_cylindroides)、普氏栖粪杆菌(faecalibacterium_prausnitzii)、直肠真杆菌(eubacterium_rectale)、霍氏真杆菌(eubacterium_hallii)、陪伴粪球菌(coprococcus_comes)、灵巧粪球菌(coprococcus_catus)、柔嫩梭菌(clostridium_leptum)、梭菌(clostridia_bacterium)_uc5_1_2f7、梭菌(clostridia_bacterium)uc5_1_1e11、穗状丁酸弧菌(butyrivibrio_crossotus)、伯克氏菌(burkholderiales_bacterium)_1_1_47、劳特氏菌(blautia_wexlerae)、劳特氏菌(blautia_obeum)、青春双岐
杆菌(bifidobacterium_adolescentis)、丁酸弧菌(anaerostipes_hadrus)；所述第二微生物集由以下菌种组成：副血链球菌(streptococcus parasanguinis)、巨单胞菌(megamonas rupellensis)、迟缓埃格特菌(eggerthella lenta)、粪芽孢菌属(coprobacillus sp.)3_3_56faa。11.根据权利要求10所述的装置，其特征在于，所述丰度确定单元适于通过下列步骤确定所述丰度：获得所述个体的粪便样本中的核酸测序数据；将所述测序数据与参考基因组进行比对；基于所述比对的结果，确定所述标志微生物的丰度。12.一种装置，其特征在于，包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述程序用于执行权利要求8或9所述的方法；以及一个或者多个处理器，用于执行所述计算机可读存储介质中的程序。13.一种筛选药物的方法，其特征在于，所述药物用于治疗或者预防格雷夫斯病，所述方法包括：将候选药物施用于受试者，检测施用前后，所述受试者粪便中标志微生物的丰度，所述标志微生物包括第一微生物集和第二微生物集中的至少一种菌种，其中，满足下列条件至少之一的候选药物适于用于治疗或者预防格雷夫斯病：(1)进行所述施用后，所述第一微生物集中的至少一种菌种的所述丰度升高；和(2)进行所述施用后，所述第二微生物集中的至少一种菌种的所述丰度降低；其中，所述第一微生物集由以下菌种组成：毛螺旋菌属(parasutterella_excrementihominis)、毛螺菌(lachnospiraceae_bacterium)_5_1_63faa、屎豆属菌(faecalitalea_cylindroides)、普氏栖粪杆菌(faecalibacterium_prausnitzii)、直肠真杆菌(eubacterium_rectale)、霍氏真杆菌(eubacterium_hallii)、陪伴粪球菌(coprococcus_comes)、灵巧粪球菌(coprococcus_catus)、柔嫩梭菌(clostridium_leptum)、梭菌(clostridia_bacterium)_uc5_1_2f7、梭菌(clostridia_bacterium)uc5_1_1e11、穗状丁酸弧菌(butyrivibrio_crossotus)、伯克氏菌(burkholderiales_bacterium)_1_1_47、劳特氏菌(blautia_wexlerae)、劳特氏菌(blautia_obeum)、青春双岐杆菌(bifidobacterium_adolescentis)、丁酸弧菌(anaerostipes_hadrus)；所述第二微生物集由以下菌种组成：副血链球菌(streptococcus parasanguinis)、巨单胞菌(megamonas rupellensis)、迟缓埃格特菌(eggerthella lenta)、粪芽孢菌属(coprobacillus sp.)3_3_56faa。

技术总结
本发明提出了格雷夫斯病标志微生物及其应用，该格雷夫斯病标志微生物包括第一微生物集，因此，进一步提出了一种试剂盒，包括适于检测第一微生物集中的至少一种菌种的试剂，所述第一微生物集由以下菌种组成：毛螺旋菌属、毛螺菌、屎豆属菌、普氏栖粪杆菌、直肠真杆菌、霍氏真杆菌、陪伴粪球菌、灵巧粪球菌、柔嫩梭菌、梭菌、梭菌、穗状丁酸弧菌、伯克氏菌、劳特氏菌、劳特氏菌、青春双岐杆菌、丁酸弧菌。本发明提出的微生物在健康人群和格雷夫斯病患者中的丰度具有显著差异，可以作为检测和/或治疗格雷夫斯病的标志物。夫斯病的标志物。


技术研发人员：宋瑞雪 郑智俊 张笑笑
受保护的技术使用者：杭州拓宏生物科技有限公司
技术研发日：2021.11.25
技术公布日：2022/4/22