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一种pProTM质粒、其构建方法及应用与流程

2022-03-26 10:14:21 来源:中国专利 TAG:

一种pprotm质粒、其构建方法及应用
技术领域
1.本发明涉及一种pprotm质粒、其构建方法及应用,属于质粒构建技术领域。


背景技术:

2.杀稻瘟菌素抗性基因(bsdr)能够构建在多种载体上,通过杀稻瘟菌素(bsd) 筛选转染bsdr抗性基因阳性细胞,从而筛选到目的细胞,这项技术广泛应用与医学生物研究领域。不过杀稻瘟菌素筛选后会出现部分耐药细胞,达不到精确筛选阳性细胞的目的,影响研究结果的准确性。
3.红色荧光蛋白(mcherry)可以通过对细胞进行标记从而追踪细胞,在生物和医学研究中有广泛的应用。不过,该项技术通常需要使用流式细胞仪,很多实验室可能不具备开展这项实验的条件,而且,使用mcherry在活体动物中进行细胞追踪获得的图像背景信号信噪比高,因此定量检测性能差。
4.萤火虫荧光素酶(firefly luciferase,简称fluc)可以在活体动物中进行细胞追踪,获得的图像背景信号信噪比低,适用于活体动物定量研究。但缺点是没有药物抗性,不能进行流氏分选从而筛选细胞,另外fluc只有在活细胞内才会产生发光现象,且发光光强度与标记细胞的数目线性相关。
5.综上,如何克服bsd筛选后出现耐药细胞,mcherry需要特定设备和无法在活体动物体内进行精确定量追踪,以及fluc不能筛选细胞的缺点,目前尚未有将bsdr、mcherry和fluc这三种基因构建在一起的质粒的报道。


技术实现要素:

6.本发明的目的之一,是提供一种pprotm质粒的构建方法。
7.本发明解决上述技术问题的技术方案如下:一种pprotm质粒的构建方法,包括如下步骤:
8.步骤1:构建bsdr-luciferase载体
9.步骤1.1:取blasticidin s抗性基因,进行pcr扩增反应,得到bsdr pcr 扩增产物;将bsdr pcr扩增产物进行酶切,得到bsdr酶切反应液;将bsdr酶切反应液再纯化,得到bsdr酶切产物;
10.步骤1.2:将fluc载体进行酶切,得到fluc载体酶切反应液;将fluc载体酶切反应液再纯化,得到fluc载体酶切产物;
11.步骤1.3:使用t4 dna连接酶,连接步骤1.1得到的bsdr酶切产物和步骤 1.2得到的fluc载体酶切产物,得到质粒bsd-luciferase;
12.步骤1.4:将质粒bsdr-luciferase转化至大肠杆菌dh5
ɑ
感受态,挑选阳性克隆,经测序验证,得到bsdr-luciferase载体,其核苷酸序列如seq id no.1 所示;
13.步骤2:构建pprotm质粒
14.步骤2.1:取mcherry载体,进行pcr扩增反应,得到mcherry pcr扩增产物;将
mcherry pcr扩增产物进行酶切,得到mcherry酶切反应液;将mcherry 酶切反应液再纯化,得到mcherry酶切纯化产物;
15.步骤2.2:将步骤1.4得到的bsdr-luciferase载体进行酶切,得到 bsdr-luciferase酶切反应液;将bsdr-luciferase酶切反应液再纯化,得到 bsdr-luciferase酶切纯化产物;
16.步骤2.3:使用t4 dna连接酶,连接步骤2.1得到的mcherry酶切纯化产物和步骤2.2得到的bsdr-luciferase酶切纯化产物,再转化至大肠杆菌dh5 ɑ
感受态,挑选阳性克隆,经测序验证,得到mcherry-bsd-luciferase载体,即为pprotm质粒,其核苷酸序列如seq id no.2所示;
17.步骤3:验证pprotm质粒是否构建成功
18.将步骤2构建的pprotm质粒转染人肾上皮细胞系293t,验证pprotm质粒是否构建成功。
19.其中,bsdr-luciferase载体的核苷酸序列(seq id no.1):
20.atggccaagcctttgtctcaagaagaatccaccctcattgaaagagcaacggctacaatcaaca gcatccccatctctgaagactacagcgtcgccagcgcagctctctctagcgacggccgcatcttcact ggtgtcaatgtatatcattttactgggggaccttgtgcagaactcgtggtgctgggcactgctgctgc tgcggcagctggcaacctgacttgtatcgtcgcgatcggaaatgagaacaggggcatcttgagcccct gcggacggtgccgacaggtgcttctcgatctgcatcctgggatcaaagccatagtgaaggacagtgat ggacagccgacggcagttgggattcgtgaattgctgccctctggttatgtgtgggagggcgccaccat ggaagacgccaaaaacataaagaaaggcccggcgccattctatccgctggaagatggaaccgctggag agcaactgcataaggctatgaagagatacgccctggttcctggaacaattgcttttacagatgcacat atcgaggtggacatcacttacgctgagtacttcgaaatgtccgttcggttggcagaagctatgaaacg atatgggctgaatacaaatcacagaatcgtcgtatgcagtgaaaactctcttcaattctttatgccgg tgttgggcgcgttatttatcggagttgcagttgcgcccgcgaacgacatttataatgaacgtgaattg ctcaacagtatgggcatttcgcagcctaccgtggtgttcgtttccaaaaaggggttgcaaaaaatttt gaacgtgcaaaaaaagctcccaatcatccaaaaaattattatcatggattctaaaacggattaccagg gatttcagtcgatgtacacgttcgtcacatctcatctacctcccggttttaatgaatacgattttgtg ccagagtccttcgatagggacaagacaattgcactgatcatgaactcctctggatctactggtctgcc taaaggtgtcgctctgcctcatagaactgcctgcgtgagattctcgcatgccagagatcctatttttg gcaatcaaatcattccggatactgcgattttaagtgttgttccattccatcacggttttggaatgttt actacactcggatatttgatatgtggatttcgagtcgtcttaatgtatagatttgaagaagagctgtt tctgaggagccttcaggattacaagattcaaagtgcgctgctggtgccaaccctattctccttcttcg ccaaaagcactctgattgacaaatacgatttatctaatttacacgaaattgcttctggtggcgctccc ctctctaaggaagtcggggaagcggttgccaagaggttccatctgccaggtatcaggcaaggatatgg gctcactgagactacatcagctattctgattacacccgagggggatgataaaccgggcgcggtcggta aagttgttccattttttgaagcgaaggttgtggatctggataccgggaaaacgctgggcgttaatcaa agaggcgaactgtgtgtgagaggtcctatgattatgtccggttatgtaaacaatccggaagcgaccaa cgccttgattgacaaggatggatggctacattctggagacatagcttactgggacgaagacgaacact tcttcatcgttgaccgcctgaagtctctgattaagtacaaaggctatcaggtggctcccgctgaattg gaatccatcttgctccaacaccccaacatcttcgacgcaggtgtcgcaggtcttcccgacgatgacgc cggtgaacttcccgccgccgttgttgttttggagcacggaaagacgatgacggaaaaagagatcgtgg attacgtcgccagtcaagtaacaaccgcgaaaaagttgcgcg
gaggagttgtgtttgtggacgaagta ccgaaaggtcttaccggaaaactcgacgcaagaaaaatcagagagatcctcataaaggccaagaaggg cggaaagatcgccgtgtaa。
21.pprotm质粒的核苷酸序列(seq id no.2):
22.atggtgagcaagggcgaggaggataacatggccatcatcaaggagttcatgcgcttcaaggtgc acatggagggctccgtgaacggccacgagttcgagatcgagggcgagggcgagggccgcccctacgag ggcacccagaccgccaagctgaaggtgaccaagggtggccccctgcccttcgcctgggacatcctgtc ccctcagttcatgtacggctccaaggcctacgtgaagcaccccgccgacatccccgactacttgaagc tgtccttccccgagggcttcaagtgggagcgcgtgatgaacttcgaggacggcggcgtggtgaccgtg acccaggactcctccctgcaggacggcgagttcatctacaaggtgaagctgcgcggcaccaacttccc ctccgacggccccgtaatgcagaagaagaccatgggctgggaggcctcctccgagcggatgtaccccg aggacggcgccctgaagggcgagatcaagcagaggctgaagctgaaggacggcggccactacgacgct gaggtcaagaccacctacaaggccaagaagcccgtgcagctgcccggcgcctacaacgtcaacatcaa gttggacatcacctctcacaacgaggactacaccatcgtggaacagtacgaacgcgccgagggccgcc actccaccggcggcatggacgagctgtacaagaagcttatggccaagcctttgtctcaagaagaatcc accctcattgaaagagcaacggctacaatcaacagcatccccatctctgaagactacagcgtcgccag cgcagctctctctagcgacggccgcatcttcactggtgtcaatgtatatcattttactgggggacctt gtgcagaactcgtggtgctgggcactgctgctgctgcggcagctggcaacctgacttgtatcgtcgcg atcggaaatgagaacaggggcatcttgagcccctgcggacggtgccgacaggtgcttctcgatctgca tcctgggatcaaagccatagtgaaggacagtgatggacagccgacggcagttgggattcgtgaattgc tgccctctggttatgtgtgggagggcgccaccatggaagacgccaaaaacataaagaaaggcccggcg ccattctatccgctggaagatggaaccgctggagagcaactgcataaggctatgaagagatacgccct ggttcctggaacaattgcttttacagatgcacatatcgaggtggacatcacttacgctgagtacttcg aaatgtccgttcggttggcagaagctatgaaacgatatgggctgaatacaaatcacagaatcgtcgta tgcagtgaaaactctcttcaattctttatgccggtgttgggcgcgttatttatcggagttgcagttgc gcccgcgaacgacatttataatgaacgtgaattgctcaacagtatgggcatttcgcagcctaccgtgg tgttcgtttccaaaaaggggttgcaaaaaattttgaacgtgcaaaaaaagctcccaatcatccaaaaa attattatcatggattctaaaacggattaccagggatttcagtcgatgtacacgttcgtcacatctca tctacctcccggttttaatgaatacgattttgtgccagagtccttcgatagggacaagacaattgcac tgatcatgaactcctctggatctactggtctgcctaaaggtgtcgctctgcctcatagaactgcctgc gtgagattctcgcatgccagagatcctatttttggcaatcaaatcattccggatactgcgattttaag tgttgttccattccatcacggttttggaatgtttactacactcggatatttgatatgtggatttcgag tcgtcttaatgtatagatttgaagaagagctgtttctgaggagccttcaggattacaagattcaaagt gcgctgctggtgccaaccctattctccttcttcgccaaaagcactctgattgacaaatacgatttatc taatttacacgaaattgcttctggtggcgctcccctctctaaggaagtcggggaagcggttgccaaga ggttccatctgccaggtatcaggcaaggatatgggctcactgagactacatcagctattctgattaca cccgagggggatgataaaccgggcgcggtcggtaaagttgttccattttttgaagcgaaggttgtgga tctggataccgggaaaacgctgggcgttaatcaaagaggcgaactgtgtgtgagaggtcctatgatta tgtccggttatgtaaacaatccggaagcgaccaacgccttgattgacaaggatggatggctacattct ggagacatagcttactgggacgaagacgaacacttcttcatcgttgaccgcctgaagtctctgattaa gtacaaaggctatcaggtggctcccgctgaattggaatccatcttgctccaacaccccaacatcttcg acgcaggtgtcgcaggtcttcccgacgatgacgccggtgaacttcccgccgccgttgttgttttggag cacggaaagacgatgacggaaaaagagatcgtggattacgtcgccagtcaagtaacaaccgcgaaaaa gttgcgcggaggagttgtgtttgtggacgaagtaccgaaaggt
cttaccggaaaactcgacgcaagaa aaatcagagagatcctcataaaggccaagaagggcggaaagatcgccgtgtaa。
23.本发明的原理是:
24.第一点,本发明的步骤1中,mcherry在荧光显微镜下显示明亮的红色,可作为报告基因研究基因表达与调控、细胞分化及蛋白质在生物体内定位和转运等。
25.第二点,本发明的步骤2中,bsdr基因编码抗稻瘟菌素抗性蛋白,转染细胞后可以抵抗稻瘟菌素的杀死作用,筛选出转染bsdr抗性的细胞。
26.第三点,firefly luciferase(fluc,萤火虫荧光素酶)催化luciferin(萤光素)氧化成oxyluciferin(氧化萤光素),会发出生物荧光,可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。
27.综上,本发明通过融合bsdr、mcherry和fluc这三种基因,构建出pprotm 质粒,可以在细胞水平检测红色荧光蛋白,杀稻瘟菌素药物筛选耐药细胞,在活体动物上灵敏检测fluc,满足实验中药物筛选的要求。
28.本发明的pprotm质粒的构建方法的有益效果是:
29.1、现有技术中并未有将bsdr、mcherry和fluc这三种基因构建在一起的质粒的报道。本发明构建得到的pprotm质粒,整合了bsdr、mcherry和fluc 三种基因的优点,一是可以通过bsdr筛选阳性细胞,用于细胞筛选;二是可以通过mcherry鉴定药物筛选阳性细胞,区别药物筛选后的耐药细胞;三是可以通过fluc在活体动物体内追踪该质粒转染的细胞。因此,可以克服bsd筛选后出现耐药细胞,mcherry需要特定设备和不能在活体动物精确定量追踪,以及 fluc不能筛选细胞的缺点,可以满足实验中药物筛选的要求,具有广泛的应用前景。
30.2、本发明的构建方法简单,操作容易,应用领域广泛,适合规模化推广应用,能产生积极效果。
31.在上述技术方案的基础上,本发明还可以做如下改进。
32.进一步,步骤1.1中,所述bsdr pcr扩增反应的体系为:10xbuffer 5μ l,2mm dntps 5μl,25mm mgso42μl,10pmol/μl的seq id no.3所示的正向引物1.5μl,10pmol/μl的seq id no.4所示的反向引物1.5μl,模板dna 50ng,1.0u/μl的kod plus酶1μl和余量为蒸馏水,总体系为50μl;反应程序为:94℃初始变性2min;94℃变性15s,68℃延伸1min,重复25次;68℃延伸10min,4℃,无限循环。
33.采用上述进一步的有益效果是:采用上述反应体系和反应程序,能够将bsdr 进行pcr扩增。
34.其中,bsdr正向引物(seq id no.3):
35.ggaagcttatggccaagcctttgtctcaag;
36.bsdr反向引物(seq id no.4):
37.ggccatggtggcgccctcccacacataac。
38.进一步,步骤1.1中,所述bsdr pcr扩增产物进行酶切的反应体系为:10
ꢀ×
cutsmart buffer 5μl,hindⅲ酶1μl,ncoⅰ酶1μl,bsd pcr扩增产物 30μl和余量为蒸馏水,总体系为50μl;将上述反应体系置于37℃水浴锅1h,得到bsd酶切反应液。
39.采用上述进一步的有益效果是:采用上述反应体系和反应程序,能够将bsdrpcr
扩增产物进行酶切。上述hindⅲ酶和ncoⅰ酶均购自neb公司。
40.进一步,步骤1.1中,所述纯化的具体方法是:
41.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
42.(2)bsdr酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
43.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
44.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到酶切bsdr酶切产物。
45.采用上述进一步的有益效果是:采用上述方法,能够将bsdr酶切反应液或进行纯化。
46.进一步,步骤1.2中,所述fluc载体进行酶切的反应体系为:10
×
cutsmartbuffer 5μl,hindⅲ酶1μl,ncoⅰ酶1μl,fluc载体1μg和余量为h2o,总体系为50μl;将上述反应体系置于37℃水浴锅1h,得到fluc载体酶切反应液。
47.采用上述进一步的有益效果是:采用上述反应体系和反应程序,能够将fluc 载体进行酶切。
48.进一步,步骤1.2中,所述纯化的具体方法是:
49.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
50.(2)fluc酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
51.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
52.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到fluc载体酶切产物。
53.采用上述进一步的有益效果是:采用上述方法,能够将fluc载体酶切反应液进行纯化。
54.进一步,步骤2.1中,所述mcherry pcr扩增反应的体系为:10xbuffer 5μl,2mm dntps 5μl,25mm mgso42μl,10pmol/μl的seq id no.5所示的正向引物1.5μl,10pmol/μl的seq id no.6所示的反向引物1.5μl, pcdna3.1-mcherry模板dna 50ng,1.0u/μl的kod plus酶1μl和余量为蒸馏水,总体系为50μl;反应程序为:94℃初始变性2min;94℃变性15s,68℃延伸1min,重复25次;68℃延伸10min,4℃,无限循环。
55.采用上述进一步的有益效果是:采用上述反应体系和反应程序,能够将 mcherry载体进行pcr扩增反应。
56.其中,mcherry正向引物(seq id no.5):
57.tgctagcgccaccatggtgagcaagggcgag;
58.mcherry反向引物(seq id no.6):
59.aagcttcttgtacagctcgtccatgc。
60.进一步,步骤2.1中,所述mcherry pcr扩增产物进行酶切的反应体系为: 10
×
cutsmart buffer 5μl,hindⅲ酶1μl,nheⅰ酶1μl,mcherry pcr扩增产物30μl和余量为h2o,
总体系为50μl;将上述反应体系置于37℃水浴锅 1h,得到mcherry酶切反应液。
61.采用上述进一步的有益效果是:采用上述反应体系和反应程序,能够将 mcherry pcr扩增产物进行酶切。
62.进一步,步骤2.1中,所述纯化的具体方法是:
63.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
64.(2)mcherry酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
65.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
66.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到mcherry酶切产物。
67.采用上述进一步的有益效果是:采用上述方法,能够将mcherry酶切反应液进行纯化。
68.进一步,步骤2.2中,所述bsdr-luciferase载体进行酶切的反应体系为: 10
×
cutsmart buffer 5μl,hindⅲ酶1μl,nheⅰ酶1μl,bsdr-luciferase 载体1μg和余量为h2o,总体系为50μl,将上述反应体系置于37℃水浴锅1h,得到bsd-luciferase酶切反应液。
69.采用上述进一步的有益效果是:采用上述反应体系和反应程序,能够将 bsdr-luciferase载体进行酶切。
70.进一步,步骤2.2中,所述纯化的具体方法是:
71.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
72.(2)bsdr-luciferase酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
73.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
74.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到bsdr-luciferase 酶切纯化产物。
75.采用上述进一步的有益效果是:采用上述方法,能够将bsdr-luciferase 酶切反应液进行纯化。
76.进一步,步骤3中,所述转染的具体方法是:
77.在100μl减血清培养基和1μg步骤2得到的pprotm质粒,混匀,得到质粒溶液;
78.在100μl减血清培养基中加入5μl转染试剂lipo2000,混匀,静置5min, 得到lipo2000溶液;
79.将上述质粒溶液轻轻滴入上述lipo2000溶液中,混匀,静置20min,得到转染混合液;
80.将上述转染混合液滴入培养密度为80%的人肾上皮细胞系293t中,24h后,更换新的减血清培养基。
81.采用上述进一步的有益效果是:采用上述方法,可以将步骤2构建的pprotm 质粒
转染至人肾上皮细胞系293t中。
82.进一步,步骤3中,所述验证pprotm质粒是否构建成功的具体方法是:
83.(1)转染48h后,在荧光显微镜下,如果观察到红色荧光,则初步判断 mcherry构建成功;
84.(2)转染48h后,使用浓度为5μg/ml的bsd筛选3天,若bsd可以杀死未转染细胞,则初步判断bsdr构建成功;
85.(3)在293t细胞中检测到fluc表达,则判断在细胞水平fluc构建成功;
86.同时具备以上三条,则判断pprotm质粒构建成功。
87.本发明的目的之二,是提供上述构建得到的pprotm质粒。
88.本发明解决上述技术问题的技术方案如下:上述构建得到的pprotm质粒。
89.上述构建得到的pprotm质粒的有益效果是:
90.上述构建得到的pprotm质粒,其核苷酸序列如seq id no.2所示,整合了 bsdr、mcherry和fluc三种基因的优点,可以满足实验中药物筛选的要求,具有广泛的应用前景。
91.本发明的目的之三,是提供上述构建得到的pprotm质粒的应用。
92.本发明解决上述技术问题的技术方案如下:上述构建得到的pprotm质粒在基因功能研究和干细胞分离中的应用。
93.上述构建得到的pprotm质粒的应用的有益效果是:
94.上述构建得到的pprotm质粒,构建在干扰载体或者高表达载体上,可以用于研究基因的功能;构建在启动子下游,可以用于分离和研究干细胞,对生物医学基础研究具有重要意义,适合规模化推广应用。
附图说明
95.图1为本发明实施例构建的pprotm质粒的结构图。
96.图2为pprotm质粒转染293t细胞后的红色荧光图。
97.图3为pprotm质粒转染293t细胞后进行bsd筛选。其中图3a表示pprotm 质粒转染293t细胞培养3天后的细胞,图3b表示pprotm质粒转染293t细胞 bsd筛选3天后的细胞,图3c表示293t细胞bsd培养3天后的细胞。
98.图4为pprotm质粒转染293t细胞bsd筛选的荧光融合图。其中图4a显示荧光镜下的细胞,图4b显示白场镜下的细胞。
99.图5为应用synergy h4全功能酶标仪,检测293t细胞和细胞 fireluciferase生物发光图。
100.图6为应用ivis luminaⅲ活体动物成像仪,检测bsd筛选293t细胞(左侧3个)和293t-pprotm细胞(右侧3个)fireluciferase生物发光图。
具体实施方式
101.以下结合具体附图对本发明的原理和特征进行描述,所举实例只用于解释本发明,并非用于限定本发明的范围。
102.本实施例的pprotm质粒的构建方法,包括如下步骤:
103.步骤1:构建bsdr-luciferase载体
104.步骤1.1:取bsdr,进行pcr扩增反应,所述pcr扩增反应的体系为: 10xbuffer 5μl,2mm dntps 5μl,25mm mgso42μl,10pmol/μl的seq id no.3 所示的正向引物1.5μl,10pmol/μl的seq id no.4所示的反向引物1.5μl, 模板dna 50ng,1.0u/μl的kod plus酶1μl和余量为蒸馏水,总体系为50μl;反应程序为:94℃初始变性2min;94℃变性15s,68℃延伸1min,重复25次; 68℃延伸10min,4℃,无限循环,得到bsd pcr扩增产物。
105.将bsdr pcr扩增产物进行酶切,所述bsdr pcr扩增产物进行酶切的反应体系为:10
×
cutsmart buffer 5μl,hindⅲ酶1μl,ncoⅰ酶1μl,bsdr pcr 扩增产物30μl和余量为蒸馏水,总体系为50μl;将上述反应体系置于37℃水浴锅1h,得到bsdr酶切反应液。
106.将bsdr酶切反应液再纯化,所述纯化的具体方法是:
107.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
108.(2)bsdr酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
109.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
110.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到酶切bsdr酶切产物。
111.步骤1.2:将fluc载体进行酶切,所述fluc载体进行酶切的反应体系为: 10
×
cutsmart buffer 5μl,hindⅲ酶1μl,ncoⅰ酶1μl,fluc载体1μg 和余量为h2o,总体系为50μl;将上述反应体系置于37℃水浴锅1h,得到 luciferase载体酶切反应液。
112.将fluc载体酶切反应液再纯化,所述纯化的具体方法是:
113.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
114.(2)fluc酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
115.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
116.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到fluc载体酶切产物。
117.步骤1.3:使用t4 dna连接酶,连接步骤1.1得到的bsdr酶切产物和步骤 1.2得到的fluc载体酶切产物,得到质粒bsdr-luciferase。
118.步骤1.4:将质粒bsdr-luciferase转化至大肠杆菌dh5
ɑ
感受态,挑选阳性克隆,经测序验证,得到bsdr-luciferase载体,其核苷酸序列如seq id no.1 所示。
119.步骤2:构建pprotm质粒
120.步骤2.1:取mcherry载体,进行pcr扩增反应,所述pcr扩增反应的体系为:10xbuffer 5μl,2mm dntps 5μl,25mm mgso42μl,10pmol/μl的seq id no.5 所示的正向引物1.5μl,10pmol/μl的seq id no.6所示的反向引物1.5μ l,pcdna3.1-mcherry模板dna 50ng,1.0u/μl的kod plus酶1μl和余量为蒸馏水,总体系为50μl;反应程序为:94℃初始变性2min;94℃变性15s,68℃延伸1min,重复25次;68℃延伸10min,4℃,无限循环,得到mcherry pcr扩增产物。
121.将mcherry pcr扩增产物进行酶切,所述mcherry pcr扩增产物进行酶切的反应体
系为:10
×
cutsmart buffer 5μl,hindⅲ酶1μl,nheⅰ酶1μl, mcherry pcr扩增产物30μl和余量为h2o,总体系为50μl;将上述反应体系置于37℃水浴锅1h,得到mcherry酶切反应液。
122.将mcherry酶切反应液再纯化,所述纯化的具体方法是:
123.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
124.(2)mcherry酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
125.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
126.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到mcherry酶切产物。
127.步骤2.2:将步骤1.4得到的bsdr-luciferase载体进行酶切,所述 bsdr-luciferase载体进行酶切的反应体系为:10
×
cutsmart buffer 5μl,hind
ꢀⅲ
酶1μl,ncoⅰ酶1μl,bsdr-luciferase载体1μg和余量为h2o,总体系为50μl,将上述反应体系置于37℃水浴锅1h,得到bsdr-luciferase酶切反应液。
128.将bsdr-luciferase酶切反应液再纯化,所述纯化的具体方法是:
129.(1)吸附柱ca2中加入500μl的平衡液bl,12000rpm离心1mi,倒掉收集管中的废液,吸附柱ca2重新放回收集管中;
130.(2)bsdr-luciferase酶切反应液凝胶中加入500μl结合液pb,50℃充分混匀,得到混合液;
131.(3)将混合液转入平衡过的吸附柱ca2中,室温放置2min后,离心,加入,12000rpm离心1min;600μl漂洗液pw进行漂洗,12000rpm离心1min,共离心2次,倒掉收集管中的废液,将吸附柱ca2放回收集管中;
132.(4)室温晾干,加入30μl-50μl的ddh2o溶解,即得到bsdr-luciferase 酶切纯化产物。
133.步骤2.3:使用t4 dna连接酶,连接步骤2.1得到的mcherry酶切纯化产物和步骤2.2得到的bsdr-luciferase酶切纯化产物,再转化至大肠杆菌dh5 ɑ
感受态,挑选阳性克隆,经测序验证,得到mcherry-bsd-luciferase载体,即为pprotm质粒,其核苷酸序列如seq id no.2所示,其结构图,如图1所示。
134.步骤3:验证pprotm质粒是否构建成功
135.将步骤2构建的pprotm质粒转染人肾上皮细胞系293t,验证pprotm质粒是否构建成功。
136.所述转染的具体方法是:
137.在100μl减血清培养基和1μg步骤2得到的pprotm质粒,混匀,得到质粒溶液;
138.在100μl减血清培养基中加入5μl转染试剂lipo2000,混匀,静置5min, 得到lipo2000溶液;
139.将上述质粒溶液轻轻滴入上述lipo2000溶液中,混匀,静置20min,得到转染混合液;
140.将上述转染混合液滴入培养密度为80%的人肾上皮细胞系293t中,24h后,更换新的减血清培养基。
141.所述验证pprotm质粒是否构建成功的具体方法是:
142.(1)转染48h后,在荧光显微镜下,如果观察到红色荧光,则初步判断 mcherry构建成功;
143.(2)转染48h后,使用浓度为2μg/μl的bsd筛选3天,若bsd可以杀死未转染细胞,则初步判断bsdr构建成功;
144.(3)在293t细胞中检测到luciferase表达,则判断在细胞水平 fireluciferase构建成功;
145.同时具备以上三条,则判断pprotm质粒构建成功。
146.pprotm质粒感染293t细胞后的红色荧光图,如图2所示。结果是pprotm 质粒的感染293t细胞后发红色荧光,可构建在干扰载体/高表达载体或者启动子下游,用于研究基因功能或者分离干细胞。
147.pprotm质粒感染293t细胞后进行bsd筛选,如图3所示。结果是 293t-pprotm培养3天后铺满培养皿(图3a),293t-pprotm经过bsd筛选3天阳性克隆(图3b);293t细胞经过bsd培养3天全部死亡(图3c),说明感染 pprotm质粒的293t细胞可以经过bsd筛选并分离出稳定转染的细胞。
148.pprotm质粒感染293t细胞后进行bsd筛选和荧光融合图,如图4所示。白场镜下293t-pprotm经过bsd筛选3天阳性克隆(图4a),荧光显微镜下显示 293t-pprotm经过bsd筛选3天的红色荧光蛋白细胞(图4b),说明经过bsd筛选后的293t-pprotm可以在镜下观察到红色荧光蛋白,克服了bsd筛选后出现耐药细胞,且不需要使用流式细胞仪的结果。
149.应用synergy h4全功能酶标仪检测pprotm转染293t细胞后的 fireluciferase生物发光,如图5所示。结果是bsd筛选后的293t-pprotm细胞fireluciferase生物发光是未转染pprotm的293t细胞约80倍,见表1所示,说明构建的质粒可用于fireluciferase生物发光,可对luciferase进行定量的结果。
150.表1
151.293t293t293t293t-pprotm293t-pprotm293t-pprotm111411814822847
152.应用ivis luminaⅲ活体动物成像仪检测pprotm质粒转染293t细胞后的 fireluciferase生物发光,如图6所示。结果是应用ivis luminaⅲ活体动物成像仪检测到未转染pprotm质粒的293t细胞没有观察到fireluciferase生物发光,bsd筛选后的293t-pprotm细胞fireluciferase生物发光,三个重复组 roi平均值为1
×
106,说明构建的质粒可用于fireluciferase生物发光,可对 luciferase进行定量的结果,见表2所示。
153.表2
154.293t293t293t293t-pprotm293t-pprotm293t-pprotm0003.167
×
1083.053
×
1082.960
×
108155.现有技术中并未有将bsdr、mcherry和fluc这三种基因构建在一起的质粒的报道。本发明成功构建得到的pprotm质粒,整合了bsdr、mcherry和fluc 三种基因的优点,一是可以通过bsdr筛选阳性细胞,用于细胞筛选;二是可以通过mcherry鉴定药物筛选阳性细胞,区别药物筛选后的耐药细胞;三是可以通过fluc在活体动物体内追踪该质粒转染的细胞。因此,可以克服bsd筛选后出现耐药细胞,mcherry需要特定设备和不能在活体动物精确定
量追踪,以及 fluc不能筛选细胞的缺点,可以满足实验中药物筛选的要求,具有广泛的应用前景。
156.本实施例还提供上述构建方法构建得到的pprotm质粒。
157.本实施例还提供上述构建方法构建得到的pprotm质粒在基因功能研究和干细胞分离中的应用。
158.以上所述仅为本发明的较佳实施例,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
再多了解一些

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