一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用的制作方法

技术特征：
1.猪mthfr基因上的两个snp分子标记hfr-1或/和hfr-2在猪繁殖性状关联分析中的应用，其特征在于，所述猪品种为丹系大白猪，所述猪繁殖性状为1胎总产仔数和2胎产活仔数，所述分子标记的核苷酸序列如下所示：其中：hfr-1分子标记：gccgggaccgggaggcggaaggtgggacacggtagcctcacgcgaagggtctcagggcgcagggtcactggcctcgggctccttctcgttgtgggggggcrtgttgagaagctcaaatgtgtcctccaccacctgccagaggcagttgtccagcggaaactcgttgtccaccaggttgaccaggaagtagttgtcgtggat；上述序列中的101位的碱基r是c或t，其中tt基因型的1胎总产仔数显著低于cc基因型和tc基因型，2胎产活仔数显著低于tc基因型；hfr-2分子标记：gattatccacgaatggcctctcgtgccaggctgggagctctcagagggcaggggcctggctctgtctgcgtgtctgtctggcacaatgcctggattggcgrggcgctccgtgattgccggatggtggcataaatgtggcgccctcggacccggtgacccaggctggcccctaccttcacatccacgatgtgataattcact；上述序列中的101位的碱基r是g或c，其中cc基因型的1胎总产仔数和2胎产活仔数显著低于cg型；mthfr-1和mthfr-2的两个位点处于连锁不平衡状态，mthfr-1和mthfr-2基因型组合与总产仔数显著关联，其tc-gg基因型是丹系大白猪母猪繁殖性状的有利基因型。2.扩增权利要求1所述的分子标记的引物组合在猪繁殖性状关联分析和辅助选择中的应用，其特征在于，所述猪品种为丹系大白猪，所述猪繁殖性状为1胎总产仔数和2胎产活仔数，所述引物组合的核苷酸序列如序列表seq id no：3，seq id no：4，seq id no：5，seq id no：,6，seq id no：7和seq id no：8所示。

技术总结
本发明属于动物分子标记筛选与应用领域，具体涉及一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用。所述分子标记是从MTHFR基因中克隆得到，该基因上的第一个分子标记MTHFR-1的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，该序列第101位碱基处存在一个C/T的等位基因突变，引起所示序列的核苷酸产生多态性，CC和TC基因型个体的1胎总产仔数性状最优，TC基因型个体的2胎产活仔数性状最优。MTHFR基因上第二个分子标记MTHFR-2的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，该序列第101位碱基处存在一个G/C的等位基因突变，引起所示序列核苷酸产生多态性，CG基因型个体的1胎总产仔数和2胎产活仔数性状为最优。的1胎总产仔数和2胎产活仔数性状为最优。


技术研发人员：李小平 李道洁 刘鑫 王晓彤 张地
受保护的技术使用者：华中农业大学
技术研发日：2021.12.21
技术公布日：2022/3/21