一种跨反应板的SNP分型分析方法及系统与流程

摘要: 本发明涉及snp分型分析,尤其涉及一种跨反应板的snp分型分析方法及系统。背景技术:1、现有snp分析方法的流程为:设置反应板,设置pcr程序,之后进行pcr实...
一种跨反应板的SNP分型分析方法及系统与流程

本发明涉及snp分型分析,尤其涉及一种跨反应板的snp分型分析方法及系统。

背景技术:

1、现有snp分析方法的流程为:设置反应板,设置pcr程序,之后进行pcr实验,最后对该反应板的pcr实验数据进行snp分析。每次创建的实验,在设置反应板时,只能选择一个96/384/1536孔的反应板,最终也只是对这个反应板的数据进行snp分析。现有snp分析方法的缺陷在于:无法实现多反应板的统一处理。现有snp分析方法在进行数据分析时,每个实验只能选定一个反应板,无法同时加载、显示和分析多个实验或多个反应板的数据,导致批量样本处理效率低下。除此之外,现有snp分析方法的聚类参数独立,无法跨板统一,每块反应板的聚类参数和阈值需要独立设置,无法在多个实验间共享或统一调整,容易引起分析标准不一致,从而影响结果的可比性;批次效应难以整体校正,在同一批次大量样本的分析场景中,不同实验之间的系统偏差无法在整体视图中统一评估和校正,分析人员无法从全局角度调整模型或阈值,导致批次效应残留;配置参数难以标准化,每个实验的分析设置均需单独配置,缺乏统一模板或批量应用机制,增加人工工作量,且容易由于配置不一致而引入额外误差。

2、因此,本发明研发出一种跨反应板的snp分型分析方法及系统来解决上述问题。

技术实现思路

1、本发明提出一种跨反应板的snp分型分析方法及系统,以解决现有snp分析方法无法实现多反应板的统一处理的问题。

2、本发明通过以下技术方案来实现上述目的:

3、本发明一种跨反应板的snp分型分析方法,包括:

4、获取实验数据和反应板数据,所述实验数据包括实验基本信息、样本板数据、试剂板数据;

5、响应于实验创建命令,根据实验数据创建实验,包括根据实验基本信息和预设实验信息模板生成实验信息,根据样本板数据和与预设样本板模板生成样本板,根据试剂板数据和与预设试剂板模板生成试剂板;

6、响应于反应板创建命令,选择所需样本板和试剂板,根据实验信息、样本板、试剂板、反应板数据和预设反应板模板生成反应板;

7、响应于反应板发送命令,将反应板发送至反应板制备设备;

8、接收高通量荧光扫描仪发送的不同反应板的荧光扫描数据,响应于反应板跨板分析命令,将不同反应板的荧光扫描数据输入跨板分析组件中,输出跨板分析结果。

9、进一步地,获取实验基本信息、样本板数据、试剂板数据和反应板数据,包括:

10、接收用户输入的实验基本信息和/或响应于实验信息模板选择命令提取历史实验信息,实验基本信息包括实验名称、制板模式、备注信息;

11、接收用户输入的样本板数据和/或响应于样本板模板选择命令提取历史样本板中的样本板数据,样本板数据包括样本板id、样本板类型、布板信息;

12、接收用户输入的试剂板数据和/或响应于试剂板模板选择命令提取历史试剂板中的试剂板数据,试剂板数据包括试剂板id、试剂板类型;

13、接收用户输入的反应板数据和/或响应于反应板模板选择命令提取历史反应板模板中的反应板数据,反应板数据包括反应板id、反应板类型、制板动作流程、移液方案、样本板、试剂板。

14、进一步地,预设实验信息模板包括:

15、实验名称模块,所述实验名称模块用于写入实验名称;

16、制板模式模块,所述制板模式模块用于写入制板模式;

17、备注信息模块,备注信息模块用于写入备注信息。

18、进一步地,预设样本板模板包括:

19、样本板内容模块,所述样本板内容包括样本板id模块、样本板类型模块、布板信息模块,样本板id模块用于写入样本板id,样本板类型模块用于写入样本板类型,布板模块用于写入布板信息;

20、样本板操作模块,所述样本板操作模块用于编辑或删除样本板内容模块中的内容。

21、进一步地,预设试剂板模板包括:

22、试剂板内容模块,所述试剂板内容模块包括试剂板id模块、试剂板类型模块,试剂板id模块用于写入试剂板id,试剂板类型模块用于写入试剂板类型;

23、试剂板操作模块,所述试剂板操作模块用于编辑或删除试剂板内容模块中的内容。

24、进一步地,反应板模板包括:

25、反应板内容模块,反应板内容模块包括反应板id模块、反应板类型模块、样本板模块、试剂板模块,反应板id模块用于写入反应板id,反应板类型模块用于写入反应板类型,样本板模块用于写入样本板,试剂板模块用于写入试剂板;

26、制板方案模块,制板方案模块包括制板动作模块、移液方案模块,制板动作模块用于写入制板动作流程,移液方案模块用于写入移液方案;

27、反应板操作模块,反应板操作模块用于对反应板内容模块中的内容进行编辑、复制、查看。

28、进一步地,反应板模板还包括制板状态模块,制板状态模块用于根据反应板制板设备返回的制板状态信息调整制板状态。

29、进一步地,反应板跨板分析命令包括选取同一个实验中的不同反应板的荧光扫描数据输入跨板分析组件,或者选取不同实验中的不同反应板的荧光扫描数据输入跨板分析组件,其中跨板分析组件,包括:

30、分析模块,分析模块用于对不同反应板的荧光扫描数据进行snp分型分析,snp分型分析为聚类分析;

31、分析结果显示模块,分析结果显示模块用于显示snp分型分析结果。

32、进一步地,响应于实验创建命令,根据实验数据批量创建实验;响应于反应板创建命令,批量选择所需样本板和试剂板,根据实验信息、样本板、试剂板、反应板数据和预设反应板模板批量生成反应板;响应于反应板发送命令,将反应板批量发送至反应板制备设备。

33、本发明还提供了一种跨反应板的snp分型分析系统,包括:

34、获取模块,所述获取模块用于获取实验数据和反应板数据,所述实验数据包括实验基本信息、样本板数据、试剂板数据;

35、第一创建模块,所述第一创建模块用于响应于实验创建命令,根据实验数据创建实验,包括根据实验基本信息和预设实验信息模板生成实验信息,根据样本板数据和与预设样本板模板生成样本板,根据试剂板数据和与预设试剂板模板生成试剂板;

36、第二创建模块,第二创建模块用于响应于反应板创建命令,选择所需样本板和试剂板,根据实验信息、样本板、试剂板、反应板数据和预设反应板模板生成反应板;

37、发送模块,所述发送模块用于响应于反应板发送命令,将反应板发送至反应板制备设备;

38、分析模块,所述分析模块用于接收高通量荧光扫描仪发送的不同反应板的荧光扫描数据,响应于反应板跨板分析命令,将不同反应板的荧光扫描数据输入跨板分析组件中,输出跨板分析结果。

39、本发明的有益效果在于:

40、本发明提出的一种跨反应板的snp分型分析方法及系统通过在单个实验中支持多反应板数据的统一加载、集中展示和协同分析,突破了现有snp分析软件必须“逐板处理”的技术限制,显著提升了高通量基因分型实验的分析效率、一致性和准确性。