分子解析系统、程序以及分子解析方法与流程
本发明涉及一种分子解析系统、程序以及分子解析方法。
背景技术:
1、以往,在进行分子的解析时,已知有如下方法,即,获取分子式、分子量、原子数、官能团数、氢键数等一维结构信息的方法,获取分子的化学键信息、相邻的官能团等二维结构信息的方法,获取分子的立体信息、分子表面积信息、电子密度、分子轨道等三维结构信息的方法。另外,专利文献1公开了一种方法,其将化合物的化学特征作为输入信息,使用包含化合物以及与化合物相关的生物学或化学信息的训练集,利用机器学习方法生成生成模型。
2、现有技术文献
3、专利文献
4、专利文献1:日本特表2019-502988号公报
技术实现思路
1、发明要解决的问题
2、上述的通过一维结构信息、二维结构信息、三维结构信息的获取而进行的分子的解析方法仅在化学的视角上具有意义,存在例如无法关联到生物体内的行为预测等问题。
3、本公开是考虑到上述点而完成的,其目的在于提供一种提取分子的空间信息的新的分子解析系统、程序以及信息处理方法。
4、用于解决问题的手段
5、本公开的分子解析系统的特征在于,具有:第一获取单元,获取通过量子化学计算得到的分子的三维结构的信息;设定单元,在分子的三维结构的内部或周围设定多个信息获取点;以及第二获取单元,获取在由所述设定单元所设定的各所述信息获取点处的关于预先设定的一个或多个参数的数据。
6、另外,在本公开的分子解析系统中,所述设定单元也可以通过规定的立方体划分由所述第一获取单元获取的分子的三维结构,并按每个所述立方体设定信息获取点。
7、另外,在本公开的分子解析系统中,所述设定单元也可以设定连结由所述第一获取单元获取的分子的三维结构的起点和终点的轴,在轴的周围配置信息获取点时,设定从所设定的所述起点到所述终点的虚拟三维曲线,并在所设定的所述虚拟三维曲线上隔开间隔地设定多个信息获取点。
8、另外,在本公开的分子解析系统中,所述设定单元也可以在由所述第一获取单元获取的分子的三维结构中设定长度方向,并在沿着该长度方向的端部附近设定所述起点和所述终点。
9、另外,在本公开的分子解析系统中,所述设定单元也可以以使所述起点和所述终点之间的直线距离最大的方式进行设定。
10、另外,在本公开的分子解析系统中,所述设定单元也可以以覆盖由所述第一获取单元获取的分子的三维结构的一部分或全部的方式设定所述虚拟三维曲线。
11、另外,在本公开的分子解析系统中,所述设定单元也可以在所述虚拟三维曲线上等间隔地设定多个所述信息获取点。
12、另外,本公开的分子解析系统也可以还具有:接收单元,接收关于分子的化学式的信息;以及生成单元,根据所述接收单元所接收的分子的所述化学式,通过量子化学计算生成分子的三维结构。
13、另外,本公开的分子解析系统也可以还具有:确定单元,使用第一模型,根据由所述第一获取单元获取的分子的三维结构,确定信息获取点的位置,所述第一模型是使用包含分子的三维结构、信息获取点的位置以及关于分子的分析结果的评分的训练数据通过机器学习生成的;所述设定单元也可以设定由所述确定单元确定的信息获取点的位置。
14、另外,本公开的分子解析系统也可以还具有:参数种类设定单元,使用第二模型,根据由所述第一获取单元获取的分子的三维结构或由所述设定单元设定的各信息获取点的位置,设定参数的种类,所述第二模型是使用包含分子的三维结构、信息获取点的位置、参数的种类以及关于分子的分析结果的评分的训练数据通过机器学习生成的;所述第二获取单元也可以获取关于由所述参数种类设定单元设定的一个或多个参数在各信息获取点处的数据。
15、本公开的程序的特征在于,通过由计算机执行而作为第一获取单元、设定单元以及第二获取单元发挥功能,所述第一获取单元获取通过量子化学计算得到的分子的三维结构的信息,所述设定单元在所述分子的三维结构的内部或周围设定多个信息获取点,所述第二获取单元获取在由所述设定单元所设定的各所述信息获取点处的关于预先设定的一个或多个参数的数据。
16、本公开的分子解析方法的特征在于,其是由计算机执行的分子解析方法,具有如下工序:获取通过量子化学计算得到的分子的三维结构的信息;在所述分子的三维结构的内部或周围设定多个信息获取点;以及获取在所设定的各所述信息获取点处的关于预先设定的一个或多个参数的数据。
17、发明的效果
18、根据本公开,能够提供一种提取分子的空间信息的新的分子解析系统、程序以及信息处理方法。
1.一种分子解析系统,其特征在于,具有:
2.根据权利要求1所述的分子解析系统,其特征在于,
3.根据权利要求1所述的分子解析系统,其特征在于,
4.根据权利要求3所述的分子解析系统,其特征在于,
5.根据权利要求3所述的分子解析系统,其特征在于,
6.根据权利要求3所述的分子解析系统,其特征在于,
7.根据权利要求3所述的分子解析系统,其特征在于,
8. 根据权利要求1所述的分子解析系统,其特征在于,还具有:
9.根据权利要求1所述的分子解析系统,其特征在于,还具有:
10.根据权利要求1所述的分子解析系统,其特征在于,还具有:
11.一种程序,通过由计算机执行而作为第一获取单元、设定单元以及第二获取单元发挥功能,其特征在于,
12.一种分子解析方法,由计算机执行,其特征在于,具有以下工序:
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