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一种胚胎发育过程视频的自动标注方法及系统与流程

2022-12-06 23:36:16 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种胚胎发育过程视频的自动标注方法,其中所述胚胎阶段视频通过对胚胎进行延时摄影获得,其特征在于,所述方法包括:胚胎图像分类步骤s10:在所述胚胎图像分类步骤中,将所述胚胎发育过程视频划分成与m个胚胎发育阶段对应的m个胚胎发育阶段视频子集,每个所述胚胎发育阶段视频子集g1~gm包括至少3帧具有同一胚胎特征的胚胎图像;胚胎图像提取步骤s20:在所述胚胎图像提取步骤中,提取所述胚胎发育阶段视频子集的首帧图像(n1)和尾帧图像(n2);胚胎图像预标记步骤s30:在所述胚胎图像预标记步骤中,标记所述首帧图像(n1)中胚胎特征的初始包围盒(b1)和所述尾帧图像(n2)中所述胚胎特征的最终包围盒(b2);胚胎图像自动标注步骤s40:在所述胚胎图像自动标注步骤中,通过插值算法利用所述初始包围盒(b1)和所述最终包围盒(b2)获取所述胚胎发育阶段视频子集的第n帧图像(n)中所述胚胎特征的中间包围盒(b),其中1<n<ns,其中ns为所述胚胎发育阶段视频子集总帧数。2.根据权利要求1所述的自动标注方法,其特征在于:所述胚胎特征为胚胎圆心、胚胎原核、胚胎核仁或胚胎极体。3.根据权利要求1所述的自动标注方法,其特征在于:所述初始包围盒(b1)、所述中间包围盒(b)和所述最终包围盒(b2)分别由四个二维顶点坐标q(x,y)限定。4.根据权利要求3所述的自动标注方法,其特征在于:在所述胚胎图像自动标注步骤中,计算所述中间包围盒(b)的顶点坐标q,且其中q1为所述初始包围盒的对应顶点坐标,q2为所述最终包围盒的对应顶点坐标。5.根据权利要求4所述的自动标注方法,其特征在于:所述自动标注方法还包括胚胎图像标注校验步骤s50,其中在所述初始包围盒(b1)、所述中间包围盒(b)和所述最终包围盒(b2)的相同长宽比例位置处分别设置初始校验点(p1)、中间校验点(p)和最终校验点(p2),并且当所述中间校验点(p)在所述中间包围盒(b)构成的坐标系中的坐标值q超过阈值时,更新所述中间包围盒(b)的坐标q;所述初始校验点(p1)在所述初始包围盒(b1)构成的坐标系中的坐标值(q1)和所述最终校验点(p2)在所述最终包围盒(b2)构成的坐标系中的坐标值(q2)设定。6.一种胚胎发育过程视频的自动标注系统,包括视频接收模块(10)、胚胎图像分类模块(20)、图像提取模块(30)、交互预标注模块(40)和自动标注模块(50),其特征在于:所述视频接收模块(10)用于接收通过对胚胎进行覆盖多个胚胎阶段的延时摄影获取的胚胎发育过程视频;所述胚胎图像分类模块(20)用于将所述胚胎发育过程视频划分成与m个胚胎发育阶段对应的m个胚胎发育阶段视频子集(g1~gm),每个所述胚胎发育阶段视频子集包括至少3帧具有同一胚胎特征的胚胎图像;所述图像提取模块(30)用于提取所述胚胎发育阶段视频子集的首帧图像(n1)和尾帧图像(n2);
所述交互预标注模块接收所述首帧图像(n1)和所述尾帧图像(n2)以及用户的交互输入,以标记所述首帧图像(n1)中胚胎特征的初始包围盒(b1)和所述尾帧图像(n2)中所述胚胎特征的最终包围盒(b2);所述胚胎图像自动标注模块利用插值算法通过所述初始包围盒(b1)和所述最终包围盒(b2)获取所述胚胎发育阶段视频子集的第n帧图像(n)中所述胚胎特征的中间包围盒(b),其中1<n<ns,其中ns为所述胚胎发育阶段视频子集总帧数。7.根据权利要求6所述的自动标注系统,其特征在于,所述初始包围盒(b1)、所述中间包围盒(b)和所述最终包围盒(b2)分别由四个二维顶点坐标q(x,y)限定,所述中间包围盒(b)的顶点坐标q为:其中q1为所述初始包围盒的对应顶点坐标,q2为所述最终包围盒的对应顶点坐标。8.根据权利要求7所述的自动标注系统,其特征在于,所述自动标注系统还包括胚胎图像标注校验模块(60),所述胚胎图像标注校验模块(60)在所述初始包围盒(b1)、所述中间包围盒(b)和所述最终包围盒(b2)的相同长宽比例位置处分别设置初始校验点(p1)、中间校验点(p)和最终校验点(p2),并且当所述中间校验点(p)在所述中间包围盒(b)构成的坐标系中的坐标值q超过阈值时,更新所述中间包围盒(b)的坐标q;所述初始校验点(p1)在所述初始包围盒(b1)构成的坐标系中的坐标值(q1)和所述最终校验点(p2)在所述最终包围盒(b2)构成的坐标系中的坐标值(q2)设定。

技术总结
本发明涉及一种胚胎发育过程视频的自动标注方法及系统,通过线性插值算法对胚胎发育过程中各个阶段的第一帧图像及最后一帧图像进行标注,就可以获得该胚胎发育阶段过程中的胚胎坐标信息。本发明的自动标注系统能够方便医师进行标签,医师只需要对该视频中的八个阶段,每个阶段分别标记首尾两帧图像坐标,就可以利用本专利提出的线性插值方法,对每个阶段中的图像进行打标签,生成包含胚胎类别以及坐标信息的标签。标信息的标签。标信息的标签。


技术研发人员:汪涛
受保护的技术使用者:爱辅科技(上海)有限公司
技术研发日:2022.09.02
技术公布日:2022/12/5
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