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一种分析生物样本中多种蛋白修饰的方法与流程

2022-06-05 06:44:44 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种分析生物样本中多种蛋白修饰的方法,其特征在于:包括按照需要检测的蛋白修饰类型分别对蛋白质酶解消化的肽段进行相应的肽段富集;所述蛋白质酶解消化的肽段为提取自待测样本的蛋白质经过酶解消化获得的肽段;将富集的各肽段混合,获得需要检测的蛋白修饰类型的混合肽段;对混合肽段进行一次性的dia采集和/或dda采集;基于需要检测的蛋白修饰类型的肽段相应的dda谱图库,对采集的dia信息和/或dda信息进行分析,获得待测样本的蛋白修饰的分析结果。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:还包括,根据富集的肽段分别获得所有需要检测的蛋白修饰类型的肽段相应的dda谱图库。3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述需要检测的蛋白修饰类型为两种或两种以上的蛋白修饰。4.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于:所述dda谱图库的建库质谱采集参数包括,采用tims离子淌度模式,扫描范围100-1700m/z,离子淌度范围0.60-1.60v.s/cm2。5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述dda谱图库的建库质谱采集参数还包括,离子传输管电压1600v,干燥气流速3.0l/min,干燥温度180℃,挑选10个母离子,碎裂能量10ev。6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:所述dda谱图库由蛋白鉴定软件对采集的dda质谱数据进行分析鉴定获得;优选的,所述蛋白鉴定软件为maxquant、proteome discoverer或mascot。7.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于:所述dia采集的参数包括,采用tims离子淌度dia-pasep模式,扫描范围302-1077m/z,1/k0设置0.602-1.336v.s/cm2。8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述dia采集的参数还包括,离子传输管电压1600v,干燥气流速3.0l/min,干燥温度180℃,碎裂能量10ev,窗口宽度25m/z,窗口分段数4,每段窗口数8,pasef循环时间100ms。9.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于:基于dda谱图库对采集的dia信息进行分析,获得待测样本的蛋白修饰的分析结果,具体包括,使用dia蛋白组分析软件,以所有需要检测的蛋白修饰类型的肽段相应的dda谱图库为数据库,进行dia数据分析,获得待测样本的蛋白修饰的分析结果;优选的,所述dia蛋白组分析软件为skyline、spectronaut或diann。10.根据权利要求1-3任一项所述的方法,其特征在于:基于dda谱图库对采集的dda信息进行分析,获得待测样本的蛋白修饰的分析结果,具体包括,采用比对分析方法,利用所有需要检测的蛋白修饰类型的肽段相应的dda谱图库解析采集的dda信息,获得待测样本的蛋白修饰的分析结果;优选的,所述比对分析方法为match between runs分析方法。

技术总结
本申请公开了一种分析生物样本中多种蛋白修饰的方法。本申请方法包括,按照需检测蛋白修饰类型分别对待测样本的蛋白质酶解消化的肽段进行肽段富集;将富集的各肽段混合,获得需要检测的蛋白修饰类型的混合肽段;对混合肽段进行一次性的DIA采集和/或DDA采集;基于需检测蛋白修饰类型肽段相应的DDA谱图库,对DIA信息和/或DDA信息进行分析,获得待测样本的蛋白修饰分析结果。本申请方法,将富集的需检测蛋白修饰类型的肽段混合,结合各肽段的DDA谱图库,只需对混合肽段采集一次数据,就可分析获得待测样本中多种蛋白修饰的分析结果;缩短了多种蛋白修饰的检测周期,节约了质谱仪的机时,降低了多种蛋白修饰的检测成本。降低了多种蛋白修饰的检测成本。降低了多种蛋白修饰的检测成本。


技术研发人员:吴冬杰 梅占龙 訾金 李琪丹 刘杰 饶媛 何嘉丽 任艳
受保护的技术使用者:深圳华大基因科技服务有限公司
技术研发日:2022.03.04
技术公布日:2022/6/4
再多了解一些

本文用于企业家、创业者技术爱好者查询,结果仅供参考。

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