一种适配多工况的复杂污染生物样本基因组DNA提取试剂体系及提取方法与流程

摘要: 本发明属于核酸提取,具体涉及一种适配多工况的法医基因组dna提取试剂体系及提取方法。背景技术:1、法医物证检验过程中,生物接触痕迹检材极易被尘土、色素、油脂、铁...
一种适配多工况的复杂污染生物样本基因组DNA提取试剂体系及提取方法与流程

本发明属于核酸提取,具体涉及一种适配多工况的法医基因组dna提取试剂体系及提取方法。

背景技术:

1、法医物证检验过程中,生物接触痕迹检材极易被尘土、色素、油脂、铁锈等物质污染或包埋,检材基质复杂,存在大量扩增抑制物。目前常用的核酸提取体系多采用胍盐作为核心组分,该类物质会影响体系原有ph环境,破坏缓冲体系稳定性。

2、目前,为维持酸碱平衡,通常选择提高缓冲盐添加量,但易造成最终核酸产物纯度下降;若调整裂解液与结合液的酸碱差值,会引发体系ph剧烈变化,不仅会造成dna链断裂损伤,还会加剧蛋白、多糖等杂质在固相载体表面的非特异性吸附,最终导致dna提取得率低、str分型结果不佳,难以满足复杂疑难检材的检测要求。

技术实现思路

1、为了解决上述问题,本发明提供了一种适配多工况的法医基因组dna提取试剂体系及提取方法,构建稳定的缓冲调控环境,提升复杂污染检材的dna提取质量。整套试剂体系各组分协同作用,整体缓冲体系稳定,除杂效果优异,可兼容多种固相载体与不同类型提取设备,能够满足不同工况下法医疑难检材的批量提取需求。

2、为实现上述技术目的,本发明采用如下技术方案:

3、本发明的第一个方面,提供了一种适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,包括:裂解液、结合液、漂洗液和洗脱液;

4、其中,所述裂解液由如下原料组成:20~40 mmol/l tris-hcl、50~100 mmol/l四烷基季铵盐复配体系、15~30 mmol/l 月桂酰胺类表面活性剂、体积分数2%-3% 曲拉通x-100、10~15 mmol/l edta,ph值为7.4~7.8。

5、本发明的第二个方面,提供了一种适配多工况的法医基因组dna提取试剂体系的提取方法,包括:

6、将待测样品、裂解液和蛋白酶k混合均匀,进行裂解处理,裂解完成后离心,取上清液;

7、向所述上清液中加入结合液,混合均匀后,再加入固相载体,震荡使dna结合富集于固相载体表面,得到负载dna的固相载体;

8、对固相载体进行分级漂洗,洗脱,得到提取产物。

9、本发明的第三个方面,提供了上述的试剂体系在法医基因组dna提取中的应用,样品包括:尘土、色素、油脂、铁锈污染或包埋的接触痕迹检材样本、包埋检材样本中至少一种。

10、本发明的有益效果在于:

11、(1)本发明以四烷基季铵盐复配体系作为主盐体系,四烷基季铵盐化学性质稳定,不会消耗体系内缓冲组分。碱性裂解液与弱碱性结合液混合后,无需额外增加缓冲盐用量,也无需拉大酸碱差值,即可平缓转变为适宜核酸结合的环境,实现自释酸调控。结合液中复配peg8000,可进一步优化dna结合效果,提升核酸富集效率。

12、(2)本发明采用平缓的ph过渡方式,彻底避免了因酸碱剧烈波动引发的dna链断裂问题,有效保障长片段核酸的完整性。多级漂洗液分级作用,搭配特定浓度的peg、氯化钠、mops及乙醇,可依次去除蛋白、多糖、残留表面活性剂、盐分等不同类型杂质,从源头减少色素、油脂、铁锈等杂质在固相载体上的附着,显著提升dna产物的纯度与回收率。

13、(3)本发明整体体系无需依靠高浓度缓冲盐维持酸碱平衡,降低了后续漂洗除杂的难度,可搭配磁珠、硅珠等多种固相载体使用,同时能够灵活适配手工操作、半自动设备、全自动设备等不同作业模式,适用范围广,检测结果重复性好。

14、(4)本发明方法简单、操作方便、实用性强,易于推广。

1.一种适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,其特征在于,包括:裂解液、结合液、漂洗液和洗脱液;

2.如权利要求1所述适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,其特征在于,所述月桂酰胺类表面活性剂为月桂酰胺单乙醇胺。

3.如权利要求1所述适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,其特征在于,所述结合液由如下原料组成:0.5~1.0 mol/l 四烷基季铵盐复配体系、质量分数10%-15% peg8000、体积分数8%~15% 醇类、20~50 mmol/l 琥珀酸复配缓冲组分,ph值为7.2~7.3。

4.如权利要求3所述适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,其特征在于,所述醇类为乙醇或异丙醇。

5.如权利要求3所述适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,其特征在于,所述琥珀酸复配缓冲组分选自琥珀酸、琥珀酸一钠、琥珀酸二钠中的至少两种。

6.如权利要求1所述适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,其特征在于,所述漂洗液包括至少三种:

7.如权利要求1所述适配多工况的复杂污染生物样本基因组dna提取试剂体系,其特征在于,所述洗脱液ph值为9.0,为5~15 mmol/l tris-hcl。

8.一种适配多工况的法医基因组dna提取试剂体系的提取方法,其特征在于,包括:

9.如权利要求8所述的适配多工况的法医基因组dna提取试剂体系的提取方法,其特征在于,所述裂解液、蛋白酶k和结合液的体积比为:50:1~2:30-50;

10.权利要求1-7任一项所述的试剂体系在法医基因组dna提取中的应用,其特征在于,样品包括:陈旧骨骼、腐败组织、毛发、指甲中至少一种。