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一种胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法与流程

2022-12-31 15:46:17 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法,其特征在于,包括以下步骤:s1:通过cox回归分析筛选与gbm预后相关的自噬基因;s2:分别构建gbm的os预后风险比例模型和pfs预后风险比例模型;s3:通过k-m生存分析刻画gbm风险比例模型预测效能;s4:对os预后风险比例模型和pfs预后风险比例模型分别进行数据处理分析;s5:构建预后预测模型。2.根据权利要求1所述的胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法,其特征在于,在步骤s1中,对每一个差异自噬基因的连续表达值进行单因素cox回归分析,识别出预后显著的基因;以性别和年龄作为协变量,继续进行多因素cox回归分析,进一步识别到最终的预后显著的基因,即:p值<0.05。3.根据权利要求2所述的胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法,其特征在于,在步骤s2中,构建gbm的os预后风险比例模型的具体流程为:利用多变量cox回归结果中的基因的回归系数组建风险模型,在每一个样本中计算风险得分risk score。4.根据权利要求3所述的胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法,其特征在于,在步骤s3中,利用构建的risk score以中位值作为阈值将样本分成两组:将大于等于中位值的分为高风险组,将低于中位值的分为低风险组,并进行km曲线分析。5.根据权利要求4所述的胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法,其特征在于,在s4中,对os预后风险比例模型的处理分析流程为,进行os预后风险比例模型在独立数据集中预测效能的验证,获得包含样本的基因表达数据和样本的生存数据;计算每个样本的风险得分,依据得分均值将样本分成高风险组和低风险组,进行km曲线分析,发现数据中生存时间显著的差异。6.根据权利要求5所述的胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法,其特征在于,在s4中,对pfs预后风险比例模型的处理分析流程为,进行自噬基因在高低风险得分组的表达差异分析。

技术总结
本发明公开了一种胶质母细胞瘤自噬相关预后模型的建立方法,包括以下步骤:S1:通过cox回归分析筛选与GBM预后相关的自噬基因;S2:分别构建GBM的OS预后风险比例模型和PFS预后风险比例模型;S3:通过K-M生存分析刻画GBM风险比例模型预测效能;S4:对OS预后风险比例模型和PFS预后风险比例模型分别进行数据处理分析;S5:构建预后预测模型。构建的风险模型能够很好地在TCGA中预测病人整体生存,并可以独立数据中得到验证;模型能够与已知的IDH1/2突变情况、MGMT甲基化水平以及患者年龄等临床高风险因素结合,具有一定的临床病理意义;建立的预测模型,能够结合临床因素,很好地在TCGA中预测病人无进展生存。中预测病人无进展生存。中预测病人无进展生存。


技术研发人员:黄麒霖 姚国杰 陈大瑜 宋健 徐国政
受保护的技术使用者:中国人民解放军中部战区总医院
技术研发日:2022.09.27
技术公布日:2022/12/30
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