一种DNA/RNA实验数据分析校验取数系统的制作方法

技术特征：
1.一种dna/rna实验数据分析校验取数系统，其特征在于：登录模块，报表管理单元，数据配置单元，所述登录模块、报表管理单元以及数据配置单元均与控制器单元连接；登录模块，用于dna/rna实验数据处理人员登录该系统的控制模块；报表管理单元，把dna/rna实验过程中导出的源数据压缩成zip后上传其压缩包，并对源数据压缩包进行数据校验，校验后下载的数据结果表按照特定的规则填充，填充的数据包括标准曲线数据结果表、质控数据结果表、提取浓度结果表、扩增结果表、异常数据结果表；其中标准曲线数据结果表中包含批次、日期、r2、扩增效率%四项内容，填充的数据可直接从扩增源数据中抓取、统计并自动填充到对应项下；质控数据结果表包含批次、日期、低质控、中质控、高质控的相关信息，填充的数据可直接从扩增源数据中抓取、统计并自动填充到对应项下；提取浓度结果表中包含时间和动物样本的相关信息，具体包括动物号、组织代号、性别，填充的数据可直接从提取源数据中抓取、统计并自动填充到对应项下；扩增结果表中包含时间和动物样本的相关信息，具体包括动物号、组织代号、性别，填充的数据可直接从扩增源数据中抓取、统计并自动填充到对应项下；对于实验过程产生的异常数据，本系统会在源数据表中做出标记，并自动生成异常数据结果表，异常数据结果表中包含的项目与源数据一致，即包括提取异常和扩增异常，填充的数据直接从提取和扩增源数据中抓取、统计并自动填充到对应项下；数据配置单元，用于配置提取浓度结果表和扩增结果表的数据校验标准；提取浓度结果表配置条件设定了提取的dna/rna浓度和纯度范围，对提取的dna/rna的质量进行把控；在设定范围内则数据直接从提取源数据中抓取、统计并自动填充到提取浓度表；扩增结果表配置条件设定了标准曲线浓度范围的上下限即cal.1和cal.7的浓度值，如果低于cal.1的浓度值在扩增结果表自动填充为bql，如果高于cal.7的浓度值则在扩增结果表中自动填充为aql，并从扩增源数据中抓取、统计并自动填充到扩增异常数据结果表中；所述dna/rna实验数据分析校验取数系统的具体工作方法如下：s1：源数据导入，即用户将仪器产生的源数据表整理到一个压缩包中，形成源数据压缩包，并采用唯一关键字命名excel输入文件，然后导入系统中；s2：数据校验，即用户先自行配置数据校验值，然后开始进行数据校验，校验异常数据报表里的异常数据，根据配置的校验值，在下载的异常数据报表中用不同颜色标出显示数据异常条目；s3：数据表输出，即从经过数据校验取数后的报表中选择要下载报表的条目，勾选要下载的报表，然后勾选所需下载的报表进行下载即可；所述数据校验取数包括两部分，分别为核酸提取数据表质量验证和扩增数据表质量验证；所述核酸提取数据表质量验证的具体方法如下： s1：浓度试验类型，即根据文件夹名称判断本次试验的类型是dna/rna；s2：样本提取核酸后，使用酶标仪测定核酸od值；s3：根据上一步骤中测定的od值计算出dna/rna的浓度；
s4：浓度数据质量验证规则如下：（1）要求dna的od260/280介于1.60-2.00，rna的od260/280介于1.80~2.20之间，比值超出此范围的需重新提取；（2）浓度大于1μg/μl 的样本用无核酸酶水r稀释后测定浓度；（3）浓度低于0.1μg/μl的样本对于od260/280比值不做要求；（4）若样本浓度大于0.5μg/μl稀释至0.5μg/μl以下；s5：提取浓度的判定规则如下：（1）：dna纯度介于1.6-2.0或者/rna纯度介于1.8-2.2之间满足要求，填充结果，如浓度>1μg/μl需重测；（2）：dna纯度介于1.6-2.0或者/rna纯度介于1.8-2.2之间满足要求，而浓度≤0.01μg/μl，需要重测；（3）：dna纯度介于1.6-2.0或者/rna纯度介于1.8-2.2不满足要求，浓度在0.1-1μg/μl需要重测；所述核酸提取数据表质量验证方法步骤s3中dna/rna的浓度的计算方式如下：（1）、dna样本浓度计算：样本浓度={（a-b）
×
稀释倍数
×
dna消光系数} /1000；其中，dna消光系数为固定常数50，样本浓度的单位为μg/μl；（2）、rna样本浓度计算：样本浓度={（a-b）
×
稀释倍数
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rna消光系数} /1000，其中，a：样本od260、b：blankod260，rna消光系数为固定常数40，样本浓度单位为μg/μl；所述扩增数据表质量验证中规则配置路径如下： （1）：用户登录后，点击数据配置，进入数据配置模块，配置定量浓度第一个浓度点值，即cal.1值，填写第一个浓度点的点值至第x个浓度点的点值，即cal.1至cal.x值，然后保存数据；（2）：数据校验，即用户进入通过报表管理单元进入报表处理模块，选择要进行校验的数据，然后点击数据校验按钮，通过报表处理模块内的数据校验单元进行数据校验；（3）：取数，即经过校验的在范围内数据可以直接取数到数据模板表中，填充到数据模板中；（4）：数据表输出，即经过“数据校验取数”后，选中要下载报表的条目，一次只能选择一条，勾选要下载的报表，下载对应报表，可以同时勾选多个报表同时下载，其中扩增、质控、提取浓度、标准曲线表的下载输出形式为excel表形式，异常数据报表的输出形式为压缩包形式；所述的扩增数据表质量验证中规则配置路径中取数的具体过程如下：提取浓度原始数据在提取-dna或提取-rna文件夹中，下级文件夹为不同日期的文件夹，每个日期文件夹中以唯一关键字命名的excel表中浓度（μg/μl）在波长为260nm下的浓度值填充在数据模板中提取浓度的表中，用行号 列号中内容组合的方式识别后一一对应填充；提取扩增原始数据表在扩增文件夹中，下级文件夹为不同日期的文件夹，每个日期文件夹中以唯一关键字命名的excel表中r2和扩增效率的值填充在模板表中标准曲线模板
中；样本名称为低质控/中质控/高质控的扩增平均浓度值填充在质控模板中；样本名称为其它时除cal.1-cal.x的扩增浓度的扩增平均浓度值对应填充在扩增模板中；产生的异常数据填充在异常数据模板表中；对实时荧光定量pcr仪平台测定的扩增数据表质量验证过程如下：（1）：标准品稀释：标准曲线有x个点，分别是cal.1，cal.2-cal.x，对其进行梯度稀释；（2）：qpcr扩增反应体系配制；（3）：样本上机进行检测，得到对应的ct值；（4）：根据ct值求得log值后，根据ct值和log值拟合出曲线方程y=ax b，r2≥0.995，其中，x为log值，y为ct值，a、b为常数，通过线性方程计算出所需的数值； （5）：目标核酸片段浓度最终结果计算如下：copies/μg = （copies/反应）/(μg/μl)/加样体积；（6）：扩增浓度判断如下：（1）当扩增表字段扩增平均浓度的值≥cal.1扩增平均浓度时，且扩增表字段ctsd的值>1，是异常值需要重测；（2）扩增浓度值<cal.1为bql，直接填充bql；（3）当目标单元格扩增平均浓度值>cal.x行的扩增浓度值，为aql，是异常值需要重测。2.根据权利要求1所述的dna/rna实验数据分析校验取数系统，其特征在于：所述压缩包包含扩增文件夹、提取文件夹和报表输出模板；所述扩增文件夹为1级文件夹，文件夹名称不可变，其下设有扩增子文件夹，所述扩增子文件夹中存放待取数据表格；提取文件夹为要进行浓度提取的1级文件夹，文件夹名称为提取-dna或者提取-rna，其下设有提取子文件夹，所述提取子文件夹中存放待取数据表格；输出报表模板为报表输出模板格式，所述报表输出模板格式的名称中有模板字样，所述输出报表模板包括异常数据模板、扩增模板、质控模板、提取浓度模板以及标准曲线报表模板。3.根据权利要求2所述的dna/rna实验数据分析校验取数系统，其特征在于：所述源数据表包含浓度数据和指标量数据，所述浓度数据和指标量数据整理于一个压缩包内，所述压缩包中可包含不同日期的文件夹，每个文件夹以唯一关键字命名excel输入文件，并导入到系统中。4.根据权利要求3所述的dna/rna实验数据分析校验取数系统，其特征在于：所述源数据压缩包导入系统的方法如下： s1：用户通过用户名登录系统；s2：从报表管理单元进入后点击报表处理，再点击报表导入，开始从文件夹中选取源数据压缩包；s3：源数据压缩包选好后，上传到服务器。

技术总结
本发明公开了一种DNA/RNA实验数据分析校验取数系统，包括：登录模块，用于用户登录该系统的控制模块；报表管理单元，用于上传源数据压缩包，并对源数据压缩包进行数据校验，还能够下载输出报表；数据配置单元，用于配置提取浓度表和扩增表的数据校验标准；所述登录模块、报表管理单元以及数据配置单元均与控制器单元连接。一种DNA/RNA实验数据分析校验取数系统，通过多系统平台、实验数据导入、数据同时校验取数校验判定统计等，对实验数据进行批量化的处理，能够有效的减轻药物生物分析工作人员的工作量，同时数据电子化，能够有效的提升数据精确性和工作效率。数据精确性和工作效率。数据精确性和工作效率。


技术研发人员：夏艳 陈颖 马宏尹 柳函
受保护的技术使用者：昭衍（苏州）新药研究中心有限公司
技术研发日：2022.10.18
技术公布日：2022/11/15