包含细菌菌株的组合物的制作方法

1.本发明属于包含细菌菌株的组合物及此类组合物在治疗疾病中的用途的领域。


背景技术：

2.人类肠道在子宫内被认为是无菌的，但它在出生后立即暴露于多种母体和环境微生物中。此后，微生物定殖和演替的动态时期发生，这受诸如分娩模式、环境、饮食和宿主基因型等因素的影响，所有这些因素都会影响肠道微生物群的组成，尤其是在生命早期。随后，微生物群稳定并变成成人样[1]。人类肠道微生物群包含超过500-1000种不同的系统发育型，它们基本上属于两个主要的细菌分支，拟杆菌门和厚壁菌门[2]。人类肠道细菌定殖产生的成功共生关系产生了多种代谢、结构、保护和其他有益功能。定殖肠道的代谢活动增强，确保在其他情况下难以消化的膳食成分被降解，伴随副产物的释放，为宿主提供重要的营养来源。类似地，肠道微生物群的免疫重要性已得到广泛认可，并在无菌动物中得到了体现，这些动物的免疫系统受损，在引入共生细菌后功能重建[3-5]。
[0003]
在肠道疾病如炎性肠病(ibd)中已记录了微生物群组成的显著变化。例如，ibd患者中梭菌簇xiva细菌的水平降低，而大肠杆菌的数量增加，这表明肠道内共生体和病原体的平衡发生了变化[6-9]。有趣的是，这种微生物失调也与t效应子细胞群的不平衡有关。
[0004]
认识到某些细菌菌株可能对动物肠道产生潜在的积极影响，已提议将各种菌株用于治疗各种疾病(参见例如，[10-13])。而且，某些菌株，主要包括乳杆菌和双歧杆菌菌株，已被提议用于治疗与肠道没有直接关系的各种炎症和自身免疫性疾病(综述参见[14]和[15])。然而，不同疾病和不同细菌菌株之间的关系，以及特定细菌菌株对肠道和全身水平以及任何特定类型疾病的确切影响，都没有得到很好的定征。
[0005]
人类微生物组的大小和复杂性的发现导致了对许多健康和疾病概念的持续评估。当然，在胃肠道疾病如炎性肠病(ibd)中已经记录了微生物群组成的巨大变化[16-19]。最近，本领域对可能在人类大脑疾病中发挥病理生理作用的肠道微生物群的变化越来越感兴趣[20]。临床前和临床证据强烈表明大脑发育与微生物群之间存在联系[21]。
[0006]
越来越多的临床前文献证明了大脑和肠道微生物组之间的双向信号传递，涉及多个神经分泌和内分泌信号系统。事实上，微生物组中梭菌种类水平的增加与大脑病症有关[22]，并且拟杆菌门和厚壁菌门的失衡也与大脑发育病症有关[23]。肠道共生菌水平改变，包括双歧杆菌、乳杆菌、萨特氏菌属(sutterella)、普氏菌属和瘤胃球菌属以及产碱菌科的肠道共生菌水平的改变，与免疫介导的中枢神经系统(cns)病症有关的提议，受到表明缺乏患者和健康对象之间的微生物群改变的研究的质疑[24]。这表明，目前，微生物组与人类大脑疾病之间联系的实际影响还未得到良好定征。因此，需要更直接的分析研究来确定改变微生物组对cns病症的治疗影响。
[0007]
认识到某些细菌菌株可能对动物肠道产生潜在的积极影响，已提议将各种菌株用于治疗各种疾病(参见例如，[24-27])。而且，某些菌株，主要包括乳杆菌和双歧杆菌菌株，已被提议用于治疗与肠道没有直接关系的各种炎症和自身免疫性疾病(综述参见[28]和
[29])。另外，已经在动物模型中研究了一系列益生菌，以确定肠道微生物群在调节情绪行为中的作用，并且双歧杆菌和乳酸杆菌是显示有益效果、减少焦虑和重复行为以及增加社交互动的主要属[30-32]。然而，不同疾病和不同细菌菌株之间的关系，以及特定细菌菌株对肠道和全身水平以及任何特定类型疾病的精确影响，都没有得到很好的定征，尤其是对于中枢神经系统疾病。
[0008]
越来越多的证据表明，微生物群-肠-脑轴在自闭症谱系障碍(asd)和其他神经发育和神经精神疾病中受到影响。动物模型为微生物群如何参与asd提供了相当多的见解。此外，临床前研究表明，通过给予有益的活生物治疗剂靶向肠道微生物群，在改善动物模型，包括母体免疫激活(mia)小鼠模型和黑棕短尾(btbr)小鼠中显示出改善自闭症相关行为的功效。btbr小鼠是一种经过基因改良的近交系小鼠品系，它表现出许多与asd相关的行为，如社交能力受损、重复行为和焦虑增加。此外，这些小鼠还表现出胃肠功能障碍以及肠道微生物群组成的改变。因此，它代表了一种用于研究asd中微生物群-肠-脑轴的作用的合适的动物模型。
[0009]
参考文献[33]讨论了通过给予包含选自拟杆菌属和/或肠球菌属的细菌种类的组合物来治疗神经发育障碍的可能方法，但仅提供了拟杆菌属的数据。参考文献[34]讨论了拟杆菌和肠球菌的类似用途，数据仅限于脆弱拟杆菌、普通拟杆菌和粪肠球菌。参考文献[35]讨论了通过anaerostipes hadrus产生丁酸盐。类似地，参考文献[36]讨论了通过包含粪厌氧棒杆菌和霍氏真杆菌的菌株的细菌聚生体产生丁酸盐。参考文献[37]讨论了包含anaerostipes hadrus的特定菌株和粪厌氧棒杆菌的特定菌株的聚生体，其中之一被描述为影响小鼠模型中糖尿病的发作，但没有描述其他治疗效果。参考文献[38]讨论了使用合成粪便组合物治疗一系列疾病，并提议在这种组合物中可能包含大量细菌种类(表1)。参考文献[39]讨论了使用包含来自厚壁菌门和拟杆菌门的细菌的组合物来减少微生物组中抗生素抗性基因的丰度。参考文献[40]讨论了产生gaba的工程菌，用于治疗精神疾病或中枢神经系统疾病。然而，只提供了与gaba产生相关的数据，并没有显示治疗效果。
[0010]
本领域需要治疗疾病的新方法，特别是治疗中枢神经系统病症的新方法。还需要对肠道细菌的潜在影响进行定征，以便可以开发使用肠道细菌的新疗法。
[0011]
发明概述
[0012]
本发明人已开发出使用梭菌目的细菌菌株的新疗法，以治疗或预防多种适应症(包括但不限于中枢神经系统病症或病况和癌症)。
[0013]
本发明提供给了用于治疗或预防中枢神经系统病症或病况的方法的包含梭菌目的革兰氏阳性、杆状和厌氧的细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株不属于罗氏菌属(roseburia)或bariatricus属、或梭菌科(clostridiacae)。本发明还提供了用于治疗或预防中枢神经系统病症或病况的方法的梭菌目的革兰氏阳性、杆状和厌氧的细菌菌株，其中所述细菌菌株不属于罗氏菌属或bariatricus属、或梭菌科。在优选的实施方案中，此类细菌菌株属于厌氧棒杆菌、真杆菌或faecalicatena属。
[0014]
本发明的其他实施方案详述如下。
[0015]
治疗用途
[0016]
本发明还提供了用于治疗用途的包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物。
[0017]
本发明人开发了可用于治疗的包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的新组合物。特别
地，本发明人开发了包含厌氧棒杆菌属的菌株的新组合物，用于治疗和预防由组蛋白脱乙酰酶(hdac)活性介导的疾病或病况。本发明人已鉴定来自厌氧棒杆菌属的细菌菌株可有效降低组蛋白脱乙酰酶活性。组蛋白脱乙酰化酶活性已显示介导一系列疾病和病况的病理症状，包括但不限于自身免疫性或炎性疾病和病况，包括但不限于移植物抗宿主病(gvhd)、炎性肠病，如克罗恩病、神经退行性疾病，如帕金森氏病、脑损伤，如中风和一系列癌症。由此，本发明的组合物在至少部分由hdac活性介导的多种疾病的治疗或预防中可具有多效益处。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗预防由增加的hdac活性介导的疾病。
[0018]
如实例中所述，经口施用包含厌氧棒杆菌的组合物可降低疾病模型中组蛋白脱乙酰酶的活性。而且，如实例中所述，经口施用包含厌氧棒杆菌的组合物可降低疾病小鼠模型中的多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于治疗或预防与多动相关的疾病或病况。组合物可用于治疗或预防多动症。组合物可用于治疗或预防与行为障碍如注意力缺陷多动障碍相关的多动症。因此，本发明人已经鉴定了有效预防或治疗由hdac活性介导的疾病的组合物，和有效治疗或预防行为障碍的组合物。适合用本发明的组合物治疗的行为障碍可能或可能不部分由hdac活性介导。
[0019]
在特定的实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防介导hdac活性的疾病。本发明人已经确定用来自该属的细菌菌株进行治疗可以降低hdac的活性，这可以在治疗由hdac活性介导的疾病中提供临床益处。在一些实施方案中，已发现本发明的组合物特别有益于降低i类hdac活性。i类hdacs普遍表达，且最常驻留在细胞核中。i类hdacs使组蛋白赖氨酸残基去乙酰化以恢复组蛋白的正电荷，从而增加组蛋白和dna之间的静电结合。因此，hdac活性会增加染色质压实，从而导致潜在dna序列中基因表达的下调。hdacs还通过修饰非组蛋白靶标而具有额外的调节作用。非组蛋白靶标乙酰化的抑制可能有益于治疗或预防与染色质扩增控制基因表达不直接相关的疾病的其他方面。在某些实施方案中，本发明的组合物因此可用于调节靶基因表达。
[0020]
在一些实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防由hdac活性介导的炎性肠病的方法。已显示抑制hdac活性可抑制胃肠道中促炎细胞因子的产生。因此，本发明的组合物可用于治疗炎性疾病。特别地，本发明的组合物可用于治疗或预防与增加的结肠促炎细胞因子发病机制相关的病况。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防炎性肠病。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防溃疡性结肠炎。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防克罗恩病。本发明人已经看到利用物种anaerostipes hadrus的细菌特别好的结果，并因此本发明提供了包含该种细菌菌株的组合物，用于治疗或预防炎性疾病。在优选的实施方案中，本发明提供了包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防结肠炎。
[0021]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于降低组蛋白脱乙酰酶活性以治疗或预防由组蛋白脱乙酰酶活性介导的疾病或病况的方法。
[0022]
在某些实施方案中，组合物用于组蛋白脱乙酰酶活性升高的患者中。在某些实施方案中，组合物用于具有升高的i类hdac活性的患者。厌氧棒杆菌菌株显示的对组蛋白脱乙酰酶活性的影响可能对此类患者特别有益。
[0023]
此外，本发明人已经确定用厌氧棒杆菌属的细菌菌株处理可以降低促炎分子如il-6、tnf-α和il-1β的活化。il-6诱导的慢性炎症最终可能导致细胞死亡。因此，本发明的
细菌菌株可特别用于治疗或预防炎症或自身免疫性病症。在一些实施方案中，细菌菌株可用于治疗以il-6活化增强为特征的炎性或自身免疫性疾病。
[0024]
在特定实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌(anaerostipes)属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防选自以下疾病或病况的方法：神经退行性疾病，如阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病；脑损伤，如中风；行为或精神障碍，如注意力缺陷多动症、强迫性障碍、焦虑障碍、双相障碍或创伤后应激障碍；炎症或自身免疫性疾病，如哮喘、关节炎、银屑病、多发性硬化、糖尿病、同种异体移植排斥、移植物抗宿主病或炎性肠病，如克罗恩病；或癌症，如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。
[0025]
在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防癌症。癌症中乙酰化途径的失调与癌细胞存活和肿瘤免疫逃避有关。例如，hdac介导的p53去乙酰化会降低p53的稳定性和半衰期。乙酰化p53以更大的效力结合并调节细胞周期调节基因和促凋亡基因的表达，减少癌细胞生长并促进细胞凋亡。因此，p53的去乙酰化可能会抑制癌细胞的凋亡，从而增加癌细胞的存活率。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防癌症。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗具有非突变p53的癌症。在一些实施方案中，本发明的组合物用于增加癌细胞凋亡的方法。在一些实施方案中，本发明的组合物用于减少肿瘤免疫逃避的方法。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防具有增加的hdac活性的癌症。在一些实施方案中，组合物用作促凋亡药物，例如用于治疗或预防癌症。在某些实施方案中，本发明提供用于治疗或预防癌症的包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物。
[0026]
在其他优选的实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防癌症，如乳腺癌、肺癌或肝癌的方法。在其他优选的实施方案中，本发明提供了厌氧棒杆菌属的细菌菌株，用于治疗或预防癌症，如乳腺癌、肺癌或肝癌的方法。在某些实施方案中，组合物用于在癌症治疗中减小肿瘤大小或防止肿瘤生长的方法。在某些实施方案中，本发明提供了包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物，用于治疗癌症。在某些实施方案中，本发明提供了用于治疗癌症的包含厌氧棒杆菌属，优选物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株不是根据保藏号登录号ncimb 43457保藏的细菌菌株。
[0027]
中枢神经系统病症或病况
[0028]
本发明人特别确定并开发了用于治疗和预防中枢神经系统病症的新疗法，如由微生物群-肠-脑轴介导的那些。此类疗法使用包含梭菌目的革兰氏阳性、杆状和厌氧的细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株不属于罗氏菌属或bariatricus属、或梭菌科。
[0029]
具体而言，本发明人已经确定厌氧棒杆菌属的细菌菌株(如物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)可有效治疗和预防由微生物群-肠-脑轴介导的疾病和病况。另外，本发明人已经确定真杆菌(eubacterium)属和faecalicatena属的细菌菌株可有效治疗和预防由微生物群-肠-脑轴介导的疾病和病况。如实例中所述，在自闭症谱系障碍的动物模型中，经口施用包含anaerostipes hadrus的组合物可以减少与微生物群-肠-脑轴功能障碍相关的症状。而且，如实例中所述，在自闭症谱系障碍小鼠模型中，经口施用包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株的组合物可减轻与微生物群-肠-脑轴功能障碍相关的症状。另外，如实例中所述，经口施用包含真杆菌或faecalicatena菌株的组合物可调节与微生物
群-肠-脑轴的功能以及神经发育和神经精神障碍相关的信号分子的水平。
[0030]
在优选的实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。例如，组合物可包含物种anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌(anaerostipes caccae)和anaerostipes rhamnosivorans的细菌菌株。特别地，组合物可包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株。可选地，组合物可包含与seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7、seq id no:15或seq id no:16的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株。中枢神经系统障碍或病况可由微生物群-肠-脑轴介导。
[0031]
本发明还提供了厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌和anaerostipes rhamnosivorans的细菌菌株)在制备用于治疗的药物，例如用于治疗或预防如本文所述的中枢神经系统障碍或病况的药物中的用途。本发明还提供了治疗或预防有需要的患者疾病的方法，特别是在治疗或预防如本文所述的中枢神经系统障碍或病况的方法，包括向有需要的患者给予包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌和anaerostipes rhamnosivorans的细菌菌株)的组合物。
[0032]
本发明提供了包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物用于治疗或预防由微生物群-肠-脑轴的功能障碍介导的疾病或病况的方法的用途。还提供了治疗或预防由微生物群-肠-脑轴的功能障碍介导的疾病或病况的方法，包括给予包含厌氧棒杆菌的细菌菌株的组合物。
[0033]
包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗或预防神经发育障碍或神经精神系统病况的方法。本发明人已经确定，用来自厌氧棒杆菌属的细菌菌株进行治疗可以在中枢神经系统障碍的小鼠模型中提供临床益处，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的那些。
[0034]
本发明人已经确定用来自该属的细菌菌株进行处理可以调节中枢、自主神经和肠神经系统中的信号传导；和/或可以调节下丘脑垂体-肾上腺(hpa)轴通路的活性；和/或可以调节神经内分泌和/或神经免疫通路；和/或可以调节对象的共生代谢物、炎症标志物和/或胃肠道通透性的水平。
[0035]
包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗或预防选自以下疾病或病况的方法：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；痴呆；阿尔茨海默氏病；帕金森氏病；和/或慢性疼痛。
[0036]
包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗或预防运动神经元疾病；亨廷顿病；guillain-barre综合征和/或脑膜炎。厌氧棒杆菌细菌菌株显示的对微生物群-肠-脑轴和由微生物群-肠-脑轴介导的疾病的效应表明对由微生物群-肠-脑轴介导的其他疾病和病况，如本文公开的那些的治疗益处。
[0037]
包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的
组合物可用于治疗与由微生物群-肠-脑轴介导的疾病和病况相关的并存病，如本文公开的那些的方法。例如，组合物可用于治疗与由微生物群-肠-脑轴介导的疾病和病况相关的胃肠道并存病，如本文公开的那些的方法。本技术中用于评估自闭症谱系障碍症状的小鼠模型实验在本领域中已知适用于评估其他中枢神经系统障碍的症状，包括本文公开的那些[41-42]。
[0038]
包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗或预防自闭症谱系障碍，如自闭症的方法。本发明人已确定用厌氧棒杆菌菌株治疗可减少自闭症谱系障碍小鼠模型中的症状严重性，并且可以预防或减少刻板、重复、强迫和焦虑行为。包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物对治疗自闭症谱系障碍可能特别有效。因此，包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(如物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗自闭症谱系障碍。组合物可用于治疗行为症状(例如，自闭症谱系障碍的)。例如，组合物可预防、减少或减轻刻板、重复、强迫和/或焦虑行为中的一种或多种。包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(如物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗自闭症谱系障碍的胃肠道症状。在优选的实施方案中，组合物可用于治疗自闭症谱系障碍的行为和胃肠道症状。用来自厌氧棒杆菌属的菌株(如物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)治疗可以调节中枢、自主神经和肠道神经系统的信号传导；可以调节hpa轴通路的活性；可以调节神经内分泌和/或神经免疫通路；和/或可以调节对象的共生代谢物、炎症标志物和/或胃肠道通透性的水平，所有这些都与自闭症谱系障碍的神经病理学有关。在某些实施方案中，用来自厌氧菌属的菌株(如物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)菌株处理可以调节催产素和/或加压素激素的水平。
[0039]
包含厌氧菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗或预防强迫性障碍(ocd)的方法。在一些实施方案中，组合物可用于在ocd的治疗中预防、减少或减轻刻板、重复、强迫和/或焦虑行为中的一种或多种。用来自厌氧棒杆菌属的菌株进行治疗可以调节中枢、自主神经和肠神经系统的信号传导；可以调节hpa轴通路的活性；可以调节神经内分泌和/或神经免疫通路；和/或可以调节对象的共生代谢物和/或胃肠道通透性的水平，所有这些都与ocd的神经病理学有关。
[0040]
包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗或预防重性抑郁障碍(mdd)的方法。用厌氧棒杆菌属的菌株进行治疗可在抑郁症小鼠模型中提供临床益处。因此，组合物可用于治疗抑郁症。包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物对于治疗抑郁症可能特别有效。在一些情况下，组合物可用于预防、减少或减轻抑郁症治疗中的刻板、重复、强迫和/或焦虑行为中的一种或多种。用来自厌氧棒杆菌属的菌株(如物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)进行处理可能会调节中枢、自主神经和肠神经系统中的信号传导；可以调节hpa轴通路的活性；可能调节神经内分泌和/或神经免疫通路；并且可以调节对象的共生代谢物、炎症标志物和/或胃肠道通透性的水平，所有这些都与mdd的神经病理学有关。用来自厌氧棒杆菌属的菌株(如本文公开的物种的细菌菌株)处理可以调节催产素和/或加压素激素的水平。
[0041]
包含厌氧菌属的细菌菌株(例如，物种anaerostipes hadrus的细菌菌株)的组合物可用于治疗或预防焦虑障碍的方法。在本技术的实例中，用来自厌氧棒杆菌属的菌株进行的治疗降低了焦虑小鼠模型中的疾病发生率和疾病严重程度。组合物可用于治疗焦虑障
脑轴，以治疗或预防自闭症谱系障碍；强迫性障碍；重性抑郁障碍；焦虑障碍；应激障碍；精神分裂症谱系障碍；双相障碍；神经认知障碍和帕金森氏病。
[0048]
在一些实施方案中，来自厌氧棒杆菌属的细菌菌株可在治疗选自以下的行为障碍中提供治疗益处：注意力缺陷多动障碍、对立违抗性障碍和品行障碍。本发明人已经确定，用厌氧棒杆菌菌株治疗可减少小鼠的多动症，这是行为障碍的一种症状，如患有adhd。因此，本发明的菌株可用于治疗或预防行为障碍，特别是治疗或预防与多动症相关的行为障碍，如adhd。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的多动症。在某些实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防行为障碍的包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防adhd的包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物。
[0049]
在一些实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防由hdac活性介导的神经变性疾病的方法。在一些实施方案中，本发明的组合物可用于治疗或预防由hdac活性介导的神经退行性疾病的症状。本发明人已经确定本发明的菌株抑制hdac活性。组蛋白乙酰化和去乙酰化是基因表达的重要表观遗传调控因子。组蛋白乙酰化失衡与阿尔茨海默氏病、亨廷顿病和帕金森氏病等神经退行性疾病的发病机制有关。在一些实施方案中，本发明的菌株用于治疗或预防与年龄相关的神经退行性疾病。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防老年发病型(age-onset)神经退行性疾病，如老年发病型帕金森氏病或老年发病型阿尔茨海默氏病。在某些实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防神经退行性疾病的包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病的包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物。
[0050]
在本发明的某些实施方案中，组合物用于治疗脑损伤。本发明组合物的神经保护活性及其降低组蛋白脱乙酰酶活性(hdac)水平的能力可使其用于治疗脑损伤。在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗中风，如治疗中风引起的脑损伤。在某些实施方案中，本发明提供了包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防脑损伤，特别是中风。
[0051]
组合物中的细菌菌株可以属于物种anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌(anaerostipes caccae)和anaerostipes rhamnosivorans。细菌菌株可具有与anaerostipes hadrus的细菌菌株的16s rrna序列(例如，seq id no:1、2、6或7)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。细菌菌株可具有与丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)的细菌菌株的16s rrna序列(例如，seq id no:3)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。细菌菌株可具有与anaerostipes rhamnosivorans的细菌菌株的16s rrna序列(例如，seq id no:4或16)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。细菌菌株可具有与粪厌氧棒杆菌的细菌菌株的16s rrna序列(例如，seq id no:5或15)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。因此，细菌菌株可具有与seq id no:1-7或15具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。在优选的实施方案中，细菌菌株可具有与seq id no:6或7具有至少95％、
96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。例如，细菌菌株具有与seq id no:6具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。例如，细菌菌株具有与seq id no:7具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。
[0052]
本发明还提供了包含细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id nos:1-7和15中任一个具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna序列，用于治疗用途，例如在治疗或预防如本文所述的中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0053]
在优选的实施方案中，组合物包含根据登录号ncimb 43457、ncimb 43526保藏的细菌菌株或其衍生物。
[0054]
在其他优选的实施方案中，本发明提供了包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法，如神经发育障碍或神经精神系统病况，如本文中更详细公开的那些。本发明还提供了真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法，如神经发育障碍或神经精神系统病况，如本文中更详细公开的那些。
[0055]
优选的细菌物种包括卡兰德真杆菌(eubacterium callanderi)、粘液真杆菌(eubacterium limosum)、直肠真杆菌(eubacterium rectale)、挑剔真杆菌(eubacterium eligens)、霍氏真杆菌(eubacterium hallii)、faecalicatena fissicatena或faecalicatena contorta。在特别优选的实施方案中，本发明的组合物包含物种卡兰德真杆菌或粘液真杆菌的细菌菌株，更优选地，卡兰德真杆菌。优选的细菌菌株还包括具有与seq id no:8、9、10、11、12、13或14具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的那些；优选地与seq id no:8；更优选地，其中所述细菌菌株具有由seq id no:8表示的16s rrna基因序列。
[0056]
在一些实施方案中，中枢神经系统障碍或病况选自：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍(mdd)；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；痴呆；阿尔茨海默；帕金森氏病；慢性疼痛；运动神经元疾病；亨廷顿病；格林巴利综合征和脑膜炎。本技术中用于评估自闭症谱系障碍症状的小鼠模型实验在本领域中已知适用于评估其他中枢神经系统障碍的症状，包括上面列出的那些(参见，例如[43-45])。来自真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株显示的对微生物群-肠-脑轴和由微生物群-肠-脑轴介导的疾病的影响可能为由微生物群-肠-脑轴介导的其他疾病和病症提供治疗益处(以上仅作为示例)。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗与由微生物群-肠-脑轴介导的疾病和病况相关的并存病(如胃肠道并存病)的方法，如上面列出的那些。
[0057]
本发明人已经确定，用来自真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株进行治疗可以调节中枢、自主神经和肠神经系统中的信号传导；可以调节下丘脑垂体-肾上腺(hpa)轴通路的活性；可以调节神经内分泌和/或神经免疫通路；和/或可以调节对象的胃肠道通透性。特别地，包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物在调节中枢、自主和肠神经系统中的信号传导；调节下丘脑垂体-肾上腺(hpa)轴通路的活性；调节神经内分泌和/或神经免疫
通路；和/或调节对象的胃肠通透性方面可能特别有效。上述机制尤其与自闭症谱系障碍、强迫性障碍(ocd)、重性抑郁障碍(mdd)、应激障碍、精神分裂症谱系和精神障碍、双相障碍和神经认知障碍如帕金森氏病的神经病理学有关。
[0058]
在优选的实施方案中，中枢神经系统障碍或病况是自闭症谱系障碍，如自闭症。发明人已经确定用真杆菌菌株(特别是卡兰德真杆菌)治疗可以降低自闭症谱系障碍小鼠模型的症状严重程度，并且可以预防或减少刻板、重复、强迫和焦虑行为。本发明可用于减少刻板、重复、强迫或焦虑行为，特别是用于治疗自闭症谱系障碍。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防自闭症谱系障碍如自闭症的方法的包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物。
[0059]
在另一优选实施方案中，中枢神经系统障碍或病况是强迫性障碍(ocd)。本发明可用于在治疗ocd中减少刻板、重复、强迫或焦虑行为。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防ocd的方法的包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物。
[0060]
在另一优选实施方案中，中枢神经系统障碍或病况是重性抑郁障碍(mdd)。用真杆菌或faecalicatena菌株治疗可在抑郁症小鼠模型中提供临床益处。本发明可用于在治疗或预防mdd中调节催产素和/或加压素激素。在优选的实施方案中，本发明提供了包含用于治疗或预防mdd的方法的物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物。
[0061]
在另一优选实施方案中，中枢神经系统障碍或病况选自焦虑障碍。在本技术的实例中，本发明人已经确定用真杆菌菌株(特别是卡兰德真杆菌)治疗降低了焦虑障碍小鼠模型中的疾病发生率和疾病严重程度。本发明可用于减少焦虑治疗中的刻板、重复、强迫或焦虑行为。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防焦虑障碍的方法的包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物。
[0062]
在另一优选实施方案中，中枢神经系统障碍或病况选自应激障碍，如创伤后应激障碍。包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株的组合物可减少应激障碍小鼠模型中的应激。本发明可用于调节催产素和/或加压素激素的水平以治疗或预防应激障碍。在优选的实施方案中，本发明提供了一种组合物，该组合物用于治疗或预防应激障碍的方法的包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物。
[0063]
在另一优选的实施方案中，中枢神经系统障碍或病况选自精神分裂症谱系和精神障碍，如精神分裂症。包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株的组合物可改善精神分裂症谱系和精神障碍小鼠模型中的阳性和阴性症状。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防精神分裂症谱系和精神障碍的方法的包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物。
[0064]
在另一优选实施方案中，中枢神经系统障碍或病况是双相障碍。包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株的组合物可减少双相障碍小鼠模型中躁狂症和/或抑郁症的发生。本发明可用于在双相障碍的治疗或预防中调节催产素和/或加压素激素的水平。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防双相情感障碍的方法的包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物。
[0065]
在另一优选实施方案中，中枢神经系统障碍或病况选自神经认知障碍，如阿尔茨海默氏病。包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株的组合物可改善神经认知障碍小鼠模型的认知和行为功能。在优选的实施方案中，本发明提供了包含物种卡兰德真杆菌的
rrna基因序列定义的)。优选地，所述细菌菌株用于治疗，特别是用于本文公开的疾病的治疗用途。
[0076]
在优选的实施方案中，组合物包含根据登录号ncimb 43457的保藏菌株，用于治疗用途，如治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。示例性的应用包括：治疗或预防神经发育障碍或神经精神系统病况；和/或治疗或预防自闭症谱系障碍，优选地自闭症。在特别优选的实施方案中，包含根据登录号ncimb 43457保藏的菌株的组合物可用于预防、减少或减轻刻板、重复、强迫和/或焦虑行为中的一种或多种，特别是在治疗自闭症的方法。
[0077]
在优选的实施方案中，组合物包含根据登录号ncimb 43526的保藏菌株，用于治疗用途，如治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。示例性用用包括：治疗或预防神经发育障碍或神经精神系统病况；和/或治疗或预防自闭症谱系障碍，优选自闭症。在特别优选的实施方案中，包含根据登录号ncimb 43526保藏的菌株的组合物可用于预防、减少或减轻刻板、重复、强迫和/或焦虑行为中的一种或多种，特别是在治疗自闭症的方法。来自厌氧棒杆菌属的细菌菌株显示的对hdac活性的影响可以为由异常hdac活性介导的疾病和病况提供治疗益处，如上面列出的那些。在某些实施方案中，本发明的组合物可以在治疗具有增加的hdac表达的疾病或病况中提供治疗益处。在某些实施方案中，本发明的组合物可以在治疗具有增加的hdac活性的疾病或病况中提供治疗益处。
[0078]
在本发明的某些实施方案中，组合物的细菌菌株属于厌氧棒杆菌。在本发明的某些实施方案中，组合物中的细菌菌株属于anaerostipes hadrus。也可使用密切相关的菌株，如具有与seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7、seq id no:15或seq id no:16具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:1表示的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:2表示的16s rrna基因序列。在其他优选的实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:6或7表示的16s rrna基因序列。
[0079]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于经口给药。本发明菌株的经口给药可有效治疗由hdac活性介导的疾病和病况。在某些实施方案中，本发明菌株的经口给药可有效治疗由i类hdac活性介导的疾病和病况。而且，经口给药方便用于患者和参与者，并允许递送至肠道和/或部分或全部定殖肠道。
[0080]
在某些实施方案中，本发明的组合物包含一种或多种药学上可接受的赋形剂或载体。
[0081]
在某些实施方案中，本发明的组合物包含已冻干的细菌菌株。冻干是制备允许细菌递送的稳定组合物的有效且方便的技术。
[0082]
在某些实施方案中，本发明提供了包含如上所述的组合物的食品。
[0083]
另外，本发明提供了治疗或预防由hdac活性介导的疾病或病况的方法，包括给予包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物。
[0084]
本发明还提供了根据登录号dsm 108065或dsm 3319保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，或其衍生物，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0085]
本发明其他编号的实施方案提供如下：
[0086]
1.包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗用途。
[0087]
2.包含与seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7、seq id no:15或seq id no:16的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株的组合物，用于治疗用途。
[0088]
3.如实施方案2所述的组合物，其中所述细菌菌株能够
[0089]
(a)当使用荧光生成测定进行测定时，将hdac 1活性抑制至少40％；和/或
[0090]
(b)当使用荧光生成测定进行测定时，将hdac 2活性抑制至少60％；和/或
[0091]
(c)当使用荧光生成测定进行测定时，将hdac 3活性抑制至少50％。
[0092]
4.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于治疗或预防由组蛋白脱乙酰酶(hdac)活性介导的疾病或病况。
[0093]
5.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于治疗或预防由i类hdac活性介导的疾病或病况。
[0094]
6.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于在由i类hdac活性介导的病况中抑制i类hdac活性的方法。
[0095]
7.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于在由i类hdac活性介导的病况中选择性地抑制i类hdac活性的方法。
[0096]
8.根据任何前述实施方案所述的组合物，其中所述组合物用于在由hdac1、hdac2或hdac3活性介导的疾病或病况中选择性地抑制hdac1、hdac2或hdac3活性。
[0097]
9.根据任何前述实施方案所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防疾病或病况，其中抑制hdac活性是有利的。
[0098]
10.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于具有升高的hdac活性的患者。
[0099]
11.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于治疗或预防选自以下的疾病或病况：神经退行性疾病，如阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病；脑损伤，如中风；行为或精神障碍，如注意力缺陷多动症、强迫性障碍、焦虑障碍、双相障碍或创伤后应激障碍；炎症或自身免疫性疾病，如哮喘、关节炎、银屑病、多发性硬化、糖尿病、同种异体移植排斥、移植物抗宿主病或炎性肠病，如克罗恩病；或癌症，如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。
[0100]
12.如实施方案11所述的组合物，用于治疗或预防神经退行性病症，优选地其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus。
[0101]
13.如实施方案12所述的组合物，用于治疗或预防帕金森氏病。
[0102]
14.如实施方案12所述的组合物，用于治疗或预防亨廷顿病。
[0103]
15.如实施方案12所述的组合物，用于治疗或预防阿尔茨海默氏病。
[0104]
16.如实施方案11所述的组合物，用于治疗或预防行为障碍，优选地其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus。
[0105]
17.如实施方案16所述的组合物，用于治疗或预防注意力缺陷多动障碍。
[0106]
18.如实施方案12所述的组合物，用于治疗或预防行为障碍，优选地其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus。
[0107]
19.如实施方案16所述的组合物，用于治疗或预防注意力缺陷多动障碍。
[0108]
20.如实施方案11所述的组合物，用于治疗或预防多动症，优选地其中所述细菌菌
株属于物种anaerostipes hadrus。
[0109]
21.如实施方案11所述的组合物，用于治疗或预防炎性肠病，优选地其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus。
[0110]
22.如实施方案21所述的组合物，用于治疗或预防溃疡性结肠炎。
[0111]
23.如实施方案21所述的组合物，用于治疗或预防克罗恩病。
[0112]
24.如实施方案11所述的组合物，用于治疗或预防癌症。
[0113]
25.用于实施方案24所述的用途的组合物，其中所述癌症选自前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。
[0114]
26.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于治疗或预防炎症或自身免疫性疾病。
[0115]
27.根据任何前述实施方案所述的组合物，用于预防或治疗移植物抗宿主病。
[0116]
28.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus。
[0117]
29.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:1具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[0118]
30.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有由seq id no:1表示的16s rrna基因序列。
[0119]
31.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:2具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[0120]
32.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有由seq id no:2表示的16s rrna基因序列。
[0121]
33.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:6具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[0122]
34.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有由seq id no:6表示的16s rrna基因序列。
[0123]
35.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:7具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[0124]
36.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有由seq id no:7表示的16s rrna基因序列。
[0125]
37.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:15具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[0126]
38.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株具有由seq id no:15表示的16s rrna基因序列。
[0127]
39.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述组合物用于经口施用。
[0128]
40.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述组合物包含一种或多种药学上可接受的赋形剂或载体。
[0129]
41.如任何前述实施方案所述的组合物，其中所述细菌菌株是冻干的。
[0130]
42.根据任何前述实施方案所述的组合物，用作组蛋白脱乙酰酶抑制药剂。
[0131]
43.根据任何前述实施方案所述的组合物，用作i类组蛋白脱乙酰酶抑制药剂。
[0132]
44.根据任何前述实施方案所述的组合物，用作hdac2抑制药剂。
[0133]
45.根据任何前述实施方案所述的组合物，用作选择性的hdac2抑制药剂。
[0134]
46.包含任何前述实施方案所述组合物的食品，用于任何前述实施方案的用途。
[0135]
47.治疗或预防由组蛋白脱乙酰酶活性介导的疾病或病况的方法，包括向有需要的患者给予包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物。
[0136]
48.根据登录号dsm 108065或dsm 3319保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，或其衍生物，用于治疗用途。
[0137]
49.根据登录号dsm 108065或dsm 3319保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，或其衍生物，用于治疗或预防如实施方案2-27中任一项定义的疾病或病况。
[0138]
50.包含根据登录号dsm 108065或dsm 3319保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，或其衍生物的药物组合物。
[0139]
51.根据登录号ncimb 43457或ncimb 43526保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，或其衍生物，用于治疗用途。
[0140]
52.根据登录号ncimb 43457或ncimb 43526保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，或其衍生物，用于治疗或预防如实施方案2-27中任一项定义的疾病或病况。
[0141]
53.包含根据登录号ncimb 43457或ncimb 43526保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞或其衍生物的药物组合物。
[0142]
54.包含与seq id no:6的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株的组合物，用于治疗用途。
[0143]
55.包含与seq id no:7的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株的组合物，用于治疗用途。
[0144]
56.包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0145]
57.包含与seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7、seq id no:15或seq id no:16的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0146]
58.包含与seq id no:6或seq id no:7的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0147]
59.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌或anaerostipes rhamnosivorans。
[0148]
60.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述中枢神经系统障碍或病况由微生物群-肠-脑轴介导。
[0149]
61.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防神经发育障碍或神经精神系统病况的方法。
[0150]
62.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防选自以下病症或病况的方法：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性
抑郁障碍；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；痴呆；阿尔茨海默氏病；帕金森氏病；慢性疼痛；运动神经元疾病；亨廷顿病；格林巴利综合征和脑膜炎。
[0151]
63.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防自闭症谱系障碍的方法。
[0152]
64.用于实施方案63所述的用途的组合物，其中所述组合物用于减少或预防自闭症的方法。
[0153]
65.用于实施方案64所述的用途的组合物，其中所述组合物预防、减少或减轻刻板、重复、强迫和/或焦虑行为中的一种或多种。
[0154]
66.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防强迫性障碍的方法。
[0155]
67.用于实施方案66所述的用途的组合物，其中所述组合物预防、减少或减轻重复、强迫和/或焦虑行为中的一种或多种。
[0156]
68.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防重性抑郁障碍的方法。
[0157]
69.用于实施方案68所述的用途的组合物，其中所述组合物治疗或预防急性重性抑郁发作和/或预防新的发作(防止复发)。
[0158]
70.用于实施方案68或69所述的用途的组合物，其中所述组合物预防、减少或减轻轻度、中度或严重mdd发作的发生。
[0159]
71.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防焦虑障碍的方法。
[0160]
72.用于实施方案71所述的用途的组合物，其中所述焦虑障碍是广泛性焦虑障碍(gad)；特定恐惧症；社交焦虑障碍；分离性焦虑障碍；广场恐怖症；惊恐障碍和/或选择性缄默症。
[0161]
73.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防神经认知障碍的方法。
[0162]
74.用于实施方案73所述的用途的组合物，其中所述神经认知障碍是血管性痴呆；混合型阿尔茨海默氏病和血管性痴呆；路易体病；额颞痴呆；帕金森病痴呆；creutzfeldt-jakob病；亨廷顿病；和wernicke-korsakoff综合征。
[0163]
75.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述组合物用于调节微生物群-肠-脑轴的方法。
[0164]
76.用于实施方案56-60所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗癫痫。
[0165]
77.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与anaerostipes hadrus的细菌菌株的16s rrna序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna序列。
[0166]
78.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:1、2、6或7具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna序列。
[0167]
79.用于任意实施方案78所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:6具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性，或优选地为seq id no:6的16s rrna序列。
[0168]
80.用于任意实施方案78所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:6具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性或优选地seq id no:7的16s rrna序列。
[0169]
81.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)的细菌菌株的16s rrna序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16srrna序列。
[0170]
82.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:3具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna序列。
[0171]
83.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与anaerostipes rhamnosivorans的细菌菌株的16s rrna序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna序列。
[0172]
84.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:4或16具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。
[0173]
85.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与粪厌氧棒杆菌的细菌菌株的16s rrna序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。
[0174]
86.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:5具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。
[0175]
87.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:15具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。
[0176]
88.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株选自根据登录号ncimb 43457保藏的菌株或其衍生物中的一种。
[0177]
89.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株选自根据登录号ncimb 43526保藏的菌株或其衍生物中的一种。
[0178]
90.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述组合物用于经口施用。
[0179]
91.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述组合物包含一种或多种药学上可接受的赋形剂或载体。
[0180]
92.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株是冻干的。
[0181]
93.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株是活的，并且能够部分或完全地定殖肠道。
[0182]
94.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述组合物包含厌氧棒杆菌属的单一菌株，如物种anaerostipes hadrus的细菌菌株。
[0183]
95.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其包含厌氧棒杆菌属的细菌菌
株，任选地物种anaerostipes hadrus的细菌菌株，作为微生物聚生体。
[0184]
96.包含任何前述实施方案所述组合物的食品，用于任何前述实施方案所述的用途。
[0185]
97.包含任何前述实施方案所述组合物的疫苗组合物，用于任何前述实施方案所述的用途。
[0186]
98.治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法，包括向有需要的患者给予包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物。
[0187]
99.治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法，包括向有需要的患者给予包含与seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7、seq id no:15或seq id no:16的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株的组合物。
[0188]
100.治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法，包括向有需要的患者给予包含与seq id no:6或7的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性的细菌菌株的组合物。
[0189]
101.厌氧棒杆菌属的细菌菌株在制备用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的药物中的用途。
[0190]
102.细菌菌株在制备用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的药物中的用途，其中所述细菌菌株与序列seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7、seq id no:15或seq id no:16具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性。
[0191]
103.细菌菌株在制备用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的药物中的用途，其中所述细菌菌株与seq id no:6或7的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性。
[0192]
104.如实施方案98-100所述的方法，或实施方案101-103所述的用途，其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus。
[0193]
105.选自根据登录号ncimb 43457保藏的菌株或其衍生物中的一种的厌氧棒杆菌菌株的细胞，用于任一实施方案所述的用途或方法。
[0194]
106.选自根据登录号ncimb 43526保藏的菌株或其衍生物中的一种的厌氧棒杆菌菌株的细胞，用于任一实施方案所述的用途或方法。
[0195]
107.包含实施方案105或106所述的细胞的组合物，用于任一前述实施方案。
[0196]
108.用于实施方案107所述的用途的组合物，其包含药学上可接受的载体或赋形剂。
[0197]
109.选自根据登录号ncimb 43457保藏的菌株或其衍生物中的一种的厌氧棒杆菌菌株的生物学纯的培养物。
[0198]
110.选自根据登录号ncimb 43526保藏的菌株或其衍生物中的一种的厌氧棒杆菌菌株的生物学纯的培养物。
[0199]
111.包含真杆菌或faecalicatena属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0200]
112.如实施方案111所述的组合物，其中所述中枢神经系统障碍或病况由微生物
群-肠-脑轴介导。
[0201]
113.如实施方案111或实施方案112所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防神经发育障碍或神经精神系统病况的方法。
[0202]
114.如实施方案111-113中任一项所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防选自以下病症或病况的方法：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍(mdd)；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；痴呆；阿尔茨海默；帕金森氏病；慢性疼痛；运动神经元疾病；亨廷顿病；格林巴利综合征和脑膜炎。
[0203]
115.如实施方案114所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防自闭症谱系障碍的方法。
[0204]
116.如实施方案114或115所述的组合物，其中所述组合物用于减少或预防自闭症的方法。
[0205]
117.如实施方案111-116中任一项所述的组合物，其中所述组合物用于预防、减少或减轻刻板、重复、强迫或焦虑行为。
[0206]
118.如实施方案114所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防强迫性障碍的方法。
[0207]
119.如实施方案118所述的组合物，其中所述组合物用于预防、减少或减轻重复、强迫和/或焦虑行为。
[0208]
120.如实施方案114所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防重性抑郁障碍的方法。
[0209]
121.如实施方案120所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防急性重性抑郁发作和/或预防新的发作(防止复发)。
[0210]
122.如实施方案120或121所述的组合物，其中所述组合物用于预防、减少或减轻轻度、中度或严重的mdd发作的发生。
[0211]
123.如实施方案114所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防焦虑障碍的方法。
[0212]
124.如实施方案123所述的组合物，其中所述焦虑障碍是广泛性焦虑障碍(gad)；特定恐惧症；社交焦虑障碍；分离性焦虑障碍；广场恐怖症；惊恐障碍和/或选择性缄默症。
[0213]
125.如实施方案111所述的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防神经认知障碍的方法。
[0214]
126.如实施方案125所述的组合物，其中所述神经认知障碍是血管性痴呆；阿尔茨海默氏病；混合型阿尔茨海默氏病和血管性痴呆；路易体病；额颞痴呆；帕金森病痴呆；creutzfeldt-jakob病；亨廷顿病；和wernicke-korsakoff综合征。
[0215]
127.如实施方案111-126中任一项所述的组合物，其中所述组合物用于调节微生物群-肠-脑轴的方法。
[0216]
128.如实施方案111-127所述的组合物中，其中所述细菌菌株具有与seq id no:8、9、10、11、12、13或14具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[0217]
129.如实施方案111-127所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:8具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或其中细菌菌株具有由seq id no:8表示的16s rrna基因序列。
[0218]
130.如实施方案111-127所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:9具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或其中所述细菌菌株具有由seq id no:9表示的16s rrna基因序列。
[0219]
131.如实施方案111-127所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:10或seq id no:11具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或其中所述细菌菌株具有由seq id no:10或seq id no:11表示的16s rrna基因序列。
[0220]
132.如实施方案111-127所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:12具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或其中所述细菌菌株具有由seq id no:12表示的16s rrna基因序列。
[0221]
133.如实施方案111-127所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:13具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或其中所述细菌菌株具有由seq id no:13表示的16s rrna基因序列。
[0222]
134.如实施方案111-127所述的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:14具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或其中所述细菌菌株具有由seq id no:14表示的16s rrna基因序列。
[0223]
135.如实施方案111-129中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种卡兰德真杆菌。
[0224]
136.如实施方案111-129中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种粘液真杆菌。
[0225]
137.如实施方案111-128或130中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种挑剔真杆菌。
[0226]
138.如实施方案111-128或131中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种直肠真杆菌。
[0227]
139.如实施方案111-128或134中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种霍氏真杆菌。
[0228]
140.如实施方案111-128或132中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种faecalicatena fissicatena。
[0229]
141.如实施方案111-128或133中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株属于物种faecalicatena contorta。
[0230]
142.包含细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:8具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16srrna基因序列，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0231]
143.包含细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:9具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16srrna基因序列，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0232]
144.包含细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:10或seq id no:11具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0233]
145.包含细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:12具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16srrna基因序列，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0234]
146.包含细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:13具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16srrna基因序列，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0235]
147.包含细菌菌株的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:14具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16srrna基因序列，用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法。
[0236]
148.如实施方案142-147中任一项所述的组合物，用于实施方案112-127中任一项所述的方法。
[0237]
149.如实施方案111-148中任一项所述的组合物，其中所述组合物用于经口施用。
[0238]
150.如实施方案111-149中任一项所述的组合物，其中所述组合物包含一种或多种药学上可接受的赋形剂或载体。
[0239]
151.如实施方案111-150中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株是冻干的。
[0240]
152.如实施方案111-151中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株是活的。
[0241]
153.如实施方案111-152中任一项所述的组合物，其中所述细菌菌株能够部分地或全部地定殖肠道。
[0242]
154.如实施方案111-153中任一项所述的组合物，其中所述组合物包含真杆菌或faecalicatena的单一物种。
[0243]
155.如实施方案111-154中任一项所述的组合物，其中所述组合物包含真杆菌或faecalicatena的单一菌株。
[0244]
156.如实施方案111-155中任一项所述的组合物，其包含真杆菌或faecalicatena的细菌菌株，作为微生物聚生体的一部分。
[0245]
157.包含实施方案111-156中任一项所述组合物的食品，用于实施方案111-156中任一项所述的用途。
[0246]
158.包含实施方案111-157中任一项所述的组合物的疫苗组合物，用于实施方案111-157中任一项所述的用途。
[0247]
159.治疗或预防中枢神经系统障碍或病况的方法，包括向有需要的患者给予包含真杆菌或faecalicatena的细菌菌株的组合物。
[0248]
160.具有与seq id no:8具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:8表示的16s rrna基因序列。
[0249]
161.具有与seq id no:9具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:9表示的16s rrna基因序列。
[0250]
162.具有与seq id no:10具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:10表示的16s rrna基因序列。
[0251]
163.具有与seq id no:11具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:11表示的16s rrna基因序列。
[0252]
164.具有与seq id no:12具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:12表示的16s rrna基因序列。
[0253]
165.具有与seq id no:13具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:13表示的16s rrna基因序列。
[0254]
166.具有与seq id no:14具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:14表示的16s rrna基因序列。
[0255]
167.根据登录号ncimb 43455保藏的细菌菌株的细胞，或其衍生物。
[0256]
168.根据登录号ncimb 42689保藏的细菌菌株的细胞，或其衍生物。
[0257]
169.如实施方案160-168中任一项所述的细菌菌株或细胞，用于治疗用途。
[0258]
170.如实施方案160-168中任一项所述的细菌菌株或细胞，用于实施方案112-127中任一项所述的方法。
[0259]
171.包含实施方案160-168中任一项所述的细菌菌株或细胞的组合物，还包含药学上可接受的载体或赋形剂。
[0260]
172.如实施方案160-168中任一项所述的细菌菌株或细胞的生物学纯的培养物。
[0261]
附图的简要说明
[0262]
图1显示了盲肠内容物中短链脂肪酸乙酸酯(a)、丙酸酯(b)、异丁酸酯(c)、异戊酸酯(d)和戊酸酯(e)的浓度。
[0263]
图2显示了在lps或cona刺激后，来自用anaerostipes hadrus处理的小鼠的脾细胞的il-1β(a)、il-6(b)、tnfα(c)和il-10(d)表达。
[0264]
图3显示了海马体中加压素受体(a)、crfr2(b)、cd11b(c)、5htr1a(d)、grin2a(e)和grin2b(f)、杏仁核中盐皮质激素受体(g)、crfr2(h)、crfr1(i)和cd11b(j)，以及前额叶皮层中crfr2(k)、cd11b(l)和il-6(m)的表达，标准化至β-肌动蛋白，有和没有用anaerostipes hadrus处理。*＝p≤0.05，**＝p≤0.01。
[0265]
图4显示了组蛋白脱乙酰酶(hdac)活性的变化。
[0266]
图5：厌氧棒杆菌对肠道通透性的影响。
[0267]
图6：厌氧棒杆菌对短链脂肪酸产生的影响。
[0268]
图7：厌氧棒杆菌对外周免疫标志物的影响。
[0269]
图8：厌氧棒杆菌对大脑中基因表达的影响。
[0270]
图9：厌氧棒杆菌对大理石掩埋试验中btbr和mia小鼠刻板行为的影响。
[0271]
图10：厌氧棒杆菌对梳毛测试中btbr小鼠的刻板或重复行为的影响。
[0272]
图11：厌氧棒杆菌对btbr小鼠高架十字迷宫中焦虑样行为的影响，如通过开放臂的持续时间所测量的。
[0273]
图12：厌氧棒杆菌对btbr和mia小鼠社交行为的影响，在比较对象与小鼠的三室测试中对社交行为的影响。
[0274]
图13：厌氧棒杆菌对btbr和mia小鼠社交行为的影响，在比较熟悉的小鼠与新的小鼠的三室测试中对社交行为的影响。
[0275]
图14：厌氧菌对新物体识别测试中btbr和mia小鼠认知性能的影响。
[0276]
图15：厌氧棒杆菌对强迫游泳试中btbr和mia小鼠验社交行为不动时间的影响。
[0277]
图16：厌氧棒杆菌对btbr小鼠肠道蠕动的影响。
[0278]
图17：厌氧棒杆菌对btbr和mia小鼠肠道通透性的影响。
[0279]
图18：厌氧棒杆菌对脑干血清素水平的影响。
[0280]
图19：厌氧棒杆菌对脑干中5-hiaa/5-ht周转的影响。5-hiaa：5-羟基-吲哚-乙酸；5-ht：5-羟基-色胺(血清素)。
[0281]
图20：厌氧棒杆菌对自闭症谱系障碍模型中杏仁核基因表达的影响。
[0282]
图21显示了btbr和mia小鼠大理石掩埋试验和梳毛测试的结果。*＝p≤0.05，且**＝p≤0.01。
[0283]
图22显示了btbr和mia小鼠中高架十字迷宫和旷场试验的结果。*＝p≤0.05。
[0284]
图23显示了实验的设置，以测量btbr和mia小鼠在社交刺激相比非社交刺激下花费的时间，以及探索新动物相比熟悉动物花费的时间。持续时间以s表示。**＝p≤0.01，且****＝p≤0.0001。
[0285]
图24显示了btbr和mia小鼠的强迫游泳测试的结果。**＝p≤0.01。
[0286]
图25显示了btbr和mia小鼠的肠道运动和肠道通透性测试的结果。*＝p≤0.05。5a显示了btbr和mia小鼠的肠道运动测定的结果。5b显示了mia小鼠的结肠通透性测定的结果。5c显示了btbr小鼠的结肠通透性测定的结果。5d显示了mia小鼠回肠通透性测定的结果。5e显示了btbr小鼠的回肠通透性测定的结果。
[0287]
图26显示了btbr和mia小鼠的去甲肾上腺素、血清素和5-hiaa/5-ht周转的脑干水平。*＝p≤0.05。
[0288]
图27显示了(a)btbr和(b)mia小鼠的杏仁核基因表达水平表达，标准化至β-肌动蛋白。*＝p≤0.05。
[0289]
图28显示了在用指定细菌菌株的上清液处理或对照处理后，hct116细胞中乙酰化组蛋白h3(上图)和h4(下图)的水平。*＝0.01《p≤0.05，**＝0.001《p≤0.01，****＝p≤0.0001。
[0290]
图29显示了在用指定细菌菌株的上清液处理或对照处理后ht29细胞中乙酰化组蛋白h3(上图)和h4(下图)的水平。*＝0.01《p≤0.05，**＝0.001《p≤0.01。
[0291]
发明详述
[0292]
细菌菌株
[0293]
用于本发明所述的用途的组合物包含梭菌目的革兰氏阳性、杆状和厌氧的细菌菌株，其中所述细菌菌株不属于罗氏菌属或bariatricus属、或梭菌科(即，细菌菌株不属于罗氏菌属或bariatricus属，也不属于梭菌科)。实例证明此类细菌可用于治疗或预防中枢神
经系统障碍、癌症和其他病症。
[0294]
细菌菌株可以例如属于毛螺菌(lachnospiraceae)科或真杆菌(eubacteriaceae)科。优选地，细菌菌株属于厌氧棒杆菌(anaerostipes)属、真杆菌(eubacterium)属或faecalicatena属。如下文详述的，优选地，细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus、卡兰德真杆菌、粘液真杆菌、挑剔真杆菌、霍氏真杆菌、直肠真杆菌、faecalicatena fissicatena或faecalicatena contorta；更优选地anaerostipes hadrus、卡兰德真杆菌或粘液真杆菌；甚至更优选地anaerostipes hadrus或卡兰德真杆菌。
[0295]
术语“革兰氏阳性”意指在革兰氏菌株试验中给出阳性结果(即保留结晶紫染色试剂的颜色)。细菌对结晶紫染色的保留与细菌细胞壁中肽聚糖层的厚度有关。革兰氏阳性菌具有较厚的肽聚糖层。革兰氏染色在微生物学领域常用于帮助分类细菌菌株。
[0296]
术语“杆状”意指具有近似圆端圆柱体的细胞形状(例如，在光学显微镜下检查时)。这种形状类似于芽孢杆菌属细菌菌株的形状(例如在光学显微镜下检查时)。由此，“杆状”也与本领域中使用的术语“杆菌状”和“杆菌”同义。菌株的特征形状(如“杆状”)是微生物学领域常用的分类标准。
[0297]
术语“厌氧”意指生长不需要氧气。厌氧细菌菌株包括专性厌氧菌(即因氧气存在而受到伤害的菌株)；耐氧厌氧菌，(即那些不能使用氧气进行生长，但可以容忍其存在的菌株)；和兼性厌氧菌(即可以在没有氧气的情况下生长，但如果有氧气就会使用氧气的那些菌株)。
[0298]
上述标准很重要，因为它们可以为细菌菌株的系统发育分类提供信息。例如，细菌物种faecalicatena contorta和anaerostipes hadrus以前特别根据这些标准被归类为属于真杆菌属[46,53]。先前将这些物种归类为属于真杆菌属表明了faecalicatena contorta、anaerostipes hadrus和eubacterium callandari之间的表型(并因此也是基因型)相似性。
[0299]
用于本发明所用用途的组合物可以包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株。实例证明该属的细菌可用于治疗或预防由hdac活性介导的疾病和病况。优选的细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus。实例还证明该属的细菌对于治疗或预防cns病症如自闭症谱系障碍特别有用。发明人用于评估本发明的组合物对自闭症谱系障碍的影响的小鼠模型在本领域中已知适用于评估其他中枢神经系统障碍的症状，包括本文公开的那些。
[0300]
用于本发明用途的厌氧棒杆菌菌株的实例是物种anaerostipes hadrus的菌株。厌氧棒杆菌是革兰氏反应阳性的厌氧菌。anaerostipes hadrus可以分离自人类肠道。
[0301]
厌氧棒杆菌属目前包含4种已知物种；丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌、anaerostipes hadrus和anaerostipes rhamnosivorans。
[0302]
在某些实施方案中，组合物包含厌氧棒杆菌属的一种或多种细菌菌株，并且不包含来自任何其他细菌物种的细菌。在某些实施方案中，组合物包含厌氧棒杆菌属的单一物种(例如，物种丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌、anaerostipes hadrus或anaerostipes rhamnosivorans的一种或多种菌株)，并且不包含任何其他细菌菌株或物种。在某些实施方案中，组合物包含厌氧棒杆菌属的单一菌株(例如，物种丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌、anaerostipes hadrus或anaerostipes rhamnosivorans的单一菌株)，并且不包含任何其他的细菌菌株或
物种。
[0303]
厌氧棒杆菌是梭菌纲中的一个细菌属。科学分类如下：细菌(界)；厚壁菌门(门)；梭菌纲(纲)；梭菌目(目)；毛螺菌科(科)；厌氧棒杆菌(属)。厌氧棒杆菌是厌氧的革兰氏阳性肠道微生物。
[0304]
在实例中测试了根据dsm 3319保藏的anaerostipes hadrus菌株的hdac活性。在seq id no:1中提供了该菌株的16s rrna基因序列。该菌株保藏于dsmz-德国微生物和细胞培养物保藏中心(german collection of microorganisms and cell cultures gmbh)，并可公开获得。另一种可从dsmz公开获得的anaerostipes hadrus菌株是菌株dsm 108065。
[0305]
可用于本发明的组合物的示例性丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)菌株是作为dsm 22094保藏的菌株。该菌株具有seq id no:3中所示的16s rrna序列。
[0306]
用于本发明的合适的粪厌氧棒杆菌菌株已被保藏为dsm 14662。该菌株具有seq id no:4中所示的16s rrna序列。
[0307]
适用于本发明的anaerostipes rhamnosivorans已保藏为dsm 26241。该菌株的16s rrna序列可以在seq id no:16中找到。
[0308]
优选的anaerostipes hadrus菌株是根据登录号ncimb 43457保藏的菌株。在实例中测试了根据登录号ncimb 43457保藏的anaerostipes hadrus。测试的ncimb 43457的16s rrna序列在seq id no:6中提供。该菌株由4d pharma research ltd.(life sciences innovation building,aberdeen,ab25 2zs,scotland)于2019年8月9日作为“anaerostipes hadrus”保藏于国际保藏机构ncimb,ltd.(ferguson building,craibstone estate,bucksburn,aberdeen,ab21 9ya,scotland)，并被分配登录号ncimb 43457。
[0309]
优选的anaerostipes hadrus菌株是根据登录号ncimb 43526保藏的菌株。在实例中测试了根据登录号ncimb 43526保藏的anaerostipes hadrus。测试的ncimb 43526的16s rrna序列提供于seq id no:7中。该菌株由4d pharma research ltd.(life sciences innovation building,aberdeen,ab25 2zs,scotland)于2019年12月3日作为“anaerostipes hadrusf18-ea-p01”保藏于国际保藏机构ncimb,ltd.(ferguson building,craibstone estate,bucksburn,aberdeen,ab21 9ya,scotland)，并被分配登录号ncimb 43526。
[0310]
本发明其他优选的菌株是菌株粪厌氧棒杆菌菌株ref.1，其在实施例中也进行了测试。粪厌氧棒杆菌菌株ref.1的16s rrna基因序列提供于seq id no:15中。
[0311]
本发明还提供了具有与seq id no:15具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地其中所述细菌菌株具有由seq id no:15表示的16s rrna基因序列。优选地此类细菌菌株属于物种粪厌氧棒杆菌。本发明还提供了用于治疗用途，特别是用于本文所述的疾病的此类细菌菌株。本发明还提供了物种粪厌氧棒杆菌的细菌菌株(或包含物种粪厌氧棒杆菌的细菌菌株的组合物)，用于治疗用途，特别是用于本文所述的疾病。
[0312]
作为上述保藏细菌菌株的生物型的细菌菌株也预期可有效治疗或预防疾病和病症介导的hdac活性。生物型是一种密切相关的菌株，其具有相同或非常相似的生理和生化特征。
[0313]
在一些实施方案中，可通过常规分析细菌菌株的代谢物的产生和消耗来鉴定可用于本发明的细菌菌株。本发明人已发现实施例中使用的细菌菌株影响乙酸盐、丙酸盐、异丁酸盐、异戊酸盐和戊酸盐的产生(图1)。因此，在一些实施方案中，本发明的细菌菌株诱导体内产生一种或多种代谢物乙酸盐、丙酸盐、异丁酸盐、异戊酸盐和戊酸盐。另外，本发明的细菌菌株本身产生乙酸盐和丁酸盐中的一种或多种。
[0314]
与实例中测试的菌株密切相关的细菌菌株也预期对于治疗或预防自闭症谱系障碍和中枢神经系统障碍和病况有效，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍和病况。在某些实施方案中，细菌菌株可具有与anaerostipes hadrus的细菌菌株的16s rrna序列(例如，seq id no:1、2、6或7)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。细菌菌株可具有与丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)的细菌菌株的16s rrna序列(例如，seq id no:3)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。细菌菌株可具有与粪厌氧棒杆菌的细菌菌株的16srrna序列(例如，seq id no:4或15)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。在优选的实施方案中，细菌菌株可具有与anaerostipes hadrus的细菌菌株的16s rrna序列(例如，seq id no:6)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。
[0315]
在一些实施方案中，细菌菌株可具有与seq id no:1具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列；与seq id no:2具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列；与seq id no:3具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列；与seq id no:4具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列，或者与seq id no:5具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列，或者与seq id no:15具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列，或者与seq id no:16具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。在优选的实施方案中，细菌菌株可具有与seq id no:6或7具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列。例如，细菌菌株可具有与seq id no:6具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列，或者细菌菌株具有seq id no:6所示的16s rrna序列。细菌菌株可具有与seq id no:7具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％、99.9％或100％同一性的16s rrna序列，或者细菌菌株具有seq id no:7所示的16s rrna序列。
[0316]
作为根据登录号ncimb 43457保藏的细菌菌株的生物型的细菌菌株也有望有效治疗或预防自闭症谱系障碍和中枢神经系统障碍和病况，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统疾病障碍和病况。生物型是具有相同或非常相似的生理和生化特征的密切相关的菌株。例如，当使用实施例9中讨论的测定法进行测试时，根据登录号ncimb 43457保藏的细菌菌株的生物型可能会降低tnf-α的表达、降低il 1β的表达和/或增加il-6的表达。
[0317]
作为根据登录号ncimb 43526保藏的细菌菌株的生物型的细菌菌株也有望有效治疗或预防自闭症谱系障碍和中枢神经系统障碍和病况，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍和病况。生物型是具有相同或非常相似的生理和生化特征的密切相关的
菌株。例如，根据登录号ncimb 43526保藏的细菌菌株的生物型可以使用实施例3中讨论的测定法，降低tnf-α的il-1β、tnfα、il-6的表达。可选地，根据登录号ncimb43526保藏的细菌的生物型可使用实施例2中讨论的测定法，增加乙酸盐、丙酸盐、异丁酸盐、异戊酸盐和戊酸盐的产生。可以通过对根据登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662或dsm 26241保藏的细菌的其它核苷酸序列测序，鉴定作为上述保藏细菌的生物型并且适用于本发明用途的菌株。例如，基本上可以对整个基因组进行测序，并且用于本发明的生物型菌株可以在其整个基因组的至少80％内(例如，在至少85％、90％、95％或99％内，或在其整个基因组内)具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％的序列同一性。
[0318]
作为根据登录号ncimb 43457或ncimb 43526保藏的细菌菌株的生物型的菌株适用于本发明，可以通过对根据登录号ncimb 43457或ncimb 43526保藏的细菌菌株的其它核苷酸序列进行测序来进行鉴定。例如，基本上整个基因组可以被测序，并且用于本发明的生物型菌株在其整个基因组的至少80％内(例如，在至少85％、90％、95％或99％内，或在其整个基因组内)可以具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％的序列同一性。例如，在一些实施方案中，生物型菌株在其基因组的至少98％内具有至少98％的序列同一性，或在其基因组的99％内具有至少99％的序列同一性。优选地，生物型菌株在其基因组的100％内具有至少99.5％或至少99.9％的序列同一性。
[0319]
用于鉴定生物型菌株的其他合适的序列可包括hsp60或重复序列，如box、eric、(gtg)5或rep[47]。生物型菌株可具有与保藏细菌的相应序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％序列同一性的序列。生物型菌株可具有与根据登录号ncimb 43457保藏的细菌的相应序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％序列同一性的序列。在一些实施方案中，生物型菌株具有与seq id no:6的16srrna序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％序列同一性的序列。生物型菌株可具有与根据登录号ncimb 43526保藏的细菌的相应序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％序列同一性的序列。在一些实施方案中，生物型菌株具有与seq id no:7的16s rrna序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％序列同一性的序列。
[0320]
可选地，可以通过使用登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662或dsm 26241以及限制性片段分析和/或pcr分析，例如通过使用荧光扩增片段长度多态性(faflp)和重复dna元件(rep)-pcr指纹识别，或蛋白质分析，或部分16s或23s rdna测序，来鉴定作为如上所述的且适合用本发明用途的保藏细菌的生物型的菌株。在优选的实施方案中，此类技术可用于鉴定其他厌氧棒杆菌菌株。
[0321]
可选地，可以通过使用登录号ncimb 43457保藏和限制性片段分析和/或pcr分析，例如，通过使用荧光扩增片段长度多态性(faflp)和重复dna元件(rep)-pcr指纹识别，或蛋白质分析，或部分16s或23s rdna测序，来鉴定作为根据登录号ncimb 43457或ncimb 43526保藏的细菌菌株的并且适用于本发明的生物型的菌株。在优选的实施方案中，此类技术可用于鉴定其他厌氧棒杆菌菌株(例如丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌、anaerostipes hadrus或anaerostipes rhamnosivorans菌株)。在某些实施方案中，当通过扩增核糖体dna限制性分析(ardra)进行分析时，例如当使用sau3ai限制酶时(示例性方法和指导参见，例如，[48]，作为根据登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662、dsm 26241、ncimb 43457或ncimb 43526保藏的细菌的并且适用于本发明的生物型
的菌株是提供与根据登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662或dsm 26241、ncimb 43457或ncimb 43526保藏的细菌相同的模式的菌株。可选地，生物型菌株被识别为具有与根据登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662、dsm 26241、ncimb 43457偶ncimb 43526保藏的细菌相同的碳水化合物发酵模式的菌株。
[0322]
可以使用任何适当的方法或策略，包括实例中描述的测定，来鉴定可用于本发明的组合物和方法的其他厌氧棒杆菌菌株，如根据登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662、dsm 26241、ncimb 43457或ncimb 43526保藏的细菌的生物型。例如，可以通过将细菌给予hdac活性测定并评估hdac活性抑制来鉴定可用于本发明的菌株。具有与dsm 3319、ncimb 43457或ncimb 43526相当的hdac抑制活性的细菌菌株适用于本发明。特别地，与根据登录号dsm 3319、ncimb 43457或ncimb 43526保藏的细菌具有相似生长模式、代谢类型和/或表面抗原的细菌菌株可用于本发明。在实施例中使用的测定中，有用的菌株将具有与dsm 3319菌株相当的hdac抑制活性和/或相当的减少多动症的效果，这可以通过使用实施例中描述的培养和给药方案来鉴定。例如，当使用荧光测定法，例如实施例6中讨论的测定法进行测定时，合适的厌氧棒杆菌菌株可以将hdac 1的活性抑制至少40％(例如至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少90％或100％)。另外地或可选地，当使用荧光生成测定法，例如实施例6中讨论的测定法进行测定时，合适的厌氧棒杆菌菌株可以将hdac 2的活性抑制至少60％(例如至少70％、至少80％、至少90％或100％)。另外地或可选地，当使用荧光生成测定法，例如实施例6中讨论的测定法进行测定时，合适的厌氧棒杆菌菌株可以将hdac 3的活性抑制至少50％(例如至少60％、至少70％、至少80％、至少90％或100％)。
[0323]
本发明特别优选的菌株是根据登录号dsm 3319保藏的anaerostipes hadrus菌株。这是在实例中测试的示例性菌株并且显示对降低hdac活性和降低多动症是有效的。因此，本发明提供了用于治疗用途的根据登录号dsm 3319保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，如分离的细胞，或其衍生物。
[0324]
本发明特别优选的菌株是根据登录号ncimb 43457保藏的anaerostipes hadrus菌株。这是在实例中测试的示例性菌株并且显示对降低hdac活性和降低多动症是有效的。因此，本发明提供了用于治疗用途的根据登录号ncimb 43457保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，如分离的细胞，或其衍生物。
[0325]
本发明特别优选的菌株是根据登录号ncimb 43526保藏的anaerostipes hadrus菌株。这是在实例中测试的示例性菌株并且显示对降低hdac活性和降低多动症是有效的。因此，本发明提供了用于治疗用途的根据登录号ncimb 43526保藏的anaerostipes hadrus菌株的细胞，如分离的细胞，或其衍生物。在某些实施方案中，当通过扩增核糖体dna限制分析(ardra)进行分析时，例如当使用sau3ai限制酶时(示例性方法和指导参见例如[49])，作为根据登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662、dsm 26241、ncimb 43457或ncimb 43526ncimb 43457保藏的细菌菌株的并且适用于本发明的生物型的菌株是提供与根据登录号dsm 3319、dsm 108065、dsm 22094、dsm 14662、dsm 26241、ncimb 43457或ncimb 43526中的任一项保藏的细菌相同模式的菌株。
[0326]
可以使用任何适当的方法或策略，包括实例中所述的测定，来鉴定可用于本发明的组合物和方法的其他厌氧棒杆菌菌株(例如，anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、粪厌氧棒杆菌或anaerostipes rhamnosivorans菌株)，如
22094、dsm 14662或dsm 26241中的任一项保藏的菌株相同的安全性和治疗功效特征的菌株，并且本发明包括此类细胞。
[0331]
本发明的组合物可包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株。实例还表明，该属的细菌可用于治疗，特别是用于治疗或预防由微生物-肠-脑轴介导的自闭症谱系障碍和中枢神经系统障碍。本技术中用于评估自闭症谱系障碍症状的小鼠模型实验在本领域中已知适用于评估其他中枢神经系统障碍的症状，包括上面列出的那些。
[0332]
因此，本发明还提供了包含真杆菌属或faecalicatena属的细菌菌株的组合物，用于治疗，例如用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍或病况。在某些实施方案中，本发明的组合物包含真杆菌属或faecalicatena属的菌株并且不包含任何其他细菌属。在某些实施方案中，本发明的组合物包含真杆菌属或faecalicatena属的单一菌株并且不包含任何其他细菌菌株、属或种。
[0333]
用于本发明的真杆菌菌株的实例包括属于以下物种的那些：卡兰德真杆菌(e.callanderi)、粘液真杆菌(e.limosum)、挑剔真杆菌(e.eligens)、霍氏真杆菌(e.hallii)、直肠真杆菌(e.rectale)、巴氏真杆菌(e.barkeri)、两形真杆菌(e.biforme)、圆柱状真杆菌(e.cylindroides)、细长真杆菌(e.dolichum)、念珠状真杆菌(e.moniliforme)和凸腹真杆菌(e.ventriosum)。优选地，用于本发明的真杆菌菌株属于物种卡兰德真杆菌、粘液真杆菌、挑剔真杆菌、霍氏真杆菌或直肠真杆菌。用于本发明的更优选的物种是卡兰德真杆菌或粘液真杆菌。用于本发明的最优选的物种是卡兰德真杆菌。卡兰德真杆菌在文献中有时也拼写为e.callenderi(参见，例如[50])，尽管指的是同一物种。真杆菌属细菌已被描述为革兰氏阳性、无孢子、严格厌氧的杆菌。
[0334]
用于本发明的faecalicatena菌株的实例包括属于物种faecalicatena fissicatena(f.fissicatena)、f.contorta和f.orotica的那些。优选地，用于本发明的faecalicatena菌株属于物种f.fissicatena或f.contorta。faecalicatena属细菌已被描述为革兰氏染色阳性、专性厌氧、形成孢子或不形成孢子、无运动、无色素的杆状菌，呈链状或成对出现。
[0335]
faecalicatena属是在2017年提出的，当时先前的物种eubacteriumcontortum、eubacterium fissicatena和clostridium contortum被重新分类为新属的一部分，并分别更名为faecalicatena contorta、faecalicatena fissicatena和faecalicatena orotica[51]。eubacterium contortum和eubacterium fissicatena(现在为faecalicatena contorta和faecalicatena fissicatena)最初根据共同的表型特征被归类为真杆菌属的一部分，包括为革兰氏阳性的、专性厌氧的、杆状的、非孢子形成的和在葡萄糖发酵过程中产生乙酸、co2和h2[52],[53]。因此，如在本发明的组合物中使用的，在真杆菌属和faecalicatena属的细菌菌株之间存在密切的表型(并因此也是基因型)相似性。
[0336]
在实施例中测试了根据登录号ncimb 43455保藏的卡兰德真杆菌的细菌菌株。该菌株的16s rrna基因序列提供于seq id no:8中。菌株由4d pharma research ltd.(life sciences innovation building,aberdeen,ab25 2zs,scotland)于2019年8月9日保藏于国际保藏机构ncimb,ltd.(ferguson building,aberdeen,ab21 9ya,scotland)，并被分配登录号ncimb 43455。
[0337]
因此，本发明还提供了根据登录号ncimb 43455保藏的细菌菌株的细胞，如分离的
细胞，或其衍生物。本发明还提供了包含根据登录号ncimb 43455保藏的细菌菌株或其衍生物的细胞的组合物。本发明还提供了根据登录号ncimb 43455保藏的细菌菌株的生物学纯的培养物。本发明还提供了根据登录号ncimb 43455保藏的细菌菌株或其衍生物的细胞，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗目的。
[0338]
本发明还提供了具有与seq id no:8具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地其中所述细菌菌株具有由seq id no:8表示的16s rrna基因序列。优选地，此类细菌菌株属于物种卡兰德真杆菌。可选地，此类细菌菌株属于物种粘液真杆菌。本发明还提供了此类细菌菌株(或包含此类细菌菌株的组合物)用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗的用途。本发明还提供了物种卡兰德真杆菌的细菌菌株(或包含物种卡兰德真杆菌的细菌菌株的组合物)，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。本发明还提供了物种粘液真杆菌的细菌菌株(或包含物种粘液真杆菌的细菌菌株的组合物)，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0339]
本发明其他优选的细菌菌株是菌株挑剔真杆菌菌株ref.1，其在实施例中也进行了测试。挑剔真杆菌菌株ref.1的16s rrna基因序列提供于seq id no:9中。
[0340]
本发明还提供了具有与seq id no:9具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地其中所述细菌菌株具有由seq id no:9表示的16s rrna基因序列。优选地此类细菌菌株属于物种挑剔真杆菌。本发明还提供了此类细菌菌株用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。本发明还提供了物种挑剔真杆菌的细菌菌株(或包含物种挑剔真杆菌的细菌菌株的组合物)，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0341]
本发明其他优选的细菌菌株是菌株直肠真杆菌菌株ref.2，其在实施例中也进行了测试。直肠真杆菌菌株ref.2的16s rrna基因序列提供于seq id no:10中。
[0342]
本发明还提供了具有与seq id no:10具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地其中所述细菌菌株具有由seq id no:10表示的16s rrna基因序列。优选地，此类细菌菌株属于物种直肠真杆菌。本发明还提供了此类细菌菌株用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。本发明还提供了物种直肠真杆菌的细菌菌株(或包含物种直肠真杆菌的细菌菌株的组合物)用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0343]
本发明其他优选的菌株是菌株直肠真杆菌菌株ref.1，其也在实施例中进行了测试。直肠真杆菌菌株ref.1的16s rrna基因序列提供于seq id no:11中。
[0344]
本发明还提供了具有与seq id no:11具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地，其中所述细菌菌株具有由seq id no:11表示的16s rrna基因序列。优选地此类细菌菌株属于物种直肠真杆菌。本发明还提供了此类细菌菌株用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0345]
本发明其他优选的菌株是菌株霍氏真杆菌菌株ref.1，其也在实施例中进行了测试。霍氏真杆菌菌株ref.1的16s rrna基因序列提供于seq id no:14中。
[0346]
本发明还提供了具有与seq id no:14具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地其中所述细菌菌株具有由seq id no:14表示的16s rrna基因序列。优选地，此类细菌菌株属于物种霍氏真杆菌。本发明还提供了此类细菌
菌株用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。本发明还提供了物种霍氏真杆菌的细菌菌株(或包含物种霍氏真杆菌的细菌菌株的组合物)用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0347]
本发明其他优选的菌株是菌株f.fissicatena菌株ref.1，其也在实施例中进行了测试。f.fissicatena菌株ref.1的16s rrna基因序列提供于seq id no:12中。
[0348]
本发明还提供了具有与seq id no:12具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地，其中所述细菌菌株具有由seq id no:12表示的16s rrna基因序列。优选地，此类细菌菌株属于物种faecalicatena fissicatena。本发明还提供了用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途的细菌菌株。本发明还提供了物种faecalicatena fissicatena的细菌菌株(或包含物种faecalicatena fissicatena的细菌菌株的组合物)，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0349]
本发明其他优选的菌株是菌株f.contorta菌株ref.1，其也在实施例中进行了测试。该菌株的16s rrna基因序列提供于seq id no:13中。该菌株由4d pharma research ltd.(life sciences innovation building,aberdeen,ab25 2zs,scotland)于2016年11月15日保藏于国际保藏机构ncimb,ltd.(ferguson building,aberdeen,ab21 9ya,scotland)，并被分配登录号ncimb 42689。
[0350]
本发明提供了根据登录号ncimb 42689保藏的细菌菌株的细胞，如分离的细胞，或其衍生物。本发明还提供了包含根据登录号ncimb 42689保藏的细菌菌株的细胞或其衍生物的组合物。本发明还提供了根据登录号ncimb 42689保藏的细菌菌株的生物学纯的培养物。本发明还提供了根据登录号ncimb 42689保藏的细菌菌株或其衍生物的细胞，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0351]
本发明还提供了具有与seq id no:13具有至少98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列的细菌菌株，优选地，其中所述细菌菌株具有由seq id no:13表示的16s rrna基因序列。优选地此类细菌菌株属于物种faecalicatena contorta。本发明还提供了此类细菌菌株用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。本发明还提供了物种faecalicatena contorta(或包含物种faecalicatena contorta的细菌菌株的组合物)的细菌菌株，用于治疗，特别是用于本文所述疾病的治疗用途。
[0352]
与实例中测试的菌株密切相关的细菌菌株也预期对治疗有效，包括用于治疗或预防自闭症谱系障碍和中枢神经系统障碍和病况，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍和病况。用于本发明的细菌菌株优选地具有与seq id no:8、9、10、11、12、13或14中的任一个具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[0353]
在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与真杆菌的细菌菌株的16s rrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与卡兰德真杆菌或粘液真杆菌(优选地卡兰德真杆菌)的细菌菌株的16s rrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:8具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:8表示的16s rrna基因序列。此类细
菌菌株(具有与seq id no:8具有同一性的16s rrna基因序列，或具有由seq id no:8表示的16s rrna基因序列)，特别优选用于本发明。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与挑剔真杆菌的细菌菌株的16srrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:9具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:9表示的16s rrna基因序列。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与霍氏真杆菌的细菌菌株的16s rrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:10具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:10表示的16srrna基因序列。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与直肠真杆菌的细菌菌株的16s rrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:10具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:10表示的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:11具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:11表示的16s rrna基因序列。
[0354]
在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与faecalicatena的细菌菌株的16s rrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与faecalicatena fissicatena的细菌菌株的16srrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:12具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:12表示的16s rrna基因序列。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与faecalicatena contorta的细菌菌株的16s rrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:13具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16srrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:13表示的16s rrna基因序列。
[0355]
在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株具有与霍氏真杆菌的细菌菌株的16s rrna基因序列具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有与seq id no:14具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。优选地，用于本发明的细菌菌株具有由seq id no:14表示的16s rrna基因序列。
[0356]
优选地，细菌菌株具有与seq id no:8、9、10、11、12、13或14具有至少98.65％序列的16s rrna基因序列。优选地，细菌菌株具有与seq id no:8具有至少98.65％序列相似性的16s rrna基因序列。可以基于稳健的全局比对算法如[54]中描述的eztaxon服务器计算16s rrna基因序列之间的成对相似性。
pcr指纹，或蛋白质分析，或部分16s或23s rdna测序，来鉴定作为根据登录号ncimb ncimb 43455或ncimb 42689保藏的细菌的并且适用于本发明的生物型的菌株。在优选的实施方案中，此类技术可用于鉴定其他真杆菌或faecalicatena菌株。
[0364]
在某些实施方案中，作为根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的细菌的且适用于本发明的生物型的菌株是在通过扩增核糖体dna限制性分析(ardra)，例如当使用sau3ai限制性酶时(示例性方法和指导参见，例如，[56])分析时提供与根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的细菌相同的模式的菌株。可选地，生物型菌株被鉴定为具有与根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的细菌相同的碳水化合物发酵模式的菌株。
[0365]
可使用任何适当的方法或策略，包括实例中描述的测定法，鉴定可用于本发明的组合物和方法中的其他真杆菌或faecalicatena菌株，如根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的细菌的生物型。例如，可通过在厌氧ycfa中培养和/或将细菌给予自闭症谱系障碍小鼠模型然后评估细胞因子水平来鉴定用于本发明的菌株。特别地，具有与根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的细菌相似的生长模式、代谢类型和/或表面抗原的细菌菌株可用于本发明。有用的菌株将具有与ncimb 43455或ncimb 42689菌株相当的免疫调节活性。特别地，生物型菌株对自闭症谱系障碍模型的影响与实施例中所示的影响相当。
[0366]
根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的菌株的衍生物可以是子菌株(后代)或从来源培养(亚克隆)的菌株。根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的菌株的衍生物可以是子菌株(后代)或从来源培养(亚克隆)的菌株。本发明菌株的衍生物可以被修饰，例如在遗传水平上，而不消除生物活性。特别地，本发明的衍生菌株具有治疗活性。衍生菌株将具有与原始ncimb 43455或ncimb 42689菌株相当的免疫调节活性。特别地，衍生菌株将引发对中枢神经系统障碍或病况模型的与实施例中所示的影响可比较的影响以及对细胞因子水平的可比较的影响，这可以通过使用实施例中描述的培养和给药方案来鉴定。ncimb 43455或ncimb 42689菌株的衍生物通常是ncimb 43455或ncimb 42689菌株的生物型。
[0367]
对根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的细胞的提及包括与根据登录号ncimb 43455或ncimb 42689保藏的菌株具有相同安全性和治疗功效特征的任何细胞，并且此类细胞包括在本发明中。
[0368]
在优选的实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株是活的。此类活的细菌菌株能够部分或全部定殖肠道。
[0369]
本发明的组合物包含治疗有效量的一种或多种细菌菌株。同样，根据本发明所述用途的一种或多种细菌菌株以治疗有效量使用。
[0370]
优选地，本文公开的组合物将被给予至胃肠道，以便能够将本发明的细菌菌株递送至肠道和/或部分或全部定殖于肠道。换言之，细菌可能已经定殖在一些或全部胃肠道和/或这种定殖可能是暂时的或永久的。
[0371]
更具体地，在一些实施方案中，“肠道的总定殖”意指细菌已定殖于肠道的所有部分(即小肠、大肠和直肠)。另外地或可选地，术语“完全定殖”意指细菌永久地移入肠道的一些或所有部分。
[0372]
在一些实施方案中，“肠的部分定殖”意指细菌已定殖于肠道的一些但不是全部部分。另外或可选地，术语“部分定殖”意指细菌在肠的一些或所有部分中瞬时移入。
[0373]
可以通过在给药间隔结束后定期(例如每天)评估(例如在粪便样品中)本发明的细菌菌株的丰度来确定殖入的短暂性，以确定清除期，即在给药间隔结束之间的时期，并且不存在可检测水平的本发明的细菌菌株。在本发明的实施方案中，清除期为14天或更少、12天或更少、10天或更少、7天或更少、4天或更少、3天或更少、2天或更少或1天或更少。
[0374]
在本发明的实施方案中，本发明的细菌瞬时移入大肠。
[0375]
在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株对四环素、杆菌肽、阿莫西林、氨苄青霉素、阿贝卡星和地贝卡星、阿洛西林、巴氨西林、羧苄青霉素、头孢吡普、克拉霉素、多利培南、红霉素、夫西地酸、庆大霉素、格帕沙星、亚胺培南、交沙霉素、美罗培南、美洛西林、哌拉西林、利福平、利福昔明、罗他霉素、蔷薇霉素、罗红霉素、螺旋霉素、链霉素、磺胺甲恶唑/甲氧苄啶、泰利霉素、替卡西林、替卡西林/克拉维酸、托氟沙星、甲氧苄啶和维吉霉素中的一种或多种具有抗性。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株对奎奴普丁-达福普丁敏感。在优选的实施方案中，用于本发明的细菌菌株对四环素和/或杆菌肽具有抗性。
[0376]
在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株对β-内酰胺抗生素具有抗性。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株对万古霉素具有抗性。在某些实施方案中，用于本发明的细菌菌株对氨苄青霉素具有抗性。
[0377]
在优选的实施方案中，用于本发明的细菌菌株是天然存在的。例如，细菌菌株分离自哺乳动物消化道。
[0378]
在优选的实施方案中，用于本发明的细菌菌株未经遗传改良。例如，细菌菌株未用重组dna转化。
[0379]
在一些实施方案中，用于本发明的组合物不包含两种细菌菌株：粪厌氧棒杆菌dsm 14662和anaerostipes hadrus dsm 3319/atcc 29173。
[0380]
在一些实施方案中，用于本发明的组合物包含少于40种不同的细菌菌株。在一些实施方案中，用于本发明的组合物包含少于30种不同的细菌菌株。在一些实施方案中，用于本发明的组合物包含少于20种不同的细菌菌株。在一些实施方案中，用于本发明的组合物包含少于10种不同的细菌菌株。
[0381]
治疗用途
[0382]
如实例中所证明的，本发明的细菌组合物可有效降低hdac活性。特别地，用本发明的组合物处理实现了1类hdac活性的降低。特别地，用本发明的组合物处理实现了hdac2活性的降低。本发明的组合物还在多动症动物模型中显示出临床改善。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防由hdac活性介导的疾病或病症。病况可能是疾病的症状。特别地，本发明的组合物可用于减少或预防由升高的hdac活性水平介导的疾病或病况。特别地，本发明的组合物可用于减少或预防由升高的i类hdac活性水平介导的疾病或病况。特别地，本发明的组合物可用于减少或预防由升高的hdac2活性水平介导的疾病或病况。
[0383]
组蛋白脱乙酰酶是一类从蛋白质靶标中去除乙酰基的酶。最丰富的hdac靶标是组蛋白，但已知hdacs可使非组蛋白靶标的赖氨酸残基去乙酰化，以暂时调节蛋白质活性。由此，hdacs有时被称为赖氨酸脱乙酰酶。目前有13种已知的hdacs，其分为四个主要类别i类(hdacs1、2、3和8)、iia类(hdacs 4、5、7和9)和iib类(hdacs 6和10)、iii类(sirt1-sirt7)和iv类(hdac 11)[7]。每个类别通常具有不同的组织表达模式和亚细胞定位。
[0384]
蛋白质乙酰化/去乙酰化通常用作蛋白质活性的翻译后控制机制。组蛋白乙酰化/
去乙酰化是公认的转录调控机制。遗传调控是由组蛋白脱乙酰酶介导的乙酰基从组蛋白尾中的赖氨酸氨基酸的ε-n-乙酰基上裂解而引起的。乙酰基的去除恢复组蛋白尾部的正电荷，导致与带负电荷的磷酸二酯dna骨架的更有利结合。改进的结合导致更紧密的染色体压实和组蛋白去乙酰化位点基因表达的整体降低。
[0385]
组蛋白脱乙酰酶活性与多种疾病和病况有关。组蛋白脱乙酰酶活性的抑制可用于减轻或改善这些疾病或病况。组蛋白脱乙酰酶的泛抑制剂可用于治疗或预防hdac介导的疾病。同种型特异性hdac抑制剂可用于治疗或预防由特异性hdac同种型活性介导的疾病。
[0386]
抑制hdac活性是一种既定的治疗方式，并且许多hdac抑制剂是批准的药物，包括：伏立诺他(ctcl)、罗米地辛(ctcl)、西达本胺(ptcl)、帕比司他(多发性骨髓瘤)、贝利司他(t细胞淋巴瘤)，并且许多正在进行临床试验，包括：帕比司他(ctcl)、丙戊酸(宫颈癌和卵巢癌、脊髓性肌萎缩)、莫塞替诺特(mocetinostat)(滤泡性淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤和急性髓性白血病)、艾贝司他(abexinostat)(肉瘤)、恩替诺特(霍奇金淋巴瘤、肺癌和乳腺癌)、sb939(复发性或转移性前列腺癌)、瑞米司他(resminostat)(霍奇金淋巴瘤)、吉维司他(givinostat)(难治性白血病和骨髓瘤)、hbi-800(晚期实体瘤，包括黑色素瘤、肾细胞癌(rcc)和非小细胞肺癌(nsclc))、kevetrin(卵巢癌)、cudc-101、ar-42(复发或难治性多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病或淋巴瘤)、chr-2845、chr-3996、4sc-202(晚期血液学适应症)、cg200745(实体瘤)、acy-1215(多发性骨髓瘤)、me-344(实体难治性肿瘤)、萝卜硫素和曲古抑菌素(抗炎剂)。
[0387]
由hdac活性介导的疾病或病况的实例包括神经退行性疾病，如阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病、脑损伤，如中风、行为障碍，如注意力缺陷多动症、炎性肠病，如克罗恩病、癌症，如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。在某些实施方案中，本发明组合物用于治疗或预防这些疾病或病况中的一种。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防由hdac活性介导的这些疾病或病况中的一种。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防由i类hdac活性介导的这些疾病或病况中的一种。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防由hdac2介导的这些疾病或病况中的一种。
[0388]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗用途。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防由hdac活性介导的疾病或病况。在某些实施方案中，本发明的组合物用于降低hdac活性的方法，以治疗或预防由hdac活性介导的疾病或病况。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防由i类hdac活性介导的疾病或病况。在某些实施方案中，本发明的组合物用于抑制i类hdac活性的方法。在某些实施方案中，本发明的组合物用于选择性地抑制i类hdac活性的方法，以治疗或预防由i类hdac活性介导的疾病。本发明人已确定本发明的某些组合物选择性地抑制i类hdacs。如本文所用，“选择性”是指例如与其对来自其他类别的hdacs的抑制作用相比，对i类hdacs具有最大抑制作用的组合物。hdacs的选择性抑制有利于治疗需要长期给予治疗剂的疾病，例如需要在患者的整个生命周期中治疗疾病或病况的情况。在某些实施方案中，作为i类hdac选择性抑制剂的本发明组合物用于姑息治疗或预防由i类hdac活性介导的疾病或病况。选择性抑制剂优于本领域已知的泛抑制剂，因为它减少了与对其他类别的hdacs的不希望的抑制相关的副作用。在某些实施方案中，本发明的组合物是hdac2选择性抑制剂。在某些实施方案中，本发明的组合物用于选择性降低hdac2活性的方法。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防由hdac2
活性介导的疾病。
[0389]
微生物群-肠-脑轴的调节
[0390]
肠道和大脑之间的交流(微生物-肠-脑轴)经由双向神经体液通信系统发生。最近的证据表明，肠道中存在的微生物群可以调节大脑发育并经由微生物群-肠-脑轴产生行为表型。实际上，许多评论表明微生物群-肠-脑轴在维持中枢神经系统功能中的作用，并暗示中枢神经系统障碍和病况发展中的微生物-肠-脑轴功能障碍[20],[23],[24],[57]。
[0391]
大脑和肠道之间的双向交流(即肠-脑轴)包括中枢神经系统、神经内分泌和神经免疫系统，包括下丘脑-垂体-肾上腺(hpa)轴、自主神经系统的交感神经和副交感神经(ans)臂，包括肠神经系统(ens)和迷走神经，以及肠道微生物群。
[0392]
如实例中所证明的，本发明的组合物可以调节微生物群-肠-脑轴并减少与cns病症相关的行为症状。因此，本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于治疗或预防中枢神经系统(cns)病症，特别是与微生物群-肠-脑轴功能障碍相关的那些病症和病况。
[0393]
本文公开的组合物(本发明的组合物)还可用于治疗或预防神经发育障碍和/或神经精神系统病况。神经发育疾病和神经精神系统病况通常与微生物-肠-脑轴有关。本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于治疗或预防由微生物-肠-脑轴功能障碍介导的神经发育疾病和/或神经精神系统病况。在其他优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防神经发育障碍或神经精神系统病况。
[0394]
在特定的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于治疗或预防选自以下的疾病或病况：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；痴呆；阿尔茨海默；帕金森氏病；和/或慢性疼痛，如中枢敏化或纤维肌痛。在其他实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于治疗或预防运动神经元疾病；亨廷顿病；格林-巴利综合征和/或脑膜炎。
[0395]
本文公开的组合物(本发明的组合物)可特别用于治疗或预防慢性疾病、治疗或预防对其他疗法(如用抗精神病药和/或抗抑郁药治疗)没有反应的患者的疾病，和/或治疗或预防与微生物-肠-脑轴功能障碍相关的组织损伤和症状。
[0396]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节cns。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节自主神经系统(ans)。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节肠神经系统(ens)。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节下丘脑、垂体、肾上腺(hpa)轴。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节神经内分泌途径。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节神经免疫途径。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节cns、ans、ens、hpa轴和/或神经内分泌和神经免疫通路。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节对象的共生代谢物和/或胃肠通透性水平。
[0397]
微生物群-肠-脑轴的信号传导由神经系统调节。因此，在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节神经系统中的信号传导。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节中枢神经系统的信号传导。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节感觉神经元中的信号传导。在其他实施方案中，本文公开
的组合物(本发明的组合物)调节运动神经元中的信号传导。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节ans中的信号传导。在一些实施方案中，ans是副交感神经系统。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节迷走神经的信号传导。在其他实施方案中，ans是交感神经系统。在其他实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节肠神经系统中的信号传导。在某些实施方案中，ans和ens神经元的信号传导直接响应胃肠道的腔内容物。在其他实施方案中，ans和ens神经元的信号传导间接响应由管腔细菌产生的神经化学物质。在其他实施方案中，ans和ens神经元的信号传导响应由管腔细菌或肠内分泌细胞产生的神经化学物质。在某些优选实施方案中，ens的神经元激活影响cns功能的迷走神经传入。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节肠嗜铬细胞的活性。
[0398]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节动物模型中的条件恐惧。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于调节恐惧和/或焦虑的发展，和/或调节恐惧和/或焦虑在对象中消失的程度。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于调节动物模型中应激诱导的体温过高的程度。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节对象中的压力和/或焦虑水平。
[0399]
自闭症谱系障碍(asd)
[0400]
自闭症谱系障碍是一组异质的神经发育病况，其特征是社交互动、沟通方面的早发困难以及异常受限、重复的行为和兴趣。症状可以从很小的时候就被识别出来，但asd通常在开始接受主流教育的更有能力的儿童中被诊断出来。自闭症代表了asd的主要类型。
[0401]
从历史上看，自闭症的诊断基于三个核心领域：社交互动受损、沟通异常，以及行为和兴趣受限和重复。在国际疾病分类(icd-10r,who 1993)和诊断和统计手册(dsm iv,美国精神病协会,2000)中，自闭症属于普遍性发育障碍(pdd)的总称，有四种可能的诊断亚型：阿斯伯格综合征、儿童自闭症/自闭病症、非典型自闭症和未另外指定的pdd。在dsm-5中，这些诊断亚型被合并为单一类别的自闭症谱系障碍(asd)，并且之前使用的三个核心障碍领域已减少到两个主要领域，即社交沟通和互动，以及重复行为，这包括感觉统合失调。
[0402]
asd是一种“谱系障碍”，因为它以各种不同的方式影响每个人，并且范围可以从非常轻微到严重。受影响个体的功能发挥因语言能力、智力水平、合并症、症状的构成和获得服务的机会而有很大差异。认知功能、学习、注意力和感觉处理通常受损。
[0403]
dsm-iv指出，自闭症的诊断需要存在至少六种症状，包括至少两种社交互动中的质量障碍度量，一种症状是沟通的定量受损，且另一种症状是限制和重复行为。dsm-5将asd的诊断重新定义为两个症状领域：(i)社交互动和社交沟通缺陷；和(ii)受限的、重复的行为、兴趣或活动模式。
[0404]
共病性医学状况在asds中非常普遍。共病包括焦虑和抑郁、癫痫发作、注意力缺陷、攻击性行为、睡眠问题、胃肠道病症、癫痫、智力低下、智力障碍和喂养困难。
[0405]
实例表明本文公开的组合物(本发明的组合物)在自闭症谱系障碍的动物模型中实现了疾病发病率和疾病严重程度的降低，并因此它们可用于治疗或预防自闭症谱系障碍。
[0406]
asd是一种中枢神经系统疾病，部分由环境因素引发。因此，微生物群-肠-脑轴的功能障碍可能是导致asds发展和持续的原因。因此，在优选的实施方案中，本发明的组合物
用于治疗或预防自闭症谱系障碍。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防自闭症。在一些实施方案中，自闭症是普遍性发育障碍(pdd)。在另一个实施方案中，pdd是阿斯伯格综合征、儿童自闭症/自闭病症、非典型自闭症和/或未另外指定的pdd。因此，在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防自闭症谱系障碍、自闭症、普遍性发育障碍；阿斯伯格综合征；儿童自闭症/自闭病症、非典型自闭症和/或未另外指定的pdd。
[0407]
本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于调节对象的微生物群-肠-脑轴。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于预防已被鉴定为有患asd风险或已在产前或早期发育阶段；在童年和/或成年期诊断出患有asd的患者中的asd。本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于预防asds的发展。
[0408]
本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于管理或减轻asds。asds的治疗或预防可以指，例如，减轻症状的严重性或减少恶化的频率或对患者来说是个问题的触发因素的范围。
[0409]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻asd的至少一种核心症状。
[0410]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻在dsm-5中分类为asd的两个症状领域中的至少一个。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻社交互动和/或社交沟通缺陷。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)防止、减少或减轻限制性的、重复的行为、兴趣或活动模式。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻社交互动、社交沟通缺陷和/或限制性的、重复的行为、兴趣或活动模式。
[0411]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻重复行为、刻板行为、强迫行为、常规行为、相同行为和受限行为。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了患有asds对象的社交意识、社交信息处理、社交沟通能力、社交焦虑/回避以及自闭症的先入之见和特征。
[0412]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻与asds的核心症状相关的另外的症状。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻患有asds对象的易怒(包括攻击性、故意自残和发脾气)、激越、哭泣、嗜睡、社交退缩、刻板行为、多动症、不顺从、不恰当的言语、焦虑、抑郁和/或过度控制或控制不足的行为。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善患有asd对象的认知功能、学习、注意力和/或感觉处理。
[0413]
在其他实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了患有asds对象的次要结果度量。在一些实施方案中，次要结果测量包括另外的症状和/或功能评定量表、行为量表和其他目标度量。
[0414]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)引起用于评估患有asds对象的核心症状的诊断和/或症状量表的积极变化。在一些实施方案中，诊断和/或症状量表是自闭症诊断访谈-修订版(asi-r)。在一些实施方案中，诊断或症状量表是现在的ados-2的自闭症诊断观察时间表-通用版(ados-g)。在其他实施方案中，诊断或症状量表是修订的自闭症诊断访谈(adi-r)。在其他实施方案中，诊断或症状量表是社交和交流障碍诊断访
谈(disco)。在其他实施方案中，诊断或症状量表是儿童自闭症评定量表(cars和cars2)。
[0415]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)引起asds功效终点的一般测量的积极变化。在某些实施方案中，通用测量包括但不限于异常行为检查表(abc)、儿童行为检查表(cbcl)、vineland-ii适应性行为量表(vabs)、社会反应量表(srs)和/或重复行为量表-修订版(rbs-r)。
[0416]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)对患有asds对象的整体功能表现出积极影响。
[0417]
对于本领域技术人员来说，另外的量表是已知的。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)将改善本领域技术人员已知的诊断和/或症状量表的结果。
[0418]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻asds并存病的发生率。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻焦虑和抑郁、癫痫发作、注意力缺陷、攻击性行为、睡眠问题、胃肠道病症(包括肠易激综合征(ibs))、癫痫、智力低下、智力障碍和/或喂养困难的发生率。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻胃肠并存病，如腹痛、腹泻和肠胃气胀。
[0419]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻临床上可能与自闭症存在相似的某些精神和行为障碍的症状。因此，在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻注意力缺陷障碍(adhd)；情感/焦虑障碍；依恋障碍；对立违抗障碍(odd)；强迫性障碍(ocd)和/或精神病，包括精神分裂症(认知障碍)。
[0420]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在与用于治疗asds的另一种疗法组合使用时在预防、减少或减轻asds方面特别有效。此类疗法包括抗精神病药、抗焦虑药和抗抑郁药。此类药物包括利培酮奥氮平氟西汀舍曲林氟伏沙明氯米帕明氟哌啶醇硫利达嗪；氟奋乃静；氯丙嗪；齐拉西酮卡马西平拉莫三嗪托吡酯丙戊酸哌醋甲酯地西泮和劳拉西泮
[0421]
ema关于治疗自闭症谱系障碍药物产品的临床开发的指南指出，由于疾病的异质性，利用单一化合物可能无法对所有核心症状产生显著效果，并因此必须基于至少一种核心症状上证明短期疗效。实施例中使用的活生物治疗菌株已显示出对自闭症谱系障碍的至少一种核心症状的有效治疗，因此预计厌氧棒杆菌、真杆菌或faecalicatena属的细菌菌株对人类疾病有效。
[0422]
强迫性障碍(ocd)
[0423]
ocd是一种异质的、慢性的和致残的病症，属于焦虑障碍。根据dsm-iv的定义，ocd的基本特征是反复出现的强迫观念和/或强迫行为(标准a)，这些行为严重且耗时(每天超过一小时)或引起明显痛苦或显著干扰对象的正常日常生活、职业功能、日常社交活动或关系(标准c)。在病症过程中的某个时刻，患者已经认识到强迫观念或强迫行为是过度的或不合理的(标准b)。
[0424]
强迫观念被定义为反复和持续的想法、冲动或图像，这些想法、冲动或图像被认为是侵入性的和不恰当的，并导致明显的焦虑或痛苦。这些想法、冲动或图像不仅仅是关于现实生活问题的过度担忧，它们被患者认为是他自己思想的产物(例如对于污染的恐惧、对于对称的痴迷)。这个人试图用其他一些想法或行为来忽略、抑制或中和对它的痴迷。
[0425]
强迫性障碍被定义为重复行为(例如洗手、订购、囤积、检查)或精神行为(例如祈祷、数数、默默地重复词语)，其使人们感到被驱使以响应痴迷或根据必须僵硬地应用的规则。
[0426]
ocd通常与其他精神疾病的共病率相关，包括重性抑郁障碍、其他焦虑障碍(广泛性焦虑障碍、社交焦虑障碍、惊恐障碍)、药物滥用和饮食失调(厌食症和贪食症)。
[0427]
ocd是一种精神病症，可能由于微生物-肠-脑轴功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防对象的ocd。
[0428]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻ocd的基本症状特征。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的反复强迫观念和/或强迫行为。在某些实施方案中，强迫观念是反复出现的或持续的想法、冲动或图像，这些想法、冲动或图像被认为是侵入性的和不适当的，并导致明显的焦虑或痛苦。在某些实施方案中，强迫观念是对象感到被驱使执行以响应强迫性障碍或根据必须僵硬地应用的规则的重复行为。
[0429]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)根据y-bocs和/或nimh-oc诊断和/或症状量表改善对象的ocd症状。在一些实施方案中，y-bocs量表用于监测主要终点的改善。在一些实施方案中，nimh-oc量表用于监测次要参数的改善。
[0430]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象
–
整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)对患有asds的对象的整体社会功能(关系、工作等)显示出积极影响。在一些实施方案中，整体量表是sheehan失能量表。
[0431]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻ocd的至少一种合并症。ocd的并存病包括重性抑郁障碍、其他焦虑障碍(广泛性焦虑障碍、社交焦障碍、惊恐障碍)、药物滥用和饮食失调(厌食症和贪食症)、gilles de la tourette综合征、adhd(注意力缺陷/多动症)和发育障碍。
[0432]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在与用于治疗ocd的另一种疗法组合使用时在预防、减少或减轻ocd方面特别有效。此类疗法包括血清素和多巴胺再摄取抑制剂；氯米帕明和抗精神病药。
[0433]
重性抑郁障碍(mdd)
[0434]
mdd与严重的社会心理功能障碍和高度的个体精神压力以及过高的发病率和死亡率(自杀风险相当大)有关。术语重性抑郁障碍包括临床抑郁症、重度抑郁症、单相抑郁症、单相障碍、复发性抑郁症和单纯性抑郁症。术语重性抑郁障碍涵盖了心境障碍；心境恶劣；慢性忧郁症；季节性情感障碍和边缘型人格障碍。
[0435]
根据dsm-5标准，mdd症状包括情绪低落，或对日常活动失去兴趣或乐趣超过两周；和受损的社会、职业和教育功能。几乎每天都会出现以下九种症状中的至少五种特定症状：
情绪低落或一天中大部分时间易怒；每天大部分时间对大多数活动的兴趣或乐趣降低；体重显著变化或食欲改变；睡眠改变(失眠或嗜睡)；活动变化(精神运动性激越或迟缓)；疲劳或能量损失；内疚或无价值(无价值感或过度或不适当的内疚感)；注意力下降(思考或集中注意力的能力下降，或者更犹豫不断；和自杀倾向(死亡或自杀的想法，或对象有自杀计划)。另外，mdd与焦虑障碍状有关，包括非理性担忧；全神贯注于不愉快的担忧；放松困难和/或感觉紧张。mdd发作可能是轻度、中度或重度。
[0436]
mdd发作通常与其他精神障碍或躯体病症如帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、脑血管病症、癌症和慢性疼痛综合征的合并症有关。mdd经常与广泛的其他精神障碍相关，包括广泛性焦虑障碍；焦虑障碍；物质使用障碍；创伤后应激障碍(ptsd)；人格障碍；疼痛；压力；肠易激综合征；失眠；头痛和人际关系问题。
[0437]
重性抑郁障碍是一种精神障碍，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防对象的mdd。
[0438]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防急性重性抑郁发作和/或预防新的发作(预防复发)。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻轻度、中度或重度mdd发作的发生。
[0439]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻如通过本文所列dsm-5标准分类的mdd的一种或多种症状。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的抑郁情绪。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象对大多数活动的兴趣或愉悦感降低。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在2周内减少mdd症状的发生。
[0440]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)根据症状或诊断量表改善mdd的症状。这种评估症状改善的量表包括hamilton抑郁评定量表(hamd)和montgomery asberg抑郁评定量表。另外，zung自评抑郁量表(sds)和zung自评焦虑量表(sas)也是合适的症状改善量表。
[0441]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)对患有mdd的对象的整体社会和职业功能表现出积极影响。
[0442]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防治疗抗性mdd。
[0443]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻mdd的至少一种合并症。mdd的并存病包括广泛性焦虑障碍；焦虑障碍；物质使用障碍；创伤后应激障碍(ptsd)；人格障碍；疼痛；压力；ibs；失眠；头痛和人际关系问题。
[0444]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在与用于治疗mdd的另一种疗法组合使用时在预防、减少或减轻mdd方面特别有效。此类疗法包括抗抑郁药、增强策略(例如联合疗法、锂和其他情绪稳定剂、甲状腺激素和非典型抗精神病药)或甚至第二代抗精神病药。
[0445]
焦虑障碍
[0446]
焦虑障碍是一组以焦虑和恐惧感为特征的精神障碍。有许多焦虑障碍，包括广泛
性焦虑障碍(gad)；特定恐惧症；社交焦虑障碍；分离性焦虑障碍；广场恐怖症；惊恐障碍和选择性缄默症。
[0447]
gad的诊断依据dms-5中的六项标准。第一项标准是超过六个月的过度焦虑或担忧，其中焦虑或担忧在与许多活动相关的大部分时间都存在。第二项标准是对象不能处理第一项标准的症状。第三项标准是至少出现以下三种(儿童中为一种)：躁动；容易厌倦；注意力不集中；易怒；肌肉紧张和睡眠问题。最后三项标准是症状导致严重的社会、职业和功能障碍；症状不是由药物治疗、药物或其他身体健康问题引起的；并且这些症状与另一种精神问题如惊恐障碍不更好地相符。所有其他焦虑障碍均可被视为gad的差别诊断。
[0448]
gad经常与作为并存病的包括抑郁症；物质使用障碍；压力；ibs；失眠；头痛；疼痛；心脏事件；人际关系问题和adhd在内的多种其他精神障碍相关联。
[0449]
焦虑障碍是一种精神障碍，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防对象的焦虑障碍。在某些实施方案中，焦虑障碍是广泛性焦虑障碍(gad)；特定恐惧症；社交焦虑障碍；分离性焦虑障碍；广场恐怖症；惊恐障碍和选择性缄默症。
[0450]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的如通过本文所列dms-5标准分类的一种或多种gad症状。根据dms-5，相同的症状与其他焦虑障碍有关。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减邵或减轻对象焦虑障碍的一种或多种症状。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的焦虑或担忧。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在六个月时间段内减少症状的发生。在某些实施方案中，组合物预防、减少或减轻不安；疲劳；注意力不集中；易怒；肌肉紧张；和/或睡眠问题。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻与焦虑障碍相关的社交、职业和功能障碍。
[0451]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)根据症状或诊断量表改善焦虑障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估症状改善的量表包括hamilton焦虑评定量表(ham-a)。在一些实施方案中，ham-a总量表用于评估主要终点。在其他实施方案中，ham-a精神焦虑因子可用作次要终点。
[0452]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)对患有焦虑障碍的对象的整体社交、职业和功能受损表现出积极作用。在一些实施例中，整体量表是sheehan失能量表。
[0453]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻gad和焦虑障碍的至少一种共病。gad的并存病包括抑郁症；物质使用障碍；压力；ibs；失眠；头痛；疼痛；心脏事件；人际关系问题和adhd。
[0454]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在与用于治疗焦虑障碍的另一种疗法组合使用时在预防、减少或减轻焦虑障碍方面特别有效。此类疗法包括选择性血清素再摄取抑制剂(文拉法辛、度洛西汀、依他普仑和帕罗西汀)；苯二氮卓类药物(阿普唑仑、劳拉西泮和氯硝西泮)；普瑞巴林和加巴喷丁5-羟色胺受体部分激越剂(丁螺环酮和坦度螺酮)；非典型5-羟色胺能抗抑郁药(如丙咪嗪和氯米帕
明)；单胺氧化酶抑制剂(maois)(如吗氯贝胺和苯乙肼)；羟嗪；心得安；可乐定；胍法辛和哌唑嗪。
[0455]
创伤后应激障碍(ptsd)
[0456]
ptsd是一种严重且致残的病症，其基本特征是将创伤性事件包含为该病症的诱发因素。
[0457]
根据dsm-5标准，ptsd的症状分为四个主要类别：(i)侵扰：实例包括噩梦、对创伤性事件的不想要的想法、闪回以及对创伤性提醒的情绪困扰反应或生理反应；(ii)回避：实例包括避免触发创伤性记忆，包括地点、对话或其他提醒；(iii)认知和情绪的负面改变：实例包括对创伤事件的自我或他人的扭曲责备、对自己或世界的负面信念、持续的负面情绪(例如，恐惧、内疚、羞耻)、疏离感和情感受限(例如，无法体验积极情绪)；(iv)觉醒和反应的改变：实例包括愤怒、鲁莽或自毁行为、睡眠问题、注意力问题、惊吓反应增加和过度警觉。
[0458]
在创伤事件发生后4周内消退的症状符合急性应激障碍的标准。dsm区分急性(症状持续时间少于3个月)和慢性ptsd(症状持续时间超过3个月)。如果症状在压力源后6个月以上开始出现，则该病症被定义为延迟发作性ptsd。
[0459]
ptsd携带重性抑郁障碍和物质使用障碍的高并存病。
[0460]
ptsd是一种精神障碍，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防对象的ptsd。根据类似的发病机制，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防应激障碍。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗急性应激障碍。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗急性和/或慢性ptsd。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗延迟发作ptsd。
[0461]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的如通过本文所列dsm-5标准分类的一种或多种ptsd(或应激障碍)症状。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻患有ptsd对象的侵入性想法。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻患有ptsd的对象的回避行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻患有ptsd对象的认知和情绪的负面改变。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)防止患有ptsd对象的觉醒和反应改变。
[0462]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)根据症状或诊断量表改善ptsd和应激障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估症状改善的量表是临床管理的ptsd(caps)量表。
[0463]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象
–
整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)对患有ptsd和应激障碍的对象的整体社会、职业和功能障碍表现出积极作用。在一些实施方案中，整体量表是sheehan失能量表。
[0464]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻ptsd和应激障碍的至少一种共病。ptsd和应激障碍的并存病包括mdd、物质使用障碍；压力和焦虑。
[0465]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在与用于治疗ptsd和应激障碍的另一种疗法组合使用时在预防、减少或减轻ptsd和应激障碍方面特别有效。此类疗法包括血清素能试剂、三环类抗抑郁药、情绪稳定剂、肾上腺素能抑制剂、抗精神病药、苯二氮卓类药物、舍曲林氟西汀和/或帕罗西汀
[0466]
精神分裂症谱系和精神障碍
[0467]
这些疾病会影响对象清晰思考、做出良好判断、情绪反应、有效沟通、理解现实和适当行为的能力。精神病包括精神分裂症(下面列出的症状)；分裂情感障碍(对象有精神分裂症和心境障碍的症状，如抑郁症或双相障碍)；精神分裂症样病症(表现出精神分裂症的症状，但症状持续时间较短：1-6个月)；短暂的精神障碍(对象表现出突然的、短期的精神病行为，通常是对非常紧张的事件的反应，如家庭中的死亡-恢复通常不到一个月)；妄想障碍(妄想持续至少1个月)；共有精神障碍；物质诱发的精神障碍；由于另一种医学病况引起的精神障碍；妄想痴呆(表现出与精神分裂症相似的症状，并且在人们上了年纪时开始在晚年出现)。最熟知的精神障碍是精神分裂症，并且大多数精神障碍表现出与精神分裂症相似的症状。
[0468]
精神分裂症是一种具有异质病程和症状特征的严重精神疾病。精神分裂症在临床上表现为所谓的阳性和负面症状。阳性症状包括妄想、幻觉、杂乱无章的言语以及杂乱无章或紧张的行为。阴性症状包括情感扁平化、思维和言语的流畅性和产生能力受限以及目标导向行为的开始。阳性症状似乎反映了正常功能的过度或扭曲，而阴性症状似乎反映了正常功能的减少或丧失。另外，认知缺陷(工作记忆、信息处理、注意力/警觉、学习、推理和社会认知的缺陷)很常见。目前的抗精神病药物治疗通常显示认知缺陷改善不佳。精神分裂症患者也会出现情绪症状。除了这些主要症状外，精神分裂症还与其他精神症状如躁狂和抑郁症状、焦虑或强迫性障碍状、药物滥用和依赖以及人格障碍等共病有关。
[0469]
根据dsm-5，对于诊断精神分裂症，对象必须至少有以下症状中的两种：妄想；幻觉；杂乱无章的言语；杂乱无章的或紧张的行为和阴性症状。症状之一必须是存在妄想、幻觉或杂乱无章的言语。持续的干扰迹象必须持续至少6个月，在此期间对象必须经历至少1个月的活跃症状，并且在相当长的时间内出现社交或职业恶化问题。
[0470]
精神分裂症谱系和精神障碍是由于微生物群-肠-脑轴功能障碍而可能发展或持续存在的精神障碍。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防对象的精神分裂症谱系和/或精神障碍。在某些实施方案中，精神分裂症谱系和精神障碍选自精神分裂症；分裂情感障碍；精神分裂症样病症；短暂的精神障碍；妄想症；共有精神障碍；物质诱发的精神障碍；由于另一种医疗状况和妄想痴呆引起的精神障碍。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防精神分裂症。在某些实施方案中，精神分裂症选自偏执型、紊乱型、紧张型、未分化型和残留型精神分裂症。
[0471]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的如通过本文所列dsm-5标准分类的一种或多种精神分裂症症状。这些实施方案适用于预防、减少或减轻其他精神分裂症谱系和精神障碍的症状。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻精神分裂症的阴性症状。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻精神分裂症的阳性症状。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻精神分裂症的阴性和阳性症
状。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻患有精神分裂症对象的妄想、幻觉、杂乱无章的言语以及杂乱无章或紧张的行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻精神分裂症对象的情感扁平化、思想和言语的流畅性和产生能力的限制以及目标导向行为的开始。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻精神分裂症对象的认知缺陷和/或心境障碍。
[0472]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在6个月时间段内减少对象精神分裂症阳性和/或阴性症状的发生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了患有精神分裂症谱系或精神障碍对象的社交和/或职业功能。
[0473]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)根据症状或诊断量表改善精神分裂症谱系或精神障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估症状改善的量表是阳性和阴性症状量表(panss)和简要精神病评定量表(bprs)。在某些实施方案中，使用了阴性症状评定量表(sans)。
[0474]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)对患有精神分裂症谱系或精神障碍的对象的整体社交和职业损害显示出积极作用。
[0475]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻精神分裂症谱系或精神障碍的至少一种共病。在某些实施方案中，共病是躁狂和抑郁症状、焦虑或强迫性障碍状、物质滥用和依赖以及人格障碍。
[0476]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防难治性精神分裂症的治疗抵抗性。
[0477]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在与用于治疗ptsd和应激障碍的另一种疗法组合使用时在预防、减少或减轻精神分裂症谱系或精神障碍方面特别有效。在某些实施方案中，此类疗法包括第一代抗精神病药，包括氯丙嗪、氟奋乃静、氟哌啶醇和/或奋乃静。在某些实施方案中，此类疗法包括第二代疗法，包括阿立哌唑阿塞那平依匹唑派卡利拉嗪氯氮平伊潘立酮鲁拉西酮奥氮平帕利哌酮(invega)；喹硫平利培酮齐拉西酮
[0478]
双相障碍
[0479]
双相障碍通常是一种慢性疾病。躁狂是双相障碍的主要症状。根据躁狂和抑郁发作的特定持续时间和模式，有数种类型的双相障碍。在dsm-5中，对双相i型障碍、双相ii型障碍、循环性精神障碍、快速循环型双相障碍和双相障碍nos进行了区分。
[0480]
根据dsm，躁狂症是一个明显的异常和持续升高、膨胀或易怒情绪的时期。发作必须持续一周，并且情绪必须至少具有以下三种症状：自尊心高；减少睡眠需求；提高语速；想法的快速跳跃；容易分心；对目标或活动的兴趣增加；精神运动激越；增加对具有高危险风险的活动的追求。
[0481]
双相i型障碍包括一次或多次躁狂或混合(躁狂和抑郁)发作和至少一次重度抑郁
发作(有关mdd发作的症状见上文)。双相ii型障碍有一次或多次重度抑郁发作并伴有至少一次轻躁狂发作。没有躁狂或混合发作。轻躁狂是一种较轻的躁狂形式。这些症状是造成重大社会、职业和功能障碍的原因。循环性精神病的特征是随着轻度躁狂期的改变而改变低水平的抑郁症。在可以做出诊断之前，成人的症状必须至少存在两年或儿童的症状必须至少存在一年。成人和儿童的无症状期分别持续不超过两个月或一个月。快速循环双相障碍是一种严重的双相障碍形式。当一个人在一年内至少有四次重度抑郁症、躁狂症、轻度躁狂症或混合状态发作时，就会发生此病况。未另外指定的(nos)双相障碍对不明确适合其他类型的双相症状进行归类。当存在多种双相症状但不足以满足任何其他亚型的标签时，即可诊断为nos。
[0482]
双相障碍与以下并存病有关：adhd；焦虑障碍；物质障碍；肥胖和代谢综合征。
[0483]
双相障碍是一种精神疾病，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防对象的双相障碍。在某些实施方案中，双相障碍是双相i型障碍。在某些实施方案中，双相障碍是双相ii型障碍。在某些实施方案中，双相障碍是循环精神障碍。在某些实施方案中，双相情感障碍是快速循环双相障碍。在某些实施方案中，双相情感障碍是双相障碍nos。
[0484]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减轻或减轻对象双相障碍的一种或多种症状。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象躁狂发作的发生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻异常和持续升高、膨胀或易怒情绪的发生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻以下一种或多种症状：高自尊；减少睡眠需求；提高语速；想法的快速跳跃；容易分心；对目标或活动的兴趣增加；精神运动激越；对具有高危险风险的活动的追求增加。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的一种或多种躁狂或混合发作的发生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)减少对象中至少一次重度抑郁发作的发生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻伴有至少一次轻躁狂发作的至少一次重度抑郁发作的发生。
[0485]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗双相障碍的急性期和/或预防进一步发作的发生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗患有双相障碍的对象的躁狂/抑郁发作的急性期并防止进一步的躁狂/抑郁发作的发生。
[0486]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)根据症状或诊断量表改善双相障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估躁狂发作症状改善的量表是躁狂状态评定量表和青年躁狂评定量表。在某些实施方案中，量表是bech-rafaelsen躁狂量表(brmas)。在某些实施方案中，用于评估从躁狂发作转变为抑郁发作的症状改善的量表包括hamilton抑郁量表、montgomery-asberg评定量表和bech rafaelsen抑郁量表。
[0487]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善了的临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)对患有双相障碍的对象的整体社会、职业和功能障碍表现出积极作用。
[0488]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻双
相障碍的至少一种共病。在某些实施方案中，共病选自adhd、焦虑障碍、物质障碍、肥胖症和代谢综合征。
[0489]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防对锂和双丙戊酸钠无反应的躁狂抑郁症和双相障碍。
[0490]
在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在与用于治疗双相障碍的另一种疗法组合使用时在预防、减少或减轻双相情感障碍方面特别有效。在某些实施方案中，此类疗法包括碳酸锂、抗惊厥药(包括丙戊酸盐、双丙戊酸盐、卡马西平和拉莫三嗪)和抗精神病药(包括阿立哌唑、奥氮平、喹硫平和利培酮)。
[0491]
神经认知障碍和阿尔茨海默氏病
[0492]
阿尔茨海默氏病和痴呆
[0493]
过度磷酸化的tau蛋白的异常积累是诸如阿尔茨海默氏病等神经退行性tau蛋白病的标志。hdac活性的降低可以降低过度磷酸化的tau水平并减轻tau驱动的神经系统病症的症状[58]。因此，在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防神经退行性tau蛋白病。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗阿尔茨海默氏病。
[0494]
在dsm-5中，术语痴呆被替换为术语主要神经认知障碍和轻度神经认知障碍。神经认知障碍是一类异质的精神疾病。最常见的神经认知障碍是阿尔茨海默氏病，其次是血管性痴呆或两者的混合形式。其他形式的神经退行性病症(例如路易体病、额颞痴呆、帕金森病痴呆、creutzfeldt-jakob病和wernicke-korsakoff综合征)都伴有痴呆。
[0495]
阿尔茨海默氏病和痴呆的特征还在于神经元损失，因此本发明组合物的实例中显示的神经保护和神经增殖作用表明它们可用于治疗或预防这些病况。
[0496]
dsm-5下痴呆的症状标准是认知从先前的在一个或多个选自以下的认知领域的表现水平显著下降的证据：学习和记忆；言语；执行功能；复杂的注意力；知觉运动和社会认知。认知缺陷必须干扰日常活动的独立性。另外，认知缺陷不仅仅发生在谵妄的情况下，也不能通过另一种精神障碍(例如mdd或精神分裂症)更好地解释。
[0497]
除了主要症状外，患有神经退行性病症的对象还表现出行为和精神症状，包括激越、攻击性、抑郁、焦虑、冷漠、精神病和睡眠-觉醒周期紊乱。
[0498]
神经退行性和神经认知障碍是一种精神障碍，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在的。因此，在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经退行性或神经认知障碍。在优选的实施方案中，神经退行性或神经认知障碍是阿尔茨海默氏病。在其他实施方案中，神经退行性或神经认知障碍选自血管性痴呆；混合型阿尔茨海默氏病和血管性痴呆；路易体病；额颞痴呆；帕金森病痴呆；creutzfeldt-jakob病；亨廷顿病；和wernicke-korsakoff综合征。
[0499]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象的神经退行性或神经认知障碍的一种或多种症状。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象认知衰退的发生。在某些实施方案中，本发明的组合物改善患有神经退行性或神经认知障碍对象在选自以下的一个或多个认知领域的表现水平：学习和记忆；言语；执行功能；复杂的注意力；知觉运动和社会认知。在一些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻与选自激越、攻击性、抑郁、焦虑、冷漠、精神病和睡眠-觉醒周期紊乱的神经退行性或神经认知障碍相关的一种或多种行为和精神症状的发生。
[0500]
在某些实施方案中，本发明的组合物通过在临床前阶段干预可疑的致病机制来预防、减少或减轻症状性疾病。在某些实施方案中，本发明的组合物改善疾病改善，减缓或阻止症状进展。在一些实施方案中，症状进展的减缓或停止与延迟潜在神经病理学过程的证据相关。在优选的实施方案中，本发明的组合物改善神经退行性或神经认知障碍的症状，包括增强的认知和功能改善。在优选的实施方案中，本发明的组合物改善痴呆的行为和精神症状(bpsd)。在优选的实施方案中，本发明的组合物提高患有神经退行性或神经认知障碍的对象进行日常活动的能力。
[0501]
在优选的实施方案中，本发明的组合物改善了患有阿尔茨海默氏病的对象的认知和功能。在一些实施方案中，本发明的组合物改善了患有阿尔茨海默氏病的对象的认知终点。在一些实施方案中，本发明的组合物改善了患有阿尔茨海默氏病的对象的功能终点。在优选的实施方案中，本发明的组合物改善了患有阿尔茨海默氏病的对象的认知和功能终点。在其他优选的实施方案中，本发明的组合物改善了患有阿尔茨海默氏病的对象的整体临床反应(整体终点)。
[0502]
在一些实施方案中，本发明的组合物根据症状或诊断测试改善了神经退行性或神经认知障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估阿尔茨海默氏病(和其他神经退行性或神经认知障碍)的症状改善的测试选自客观认知、日常生活活动、变化的整体评估、健康相关的生活质量测试和评估神经退行性或神经认知障碍的行为和精神症状的测试。
[0503]
在某些实施方案中，用于评估症状改善的客观认知测试使用阿尔茨海默氏病评估量表认知子量表(adas-cog)和经典adas量表。在某些实施方案中，使用用于阿尔茨海默氏病的神经生理学测试组合(ntb)来评估认知的症状改善。
[0504]
在一些实施方案中，改变测试的整体评估使用临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表来评估精神和神经障碍。在一些实施方案中，整体量表是基于临床医生访谈的变化印象加(cibic plus)。在一些实施方案中，整体量表是阿尔茨海默氏病合作研究单位临床医生的整体变化印象(adcs-cgic)。
[0505]
在某些实施方案中，健康相关的生活质量测量是阿尔茨海默氏病相关的qol(adrql)和qol-阿尔茨海默病(qol-ad)。
[0506]
在某些实施方案中，评估神经退行性或神经认知障碍的行为和精神症状的测试选自阿尔茨海默氏病评定量表(behave ad)；用于痴呆的行为评定量表(brsd)；神经精神系统量表(npi)；和cohen-mansfield激越量表(cmai)中的行为病理学。
[0507]
在一些实施方案中，当与用于治疗神经退行性或神经认知障碍的另一种疗法组合使用时，本发明的组合物在预防、减少或减轻神经退行性或神经认知障碍方面特别有效。在某些实施方案中，此类疗法包括乙酰胆碱酯酶抑制剂，包括多奈哌齐加兰他敏和卡巴拉汀以及美金刚。
[0508]
帕金森氏病
[0509]
帕金森氏病是一种常见的神经退行性疾病，其神经病理学特征是异质神经细胞群(产生多巴胺的细胞)的退化。帕金森氏病的临床诊断需要运动迟缓和至少以下核心症状之一：静息性震颤；肌肉强直和姿势反射障碍。在疾病进展过程中可能出现或发展的其他体征和症状是自主神经扰动(流涎、皮脂溢、便秘、排尿障碍、性机能、直立性低血压、多汗症)、睡
眠障碍和嗅觉或温度感觉障碍。帕金森氏病是一种神经退行性疾病，可能由于hdac活性而发展或持续存在。例如，hdac活性已被证明可以调节聚集和沉积有毒的细胞内蛋白丝，这些蛋白丝是诸如帕金森氏病等神经退行性疾病的标志[59]。已显示抑制hdac活性可减少帕金森氏病模型中的有毒蛋白质错误折叠事件。另外，帕金森氏病也是一种精神障碍，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的帕金森氏病。许多帕金森氏病患者会出现抑郁症状和认知功能障碍并存病，以及与路易小体相关的神经认知障碍。
[0510]
在其他优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防帕金森氏病的方法。本发明的组合物可以改善帕金森氏病模型中的运动和认知功能。用组合物治疗可以调节中枢、自主神经和肠神经系统中的信号传导；可调节hpa轴通路的活性；可以调节神经内分泌和/或神经免疫通路；并且可能调节对象的共生代谢物、炎症标志物和/或胃肠道通透性的水平，所有这些都与帕金森氏病的神经病理学有关。在优选的实施方案中，本发明提供了用于治疗或预防帕金森氏病的方法的包含物种anaerostipes hadrus的细菌菌株的组合物。使用厌氧棒杆菌的组合物可能对治疗帕金森氏病特别有效。组合物还可包含有机酸。
[0511]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象的帕金森氏病的一种或多种症状。在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象帕金森氏病的一种或多种核心症状。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象的运动迟缓。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象的静息震颤；肌肉僵硬和/或姿势反射障碍。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻与帕金森氏病进展相关的一种或多种症状，所述症状选自自主神经紊乱(流涎、皮脂溢、便秘、排尿障碍、性机能、直立性低血压、多汗症)、睡眠障碍和嗅觉或温度感觉障碍。
[0512]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻与帕金森氏病共存的抑郁症状。在某些实施方案中，本发明的组合物改善言语记忆和/或执行功能。在某些实施方案中，本发明的组合物改善注意力、工作记忆、语言流利度和/或焦虑。
[0513]
在其他优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻与帕金森氏病共存的认知功能障碍。
[0514]
在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻与帕金森氏病共存的多动或焦虑样行为。帕金森氏病的小鼠模型已被证明表现出多动症。某些模型表明，多动症可能是大脑中神经递质水平不平衡或大脑内其他结构在多巴胺能神经元退化之前发生功能变化的结果。因此，行为障碍，如多动症，可能是运动障碍发作之前的帕金森氏病的症状。本发明的组合物已显示可减少帕金森氏病小鼠模型的多动症。因此，在某些实施方案中，本发明的组合物可用于预防帕金森氏病中的运动障碍。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防与帕金森氏病相关的行为障碍。
[0515]
在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻帕金森氏病的进展。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻后期运动并发症。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻晚期运动波动。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻神经元损失。在某些实施方案中，本发明的组合物改善帕金森氏病痴呆(pdd)的症状。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻执行功能、注意力和/或工作记忆的损害。在某些实施方案中，本发明的组合物改善多巴胺能神经传递。在某些实施方案中，
本发明的组合物预防、减少或减轻受损的多巴胺能神经传递。
[0516]
在一些实施方案中，本发明的组合物根据症状或诊断量表改善帕金森氏病的症状。在某些实施方案中，用于评估帕金森氏病运动功能症状改善的测试是统一帕金森氏病评定量表。特别地，updrs ii考虑日常生活活动，且updrs iii考虑运动检查。
[0517]
在一些实施方案中，本发明的组合物根据症状或诊断测试和/或量表改善与pdd相关的症状。在某些实施方案中，测试或量表选自hopkins语言学习测试
–
修订版(hvlt-r)；delis-kaplan执行功能系统(d-kefs)颜色词干扰测试；hamilton抑郁评定量表(ham-d 17；抑郁)；hamilton焦虑评定量表(ham-a；焦虑)和统一帕金森氏病评定量表(updrs；pd症状严重程度)。
[0518]
在一些实施方案中，本发明的组合物改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象
–
整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本发明的组合物对患有金森氏病对象的整体社会和职业损害表现出积极作用。
[0519]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经障碍如帕金森氏病，其中所述用途涉及减少或预防黑质中多巴胺能细胞的损失。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经障碍如帕金森氏病，其中所述用途涉及减少或预防黑质致密部中的多巴胺能神经元的退化。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经障碍，如帕金森氏病，其中所述用途涉及减少或预防黑质致密部中多巴胺能神经元的退化以及由此导致的它们的纹状体中的突出神经纤维的丧失。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经障碍如帕金森氏病，其中所述用途涉及减少或预防黑质纹状体多巴胺能神经元的损失。
[0520]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经障碍如帕金森氏病，其中所述用途涉及增加多巴胺水平。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经障碍如帕金森氏病，其中所述用途涉及增加dopac水平。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的神经障碍如帕金森氏病，其中所述用途涉及增加多巴胺和dopac水平。在某些实施方案中，纹状体中的多巴胺和/或dopac水平增加。
[0521]
实例证明本发明的组合物激活map2(微管相关蛋白2)激活。map2是与map2的神经元分化相关的基因并且被认为对于神经发生中的微管形成是必需的，因此本发明的组合物对于治疗神经退行性疾病可能特别有用。在一些实施方案中，本发明的组合物用于通过激活或增加map2的水平来治疗神经退行性疾病，如阿尔茨海默氏病或帕金森氏病。此外，由于map2促进神经突的生长，这在受损神经元的重新联网和突触发生中起主要作用，map2的表达可能不仅仅是神经元分化的标志物，并且表明与神经病理学疾病的治疗结果相关的“神经元重新布线”。
[0522]
实例证明本发明的组合物调节脑中多种蛋白质的表达。特别地，本发明的组合物增加了海马体和前额叶皮层中bdnf的表达。bdnf对于成人突触可塑性和记忆的形成至关重要，并且在阿尔茨海默和亨廷顿病患者中观察到bdnf水平的降低。因此，本发明的组合物特别适用于治疗阿尔茨海默和亨廷顿病。在某些实施方案中，本发明的组合物增加脑中bdnf的表达。
[0523]
在一些实施方案中，当与用于治疗神经认知障碍的另一种疗法组合使用时，本发明的组合物在预防、减少或减轻神经认知障碍方面特别有效。在某些实施方案中，此类疗法
包括多巴胺激动剂(包括l-dopa )；单胺氧化酶抑制剂、儿茶酚胺-o-甲基转移酶抑制剂；抗胆碱能药和谷氨酸调节剂。
[0524]
其他中枢神经系统障碍
[0525]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防与微生物群-肠-脑轴功能障碍相关的中枢神经系统障碍。除上述实施方案外，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防精神病；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)和/或慢性疼痛。在其他实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)可用于治疗或预防运动神经元疾病；亨廷顿病；guillain-barre综合征和/或脑膜炎。
[0526]
亨廷顿病
[0527]
亨廷顿病是一种遗传性脑部病况，由遗传性缺陷基因引起，该基因会损害大脑中的某些神经细胞。随着时间的推移，这种脑损伤会逐渐恶化，并会影响运动、认知(感知、意识、思维、判断)和行为。这种疾病的早期特征可能包括性格变化、情绪波动、烦躁的动作、易怒和行为改变。
[0528]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)用于治疗或预防亨廷顿病。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)控制亨廷顿病的症状，如易怒或过度运动。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗与亨廷顿病相关的抑郁症和/或改善症状，如社交退缩、缺乏或兴趣和睡眠障碍。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善记忆力和专注于任务的能力。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗失能异常运动。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)治疗与亨廷顿病相关的行为问题、反社会行为、易怒和精神病。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)诱导神经保护并防止神经损伤。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)增加多巴胺的水平和/或含多巴胺的细胞的水平。
[0529]
神经化学因子、神经肽和神经递质以及微生物-肠-脑轴
[0530]
如上所示，微生物群-肠-脑轴由许多不同的生理系统调节。微生物群-肠-脑轴由许多信号传导分子调节。这些信号传导分子水平的改变会导致中枢神经系统发育和/或功能的缺陷。实际上，本节中公开的许多分子都与微生物群-肠-脑轴的功能和中枢神经系统障碍或病况的发病机制有关([20],[24],[63],[60])。由本发明人进行的实验表明，行为改变可以通过给予厌氧棒杆菌属的细菌菌株来触发，如anaerostipes hadrus菌株和真杆菌或faecalicatena菌株。这种效应可能是由对信号传导分子水平的影响所介导的，特别是在本节中列出的那些。这些改变可能是与厌氧棒杆菌；或真杆菌或faecalicatena菌株相关的治疗益处的原因。因此，由于本文公开的中枢神经系统障碍和病况表现出相似的基本生化和生理发病机制(即经由微生物群-肠-脑轴)这一事实，对于这些病症和病况也可能实现厌氧棒杆菌、或真杆菌或faecalicatena菌株的相似治疗益处。给予真杆菌或faecalicatena菌株对于触发与中枢神经系统障碍或病况相关的行为变化可能特别有效。
[0531]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受神经化学因子、神经肽和神经递质水平的调节。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节神经化学因子、神经肽和神经递质的水平。因此，在某些优选实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)直接改变cns生物化学。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节脑源
性神经营养因子(bdnf)的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节一元胺的水平。在某些实施方案中，单胺是血清素(5-羟色胺(5-ht))、多巴胺、去甲肾上腺素和/或肾上腺素。在某些实施方案中，单胺是儿茶酚胺。在某些实施方案中，儿茶酚胺是多巴胺、去甲肾上腺素和肾上腺素。在某些实施方案中，单胺是色胺。在某些实施方案中，色胺是血清素和褪黑激素。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节乙酰胆碱的水平。bdnf、单胺或乙酰胆碱的水平可以相对于治疗前患者或健康个体中观察到的bdnf、单胺或乙酰胆碱水平来测量。
[0532]
在某些优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节氧化毒素的水平。催产素与情绪、社会、认知和神经内分泌生理学以及自动调节有关。特别地，催产素的释放与无虑(anxiolysis)；积极的情绪；母性行为、夫妻关系；性行为；社会记忆；嗅觉记忆；厌食作用；hpa轴对压力的反应减弱；出生和哺乳期间的自激以及其他生理和心理过程。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)增加催产素的水平有关。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低催产素的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)增加或减少催产素信号传导。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节催产素受体的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节钙离子流入或流出神经元、肌肉和胃肠细胞的流量。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)通过调节催产素的水平来治疗和预防与微生物群-肠-脑轴相关的神经发育和神经精神障碍和疾病。可以相对于治疗前患者或健康个体中观察到的催产素水平来测量催产素水平。
[0533]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节脑单胺及其代谢物的水平。在优选的实施方案中，单胺是血清素。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节色氨酸代谢的血清素能和/或犬尿氨酸途径。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节血清素代谢物如5-羟基吲哚乙酸(5-hiaa)的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节多巴胺代谢物如高香草酸(hva)的水平。调节这些神经递质和神经化学因子可用于治疗压力、抑郁和焦虑相关病症。可以相对于治疗前患者或健康个体中观察到的脑单胺水平测量脑单胺水平。
[0534]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受γ氨基丁酸(gaba)水平的调节。因此，在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节gaba的水平。gaba是一种抑制性神经递质，可降低神经元的兴奋性。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)增加了gaba的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低了gaba的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改变gaba能神经传递。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节中枢神经系统不同区域中的gaba转录水平。在某些实施方案中，共生来源的gaba穿过血脑屏障并直接影响神经传递。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)导致海马体、杏仁核和/或蓝斑中的gaba减少。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)导致皮质区域中gaba的增加。可以相对于治疗前患者或健康个体中观察到的gaba水平来测量gaba水平。
[0535]
诸如5-羟色胺、褪黑激素、gaba、组胺和乙酰胆碱等神经活性分子的水平与诸如痴呆、阿尔茨海默氏病和亨廷顿病等中枢神经系统疾病的病理生理学有关。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防由gaba介导的疾病，例如癫痫。
[0536]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受组胺水平的调节。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节组胺水平。在某些实施方案中，组胺具有免疫调节作用。在某些实施方案中，组胺水平使细菌能够从内腔转位到体循环中。因此，在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改变了胃肠道通透性和/或屏障功能。在某些其他实施方案中，组胺充当与中枢过程相关的神经递质。
[0537]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受hpa轴的调节。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节hpa活性。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)减弱hpa应激反应。在某些优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节与hpa活性相关的炎症反应。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节糖皮质激素的水平。在某些优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节皮质酮和肾上腺素的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节促皮质激素释放因子和/或加压素的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节加压素和/或其他神经垂体或抗利尿激素的水平。hpa轴活动的改变与焦虑和应激障碍有关。
[0538]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受免疫反应和炎症因子和标志物的改变的调节。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)可以调节免疫反应。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节循环神经免疫信号传导分子的全身水平。在某些优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节促炎细胞因子的产生和炎症。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节炎症状态。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节脾细胞增殖反应。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节c反应蛋白；il-1家族细胞因子；il-1β；il-2；il-4；il-6；il-8；il-10；il-12p40；il 17；il-17a；il-21；il-23；tnf-α和ifn-γ的全身和/或血浆水平。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节抗炎细胞因子例如il-10的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)增加了il-10的水平。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节tnf-α的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节ifn-γ的水平。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节ifn-γ:il-10比率。在某些优选实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低了ifn-γ:il-10比率。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低促炎细胞因子tnf-α和ifnγ的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)(例如包含anaerostipes hadrus菌株)降低了tnf-α和/或il-1β的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)(例如包含anaerostipes hadrus的菌株)增加了il-6的水平。增加的细胞因子循环水平与各种神经精神障碍密切相关，包括抑郁症、焦虑障碍、精神分裂症和asd。在诸如精神分裂症、重性抑郁障碍和双相障碍等病症中强调了炎症状态改变的证据。可以相对于治疗前患者或健康个体中观察到的细胞因子水平测量细胞因子水平。
[0539]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节耐受介导的树突细胞的水平并相互调节促炎和抗炎细胞因子反应。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低髓过氧化物酶(炎症和氧化的标志物)的全身水平。免疫系统和炎症反应的治疗调节剂可用于治疗自闭症谱系障碍和心境障碍。
[0540]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节对感染或疫苗接种的免疫反应。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节炎症水平以响应感染或疫苗接种。在某些优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节母体免疫激活以响应妊娠期间的感染或疫苗接种。因此，本文公开的组合物(本发明的组合物)可在妊娠期间给药以治疗或预防后代的中枢神经系统障碍。
[0541]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受共生代谢物水平的调节。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节微生物群代谢物的全身水平。在某些优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节短链脂肪酸(scfas)的水平。在某些实施方案中，scfas的水平增加或减少。在一些实施方案中，scfa是丁酸(ba)(或丁酸盐)。在一些实施方案中，scfa是丙酸(ppa)。在一些实施方案中，scfa是乙酸。在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)(例如包含anaerostipes hadrus gnavus菌株)增加以下一种、两种、三种、四种、五种或全部的水平：乙酸盐、丙酸盐、戊酸盐、丁酸盐、异丁酸盐和异戊酸盐。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节scfas穿过血脑屏障的能力。可以相对于治疗前患者或健康个体中观察到的scfas水平测量scfas水平。
[0542]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节多糖a(psa)的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节有效的促炎性内毒素脂多糖(lps)的水平。lps导致炎性细胞因子的产生，这些细胞因子改变生理性大脑活动并调节神经肽合成。lps对cns的调节具有重要影响，增加了专门控制情绪的区域(例如杏仁核)的活动。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节色氨酸和/或其代谢物的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节4-乙基苯基硫酸盐(4eps；与asd相关行为异常相关的尿毒症毒性)的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低了对象中4-乙基苯基硫酸盐的水平。由腔内肠道刺激引起的神经元信号传导通路刺激产生的信号强烈调节大脑活动，包括疼痛感知、免疫反应调节、情绪控制和其他稳态功能。因此，能够调节这些因子水平的组合物将具有用于治疗或预防cns病症的广泛治疗应用。
[0543]
本文公开的组合物可以调节紧密连接蛋白，并因此可用于例如治疗或预防与肠道中紧密连接蛋白和功能标记的失调或其他异常表达相关的病症或病况。在一些实施方案中，本文公开的组合物(例如，包含anaerostipes hadrus菌株)可以调节ido1、tph1和tjp1基因表达中的一个、两个或所有三个。在一些实施方案中，本文公开的组合物(例如，包含anaerostipes hadrus菌株)可以调节ido1、tph1和tjp1基因表达中的一个、两个或所有三个。tph1的增加与血清素产生的改善相关，并因此可能可用于治疗抑郁症和相关病况。
[0544]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受胃肠通透性水平的调节。因此，在一些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改变胃肠道上皮的完整性。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节胃肠道的通透性。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节胃肠道的屏障功能和完整性。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节胃肠道运动。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节共生代谢物和炎症信号传导分子从胃肠道腔转移至血流中。
[0545]
微生物群-肠-脑轴的信号传导由胃肠道中的微生物群组成调节。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节胃肠道的微生物群组成。在某些实施
方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)防止微生物群失调和毒性代谢物(例如lps)的相关增加。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节胃肠道中梭菌的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低了胃肠道中梭菌的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)降低空肠弯曲杆菌(campylobacter jejuni)的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节有害厌氧细菌的增殖和由这些细菌产生的神经毒素的产生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节乳酸杆菌和/或双歧杆菌的微生物群水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)调节萨特氏菌(sutterella)属、普氏菌(prevotella)属、ruminoccucs属和/或产碱菌科的微生物群水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)增加植物乳杆菌(lactobacillus plantarum)和/或布拉氏酵母菌(saccharomyces boulardii)的水平。
[0546]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)通过广泛使用抗生素来防止微生物群组成的失调。在某些优选实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在妊娠期间给予抗生素后维持功能性母体微生物群组成。因此，本文公开的组合物(本发明的组合物)可在妊娠期间给药以治疗或预防后代的中枢神经系统障碍。
[0547]
微生物群的调节已被证明可有效改善与精神障碍相关的行为，包括焦虑、抑郁、自闭症谱系障碍、强迫性障碍和记忆能力(包括空间和非空间记忆)，以及其他cns相关病症，包括帕金森氏病。某些研究表明，益生菌可以减轻心理压力、躯体化、抑郁和愤怒敌意。乳酸杆菌的水平与抑郁症有关，并且与胃肠道不适相关的疼痛信号传导有关。
[0548]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻与本文所述的中枢神经系统障碍相关的至少一种行为症状。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善对象的整体临床反应。
[0549]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的刻板、重复行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻异常限制性行为和/或兴趣的发生。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的反复强迫观念和/或强迫行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的社会行为缺陷。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的回避行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的交流行为缺陷。
[0550]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的认知和情绪的负面改变。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的焦虑相关行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的压力相关行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的抑郁相关行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的攻击性行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻异常和持续升高、膨胀或易激惹的情绪的发生。
[0551]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对
象的侵入性想法。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)防止对象的觉醒和反应性改变。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的妄想、幻觉、杂乱无章的言语以及杂乱无章或紧张的行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的情感扁平化、思想和言语的流畅性和产生能力的限制以及目标导向行为的启动。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻以下一种或多种症状：高自尊；减少睡眠需求；提高语速；想法的快速跳跃；容易分心；对目标或活动的兴趣增加；精神运动激越；增加对具有高危险风险的活动的追求。
[0552]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善对象的空间和/或非空间记忆缺陷。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善对象的认知和功能。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善对象的运动活动。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的运动迟缓。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻对象的静息震颤；肌肉僵硬和/或姿势反射障碍。
[0553]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)预防、减少或减轻与本文公开的cns病症相关的至少一种合并症。
[0554]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)提高了对象关于本文所述的cns病症的症状和/或诊断量表中的至少一种的得分。在某些其他实施方案中，症状和/或诊断量表选自一般健康问卷(ghq)；抑郁焦虑和压力量表(dass)；leiden抑郁敏感性指数-修订版(leids-r)；阳性和阴性症状量表(panss)；状态-特质焦虑量表(stai)；发展行为检查表(dbc)；beck抑郁量表(bdi)；beck焦虑量表(bai)；hopkins症状检查表(hscl-90)；医院焦虑和抑郁量表(hads)；感知压力量表(pss)；应对量表(ccl)(也用于应对日常生活压力)；以及基于问卷的情绪状态概况(poms)。
[0555]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)在评估本领域技术人员已知的cns病症的其他动物模型中的治疗功效时可以改善症状和/或诊断量表。除了实例中公开的行为测定，本文公开的组合物(本发明的组合物)可以改善互惠的社会互动；嗅觉交流；超声波发声；运动刻板印象(如盘旋和垂直跳跃)、重复行为，如自我梳毛和diffing；以及在空间任务中的毅力。
[0556]
此外，本文公开的组合物(本发明的组合物)将可用于治疗和/或预防cns病症的其他动物模型中的cns病症。其他小鼠模型包括近交小鼠品系(包括balb/cj和c58/j)以及遗传改良的小鼠品系(包括neurexin1、neuroligin3、neuroligin4、shank2、shank3、cntnap2、tsc1/2和fmr1基因突变小鼠品系)。
[0557]
在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善对象的社交行为。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)提高了对象对社交新颖性的识可。在优选的实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)提高了区分熟悉的和新颖的物质以及熟悉的和新颖的对象的能力。在优选的实施方案中，本发明的组合物提高了识别其他对象的能力。
[0558]
在某些实施方案中，本文公开的组合物可以改善对象的抑郁或抑郁样行为。在某些实施方案中，本文公开的组合物(本发明的组合物)改善对象的习得性无助。
[0559]
在某些实施方案中，本文公开的组合物调节氨基酸的血浆水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物调节氨基酸的生物合成或分解代谢。在优选的实施方案中，本文公开的组合物调节脯氨酸的血浆水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物降低脯氨酸的血浆水平。已知升高的脯氨酸会通过增加前额叶皮层中的多巴胺对大脑功能产生负面影响[61]。另外，脯氨酸被认为是一种神经递质，可调节海马体中的谷氨酸能神经传递和大脑其他部位的神经传递。因此，脯氨酸与cns病症和精神病症，特别是精神病有关。在优选的实施方案中，血浆脯氨酸水平的降低治疗或预防cns病症，特别是adhd、ocd、心境障碍、自闭症谱系障碍、精神病和精神分裂症。
[0560]
在某些实施方案中，本文公开的组合物预防、减少或减轻与22q11.2缺失综合征(22q11ds)相关的精神障碍症状，例如精神分裂症和双相障碍[65]。在某些实施方案中，本文公开的组合物改善了患有22q11ds的对象的社会行为和社会认知问题。在优选的实施方案中，本文公开的组合物调节22q11ds对象的相关认知和行为结果。在优选的实施方案中，这些结果的调节是脯氨酸血浆水平降低的结果。在某些实施方案中，本文公开的组合物调节脯氨酸氢化酶的活性。
[0561]
在某些实施方案中，本文公开的组合物调节nmda受体和/或其亚基的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物调节nmda受体2b的水平。在某些实施方案中，本文公开的组合物增加nmda受体2b的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物降低了nmda受体2b的水平。nmda受体的失调与cns病症有关，特别是asd和精神分裂症。有人提出nmda受体拮抗剂可有效治疗asd[62]。另外，抑制nmda受体功能已被证明可以改善社交缺陷并减少丙戊酸诱导的asd模型中的重复行为[63]。在某些实施方案中，本文公开的组合物引起nmda受体2b功能减退。在某些实施方案中，本文公开的组合物引起nmda受体2b功能亢进。在某些实施方案中，本文公开的组合物预防、减少或减轻cns病症的症状，例如作为调节nmda受体2b活性的结果的asd或精神分裂症。在优选的实施方案中，本文公开的组合物抑制nmda受体活性并减少患有cns病症的对象的社交缺陷和刻板行为。
[0562]
在某些实施方案中，本文公开的组合物调节bdnf的水平。在优选的实施方案中，本文公开的组合物降低了bdnf的水平。在某些实施方案中，bdnf的减少局限于杏仁核。对asd人群的荟萃分析表明，与对照组相比，在asd对象中检测到更高水平的bdnf[64]。在优选的实施方案中，本文公开的组合物预防、减少或减轻由于bdnf水平降低而引起的cns病症，特别是asd的症状。bdnf水平的改变与许多神经发育障碍以及精神病和精神分裂症有关。在某些实施方案中，本文公开的组合物调节bdnf水平以预防、减少或减轻神经发育和精神障碍的症状。
[0563]
在优选的实施方案中，本文公开的组合物用于治疗或预防与微生物群-肠-脑轴功能障碍相关的中枢神经系统障碍。除上述实施方案外，本文公开的组合物用于治疗或预防精神病；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)和/或慢性疼痛。在其他实施方案中，本文公开的组合物可用于治疗或预防运动神经元疾病；亨廷顿病；guillain-barre综合征和/或脑膜炎。
[0564]
亨廷顿病是一种遗传性脑部病况，由遗传性缺陷基因引起，该基因会损害大脑中的某些神经细胞。随着时间的推移，这种脑损伤会逐渐恶化，并可能影响运动、认知(感知、意识、思维、判断)和行为。这种疾病的早期特征可能包括性格变化、情绪波动、烦躁的动作、
易怒和行为改变。
[0565]
在某些实施方案中，本文公开的组合物用于治疗或预防亨廷顿病。在某些实施方案中，本文公开的组合物控制亨廷顿病的症状，如易怒或过度运动。在某些实施方案中，本文公开的组合物治疗与亨廷顿病相关的抑郁症和/或改善症状，如社交退缩、缺乏或兴趣和睡眠扰动。在某些实施方案中，本文公开的组合物改善记忆力和专注于任务的能力。在某些实施方案中，本文公开的组合物治疗致残的异常运动。在某些实施方案中，本文公开的组合物治疗与亨廷顿病相关的行为问题、反社会行为、易怒和精神病。在某些实施方案中，本文公开的组合物诱导神经保护并防止神经损伤。在某些实施方案中，本文公开的组合物增加多巴胺的水平和/或含多巴胺的细胞的水平。
[0566]
脑损伤
[0567]
实例证明本发明的组合物具有神经保护作用并具有hdac抑制活性。hdac2是从中风恢复功能的关键靶标[65]，并且hdac抑制可以预防白质损伤[66]，因此本发明的组合物可用于治疗脑损伤。
[0568]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗脑损伤。在一些实施方案中，脑损伤是创伤性脑损伤。在一些实施方案中，脑损伤是后天性脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由外伤引起的脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由肿瘤引起的脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由中风引起的脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由脑出血引起的脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由脑炎引起的脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由脑低氧引起的脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由脑缺氧引起的脑损伤。
[0569]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗中风。实例中显示的效果与中风的治疗特别相关。当流向至少一部分大脑的血流中断时，就会发生中风。如果没有足够的血液供应来为脑组织提供氧气和营养并从脑组织中清除废物，脑细胞就会迅速开始死亡。中风的症状取决于受血流不足影响的大脑区域。症状包括瘫痪、肌肉麻木或虚弱、失去平衡、头晕、突然剧烈头痛、言语障碍、记忆丧失、推理能力丧失、突然混乱、视力障碍、昏迷或甚至死亡。中风也称为脑部发作或脑血管意外(cva)。如果在短时间内恢复足够的血流，中风的症状可能很短暂。然而，如果血流不足的情况持续很长一段时间，则症状可能是永久性的。
[0570]
在一些实施方案中，中风是脑缺血。当流向大脑组织的血流量不足以满足代谢需求时，就会导致脑缺血。在一些实施方案中，脑缺血是局灶性脑缺血，即局限于脑的特定区域。在一些实施方案中，脑缺血是全脑缺血，即包括大面积的脑组织。当脑血管被部分或完全阻塞，从而减少流向大脑特定区域的血液时，通常会发生局灶性脑缺血。在一些实施方案中，局灶性脑缺血是缺血性中风。在一些实施方案中，缺血性中风是血栓形成的，即由血栓或血凝块引起，其在脑血管中发展并限制或阻塞血流。在一些实施方案中，缺血性中风是血栓性中风。在一些实施方案中，缺血性中风是栓塞性的，即由栓塞物或穿过血流并在远离其起源点的部位限制或阻塞血流的未附着块引起。在一些实施方案中，缺血性中风是栓塞性中风。当流向大脑的血流整体受阻或减少时，通常会发生全脑缺血。在一些实施方案中，全脑缺血是由低灌注引起的，即由于休克。在一些实施方案中，全脑缺血是心脏骤停的结果。
[0571]
在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有脑缺血。在一些实施方案中，被
诊断患有脑损伤的对象患有局灶性脑缺血。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有缺血性中风。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有血栓性中风。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有栓塞性中风。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有全脑缺血。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象已遭受低灌注。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象已遭受心脏骤停。
[0572]
在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗脑缺血。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗局灶性脑缺血。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗缺血性中风。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗血栓性中风。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗栓塞性中风。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗全脑缺血。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗低灌注。
[0573]
在一些实施方案中，中风是出血性中风。出血性中风是由脑内或脑周围出血引起的，导致脑细胞和组织肿胀、受压和损伤。出血性中风通常是血管变弱的结果，血管破裂并流血到周围的大脑中。在一些实施方案中，出血性中风是脑内出血，即由脑组织本身内的出血引起。在一些实施方案中，脑出血由实质内出血引起。在一些实施方案中，脑出血由脑室内出血引起。在一些实施方案中，出血性中风是蛛网膜下腔出血，即发生在脑组织外部但仍在颅骨内的出血。在一些实施方案中，出血性中风是脑淀粉样血管病的结果。在一些实施方案中，出血性中风是脑动脉瘤的结果。在一些实施方案中，出血性中风是脑动静脉畸形(avm)的结果。
[0574]
在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有出血性中风。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有脑内出血。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有实质内出血。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有脑室内出血。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有蛛网膜下腔出血。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有脑淀粉样血管病。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有脑动脉瘤。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象患有脑avm。
[0575]
在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗出血性中风。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗脑内出血。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗实质内出血。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗脑室内出血。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗蛛网膜下腔出血。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗脑淀粉样血管病。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗脑动脉瘤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗脑avm。
[0576]
在中断一段时间后恢复足够的血液流向大脑，虽然可以有效缓解与中风相关的症状，但可能自相矛盾地导致对脑组织的进一步损伤。在中断期间，受影响的组织遭受缺乏氧气和营养，并且血流的突然恢复可通过诱导氧化应激导致炎症和氧化损伤。这被称为再灌注损伤，并且不仅在中风之后，而且在心脏病发作或其他组织损伤之后，当血液供应在一段时间的缺血或缺氧后返回组织时都有充分的记录。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的对象由于中风而遭受再灌注损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗由中风引起的再灌注损伤。
[0577]
短暂性脑缺血发作(tia)，通常称为小中风，是公认的更严重中风的警告标示。因此，患有一种或多种tias的对象中风的风险更大。在一些实施方案中，被诊断患有脑损伤的
对象患有tia。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗tia。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗患有tia的对象的脑损伤。
[0578]
高血压、高血胆固醇、中风家族史、心脏病、糖尿病、脑动脉瘤、动静脉畸形、镰状细胞病、血管炎、出血性病症、使用非甾体抗炎药(nsaids)、吸烟、大量饮酒、非法吸毒、肥胖、缺乏身体活动和不健康的饮食都被认为是中风的危险因素。特别地，降低血压已被最终证明可以预防缺血性和出血性中风[67,68]。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗具有至少一种中风危险因素的对象的脑损伤。在一些实施方案中，对象具有两种中风风险因素。在一些实施方案中，对象具有三个中风风险因素。在一些实施方案中，对象具有四种中风风险因素。在一些实施方案中，对象具有多于四种中风风险因素。在一些实施方案中，对象患有高血压。在一些实施方案中，对象具有高血胆固醇。在一些实施方案中，对象具有中风家族史。在一些实施方案中，对象患有心脏病。在一些实施方案中，对象患有糖尿病。在一些实施方案中，对象患有脑动脉瘤。在一些实施方案中，对象具有动静脉畸形。在一些实施方案中，对象患有血管炎。在一些实施方案中，对象患有镰状细胞病。在一些实施方案中，对象患有出血性病症。在一些实施方案中，对象具有非甾体抗炎药(nsaid)使用史。在一些实施方案中，对象吸烟。在一些实施方案中，对象饮用大量酒精。在一些实施方案中，对象使用非法药物。在一些实施方案中，对象是肥胖的。在一些实施方案中，对象超重。在一些实施方案中，对象缺乏身体活动。在一些实施方案中，对象具有不健康的饮食。
[0579]
实例表明，当在损伤事件发生之前给药时，本发明的组合物可用于治疗脑损伤和帮助恢复。因此，当将本发明的组合物给予有脑损伤风险如中风的对象时，本发明的组合物可特别用于治疗脑损伤。
[0580]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于减少由潜在的脑损伤，优选中风引起的损伤。当在潜在的脑损伤发生之前给予组合物时，特别是当给予被确定为有脑损伤风险的患者时，组合物可以减少所造成的损害。
[0581]
实例表明，当在损伤事件发生后给予时，本发明的组合物可用于治疗脑损伤和帮助恢复。因此，当在脑损伤如中风后向对象给药时，本发明的组合物可特别用于治疗脑损伤。
[0582]
在一些实施方案中，本发明的组合物通过减少运动损伤来治疗脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物通过改善运动功能来治疗脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物通过提高肌肉力量来治疗脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物通过改善记忆来治疗脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物通过改善社会认知来治疗脑损伤。在一些实施方案中，本发明的组合物通过改善神经功能来治疗脑损伤。
[0583]
脑损伤的治疗可以指例如减轻症状的严重性。脑损伤的治疗也可以指减少中风后的神经损伤。用于治疗中风的本发明的组合物可以在中风发作之前提供给对象，例如在被确定为有中风风险的患者中。用于治疗中风的本发明组合物可以在中风发生后，例如在恢复期间提供。用于治疗中风的本发明组合物可在恢复的急性期(即中风后长达一周)提供。用于治疗中风的本发明组合物可在恢复的亚急性期(即中风后一周至多达三个月)期间提供。用于治疗中风的本发明组合物可以在恢复的慢性期(从中风后三个月)提供。
[0584]
在某些实施方案中，本发明的组合物与第二活性剂组合使用。在某些实施方案中，本发明的组合物与阿司匹林或组织纤溶酶原激活剂(tpa)联合使用。其他辅助试剂包括其
他抗血小板药物(如氯吡格雷)、抗凝剂(如肝素、华法林、阿哌沙班、达比加群、依度沙班或利伐沙班)、抗高血压药(如利尿剂、ace抑制剂、钙通道阻滞剂、β受体阻滞剂或α受体阻滞剂)或他汀类药物。本发明的组合物可以改善患者对第二活性剂的反应。
[0585]
在某些实施方案中，本发明的组合物降低局部缺血对组织的影响。在某些实施方案中，本发明的组合物减少由局部缺血引起的组织损伤的量。在某些实施方案中，被缺血损伤的组织是脑组织。在某些实施方案中，本发明的组合物减少坏死或坏死细胞的数量。在某些实施方案中，本发明的组合物减少凋亡或凋亡细胞的数量。在某些实施方案中，本发明的组合物减少坏死和凋亡细胞的数量。在某些实施方案中，本发明的组合物防止细胞因坏死和/或凋亡而死亡。在某些实施方案中，本发明的组合物防止因由缺血引起的坏死和/或凋亡而死亡。在某些实施方案中，本发明的组合物改善了受局部缺血损伤的组织的恢复。在某些实施方案中，本发明的组合物提高坏死细胞和/或凋亡细胞的清除速度。在某些实施方案中，本发明的组合物提高了清除坏死细胞和/或凋亡细胞的功效。在某些实施方案中，本发明的组合物改善组织内细胞的替换和/或再生。在某些实施方案中，本发明的组合物改善因局部缺血受损的组织内的细胞的替换和/或再生。在某些实施方案中，本发明的组合物改善组织的整体组织学(例如在活检时)。
[0586]
炎症和自身免疫性病症
[0587]
实例证明本发明的组合物具有hdac抑制活性并且它们还具有抗炎特性。hdac活性是许多炎症性和自身免疫性病症病理学的核心，并且hdac抑制剂已显示出治疗许多炎症性和自身免疫性病症的功效，如下文关于特定病况所讨论的(还参见[69])。因此，本发明的组合物可用于治疗炎性和自身免疫性病症，特别是由组蛋白脱乙酰酶(hdac)活性介导的炎性和自身免疫性病症。
[0588]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防炎性或自身免疫性病症的方法。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防炎症或自身免疫性疾病，其中所述治疗或预防通过减少或预防hdac活化来实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗患有炎症或自身免疫性疾病的患者，其中该患者具有升高的hdac水平或活性。在某些实施方案中，患者可能已被诊断患有慢性炎症或自身免疫性疾病或病况，或者本发明的组合物可用于预防炎症或自身免疫性疾病或病况发展成慢性炎症或自身免疫性疾病或病况。在某些实施方案中，疾病或病况可能对用tnf-α抑制剂治疗没有反应。
[0589]
hdac可能与慢性炎症和自身免疫性疾病有关，因此本发明的组合物可能特别适用于治疗或预防如上所列的慢性疾病或病况。在某些实施方案中，组合物用于患有慢性疾病的患者。在某些实施方案中，组合物用于预防慢性疾病的发展。
[0590]
本发明的组合物可用于治疗由hdac介导的疾病和病况以及解决hdac活化问题，因此本发明的组合物可特别用于治疗或预防慢性疾病、治疗或预防未响应其他疗法(如用tnf-α抑制剂治疗)的患者的疾病，和/或治疗或预防与hdac相关的组织损伤和症状。
[0591]
实例证明本发明的组合物减少il-6的产生和分泌，这可能对治疗炎性和自身免疫性病症特别有用。在某些实施方案中，本发明的组合物用于在疾病治疗中减轻炎症。在某些实施方案中，本发明的组合物减少il-6的产生和分泌。在某些实施方案中，本发明的组合物降低了nfκb启动子的活化。在某些实施方案中，本发明的组合物能够通过有效的促炎性内毒素脂多糖(lps)调节il-6产生的活化。
[0592]
炎性肠病
[0593]
实例证明本发明的组合物具有hdac抑制活性并且它们还具有抗炎特性，并因此它们可用于治疗炎性肠病。不同的hdac同种型的过度表达与多种疾病病理有关，包括结肠炎。另外，在dss-结肠炎小鼠模型中，丙戊酸与i类hdac抑制和结肠炎改善有关[70]。该研究表明hdac i类抑制剂在ifn-γ、il-10、il-1β和tnf-α抑制中的作用，将功能分配给hdac抑制和结肠炎疗效。因此，实例表明本发明的组合物可用于治疗炎性肠病。
[0594]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防炎性肠病。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防炎性肠病，其中所述治疗或预防通过减少或防止hdac活化而实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗患有炎性肠病的患者，其中所述患者具有升高的hdac水平或活性。
[0595]
炎性肠病(ibd)是一种复杂的疾病，可由多种环境和遗传因素引起。导致ibd发病的因素包括饮食、微生物群、肠道通透性和对肠道感染炎症反应增加的遗传易感性。炎性肠病的症状包括腹痛、呕吐、腹泻、直肠出血、骨盆区域中严重的内部痉挛/肌肉痉挛、体重减轻和贫血。在某些实施方案中，组合物用于减轻与ibd相关的一种或多种症状。在某些实施方案中，本发明的组合物用于预防ibd的一种或多种症状。
[0596]
ibd可能伴随其他疾病或病况，如关节炎、坏疽性脓皮病、原发性硬化性胆管炎、非甲状腺疾病综合征、深静脉血栓形成、闭塞性细支气管炎机化性肺炎。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防一种或多种伴随ibd的疾病或病况。
[0597]
炎性肠病通常通过活检或结肠镜检查来诊断。粪便钙卫蛋白的测量可用于ibd的初步诊断。用于诊断ibd的其他实验室检查包括全血细胞计数、红细胞沉降率、综合代谢组、粪便潜血检查或c反应蛋白检查。通常将使用实验室检查和活检/结肠镜检查的组合来确认ibd的诊断。在某些实施方案中，本发明的组合物用于诊断患有ibd的对象。
[0598]
在某些实施方案中，炎性肠病是克罗恩病。研究表明，一些hdacs在克罗恩病患者的炎症性粘膜中上调。因此，抑制hdac活性可用于治疗克罗恩病。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防克罗恩病。
[0599]
克罗恩病是一种复杂的疾病，有一系列可能的原因，包括遗传风险因素、饮食、其他生活方式因素，如吸烟和饮酒，以及微生物群组成。克罗恩病可以出现在沿胃肠道的任何地方。
[0600]
克罗恩病的胃肠道症状从轻微到严重不等，并且包括腹痛、腹泻、粪血、回肠炎、排便增加、肠胃胀气增加、肠狭窄、呕吐和肛周不适。本发明的组合物可用于治疗预防克罗恩病的一种或多种胃肠道症状。
[0601]
克罗恩病的全身症状包括生长缺陷，如青春期无法维持生长、食欲下降、发烧和体重减轻。克罗恩病的肠外特征包括葡萄膜炎、photobia、巩膜外层炎、胆囊结石、血清阴性脊柱关节病、关节炎、附着点炎、结节性红斑、坏疽性脓皮病、深静脉血栓形成、肺栓塞、自身免疫性溶血性贫血、杵状指和骨质疏松症。肠外特征是与克罗恩病相关的另外的病况，表现在胃肠道外。患有克罗恩病的对象也表现出对神经系统并发症的敏感性增加，如癫痫发作、中风、肌病、外周神经病、头痛和抑郁症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防克罗恩病的一种或多种全身症状。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防克罗恩病的一种或多种肠外特征。
[0602]
克罗恩病的诊断通常涉及进行多项检查和外科程序，如胃镜检查和/或结肠镜检查和活检，通常是回肠、放射学检查、全血细胞计数、c反应蛋白测试和红细胞沉降率。在某些实施方案中，本发明的组合物用于被诊断患有克罗恩病的对象。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗已被诊断患有克罗恩病的对象。
[0603]
克罗恩病根据受影响的胃肠道区域的范围进行分类[71]。回肠和结肠的疾病被归类为回结肠克罗恩病。在一些实施方案中，组合物用于治疗或预防回结肠克罗恩病。在一些实施方案中，组合物用于被诊断患有回结肠克罗恩病/如果仅回肠受到影响，则分类克罗恩回肠炎。如果仅影响结肠，则分类克罗恩结肠炎。在某些实施方案中，组合物用于治疗或预防克罗恩回肠炎。在一些实施方案中，组合物用于诊断患有克罗恩回肠炎的对象。在某些实施方案中，组合物用于治疗或预防克罗恩结肠炎。在一些实施方案中，组合物用于被诊断患有克罗恩结肠炎的对象。
[0604]
克罗恩病可以用多种治疗剂治疗，如皮质类固醇，如泼尼松、免疫抑制剂，如硫唑嘌呤，或生物制剂，如英夫利昔单抗、阿达木单抗和戈利木单抗、维多珠单抗和依曲利组单抗(etrolizumab)。在某些实施方案中，本发明的组合物与另外的治疗剂组合用于治疗或预防克罗恩病。在某些实施方案中，另外的治疗剂用于治疗或预防克罗恩病。
[0605]
多发性硬化
[0606]
多发性硬化症(ms)是一种中枢神经系统的自身免疫性炎性病症。可以通过诱导实验性自身免疫性脑脊髓炎(eae)在动物中对ms建模。在患有过继性eae的小鼠中，hdac抑制剂已显示可减轻临床症状并抑制疾病进展(dasgupta et al.,2003,j immunol,170(7),3874-3882)。还显示注射hdac抑制剂可显著降低慢性ms实验模型小鼠的神经损伤和残疾(camelo et al.,2005,j neuroimmunol,164(1-2),10-21)。已提出将抑制hdac活性作为ms的有希望的疗法(gray et al.,2006,epigenetics,1:2,67-75)。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防对象的多发性硬化。
[0607]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防多发性硬化，其中所述治疗或预防通过减少或防止hdac活化来实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗患有多发性硬化的患者，其中所述患者具有升高的hdac水平或活性。
[0608]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防多发性硬化。本发明的组合物可实现hdac抑制，并因此它们可用于治疗或预防多发性硬化。多发性硬化是一种与神经元髓鞘损伤有关的炎性病症，特别是在大脑和脊柱中。多发性硬化症是一种慢性疾病，其使功能逐渐丧失并在发作中演变。
[0609]
在某些实施方案中，用本发明的组合物治疗导致疾病发病率或疾病严重程度降低。在某些实施方案中，本发明的组合物用于降低疾病发病率或疾病严重程度。在某些实施方案中，用本发明的组合物治疗可防止运动功能下降或导致运动功能改善。在某些实施方案中，本发明的组合物用于防止运动功能下降或用于改善运动功能。在某些实施方案中，用本发明的组合物治疗防止麻痹的发展。在某些实施方案中，本发明的组合物用于在治疗多发性硬化中预防麻痹。
[0610]
本发明的组合物可用于调节患者的免疫系统，因此在某些实施方案中，本发明的组合物用于预防已被鉴定为具有多发性硬化风险或已被诊断出患有早期多发性硬化或“缓解后再复发”多发性硬化的患者的多发性硬化。本发明的组合物可用于预防硬化症的发展。
[0611]
本发明的组合物可用于控制或减轻多发性硬化。本发明的组合物可特别用于减轻与多发性硬化相关的症状。多发性硬化的治疗或预防可以指例如减轻症状的严重性或减少对患者来说是问题的恶化频率或触发范围。
[0612]
关节炎
[0613]
关节炎是一种以慢性关节炎症为特征的疾病。类风湿性关节炎是一种慢性自身免疫性病症，通常会导致关节肿胀和疼痛。已经提出抑制hdac以通过多种机制治疗类风湿性关节炎，包括影响细胞因子的产生、抑制t细胞分化、抑制滑膜成纤维细胞的增殖以及通过影响破骨细胞和成骨细胞减少骨质流失(vojinov et al.,2011,mol med,17(5-6)397-403)。在数种关节炎动物模型中，hdac抑制已被证明具有很强的抗炎作用(joosten et al.,2011,mol med,17(5-6),391-396)。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防对象的关节炎。
[0614]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防类风湿性关节炎(ra)。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防类风湿性关节炎，其中所述治疗或预防通过减少或预防hdac活化来实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗患有类风湿性关节炎的患者，其中该患者具有升高的hdac水平或活性。
[0615]
在某些实施方案中，用本发明的组合物治疗导致关节肿胀减少。在某些实施方案中，本发明的组合物用于关节肿胀的患者或鉴定为有关节肿胀风险的患者。在某些实施方案中，本发明的组合物用于减少ra中的关节肿胀的方法。
[0616]
在某些实施方案中，用本发明的组合物治疗导致软骨损伤或骨损伤减少。在某些实施方案中，本发明的组合物用于减少或预防ra治疗中的软骨或骨损伤。在某些实施方案中，组合物用于治疗具有软骨或骨损伤风险的严重ra患者。
[0617]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于在ra的治疗中预防骨侵蚀或软骨损伤。在某些实施方案中，组合物用于治疗表现出骨侵蚀或软骨损伤的患者或鉴定为有骨侵蚀或软骨损伤风险的患者。
[0618]
本发明的组合物可用于调节患者的免疫系统，因此在某些实施方案中，本发明的组合物用于预防已被鉴定为具有ra风险或已被诊断为早期ra的患者中的ra。本发明的组合物可用于预防ra的发展。
[0619]
本发明的组合物可用于控制或减轻ra。本发明的组合物可特别用于减轻与关节肿胀或骨破坏相关的症状。ra的治疗或预防可以指例如减轻症状的严重性或减少恶化的频率或对患者来说是问题的触发范围。
[0620]
哮喘
[0621]
哮喘是一种慢性炎症性呼吸道疾病。hdac抑制剂已被证明具有抗炎作用，可在慢性哮喘小鼠模型中缓解气道炎症、气道重塑和气道超敏反应(ren et al.,2016,inflamm res,65,995-1008)。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防对象的哮喘。
[0622]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防哮喘。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防哮喘，其中所述治疗或预防通过减少或防止hdac活化而实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗哮喘患者，其中所述患者具有升高的hdac水平或活性。
[0623]
在某些实施方案中，哮喘是嗜酸性或过敏性哮喘。嗜酸性哮喘和过敏性哮喘的特
征是外周血和气道分泌物中嗜酸性粒细胞数量增加，且病理学上与基底膜区增厚有关，且药理学上与皮质类固醇反应性有关[72]。减少或抑制嗜酸性粒细胞募集或活化的组合物可用于治疗或预防嗜酸性哮喘和过敏性哮喘。嗜酸性和过敏性哮喘的特征还在于由t辅助2型淋巴细胞(th2)过程介导的级联炎症事件。减少或抑制t辅助2型淋巴细胞(th2)过程的组合物可用于治疗或预防嗜酸性和过敏性哮喘。
[0624]
在另外的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防嗜中性哮喘(或非嗜酸性哮喘)。高中性粒细胞数量与可能对皮质类固醇治疗不敏感的严重哮喘有关。减少或抑制嗜中性粒细胞募集或活化的组合物可用于治疗或预防嗜中性哮喘。
[0625]
嗜酸性哮喘(也称为高th2哮喘)和嗜中性哮喘(也称为低th2或非th2哮喘)具有不同的潜在病理生理机制并呈现不同的临床特征。例如，高th2哮喘通常出现早发并表现出症状的季节性变化，而低th2哮喘发病时间要晚得多，通常在40岁左右或更晚。th2高哮喘的特征还在于免疫球蛋白e(ige)血液水平升高，而th2低哮喘则不存在这一特征。th2高哮喘的特征还在于痰中嗜酸性粒细胞水平高。相比之下，低th2哮喘的特征可能是痰中中性粒细胞水平升高。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗低th2或非th2哮喘。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗高th2哮喘。
[0626]
嗜酸性哮喘和嗜中性哮喘不是相互排斥的病况，且有助于解决嗜酸性粒细胞和嗜中性粒细胞反应的治疗通常可用于治疗哮喘。
[0627]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于在治疗或预防哮喘中降低嗜酸性炎症反应的方法，或用于在治疗或预防哮喘中降低嗜中性炎症反应的方法。如上所述，哮喘中高水平的嗜酸性粒细胞在病理上与基底膜区增厚有关，因此在治疗或预防哮喘中减少嗜酸性炎症反应可能能够专门解决疾病的这一特征。而且，升高的嗜中性粒细胞与升高的嗜酸性粒细胞相结合或在它们不存在的情况下，与严重的哮喘和慢性气道狭窄有关。因此，减少嗜中性炎症反应可能对治疗严重哮喘特别有用。
[0628]
在某些实施方案中，组合物减少过敏性哮喘中的细支气管周围浸润，或用于减少过敏性哮喘治疗中的细支气管周围浸润。在某些实施方案中，组合物减少嗜中性哮喘中的细支气管周围和/或血管周围浸润，或用于在治疗过敏性嗜中性哮喘中减少细支气管周围和/或血管周围浸润。
[0629]
在某些实施方案中，用本发明的组合物治疗提供降低或防止tnfα水平升高。
[0630]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗导致嗜酸性和/或嗜中性炎症反应减少的哮喘的方法。在某些实施方案中，待治疗的患者已经或之前被鉴定为具有升高的嗜中性粒细胞或嗜酸性粒细胞水平，例如通过采血或痰液分析鉴定的。
[0631]
当给予新生儿或孕妇时，本发明的组合物可用于预防新生儿哮喘的发展。组合物可用于预防儿童哮喘的发展。本发明的组合物可用于治疗或预防成人发作哮喘。本发明的组合物可用于控制或减轻哮喘。本发明的组合物可特别用于减轻与由过敏原如屋尘螨加重的哮喘相关的症状。
[0632]
哮喘的治疗或预防可以指例如减轻症状的严重性或减少恶化的频率或对患者来说是个问题的触发因素的范围。
[0633]
银屑病
[0634]
银屑病是一种慢性炎症性皮肤病。据报道，在来自银屑病患者的皮肤活检中hdac1
过度表达(tovar-castillo et al.,2007,int j dermatol,46,239-46)，并且已显示hdac抑制剂可阻断foxp3 tregs转化为foxp3
–
rorγt il-17/tregs(与银屑病进展相关的转变)(bovenschen et al.,2011,j invest dermatol,131,1853-60)。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防对象的银屑病。
[0635]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防银屑病。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防银屑病，其中所述治疗或预防通过减少或防止hdac活化而实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗银屑病患者，其中所述患者具有升高的hdac水平或活性。
[0636]
系统性红斑狼疮
[0637]
系统性红斑狼疮(sle)是一种自身免疫性疾病。基于对sle的细胞培养物和小鼠模型的研究，hdac抑制被认为是治疗sle的有前景的治疗方法(reilly et al.,2011,mol med,17(5-6),417-425)。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防对象的系统性红斑狼疮。
[0638]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防sle。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防sle，其中所述治疗或预防通过减少或防止hdac活化而实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗sle患者，其中所述患者具有升高的hdac水平或活性。
[0639]
同种异体移植排斥
[0640]
当移植组织被接受者的免疫系统排斥时，就会发生同种异体移植排斥。对鼠心脏移植的研究表明，hdac抑制增加了移植内组蛋白3乙酰化，并与相对于对照的移植内foxp3蛋白(参与控制免疫反应的叉头转录家族成员)水平的增加、组织结构的维持和慢性排斥的红斑的缺乏有关(wang et al.,immunol cell biol,1-8)。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防对象的同种异体移植排斥。
[0641]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防同种异体移植排斥。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防同种异体移植排斥，其中所述治疗或预防通过减少或防止hdac活化而实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗同种异体移植排斥患者，其中所述患者具有升高的hdac水平或活性。
[0642]
糖尿病
[0643]
糖尿病是一组疾病，其中低水平的胰岛素和/或外周胰岛素抵抗导致高血糖症。已经提出hdac抑制通过多种机制治疗糖尿病，包括pdx1的去抑制(park et al.,2008,j clin invest,118,2316-24)、增强转录因子ngn3的表达以增加内分泌祖细胞库(haumaitre et al.,2008,mol cell biol,28,6373-83)，和增强胰岛素表达(molsey et al.,2003,j biol chem,278,19660-6)等。hdac抑制也是糖尿病晚期并发症如糖尿病肾病和视网膜缺血的有希望的治疗方法(christensen et al.,2011,mol med,17(5-6),370-390)。因此，本发明的组合物可用于治疗或预防对象的糖尿病。
[0644]
在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防糖尿病。在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防i型糖尿病。在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防ii型糖尿病。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防糖尿病，其中所述治疗或预防通过减少或防止hdac活化而实现。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗糖尿病患者，其中所述患者具有升高的hdac水平或活性。
[0645]
移植物抗宿主病(gvhd)
[0646]
本发明的组合物可用于治疗或预防移植物抗宿主病(gvhd)。gvhd是将异体组织移植到对象体内后的医学并发症。gvhd通常发生在干细胞或骨髓移植或实体器官移植之后，特别是在移植物(即供体)和宿主(即受体)的遗传背景不同的情况下。
[0647]
gvhd的病理生理学包括三个不同的阶段。首先，宿主抗原呈递细胞(apc)，如树突细胞(dc)，在将移植组织识别为外来物质后被激活。apc激活先于效应子免疫细胞如常规细胞毒性t细胞的募集和激活，这会导致外来组织的破坏或排斥。
[0648]
已显示hdac抑制可介导有效的多效抗炎作用，可用于治疗或预防gvhd。hdac抑制可能会抑制gvhd病理生理级联的多个点。例如，hdac抑制通过以stat-3依赖性方式增强吲哚胺2,3-双加氧酶的表达，防止体内针对同种异体组织的抗原呈递细胞和树突细胞活化[73]。hdac对stat-1活性的抑制也已被证明有益于治疗或预防gvhd[74]。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于通过抑制apc活化来治疗或预防gvhd。
[0649]
hdac抑制也被证明可以扩大treg细胞群和体内活性[75]。hdac抑制介导的treg细胞活性上调已显示可抑制常规细胞毒性t细胞活性，其可以用于通过抑制gvhd病理生理级联的第二阶段来治疗或预防gvhd。在某些实施方案中，本发明的组合物用于通过降低常规细胞毒性t细胞活性来治疗或预防gvhd。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于降低常规的细胞毒性t细胞活性。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于通过上调treg细胞活性来治疗或预防gvhd。
[0650]
已显示供体nk细胞通过消除宿主apcs来减少gvhd。已显示hdac抑制可增加nk细胞活性。因此，本发明的组合物可用于增加nk细胞活性，这可用于通过增加apcs的消除来治疗或预防gvhd。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于通过增强宿主apcs的消除来治疗或预防gvhd。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于通过增强nk细胞活性来治疗或预防gvhd。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于通过增强nk细胞活性介导的宿主apcs消除来治疗或预防gvhd。
[0651]
在某些实施方案中，本发明的组合物可以在宿主接受移植后给药。在某些实施方案中，本发明的组合物可以在对象接受移植之前给予宿主。在接受移植之前给予本发明的组合物可用于启动对象的免疫系统以不引发针对移植组织的炎症或自身免疫反应。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于预防或预防gvhd的发作。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于预防性地治疗或预防gvhd。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于预防gvhd。在某些实施方案中，本发明的组合物可用于在对象中预防移植组织排斥的方法。
[0652]
在某些实施方案中，本发明的组合物可用于治疗、延迟、预防或预防急性gvhd的发作。急性gvhd的症状通常在移植的前100天内出现。延迟、治疗或预防急性gvhd可能对帮助移植手术后立即恢复的对象特别有益。在某些实施方案中，组合物可以通过抑制hdac活性来治疗、延迟急性gvhd的发作、预防或预防急性gvhd的发作。在某些实施方案中，组合物可以通过上调treg细胞活性来治疗、延迟急性gvhd的发作、预防或预防急性gvhd的发作。组合物可以通过抑制常规细胞毒性t细胞活性来治疗、延迟急性gvhd的发作、预防或预防急性gvhd的发作。本发明的组合物可以通过增强nk细胞活性来治疗、延迟急性gvhd的发作、预防或预防急性gvhd的发作。本发明的组合物可以通过抑制apc活化来治疗、延迟急性gvhd的发作、预防或预防急性gvhd的发作。
[0653]
在某些实施方案中，当在移植后100天内给予对象时，本发明的组合物可以治疗、延迟急性gvhd的发作、预防或预防急性gvhd的发作。在某些实施方案中，当预防性地给予对象时，例如，当在移植前将组合物给予对象时，本发明的组合物可以治疗、延迟急性gvhd的发作、预防或预防急性gvhd的发作。在某些实施方案中，本发明的组合物可以治疗、延迟持续性、迟发性或复发性急性gvhd，如移植后超过100天发生或复发的急性gvhd的发作、预防或预防持续性、迟发性或复发性急性gvhd，如移植后超过100天发生或复发的急性gvhd的发作。
[0654]
在某些实施方案中，本发明的组合物可以治疗、延迟选自以下的急性gvhd的一种或多种症状的发作、预防或预防选自以下的急性gvhd的一种或多种症状的发作：巨丘疹皮疹、恶心、厌食、腹泻、严重腹痛、肠梗阻和胆汁淤积性高胆红素血症。
[0655]
在某些实施方案中，本发明的组合物可用于治疗、延迟慢性gvhd的发作、预防或预防慢性gvhd的发作。慢性gvhd是一种复杂的多系统病症，可累及任何器官，且通常以纤维化为特征。慢性gvhd可能从急性gvhd演变而来，或者可能在急性gvhd后的一段静止期后出现，或者可能重新出现。移植后的任何时间都可能出现慢性gvhd的症状。在某些实施方案中，组合物可用于通过抑制hdac活性来治疗、预防、预防慢性gvhd的发作或延迟慢性gvhd的发作。组合物可以通过上调treg细胞活性来治疗、延迟慢性gvhd的发作、预防或预防慢性gvhd的发作。组合物可以通过抑制常规的细胞毒性t细胞活性来治疗、延迟慢性gvhd的发作、预防或预防慢性gvhd的发作。本发明的组合物可以通过增强nk细胞活性来治疗、延迟慢性gvhd的发作、预防或预防慢性gvhd的发作。本发明的组合物可以通过抑制apc dc活化来治疗、延迟慢性gvhd的发作、预防或预防慢性gvhd的发作。
[0656]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于给予最近经历过干细胞、骨髓或实体器官移植的患者。在某些实施方案中，本发明的组合物用于给予需要干细胞、骨髓或实体器官移植的患者。
[0657]
在某些实施方案中，本发明的组合物可以治疗、延迟选自以下的慢性gvhd的一种或多种症状的发作、预防或预防选自以下的慢性gvhd的一种或多种症状的发作：色素沉着不良、新发脱发、皮肤异色症、扁平苔藓样皮疹或硬化特征、指甲营养不良或脱落、口干症、口腔溃疡(如口疮性口炎)、口腔苔藓型特征(如苔藓硬化)、角结膜干燥症、干燥综合征、瘢痕性结膜炎、筋膜炎、肌炎、关节僵硬、阴道硬化、溃疡、厌食、体重减轻、食道蹼、黄疸、转氨酶升高(transaminitis)、胸腔积液、闭塞性细支气管炎、肾病综合征、心包炎、血小板减少症、贫血和嗜中性粒细胞减少症。
[0658]
发明人还表明，本发明的组合物可以减少与gvhd相关的结肠炎。结肠炎是在gvhd患者中观察到的炎症副作用。本发明的组合物还可用于治疗患有gvhd的对象的结肠炎症。因此，在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗患有gvhd的对象的结肠炎。在一些实施方案中，本发明的组合物用于降低患有gvhd的对象的结肠炎的严重程度。在一些实施方案中，本发明的组合物用于在治疗gvhd中降低结肠炎的严重程度。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗患有gvhd的对象的结肠炎症。在一些实施方案中，本发明的组合物用于降低患有gvhd的对象的结肠炎症的严重程度。在一些实施方案中，本发明的组合物用于在治疗gvhd中减少结肠炎症。
[0659]
本发明人还发现本发明的组合物可用于维持患有gvhd的对象的肠屏障功能。维持
肠道屏障功能可减少炎症细胞因子通过肠道屏障的易位，该异位加剧gvhd的毒性[76]。在某些实施方案中，本发明的组合物用于在治疗gvhd中维持肠屏障功能。在一些实施方案中，本发明的组合物用于在治疗gvhd中减少炎性细胞因子穿过肠屏障的易位。
[0660]
在某些实施方案中，本发明的组合物可以与一种或多种药理学试剂联合使用以治疗或预防gvhd。在某些实施方案中，一种或多种药理学试剂用于gvhd的药理学预防或治疗。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防正在接受、已经接受或将要接受一种或多种所述药理学试剂的对象的gvhd。在某些实施方案中，一种或多种药剂选自：辛二酰苯胺(suberoylanilide)、vorisnostat、itf2357环孢素(itf2357cyclosporine)、环孢素(ciclosporin)、西罗莫司、喷司他丁、利妥昔单抗、伊马替尼、吗替麦考酚酯、他克莫司、泼尼松、甲氨蝶呤、瑞米干赛-l(remestemcel-l)和prochymal，其中以治疗或预防gvhd的治疗有效量给予所述药剂。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗已经接受、正在接受或将要接受体外光分离置换疗法(extracorporeal photophoreses)的对象的gvhd。
[0661]
行为和精神障碍
[0662]
本发明的组合物可用于减少对象的多动症。多动是行为和精神障碍的一种症状，如注意力缺陷多动障碍(adhd)、创伤后应激障碍、焦虑障碍、双相情感障碍和强迫性障碍。多动可能是激素紊乱的症状，如甲状腺功能亢进、多动和对甲状腺激素的抵抗。多动也可能是神经元病症的症状，如肾上腺脑白质营养不良。多动也可能是多动症、紧张型精神分裂症、神经性厌食症、脆性x综合征(fxs)、苯丙酮尿症(pku)、胎儿酒精综合征(fas)、焦虑、抑郁和tourette综合征的症状。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防行为障碍。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防精神障碍。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗情绪和行为障碍。
[0663]
在某些实施方案中，组合物用于在治疗甲状腺机能亢进或对甲状腺激素的抵抗中降低多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有甲状腺功能亢进或甲状腺激素抵抗的患者的多动症。
[0664]
在某些实施方案中，组合物用于减少肾上腺脑白质营养不良治疗中的多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有肾上腺脑白质营养不良的患者的多动症。
[0665]
在某些实施方案中，组合物用于在治疗紧张型精神分裂症中降低多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有紧张型精神分裂症的患者的多动症。
[0666]
在某些实施方案中，组合物用于在治疗神经性厌食症中降低多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有神经性厌食症的患者的多动症。
[0667]
在某些实施方案中，组合物用于在治疗脆性x综合征中减少多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有脆性x综合征(fxs)的患者的多动症。
[0668]
在某些实施方案中，组合物用于降低苯丙酮尿症治疗中的多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有苯丙酮尿症的患者的多动症。
[0669]
在某些实施方案中，组合物用于减少胎儿酒精综合征治疗中的多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有胎儿酒精综合征的患者的多动症。
[0670]
在某些实施方案中，组合物用于在治疗焦虑中减少多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有焦虑障碍的患者的多动症。
[0671]
在某些实施方案中，组合物用于减少抑郁症治疗中的多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有抑郁症的患者的多动症。
[0672]
在某些实施方案中，组合物用于在治疗tourette综合征中减少多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗诊断患有tourette综合征的患者的多动症。
[0673]
adhd
[0674]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防adhd。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防患有行为障碍的对象的多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防患有adhd的对象的多动症。多动症可以在儿童和成人中表现出来。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防成人的adhd。在一些实施方案中，组合物用于治疗或预防儿童的adhd。
[0675]
在一些实施方案中，组合物用于被诊断患有adhd的对象。adhd的诊断是一项复杂的程序，通常涉及对表现出adhd症状的对象进行心理评估，再加上身体检查和可能的与adhd相关的生物标志物的检测，如血小板单胺氧化酶表达、尿去甲肾上腺素、尿mhpg和尿苯乙胺水平。
[0676]
正式诊断通常由精神科卫生保健专业人员进行。不同的国家使用不同的度量来诊断和分类adhd。在一些国家，诊断和分类是根据美国精神病学协会在精神障碍诊断和统计手册(dsm)中定义的标准进行的。dsm根据对象表现出的一系列症状将adhd分为不同的亚型。adhd可被诊断为注意力不集中为主的adhd类型(adhd-pi)。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防adhd-pi。在一些实施方案中，本发明的组合物用于诊断患有adhd-pi的对象。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有adhd-pi的对象的方法。adhd也可以被诊断为以多动冲动型为主的adhd。在一些实施方案中，组合物用于治疗或预防以多动冲动型为主的adhd。在一些实施方案中，本发明的组合物用于被诊断患有以多动-冲动型为主的adhd的对象。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有以多动冲动型为主的adhd的对象的方法。
[0677]
adhd的症状包括容易分心、健忘、做白日梦、杂乱无章、注意力不集中和难以完成任务、过度烦躁和不安、多动、难以等待和保持坐姿、行为不成熟。也可能存在破坏性行为。对于与adhd相关的症状，它们必须存在六个月以上，并且必须出现在多于一个环境中(如在家中和学校或工作场所)。在某些实施方案中，组合物用于治疗或预防adhd的一种或多种症状。在某些实施方案中，组合物用于治疗或预防表现出一种或多种adhd症状的对象。在一些实施方案中，本发明的组合物用于治疗预防多动症。在一些实施方案中，组合物用于减少对象多动的方法。在一些实施方案中，本发明的组合物用作抗多动症药剂。
[0678]
adhd的其他治疗方法包括心理疗法、行为疗法、认知行为疗法、人际关系心理疗法、兴奋剂药物如哌醋甲酯、非兴奋剂药物如托莫西汀、安非他酮、胍法辛和可乐定。在某些实施方案中，本发明的组合物用于与治疗adhd的另外的方法组合使用。
[0679]
强迫性障碍(ocd)
[0680]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防ocd。在某些实施方案中，组合物用于在治疗ocd中减少多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有ocd的患者的多动症。
[0681]
ocd是一种异质的、慢性的和致残的病症，属于焦虑障碍。根据dsm-iv的定义，ocd
的基本特征是反复出现的强迫观念和/或强迫行为(标准a)，这些强迫观念和/或强迫行为严重且耗时(每天超过一小时)或引起明显痛苦或显著干扰对象的正常日常生活、职业功能、日常社交活动或关系(标准c)。在病症过程中的一些时刻，这个人已经认识到强迫观念或强迫行为是过度的或不合理的(标准b)。
[0682]
强迫观念被定义为反复和持续的想法、冲动或图像，这些想法、冲动或图像被认为是侵入性的和不恰当的，并导致明显的焦虑或痛苦。这些想法、冲动或图像不仅仅是关于现实生活问题的过度担忧，它们被患者认为是他自己思想的产物(例如对于污染的恐惧、对于对称的痴迷)。个人试图用其他一些想法或行为来忽略、抑制或中和对它的痴迷。
[0683]
强迫性障碍被定义为重复行为(例如洗手、订购、囤积、检查)或精神行为(例如祈祷、数数、默默地重复词语)，其使人们感到被驱使以响应强迫性障碍或根据必须僵硬地应用的规则执行。
[0684]
ocd通常与其他精神疾病的共病率有关，包括重性抑郁障碍、其他焦虑障碍(广泛性焦虑障碍、社交焦虑障碍、惊恐障碍)、药物滥用和饮食失调(厌食症和贪食症)。
[0685]
ocd是一种精神病症，可能由于微生物-肠-脑轴功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的ocd。
[0686]
在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻ocd的基本症状特征。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象的反复强迫观念和/或强迫行为。在某些实施方案中，强迫观念是反复出现的或持续的想法、冲动或图像，这些想法、冲动或图像是侵入性的和不适当的，并导致明显的焦虑或痛苦。在某些实施方案中，强迫是对象感到被驱使以响应强迫性障碍或根据必须僵硬地应用的规则执行的重复行为。
[0687]
在某些实施方案中，本发明的组合物根据y-bocs和/或nimh-oc诊断和/或症状量表改善对象的ocd症状。在一些实施方案中，y-bocs量表用于监测主要终点的改善。在一些实施方案中，nimh-oc量表用于监测次要参数的改善。
[0688]
在一些实施方案中，本发明的组合物改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本发明的组合物对患有asds的对象的整体社会功能(关系、工作等)显示出积极影响。在一些实施方案中，整体量表是sheehan失能量表。
[0689]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻ocd的至少一种合并症。ocd的合并症包括重性抑郁障碍、其他焦虑障碍(广泛性焦障碍、社交焦虑障碍、惊恐障碍)、药物滥用和进食障碍(厌食症和贪食症)、gilles de la tourette综合征、adhd(注意力缺陷/多动症)和发育障碍。
[0690]
在一些实施方案中，当与用于治疗ocd的另一种疗法组合使用时，本发明的组合物在预防、减少或减轻ocd方面特别有效。此类疗法包括血清素和多巴胺再摄取抑制剂；氯米帕明和抗精神病药。
[0691]
焦虑障碍
[0692]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防焦虑障碍。在某些实施方案中，组合物用于在治疗焦虑障碍中减少多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗被诊断患有焦虑障碍的患者的多动症。
[0693]
焦虑障碍是一组以焦虑和恐惧感为特征的精神障碍。有许多焦虑障碍，包括广泛
性焦虑障碍(gad)；特定恐惧症；社交焦虑障碍；分离性焦虑障碍；广场恐怖症；惊恐障碍和选择性缄默症。
[0694]
gad的诊断依据dms-5中的六项标准进行。第一项标准是超过六个月的过度焦虑或担忧，其中焦虑或担忧在关于许多活动的大部分时间中都存在。第二项标准是对象不能处理第一项标准的症状。第三项标准是至少出现以下三种(儿童中为一种)：躁动；容易疲倦；注意力不集中；易怒；肌肉紧张和睡眠问题。最后三项标准是症状导致严重的社会、职业和功能障碍；症状不是由药物治疗、药物或其他身体健康问题引起的；并且这些症状与另一种精神问题如惊恐障碍不更好地相符。所有其他焦虑障碍均可被视为gad的差别诊断。
[0695]
gad经常与包括抑郁症；物质使用障碍；压力；ibs；失眠；头痛；疼痛；心脏事件；人际关系问题和adhd在内的多种其他精神障碍关联为并存病。
[0696]
焦虑障碍是可能由于微生物群-肠-脑轴功能异常而发展或持续存在的精神障碍。因此，在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的焦虑障碍。在某些实施方案中，焦虑障碍是广泛性焦虑障碍(gad)；特定恐惧症；社交焦虑障碍；分离性焦虑障碍；广场恐怖症；惊恐障碍和选择性缄默症。
[0697]
在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象的一种或多种gad症状，如本文所列dms-5标准分类的。根据dms-5，相同的症状与其他焦虑障碍有关。因此，在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象焦虑障碍的一种或多种症状。在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象的焦虑或忧虑。在某些实施方案中，本发明的组合物在六个月时间段内减少症状的发生。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻不安；疲劳；注意力不集中；易怒；肌肉紧张；和/或睡眠问题。在一些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻与焦虑障碍相关的社交、职业和功能障碍。
[0698]
在一些实施方案中，本发明的组合物根据症状或诊断量表改善焦虑障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估症状改善的量表包括hamilton焦虑评定量表(ham-a)。在一些实施方案中，ham-a总量表用于评估主要终点。在其他实施方案中，ham-a精神焦虑因子可用作次要终点。
[0699]
在一些实施方案中，本发明的组合物改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象
–
整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本发明的组合物对患有焦虑障碍的对象的整体社会、职业和功能障碍表现出积极作用。在一些实施方案中，整体量表是sheehan失能量表。
[0700]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻gad和焦虑障碍的至少一种共病。gad的并存病包括抑郁症；物质使用障碍；压力；ibs；失眠；头痛；疼痛；心脏事件；人际关系问题和adhd。
[0701]
在一些实施方案中，当与用于治疗焦虑障碍的另一种疗法组合使用时，本发明的组合物在预防、减少或减轻焦虑障碍方面特别有效。此类疗法包括选择性血清素再摄取抑制剂(文拉法辛、度洛西汀、依他普仑和帕罗西汀)；苯二氮卓类药物(阿普唑仑、劳拉西泮和氯硝西泮)；普瑞巴林和加巴喷丁5-羟色胺受体部分激动剂(丁螺环酮和坦度螺酮)；非典型5-羟色胺能抗抑郁药(如丙咪嗪和氯米帕明)；单胺氧化酶抑制剂(maois)(如吗氯贝胺和苯乙肼)；羟嗪；心得安；可乐定；胍法辛和哌唑嗪。
[0702]
创伤后应激障碍(ptsd)
[0703]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防ptsd。在某些实施方案中，组合物用于在治疗ptsd中减少多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗诊断患有ptsd的患者的多动症。
[0704]
ptsd是一种严重且致残的病症，其基本特征是将创伤性事件包括为该病症的诱发因素。
[0705]
根据dms-v标准，ptsd的症状分为四个主要类别：(i)侵扰：实例包括噩梦、对创伤事件的不想要的想法、闪回以及对创伤提示的情绪困扰或生理反应的反应；(ii)回避：实例包括避免触发创伤性记忆，包括地点、对话或其他提醒；(iii)认知和情绪的负面改变：实例包括关于创伤事件对自我或他人的扭曲责备、对自己或世界的负面信念、持续的负面情绪(例如，恐惧、内疚、羞耻)、疏离感和情感受限(例如，无法体验积极情绪)；(iv)觉醒和反应的改变：实例包括愤怒、鲁莽或自毁行为、睡眠问题、注意力问题、惊吓反应增加和过度警觉。
[0706]
在创伤事件发生后4周内消退的症状符合急性应激障碍的标准。dsm区分急性(症状持续时间少于3个月)和慢性ptsd(症状持续时间超过3个月)。如果症状在压力源后6个月以上开始出现，则该病症被定义为延发性ptsd。
[0707]
ptsd携带重性抑郁障碍和物质使用障碍的高并存病。
[0708]
ptsd是一种精神障碍，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的ptsd。根据类似的发病机制，在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防应激障碍。在某些实施方案中，本发明的组合物治疗急性应激障碍。在一些实施方案中，本发明的组合物治疗急性和/或慢性ptsd。在一些实施方案中，本发明的组合物治疗延迟发作的ptsd。
[0709]
在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象中的一种或多种ptsd(或应激障碍)症状，如本文所列dms-5标准分类的。在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻患有ptsd的对象的侵入性想法。在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻患有ptsd的对象的回避行为。在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻ptsd对象的认知和情绪的负面改变。在优选的实施方案中，本发明的组合物防止ptsd对象的觉醒和反应性改变。
[0710]
在一些实施方案中，本发明的组合物根据症状或诊断量表改善ptsd和应激障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估症状改善的量表是临床管理的ptsd(caps)量表。
[0711]
在一些实施方案中，本发明的组合物改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象
–
整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本发明的组合物对患有ptsd和应激障碍的对象的整体社会、职业和功能障碍表现出积极作用。在一些实施方案中，整体量表是sheehan失能量表。
[0712]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻ptsd和应激障碍的至少一种共病。ptsd和压力障碍的并存病包括mdd、物质使用障碍；压力和焦虑。
[0713]
在一些实施方案中，当与用于治疗ptsd和应激障碍的另一种疗法组合使用时，本发明的组合物在预防、减少或减轻ptsd和应激障碍方面特别有效。此类疗法包括血清素能试剂、三环类抗抑郁药、情绪稳定剂、肾上腺素能抑制剂、抗精神病药、苯二氮卓类药物、舍曲林氟西汀和/或帕罗西汀
[0714]
双相障碍
[0715]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防双相障碍。在某些实施方案中，组合物用于在治疗双相障碍中减少多动症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗诊断患有双相障碍的患者的多动症。
[0716]
双相障碍通常是一种慢性疾病。躁狂是双相障碍的主要症状。根据躁狂和抑郁发作的特定持续时间和模式，有数种类型的双相障碍。在dms-5中，区分了双相i型障碍、双相ii型障碍、循环障碍、快速循环双相障碍和双相障碍nos。
[0717]
根据dsm，躁狂症是一个明显的异常和持续升高、膨胀或易怒情绪的时期。发作必须持续一周，并且情绪必须至少具有以下症状中的三种：自尊心高；减少睡眠需求；提高语速；想法的快速跳跃；容易分心；对目标或活动的兴趣增加；精神运动激动；增加对具有高危险风险的活动的追求。
[0718]
双相i型障碍包括一次或多次躁狂或混合(躁狂和抑郁)发作和至少一次重度抑郁发作(有关mdd发作的症状见上文)。双相ii型障碍有一次或多次重度抑郁发作并伴有至少一次轻躁狂发作。没有躁狂或混合发作。轻躁狂是一种较轻的躁狂形式。这些症状是造成重大社会、职业和功能障碍的原因。循环性精神病的特征是随着轻躁狂期的改变而改变低水平的抑郁症。在可以做出诊断之前，成人的症状必须至少存在两年，或儿童的症状必须至少存在一年。成人和儿童的无症状期分别持续不超过两个月或一个月。快速循环双相障碍是一种严重的双相障碍形式。当一个人在一年内至少有四次重度抑郁症、躁狂症、轻躁狂症或混合状态发作时，就会发生此病况。未另外指定(nos)双相障碍对不明确适合其他类型的双相症状进行分类。当存在多种双相症状但不足以满足任何其他亚型的标签时，即可诊断为nos。
[0719]
双相障碍与以下并存病有关：adhd；焦虑障碍；物质障碍；肥胖和代谢综合征。
[0720]
双相障碍是一种精神障碍，可能由于微生物群-肠-脑轴的功能障碍而发展或持续存在。因此，在优选的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对象的双相障碍。在某些实施方案中，双相障碍是双相i型障碍。在某些实施方案中，双相障碍是双相ii型障碍。在某些实施方案中，双相障碍是循环性障碍。在某些实施方案中，双相障碍是快速循环双相障碍。在某些实施方案中，双相情感障碍是双相障碍nos。
[0721]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象中双相障碍的一种或多种症状。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象躁狂发作的发生。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻异常和持续升高、膨胀或易激惹的情绪的发生。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻以下一种或多种症状：高自尊；减少睡眠需求；提高语速；想法的快速跳跃；容易分心；对目标或活动的兴趣增加；精神运动激越；增加对具有高危险风险的活动的追求。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻对象中一种或多种躁狂或混合发作的发生。在某些实施方案中，本发明的组合物减少对象中至少一次重度抑郁发作的发生。在某些实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻至少一次伴有至少一次轻躁狂发作的重度抑郁发作的发生。
[0722]
在优选的实施方案中，本发明的组合物治疗双相障碍的急性期和/或预防进一步发作的发生。在某些实施方案中，本发明的组合物治疗患有双相障碍的对象的躁狂/抑郁发作的急性期并防止进一步的躁狂/抑郁发作的发生。
[0723]
在一些实施方案中，本发明的组合物根据症状或诊断量表改善双相障碍的症状。在某些实施方案中，用于评估躁狂发作症状改善的量表是躁狂状态评定量表和青年躁狂评定量表。在某些实施方案中，量表是bech-rafaelsen躁狂量表(brmas)。在某些实施方案中，用于评估从躁狂发作转变为抑郁发作的症状改善的量表包括hamilton抑郁评定量表、montgomery-asberg评定量表和bech rafaelsen抑郁量表。
[0724]
在一些实施方案中，本发明的组合物改善了用于评估精神和神经障碍的临床整体印象-整体改善(cgi-i)量表。在一些实施方案中，本发明的组合物对双相障碍对象的整体社会、职业和功能障碍表现出积极作用。
[0725]
在优选的实施方案中，本发明的组合物预防、减少或减轻双相障碍的至少一种共病。在某些实施方案中，共病选自adhd、焦虑障碍、物质障碍、肥胖症和代谢综合征。
[0726]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防对锂和双丙戊酸钠无反应的躁狂抑郁病和双相障碍。
[0727]
在一些实施方案中，当与用于治疗双相障碍的另一种疗法组合使用时，本发明的组合物在预防、减少或减轻双相障碍方面特别有效。在某些实施方案中，此类疗法包括碳酸锂、抗惊厥药(包括丙戊酸盐、双丙戊酸钠、卡马西平和拉莫三嗪)和抗精神病药(包括阿立哌唑、奥氮平、喹硫平和利培酮)。
[0728]
癌症
[0729]
hdac功能和表达在多种癌症中受到干扰，且通常导致预后不良。癌症中的hdac功能与促进细胞增殖和致瘤表型的基因的异常表达或功能有关。在某些癌症中，hdacs主要调节癌症的发作并被描述为癌基因。在其他癌症中，肿瘤融合蛋白募集i类hdacs来抑制调节细胞分化或细胞周期控制的基因的表达，从而导致细胞转化。hdac表达的敲低或抑制已被证明具有多种抗癌作用，如细胞周期停滞和增殖、凋亡、分化和衰老以及血管生成的破坏的抑制。因此，本发明的组合物可用于通过抑制hdac活性来治疗由hdac活性介导的癌症。
[0730]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防癌症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防由hdac活性介导的癌症。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防结直肠癌。
[0731]
在某些实施方案中，用本发明的组合物治疗导致肿瘤大小减小或肿瘤生长减少。在某些实施方案中，本发明的组合物用于减小肿瘤大小或减少肿瘤生长。本发明的组合物可有效减少肿瘤大小或生长。在某些实施方案中，本发明的组合物用于实体瘤患者。在某些实施方案中，本发明的组合物用于减少或预防癌症治疗中的血管生成。受hdacs调控的基因在血管生成中起核心作用。在某些实施方案中，本发明的组合物用于预防转移。
[0732]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防胃癌。hdac2已被证明在胃癌的发展和结直肠肿瘤发生中发挥功能性作用[77,78]。在结直肠癌的小鼠模型中，抑制hdac2导致降低肿瘤发展的速度。在某些实施方案中，选择性抑制hdac2的本发明组合物用于治疗或预防结肠直肠癌，特别是由hdac2活性介导的结肠直肠癌。
[0733]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防乳腺癌。本发明的组合物可有效治疗乳腺癌，并且已显示hdacs在乳腺癌中上调[79]。在某些实施方案中，本发明的组合物用于在治疗乳腺癌中减少肿瘤大小、减少肿瘤生长或减少血管生成。
[0734]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防前列腺癌。本发明的组合物
可有效治疗前列腺癌，因为hdac活性在前列腺癌的发展中起主要作用[80]。在某些实施方案中，本发明的组合物用于在前列腺癌的治疗中减少肿瘤大小、减少肿瘤生长或减少血管生成。在某些实施方案中，癌症是激素难治性前列腺癌。
[0735]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防肺癌。本发明的组合物可有效治疗肺癌，并且已显示hdacs在肺癌中上调[81]。在某些实施方案中，本发明的组合物用于在肺癌的治疗中减小肿瘤大小、减少肿瘤生长或减少血管生成。在优选的实施方案中，癌症是肺癌。在优选的实施方案中，组合物用于治疗具有高水平hdac2表达的肺癌。某些肺癌组织已显示大量表达hdac2。hdac2的失活抑制了肺癌细胞的生长。已显示高水平的hdac2活性可抑制p53活性[82]。活性p53阻止细胞分裂并最终导致细胞凋亡的发生。在某些实施方案中，抑制hdac2的本发明组合物用于治疗具有高水平hdac2活性的肺癌。
[0736]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防肝癌。本发明的组合物可有效治疗肝癌，并且已显示hdacs在肝癌中上调[83]。在某些实施方案中，本发明的组合物用于在肝癌的治疗中减小肿瘤大小、减少肿瘤生长或减少血管生成。在优选的实施方案中，癌症是肝癌(肝细胞癌)。在某些实施方案中，癌症是低级别或早期肿瘤。
[0737]
在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防癌症。本发明的组合物对于治疗癌症可能特别有效。在某些实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防非免疫原性癌症。本发明的组合物可有效治疗非免疫原性癌症。
[0738]
在其他的实施方案中，本发明的组合物用于治疗或预防急性淋巴细胞性白血病(all)、急性髓性白血病、肾上腺皮质癌、基底细胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨肿瘤、骨肉瘤/恶性纤维组织细胞瘤、脑干胶质瘤、脑肿瘤、小脑星形细胞瘤、脑星形细胞瘤/恶性胶质瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、幕上原始神经外胚层肿瘤、乳腺癌、支气管腺瘤/类癌、伯基特淋巴瘤、类癌瘤、宫颈癌、慢性淋巴细胞白血病、慢性骨髓性白血病、慢性骨髓增生性病症、结肠癌、皮肤t细胞淋巴瘤、子宫内膜癌、室管膜瘤、食道癌、尤文氏肉瘤、眼内黑色素瘤、视网膜母细胞瘤、胆囊癌、胃癌、胃肠道类癌瘤、胃肠道间质瘤(gist)、生殖细胞肿瘤、神经胶质瘤、儿童视觉通路和下丘脑、霍奇金淋巴瘤、黑色素瘤、胰岛细胞癌、卡波西肉瘤、肾细胞癌、喉癌、白血病、淋巴瘤、间皮瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、口咽癌、骨肉瘤、卵巢癌、胰腺癌、甲状旁腺癌、咽癌、垂体腺瘤、浆细胞瘤、前列腺癌、肾细胞癌、视网膜母细胞瘤、肉瘤、睾丸癌、甲状腺癌或子宫癌。
[0739]
当与其他治疗剂组合使用时，本发明的组合物可能特别有效。当与更直接的抗癌剂组合时，本发明的组合物的hdac抑制作用可能是有效的。因此，在某些实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌属细菌菌株和抗癌剂的组合物。在优选的实施方案中，抗癌剂是免疫检查点抑制剂、靶向抗体免疫疗法、car-t细胞疗法、溶瘤病毒或细胞抑制药物。在优选的实施方案中，组合物包含选自以下的抗癌剂：yervoy(伊匹单抗,bms)；keytruda(派姆单抗,merck)；opdivo(纳武单抗,bms)；medi4736(az/medimmune)；mpdl3280a(roche/genentech)；tremelimumab(az/medimmune)；ct-011(匹地利珠单抗,curetech)；bms-986015(lirilumab,bms)；medi0680(az/medimmune)；msb-0010718c(merck)；pf-05082566(pfizer)；medi6469(az/medimmune)；bms-986016(bms)；bms-663513(乌瑞芦单抗,bms)；imp321(prima biomed)；lag525(novartis)；argx-110(argen-x)；pf-05082466(pfizer)；cdx-1127(伐立鲁单抗；celldex therapeutics)；trx-518(gitr inc.)；mk-4166(merck)；
jtx-2011(jounce therapeutics)；argx-115(argen-x)；nlg-9189(indoximod,newlink genetics)；incb024360(incyte)；iph2201(innate immotherapeutics/az)；nlg-919(newlink genetics)；抗vista(jnj)；epacadostat(incb24360,incyte)；f001287(flexus/bms)；cp 870893(university of pennsylvania)；mga271(macrogenix)；emactuzumab(roche/genentech)；galunisertib(eli lilly)；ulocuplumab(bms)；bkt140/bl8040(biokine therapeutics)；bavituximab(peregrine pharmaceuticals)；cc 90002(celgene)；852a(pfizer)；vtx-2337(ventirx pharmaceuticals)；imo-2055(hybridon,idera pharmaceuticals)；ly2157299(eli lilly)；ew-7197(ewha women's university，韩国)；vemurafenib(plexxikon)；dabrafenib(genentech/gsk)；bms-777607(bms)；blz945(memorial sloan-kettering cancer centre)；unituxin(地努妥昔单抗,united therapeutics corporation)；blincyto(博纳吐单抗,amgen)；cyramza(雷莫芦单抗,eli lilly)；gazyva(奥比妥珠单抗,roche/biogen)；kadcyla(曲妥珠单抗-美坦新偶联物,roche/genentech)；perjeta(帕妥珠单抗,roche/genentech)；adcetris(维布妥昔单抗,takeda/millennium)；arzerra(奥法木单抗,gsk)；vectibix(帕尼单抗,amgen)；avastin(贝伐珠单抗,roche/genentech)；erbitux(西妥昔单抗,bms/merck)；bexxar(托西莫单抗-i131,gsk)；zevalin(替伊莫单抗,biogen)；campath(阿仑单抗,bayer)；mylotarg(吉妥单抗,pfizer)；herceptin(曲妥珠单抗,roche/genentech)；rituxan(利妥昔单抗,genentech/biogen)；伏洛昔单抗(abbvie)；依那妥组单抗(abbvie)；abt-414(abbvie)；埃罗妥珠单抗(abbvie/bms)；alx-0141(ablynx)；奥扎利单抗(ozaralizumab)(ablynx)；actimab-c(actinium)；actimab-p(actinium)；米拉妥珠单抗(milatuzumab)(actinium)；emab-sn-38(actinium)；埃托-那普妥莫单抗(naptumonmab estafenatox)(active biotech)；afm13(affimed)；afm11(affimed)；ags-16c3f(agensys)；ags-16m8f(agensys)；ags-22me(agensys)；ags-15me(agensys)；gs-67e(agensys)；alxn6000(沙马组单抗,alexion)；alt-836(altor bioscience)；alt-801(altor bioscience)；alt-803(altor bioscience)；amg780(amgen)；amg 228(amgen)；amg820(amgen)；amg172(amgen)；amg595(amgen)；amg110(amgen)；amg232(阿德木单抗,amgen)；amg211(amgen/medimmune)；bay20-10112(amgen/bayer)；利妥木单抗(amgen)；地诺单抗(amgen)；amp-514(amgen)；medi575(az/medimmune)；medi3617(az/medimmune)；medi6383(az/medimmune)；medi551(az/medimmune)；moxetumomab pasudotox(az/medimmune)；medi565(az/medimmune)；medi0639(az/medimmune)；medi0680(az/medimmune)；medi562(az/medimmune)；av-380(aveo)；av203(aveo)；av299(aveo)；bay79-4620(bayer)；雷星-阿奈妥单抗(bayer)；万替妥单抗(bayer)；bay94-9343(bayer)；西罗珠单抗(boehringer ingleheim)；bi-836845(boehringer ingleheim)；b-701(bioclin)；biib015(biogen)；阿托珠单抗(obinutuzumab)(biogen/genentech)；bi-505(bioinvent)；bi-1206(bioinvent)；tb-403(bioinvent)；bt-062(biotest)bil-010t(biosceptre)；mdx-1203(bms)；mdx-1204(bms)；耐昔妥珠单抗(bms)；can-4(cantargia ab)；cdx-011(celldex)；cdx1401(celldex)；cdx301(celldex)；u3-1565(daiichi sankyo)；帕曲妥单抗(patritumab)(daiichi sankyo)；替加组单抗(daiichi sankyo)；尼妥珠单抗(daiichi sankyo)；ds-8895(daiichi sankyo)；ds-8873(daiichi sankyo)；ds-5573(daiichi sankyo)；morab-004(eisai)；
pharmaceuticals)；attck20(unum therapeutics)；car-nkg2d(celyad)；onyx-015(onyx pharmaceuticals)；h101(shanghai sunwaybio)；dnx-2401(dnatrix)；vcn-01(vcn biosciences)；colo-ad1(psioxus therapeutics)；prostatak(advantagene)；oncos-102(oncos therapeutics)；cg0070(cold genesys)；pexa-vac(jx-594,jennerex biotherapeutics)；gl-onc1(genelux)；t-vec(amgen)；g207(medigene)；hf10(takara bio)；seprehvir(hsv1716,virttu biologics)；orienx010(oriengene biotechnology)；reolysin(oncolytics biotech)；svv-001(neotropix)；cacatak(cva21,viralytics)；alimta(eli lilly)、顺铂、奥沙利铂、伊立替康、亚叶酸、甲氨蝶呤、环磷酰胺、5-氟尿嘧啶、zykadia(novartis)、tafinlar(gsk)、xalkori(pfizer)、iressa(az)、gilotrif(boehringer ingelheim)、tarceva(astellas pharma)、halaven(eisai pharma)、veliparib(abbvie)、azd9291(az)、阿来替尼(chugai)、ldk378(novartis)、genetespib(synta pharma)、tergenpumatucel-l(newlink genetics)、gv1001(kael-gemvax)、tivantinib(arqule)；cytoxan(bms)；oncovin(eli lilly)；阿霉素(pfizer)；gemzar(eli lilly)；xeloda(roche)；ixempra(bms)；abraxane(celgene)；trelstar(debiopharm)；taxotere(sanofi)；nexavar(bayer)；immu-132(immunomedics)；e7449(eisai)；thermodox(celsion)；cometriq(exellxis)；lonsurf(taiho pharmaceuticals)；camptosar(pfizer)；uft(taiho pharmaceuticals)；和ts-1(taiho pharmaceuticals)。
[0740]
给药模式
[0741]
优选地，将本发明的组合物施用至胃肠道，以使本发明的细菌菌株能够递送到和/或部分或全部在肠内定殖。优选地，本发明的组合物被配制成施用至胃肠道，以使本发明的细菌菌株能够递送至和/或部分或全部定殖于肠道。在一些实施方案中，术语“肠道的总定殖”意指细菌已定殖于肠道的所有部分(即小肠、大肠和直肠)。在本发明的其他实施方案中，术语“完全定殖”或“部分定殖”意指细菌分别永久地或暂时地保留在肠中。通常，本发明的组合物经口施用，但它们可以通过直肠、鼻内或经颊或舌下途径施用。换言之，细菌可能已经定殖在一些或全部胃肠道和/或这种定殖可能是暂时的或永久的。
[0742]
更具体地，在一些实施方案中，“肠道的总定殖”意指细菌已定殖于肠道的所有部分(即小肠、大肠和直肠)。另外或可选地，术语“完全定殖”意指细菌永久地移入肠道的一些或所有部分。
[0743]
在一些实施方案中，“肠的部分定殖”意指细菌已定殖于肠道的一些但不是全部部分。另外或可选地，术语“部分定殖”意指细菌在肠的一些或所有部分中瞬时移入。
[0744]
可以通过在给药间隔结束后定期(例如每天)评估(例如在粪便样品中)本发明的细菌菌株的丰度来确定殖入的短暂性，以确定清除期，即在给药间隔结束之间的时期，并且不存在可检测水平的本发明的细菌菌株。在本发明的实施方案中，洗脱期为14天或更少、12天或更少、10天或更少、7天或更少、4天或更少、3天或更少、2天或更少或1天或更少。
[0745]
在本发明的实施方案中，本发明的细菌瞬时移入大肠中。
[0746]
在某些实施方案中，本发明的组合物可以作为泡沫、喷雾或凝胶给药。
[0747]
在某些实施方案中，本发明的组合物可以作为栓剂给药，如直肠栓剂，例如以可可油(可可脂)、合成硬脂(例如suppocire、witepsol)、甘油-明胶、聚乙二醇，或肥皂甘油组合物的形式。
[0748]
在某些实施方案中，本发明的组合物经由管，如鼻胃管、口胃管、胃管、空肠造口管(j管)、经皮内窥镜胃造口术(peg)或端口施用至胃肠道，如提供进入胃、空肠和其他合适的进入端口的胸壁端口。
[0749]
本发明的组合物可以给药一次，或者它们可以作为治疗方案的一部分依次给药。在某些实施方案中，本发明的组合物将每天给药(一次或数次)。在某些实施方案中，本文公开的组合物定期给药，如每天、每两天或每周，持续延长的时间段，如至少一周、两周、一个月、两个月、六个月，或一年。
[0750]
在一些实施方案中，本文公开的组合物给药7天、14天、16天、21天或28天或不超过7天、14天、16天、21天或28天。例如，在一些实施方案中，本文公开的组合物给药16天。
[0751]
在本发明的某些实施方案中，根据本发明的治疗伴随着对患者肠道微生物群的评估。如果未实现本发明菌株的递送和/或部分或全部定殖以致未观察到功效，则可以重复治疗，或者如果递送和/或部分或全部定殖成功并且观察到功效，则可以停止治疗。
[0752]
在某些实施方案中，本发明的组合物可以给予怀孕的动物，例如哺乳动物，如人，以预防炎症或自身免疫疾病；或在她的孩子在子宫内和/或出生后出现的中枢神经系统障碍或病况(如本文所公开的那些)。
[0753]
本发明的组合物可给予至已被诊断患有以下疾病或病况的患者：由组蛋白去乙酰化酶活性介导的疾病或病况，或已被鉴定为处于由组蛋白去乙酰化酶活性介导的疾病或病况风险中的患者；或中枢神经系统障碍或病况(如本文公开的那些)。组合物也可以作为预防措施给药，以防止健康患者中由组蛋白脱乙酰酶活性介导的疾病或病况的发展。
[0754]
本文公开的组合物可给予至已被诊断患有中枢神经系统障碍或病况，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍或病况，或已被鉴定为存在中枢神经系统障碍或病况风险，特别是由微生物-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍或病况的患者。组合物也可以作为预防措施给药以预防健康患者中中枢神经系统障碍或病况，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍或病况的发展。
[0755]
本发明的组合物可以给予至已被鉴定为具有异常肠道微生物群的患者。例如，患者可能已经减少或没有厌氧棒杆菌定殖，尤其是anaerostipes hadrus；和/或真杆菌或faecalicatena，特别是卡兰德真杆菌定殖。
[0756]
本发明的组合物可以作为食品，如营养补充剂给药。
[0757]
通常，本发明的组合物用于预防或治疗人类疾病，尽管它们可用于治疗包括单胃哺乳动物如家禽、猪、猫、狗、马或兔的动物。本发明的组合物可用于增强动物的生长和性能。如果对动物给药，可以使用口服管饲法。
[0758]
在一些实施方案中，要给予组合物的对象是成年人。在一些实施方案中，要给予组合物的的对象是人类婴儿。
[0759]
组合物
[0760]
本发明的组合物包含细菌。在本发明的优选实施方案中，将组合物配制成冻干形式。本发明的组合物可以包含颗粒或明胶胶囊，例如硬明胶胶囊，其包含本发明的细菌菌株。
[0761]
优选地，本发明的组合物包含冻干细菌。细菌的冻干是一种成熟的程序，且相关指南可在例如参考文献[84,86]中获得。实例表明冻干组合物特别有效。
[0762]
可选地，本发明的组合物可包含活的、活跃的细菌培养物。实例证明本发明细菌的培养物具有治疗效果。
[0763]
在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株未被灭活，例如，未经热灭活。在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株本发明未被杀死，例如，未经热杀灭。在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株未被减毒，例如，未经热减毒。例如，在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株未被杀死、灭活和/或减毒。例如，在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株本发明是活的。例如，在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株是有活力的。例如，在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株能够部分或全部定殖肠道。例如，在一些实施方案中，本发明组合物中的细菌菌株是有活力的，并且能够部分或全部定殖肠道。
[0764]
在一些实施方案中，组合物包含活细菌菌株和已被杀死的细菌菌株的混合物。在优选的实施方案中，本发明的组合物被封装以使细菌菌株能够递送至肠。包封保护组合物免于降解，直到通过例如可能由ph变化触发的化学或物理刺激如压力、酶活性或物理分解而在目标位置递送。可以使用任何适当的封装方法。示例性的包封技术包括在多孔基质内的截留、在固体载体表面上的附着或吸附、通过絮凝或利用交联剂的自聚集以及微孔膜或微胶囊后面的机械密封。可用于制备本发明组合物的包封指南可在例如参考文献[87]和[88]中获得。
[0765]
组合物可以经口给药并且可以是片剂、胶囊或粉末的形式。封装产品是优选的，因为厌氧棒杆菌和真杆菌属细菌是厌氧菌，而faecalicatena是专性厌氧菌。
[0766]
组合物可以经口给药并且可以是片剂、胶囊或粉末的形式。封装产品是优选的，因为厌氧棒杆菌是厌氧菌，且真杆菌是厌氧菌，而faecalicatena是专性厌氧菌。可以包括其他成分(诸如例如维生素c)作为除氧剂和益生元底物，以改善体内的递送和/或部分或全部定殖和存活。可选地，本发明的益生菌组合物可以作为食品或营养产品，如基于牛奶或乳清的发酵乳制品，或作为药物产品经口给药。
[0767]
组合物可以配制成益生菌。
[0768]
本发明的组合物包括治疗有效量的本发明的细菌菌株。治疗有效量的细菌菌株足以对患者产生有益效果。治疗有效量的细菌菌株可能足以导致患者肠道的递送和/或部分或全部定殖。
[0769]
适合的细菌日剂量，例如对于成年人来说，可以是约1x103至约1x10
11
个菌落形成单位(cfu)；例如，约1x107至约1x10
10
个cfu；在另一个实例中，约1x106至约1x10
10
个cfu；在另一个实例中，约1x107至约1x10
11
个cfu；在另一个实例中，约1x108至约1x10
10
个cfu；在另一个实例中，约1x108至约1x10
11
个cfu。
[0770]
在某些实施方案中，细菌的剂量是每天至少109个细胞，如每天至少10
10
个、至少10
11
个或至少10
12
个细胞。
[0771]
在某些实施方案中，组合物的剂量可以包含相对于组合物的重量为约1
×
106至约1
×
10
11
个菌落形成单位(cfu)/g的量的细菌菌株。剂量可能适合成年人。例如，组合物可包含约1x103至约1x10
11
个cfu/g的细菌菌株；例如，约1x107至约1x10
10
个cfu/g；在另一个实例中，约1x106至约1x10
10
个cfu/g；在另一个实例中，约1x107至约1x10
11
个cfu/g；在另一个实例中，约1x108至约1x10
10
个cfu/g；在另一个实例中，约1x108至约1x10
11
个cfu/g、约1x108至
约1x10
10
个cfu/g。例如，约1x108至约1x10
10
个cfu/g。剂量可以是例如1g、3g、5g和10g。
[0772]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中细菌菌株的量相对于组合物的重量为每克约1
×
103至约1
×
10
11
个菌落形成单位。
[0773]
在某些实施方案中，本发明提供上述药物组合物，其中所述组合物以500mg至1000mg、600mg至900mg、700mg至800mg、500mg至750mg或750mg至1000mg的剂量给药。在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中药物组合物中的冻干细菌以500mg至1000mg、600mg至900mg、700mg至800mg、500mg至750mg、或750mg至1000mg的剂量给药。
[0774]
组合物可以配制成益生菌。益生菌被fao/who定义为活的微生物，当以足够的量给予时，它会给宿主带来健康益处。
[0775]
通常，益生菌，如本发明的组合物，任选地与至少一种合适的益生元化合物组合。益生元化合物通常是一种不易消化的碳水化合物，如寡糖或多糖，或糖醇，它们不会在上消化道中降解或吸收。已知的益生元包括商业产品，如菊粉和反式半乳糖寡糖。
[0776]
可以包括其他益生元化合物(诸如例如维生素c)作为除氧剂并改善递送和/或部分或全部定殖和体内存活。可选地，本发明的益生菌组合物可以作为食品或营养产品，如基于牛奶或乳清的发酵乳制品，或作为药物产品经口给药。
[0777]
在某些实施方案中，本发明的益生菌组合物包含的益生元化合物的量为相对于组合物总重量的按重量计约1％至约30％(例如，按重量计5％至20％)。已知的益生元包括商业产品，如菊粉和反式半乳糖寡糖。
[0778]
益生元化合物通常是一种不易消化的碳水化合物，如寡糖或多糖，或糖醇，它们不会在上消化道中降解或吸收。碳水化合物可以选自：低聚果糖(或fos)、短链低聚果糖、菊粉、低聚异麦芽糖、果胶、低聚木糖(或xos)、低聚壳聚糖(或cos)、β-葡聚糖、可耕树胶改性和抗性淀粉、聚右旋糖、d-塔格糖、阿拉伯胶纤维、角豆、燕麦和柑橘纤维。一方面，益生元是短链低聚果糖(为简单起见，下文中显示为foss-c.c)；所述foss-cc是不可消化的碳水化合物，通常通过甜菜糖的转化获得并且包括与三个葡萄糖分子结合的蔗糖分子。
[0779]
可以包括其他益生元化合物(诸如例如维生素c)作为除氧剂并改善递送和/或部分或全部定殖和体内存活。可选地，本发明的益生菌组合物可以作为食品或营养产品，如基于牛奶或乳清的发酵乳制品，或作为药物产品经口给药。
[0780]
本发明的组合物可以包含药学上可接受的赋形剂或载体。这种合适的赋形剂的实例可以在参考文献[89]中找到。用于治疗用途的可接受的载体或稀释剂在制药领域是众所周知的，并且例如在参考文献[90]中进行了描述。合适的载体的实例包括乳糖、淀粉、葡萄糖、甲基纤维素、硬脂酸镁、甘露醇、山梨糖醇等。合适的稀释剂的实例包括乙醇、甘油和水。药物载体、赋形剂或稀释剂的选择可以根据预期的给药途径和标准药学实践来选择。药物组合物可包含任何合适的粘合剂、润滑剂、悬浮剂、包衣剂、增溶剂作为载体、赋形剂或稀释剂，或者除载体、赋形剂或稀释剂之外，还可包含任何合适的粘合剂、润滑剂、悬浮剂、包衣剂、增溶剂。合适的粘合剂的实例包括淀粉、明胶、天然糖如葡萄糖、无水乳糖、自由流动乳糖、β-乳糖、玉米甜味剂、天然和合成树胶如阿拉伯胶、黄蓍胶或海藻酸钠、羧甲基纤维素和聚乙二醇。合适的润滑剂的实例包括油酸钠、硬脂酸钠、硬脂酸镁、苯甲酸钠、乙酸钠、氯化钠等。可以在药物组合物中提供防腐剂、稳定剂、染料甚至调味剂。防腐剂的实例包括苯甲酸钠、山梨酸、半胱氨酸和对羟基苯甲酸酯。例如，在一些实施方案中，防腐剂选自苯甲酸
钠、山梨酸和对羟基苯甲酸酯。也可以使用抗氧化剂和悬浮剂。合适载体的另一个实例是蔗糖。防腐剂的另一个实例是半胱氨酸。
[0781]
本发明的组合物可以配制成食品。例如，除了本发明的治疗效果，食品还可以提供营养益处，如在营养补充剂中。类似地，可以配制食品以增强本发明组合物的味道或通过与普通食品而不是药物组合物更相似而使组合物对消费更具吸引力。在某些实施方案中，本发明的组合物被配制成奶基产品。术语“奶基产品”是指任何具有不同脂肪含量的液体或半固体奶基或乳清基产品。奶基产品可以是例如牛奶、山羊奶、绵羊奶、脱脂奶、全脂奶、未经任何加工从奶粉和乳清重组的奶，或加工产品，如酸奶、凝结乳、凝乳、酸牛奶、酸全脂牛奶、奶油牛奶和其他酸奶制品。另一重要组包括乳饮料，如乳清饮料、发酵乳、炼乳、婴幼儿奶；调味奶、冰淇淋；含牛奶的食物，如糖果。
[0782]
在一些实施方案中，本文公开的组合物包含厌氧棒杆菌属的一种或多种细菌菌株并且不包含来自任何其他物种的细菌，或者其仅包含来自另一物种的微量或生物学无关量的细菌。因此，在一些实施方案中，本发明提供了包含一种或多种厌氧棒杆菌属细菌菌株的组合物，其不包含来自任何其他物种的细菌或仅包含微量或生物学无关量的来自另一物种的细菌，用于治疗用途。
[0783]
在一些实施方案中，组合物包含厌氧棒杆菌属、真杆菌属或faecalicatena属的一种或多种细菌菌株，并且不包含来自任何其他属的细菌，或仅包含来自另一属的微量或生物学无关量的细菌。在一些实施方案中，组合物包含真杆菌属或faecalicatena属的一种或多种细菌菌株，并且不包含来自任何其他属的细菌，或仅包含来自另一属的微量或生物学无关量的细菌。
[0784]
在某些实施方案中，本文公开的组合物包含单一细菌物种并且不包含任何其他细菌物种。在某些实施方案中，本文公开的组合物包含单一细菌菌株并且不包含任何其他细菌菌株。例如，本发明的组合物可以仅包含卡兰德真杆菌菌株、粘液真杆菌菌株、直肠真杆菌菌株、挑剔真杆菌菌株、霍氏真杆菌菌株、faecalicatena fissicatena菌株或faecalicatena contorta菌株。例如，本发明的组合物可以仅包含anaerostipes hadrus菌株、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)菌株、anaerostipes rhamnosivorans菌株或粪厌氧棒杆菌菌株的细菌。此类组合物可仅包含微量或生物学无关量的其他细菌菌株或物种。这样的组合物可以是基本上不含其他生物物种的培养物。在一些实施方案中，此类组合物可以是基本上不含其他生物物种的冻干物。
[0785]
在一些实施方案中，本发明提供了包含厌氧棒杆菌属的单一细菌菌株的组合物，其不包含来自任何其他菌株的细菌或仅包含来自另一菌株的微量或生物学无关量的细菌，用于治疗治疗。
[0786]
在某些实施方案中，本发明的组合物包含单一细菌菌株或物种并且不包含任何其他细菌菌株或物种。此类组合物可仅包含微量或生物学无关量的其他细菌菌株或物种。这样的组合物可以是基本上不含其他生物物种的培养物。
[0787]
在某些实施方案中，本发明的组合物由1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15或16种细菌菌株或物种组成。在某些实施方案中，组合物由1至10种，优选1至5种细菌菌株或物种组成。在一些实施方案中，本文公开的组合物包含来自同一物种内的多于一种菌株(例如多于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40或45种菌株)，并且，任选地，不包含
来自任何其他物种的细菌。在一些实施方案中，本文公开的组合物包含来自同一物种内的少于50种菌株(例如少于45、40、35、30、25、20、15、12、10、9、8、7、6、5、4或3种菌株)，并且，任选地，不包含来自任何其他物种的细菌。在一些实施方案中，本文公开的组合物包含1-40、1-30、1-20、1-19、1-18、1-15、1-10、1-9、1-8、1-7、1-6、1-5、1-4、1-3、1-2、2-50、2-40、2-30、2-20、2-15、2-10、2-5、6-30、6-15、16-25或31-50种来自同一物种内的菌株，并且任选地不包含来自任何其他物种的细菌。在一些实施方案中，本文公开的组合物包含多于一种来自同一属的物种(例如多于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15、17、20、23、25、30、35或40种物种)，并且任选地，不包含来自任何其他属的细菌。在一些实施方案中，本文公开的组合物包含来自同一属的少于50种物种(例如少于50、45、40、35、30、25、20、15、12、10、8、7、6、5、4或3种物种)，并且，任选地，不包含来自任何其他属的细菌。在一些实施方案中，本文公开的组合物包含1-50、1-40、1-30、1-20、1-15、1-10、1-9、1-8、1-7、1-6、1-5、1-4、1-3、1-2、2-50、2-40、2-30、2-20、2-15、2-10、2-5、6-30、6-15、16-25或31-50种来自同一属内的物种，并且任选地不包含来自任何其他属的细菌。本发明包括前述的任意组合。
[0788]
在一些实施方案中，本发明的组合物包含多于一种细菌菌株或物种。例如，在一些实施方案中，本发明的组合物包含多于一种来自同一物种的菌株(例如多于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40或45种菌株)，并且，任选地，不包含来自任何其他物种的细菌。在一些实施方案中，本发明的组合物包含少于50种来自同一物种内的菌株(例如少于45、40、35、30、25、20、15、12、10、9、8、7、6、5、4或3种菌株)，并且，任选地，不包含来自任何其他物种的细菌。在一些实施方案中，本发明的组合物包含1-40、1-30、1-20、1-19、1-18、1-15、1-10、1-9、1-8、1-7、1-6、1-5、1-4、1-3、1-2、2-50、2-40、2-30、2-20、2-15、2-10、2-5、6-30、6-15、16-25或31-50种来自同一物种内的菌株，并且任选地，不包含来自任何其他物种的细菌。在一些实施方案中，本发明的组合物包含多于一种来自同一属的物种(例如多于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15、17、20、23、25、30、35或40种物种)，并且，任选地，不包含来自任何其他属的细菌。在一些实施方案中，本发明的组合物包含来自同一属内的少于50种物种(例如少于50、45、40、35、30、25、20、15、12、10、8、7、6、5、4或3种物种)，并且，任选地，不包含来自任何其他属的细菌。在一些实施方案中，本发明的组合物包含1-50、1-40、1-30、1-20、1-15、1-10、1-9、1-8、1-7、1-6、1-5、1-4、1-3、1-2、2-50、2-40、2-30、2-20、2-15、2-10、2-5、6-30、6-15、16-25或31-50种来自同一属的物种，并且任选地，不包含来自任何其他属的细菌。本发明包括前述的任意组合。
[0789]
在某些实施方案中，本发明的药物组合物包含1-50种不同的细菌菌株，如1-50、1-40、1-30、1-20、1-19、1-18、1-17、1-16、1-15、1-14、1-13、1-12、1-11、1-10、1-9、1-8、1-7、1-6、1-5、1-4、1-3或2种不同的细菌菌株。在某些实施方案中，本发明的药物组合物包含1-50种不同的细菌物种，如1-50、1-40、1-30、1-20、1-19、1-18、1-17、1-16、1-15、1-14、1-13、1-12、1-11、1-10、1-9、1-8、1-7、1-6、1-5、1-4、1-3或2种不同的细菌物种。
[0790]
在某些实施方案中，药物组合物包含16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5或更少种不同的细菌物种。在某些实施方案中，药物组合物包含4或更少种不同的细菌物种。在某些实施方案中，药物组合物包含3或更少种不同的细菌物种。在某些实施方案中，药物组合物包含2或更少种不同的细菌物种。在某些实施方案中，药物组合物包含卡兰德真杆菌、粘液真杆菌、直肠真杆菌、挑剔真杆菌、霍氏真杆菌、faecalicatena fissicatena或
faecalicatena contorta(特别地，卡兰德真杆菌)，并且不含其它细菌物种。在某些实施方案中，药物组合物包含anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、anaerostipes rhamnosivorans或粪厌氧棒杆菌(特别地，anaerostipes hadrus)，并且不含其它细菌物种。在优选的实施方案中，本发明的组合物包含卡兰德真杆菌、粘液真杆菌、直肠真杆菌、挑剔真杆菌、霍氏真杆菌、faecalicatena fissicatena或faecalicatena contort(特别地，卡兰德真杆菌)的单一菌株，并且不含其它细菌菌株或物种。在优选的实施方案中，本发明的组合物包含anaerostipes hadrus、丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)、anaerostipes rhamnosivorans或粪厌氧棒杆菌(特别地，anaerostipes hadrus)的单一菌株，并且不含其它细菌菌株或物种。此类组合物可仅包含微量或生物学无关量的其他细菌菌株或物种。引人注目的是，这些实例证明仅包含本发明的单一菌株的组合物可以具有有效的效果，而不依赖于与其他菌株或物种的共同给药。
[0791]
在一些实施方案中，组合物包含微生物聚生体。例如，在一些实施方案中，组合物包含厌氧棒杆菌细菌菌株作为微生物聚生体的一部分。例如，在一些实施方案中，厌氧棒杆菌细菌菌株联合一种或多种(例如，至少2、3、4、5、10、15或20种)来自厌氧棒杆菌属和/或可以与其在肠中体内共生生活的其他属的其他的细菌菌株存在。例如，在一些实施方案中，组合物包含与来自不同属的细菌菌株联合的厌氧棒杆菌属的细菌菌株。在另一实例中，组合物包含与来自厌氧棒杆菌属的第二细菌菌株联合的厌氧棒杆菌属的细菌菌株，或者组合物包含与来自厌氧棒杆菌属的第二细菌菌株和来自不同属的细菌菌株联合的厌氧棒杆菌属的细菌菌株。在一些实施方案中，组合物包含真杆菌或faecalicatena细菌菌株作为微生物聚生体的一部分。例如，在一些实施方案中，真杆菌或faecalicatena细菌菌株与一种或多种(例如，至少2、3、4、5、10、15或20种)来自真杆菌属或faecalicatena属和/或可以与其在肠中体内共生生活的其他属的其他细菌菌株联合存在。例如，在一些实施方案中，组合物包含与来自不同属的细菌菌株联合的真杆菌或faecalicatena的菌株。在另一实例中，组合物包含与来自真杆菌属的细菌菌株联合的卡兰德真杆菌的菌株，或者组合物包含与来自真杆菌属的细菌菌株和来自不同属的细菌菌株联合的卡兰德真杆菌的菌株。在一些实施方案中，微生物聚生体包含获自单一生物体，例如人的粪便样品的两种或更多种细菌菌株。在一些实施方案中，微生物聚生体未发现天然在一起。例如，在一些实施方案中，微生物聚生体包含获自至少两个不同生物体的粪便样品的细菌菌株。在一些实施方案中，两个不同的生物体来自同一物种，例如两名不同的人。在一些实施方案中，两个不同的生物体是人类婴儿和成人。在一些实施方案中，两个不同的生物体是人和非人的哺乳动物。
[0792]
在一些实施方案中，本发明的组合物另外包含具有与菌株ncimb 43457相同的安全性和治疗功效特征但不是ncimb 43457或不是anaerostipes hadrus的细菌菌株。
[0793]
在一些实施方案中，本发明的组合物另外包含具有与菌株ncimb 43526相同的安全性和治疗功效特征但不是ncimb 43526或不是anaerostipes hadrus的细菌菌株。
[0794]
在一些实施方案中，本发明的组合物另外包含细菌菌株，其具有与菌株根据登录号ncimb 43455保藏的卡兰德真杆菌菌株相同的安全性和治疗功效特征，但不是根据登录号ncimb 43455保藏的卡兰德真杆菌菌株，或者不是真杆菌。
[0795]
在一些实施方案中，本发明的组合物另外包含细菌菌株，其具有与根据登录号ncimb 42689保藏的faecalicatena contorta菌株相同的安全性和治疗功效特征，但不是
根据登录号ncimb 42689保藏的faecalicatena contorta菌株，或者不是faecalicatena。
[0796]
在其中本发明的组合物包含多于一种细菌菌株、物种或属的一些实施方案中，单个细菌菌株、物种或属可以用于分开、同时或顺序给药。例如，组合物可以包含所有的多于一种的细菌菌株、物种或属，或者细菌菌株、物种或属可以分开储存并且分开、同时或顺序给药。在一些实施方案中，多于一种细菌菌株、物种或属分开储存，但在使用前混合在一起。
[0797]
在一些实施方案中，用于本发明的细菌菌株获自成人粪便。在其中本发明的组合物包含多于一种细菌菌株的一些实施方案中，所有细菌菌株均获自成人粪便，或者如果存在其他细菌菌株，它们仅以微量存在。细菌可以在从成人粪便中获得并用于本发明的组合物之后进行培养。
[0798]
在一些实施方案中，一种或多种厌氧棒杆菌细菌菌株是本发明组合物中唯一的治疗活性剂。在一些实施方案中，组合物中的细菌菌株是本发明组合物中唯一的治疗活性剂。
[0799]
在一些实施方案中，一种或多种真杆菌或faecalicatena细菌菌株是本发明组合物中唯一的治疗活性剂。在一些实施方案中，组合物中的细菌菌株是本发明组合物中唯一的治疗活性剂。
[0800]
根据本发明使用的组合物可能需要或不需要市场批准。
[0801]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述细菌菌株是冻干的。在一些情况下，细菌菌株在给药前复原。在一些情况下，通过使用本文所述的稀释剂进行复原。在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述细菌菌株是喷雾干燥的。在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述细菌菌株是冻干或喷雾干燥的，并且其中其是活的。在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述细菌菌株是冻干或喷雾干燥的，并且其中其是活的。在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述细菌菌株是冻干或喷雾干燥的，并且其中其能够部分或全部定殖肠道。在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述细菌菌株是冻干或喷雾干燥的，并且其中其是活的，并且能够部分或全部定殖肠道。
[0802]
在一些情况下，冻干或喷雾干燥的细菌菌株在给药前被复原。在一些情况下，复原是通过使用本文所述的稀释剂进行的。
[0803]
本发明的组合物可以包含药学上可接受的赋形剂、稀释剂或载体。
[0804]
在某些实施方案中，本发明提供了药物组合物，其包含：本发明的细菌菌株；和药学上可接受的赋形剂、载体或稀释剂；其中当给予有需要的对象时所述细菌菌株为足以治疗病症的量；并且其中所述病症选自：神经退行性疾病，如阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病、脑损伤，如中风、行为障碍，如注意力缺陷多动症、炎性肠病，如克罗恩病、癌症，如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌、中枢神经系统障碍或病况(如本文所述的)。
[0805]
在某些实施方案中，本发明提供了药物组合物，其包含：本发明的细菌菌株；和药学上可接受的赋形剂、载体或稀释剂；其中所述细菌菌株为足以治疗或预防由hdac介导的疾病或病况的量。在优选的实施方案中，所述疾病或病况选自：神经退行性疾病如阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病、脑损伤如中风、行为障碍如注意力缺陷多动症、炎性肠病如克罗恩病、癌症如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。
[0806]
在优选的实施方案中，药物组合物用于治疗或预防中枢神经系统障碍或病况，特
别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍或病况。在优选的实施方案中，所述病症或病况选自：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；痴呆；阿尔茨海默；帕金森氏病；和/或慢性疼痛。在其他实施方案中，本文公开的组合物可用于治疗或预防运动神经元疾病；亨廷顿病；guillain-barre综合征和/或脑膜炎。
[0807]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中相对于组合物的重量，细菌菌株的量为每克约1
×
103至约1
×
10
11
个菌落形成单位。
[0808]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述组合物以1g、3g、5g或10g的剂量给药。
[0809]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述组合物通过选自经口、直肠、皮下、鼻、颊和舌下的方法给药。
[0810]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其包含选自乳糖、淀粉、葡萄糖、甲基纤维素、硬脂酸镁、甘露醇和山梨糖醇的载体。
[0811]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其包含选自乙醇、甘油和水的稀释剂。
[0812]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其包含选自以下的赋形剂：淀粉、明胶、葡萄糖、无水乳糖、自由流动乳糖、β-乳糖、玉米甜味剂、阿拉伯胶、黄蓍胶、海藻酸钠、羧甲基纤维素、聚乙二醇、油酸钠、硬脂酸钠、硬脂酸镁、苯甲酸钠、乙酸钠和氯化钠。
[0813]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，还包含防腐剂、抗氧化剂和稳定剂中的至少一种。
[0814]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其包含选自苯甲酸钠、山梨酸和对羟基苯甲酸酯的防腐剂。
[0815]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中所述细菌菌株是冻干的。
[0816]
在某些实施方案中，本发明提供了上述药物组合物，其中当组合物在约4℃或约25℃储存在密封容器中并且容器放置在具有50％相对湿度的气氛中时，至少80％以菌落形成单位测量的细菌菌株在至少约以下的一段时间后保留：1个月、3个月、6个月、1年、1.5年、2年、2.5年或3年。
[0817]
在一些实施方案中，本发明的组合物在包含如本文所述的组合物的密封容器中提供。在一些实施方案中，密封容器是小袋或瓶子。在一些实施方案中，本发明的组合物在包含如本文所述的组合物的注射器中提供。
[0818]
在一些实施方案中，本发明的组合物可以作为药物制剂提供。例如，组合物可以作为片剂或胶囊剂提供。在一些实施方案中，胶囊是明胶胶囊(“凝胶帽”)。胶囊可以是硬胶囊或软胶囊。在一些实施方案中，制剂是软胶囊。软胶囊是由于添加软化剂，诸如例如存在于胶囊壳中的甘油、山梨糖醇、麦芽糖醇和聚乙二醇而可以具有一定弹性和柔软性的胶囊。例如，可以基于明胶或淀粉产生软胶囊。基于明胶的软胶囊可从各种供应商处购得。根据给药方法，诸如例如经口或直肠给药，软胶囊可以具有各种形状，例如，它们可以是圆形、椭圆形、长方形或鱼雷形。软胶囊可以通过常规方法生产，诸如例如通过scherer法、accogel法或液滴或吹气法。
[0819]
在一些实施方案中，本文公开的组合物经口给药。经口给药可能涉及吞咽，以使化合物进入胃肠道。
[0820]
适合口服给药的药物制剂包括固体塞、固体微粒、半固体和液体(包括多相或分散系统)如片剂；含有多颗粒或纳米颗粒、液体(例如水溶液)、乳液或粉末的软或硬胶囊；锭剂(包括液体填充的)；咀嚼物；凝胶；快速分散剂型；薄膜；胚珠；喷雾剂；和颊/粘膜粘附贴片。
[0821]
在一些实施方案中，药物制剂是肠溶制剂，即适于通过经口给药将本发明的组合物递送至肠的耐胃制剂(例如，耐胃部ph)。当组合物中的细菌或其他成分对酸敏感，例如倾向于在胃部条件下降解时，肠溶制剂可能特别有用。
[0822]
在一些实施方案中，肠溶制剂包含肠溶衣。在一些实施方案中，制剂是肠溶包衣剂型。例如，该制剂可以是肠溶衣片剂或肠溶胶囊等。肠溶衣可以是常规的肠溶衣，例如用于经口递送的片剂、胶囊等的常规包衣。制剂可以包含薄膜包衣，例如肠溶聚合物的薄膜层，例如不溶于酸的聚合物。
[0823]
在一些实施方案中，肠溶制剂本质上是肠溶的，例如，耐胃的，而不需要肠溶包衣。因此，在一些实施方案中，制剂是不包含肠溶衣的肠溶制剂。在一些实施方案中，制剂是由热凝胶材料制成的胶囊。在一些实施方案中，热凝胶材料是纤维素材料，如甲基纤维素、羟甲基纤维素或羟丙基甲基纤维素(hpmc)。在一些实施方案中，胶囊包含不包含任何成膜聚合物的壳。在一些实施方案中，胶囊包含壳并且所述壳包含羟丙基甲基纤维素并且不包含任何成膜聚合物(例如参见[91])。在一些实施方案中，制剂是固有肠溶胶囊(例如，来自capsugel的)。
[0824]
培养方法
[0825]
用于本发明的细菌菌株可以使用标准微生物学技术培养，如参考文献[92,94]中详述的。
[0826]
用于培养的固体或液体培养基可以是例如ycfa琼脂或ycfa培养基。ycfa培养基可能包括(每100ml，近似值)：酪蛋白胨(1.0g)、酵母提取物(0.25g)、nahco3(0.4g)、半胱氨酸(0.1g)、k2hpo4(0.045g)、kh2po4(0.045g)、nacl(0.09g)、(nh4)2so4(0.09g)、mgso4·
7h2o(0.009g)、cacl2(0.009g)、刃天青(0.1mg)、血红素(1mg)、生物素(1μg)、钴胺素(1μg)、对氨基苯甲酸(3μg)、叶酸(5μg)和吡哆胺(15μg)。
[0827]
用于疫苗组合物的细菌菌株
[0828]
本发明人已经确定本发明的细菌菌株可用于治疗或预防由hdac介导的疾病或病况。这可能是本发明的细菌菌株对宿主免疫系统的影响的结果。因此，当作为疫苗组合物给药时，本发明的组合物还可用于预防由hdac介导的疾病或病况。在某些这样的实施方案中，本发明的细菌菌株可以被杀死、灭活或减毒。在某些这样的实施方案中，组合物可包含疫苗佐剂。在某些实施方案中，组合物用于经由注射给药，如经由皮下注射。
[0829]
此外，当作为疫苗组合物给药时，本文公开的组合物还可用于预防中枢神经系统障碍或病况，特别是由微生物群-肠-脑轴介导的中枢神经系统障碍或病况。在其他某些这样的实施方案中，本发明的细菌菌株可以被杀死、灭活或减毒。在某些此类实施方案中，组合物可包含疫苗佐剂。在某些实施方案中，组合物用于经由注射给药，如经由皮下注射。
[0830]
通用
[0831]
除非另有说明，否则本发明的实施将采用本领域技术范围内的化学、生物化学、分
子生物学、免疫学和药理学的常规方法。这些技术在文献中有充分的解释。参见，例如，参考文献[95]和[96,102]等。
[0832]
术语“包含(comprising)”包括“包括(including)”以及“由
…
组成(consisting)”，例如，“包含”x的组合物可以仅由x组成，也可以包括一些额外的东西，例如x y。
[0833]
与数值x有关的术语“约”是任选的并且意指例如x 10％。
[0834]“基本上(substantially)”一词不排除“完全(completely)”，例如“基本上不含”y的组合物可以完全不含y。必要时，本发明的定义中可以省略“基本上(substantially)”一词。
[0835]
提及两个核苷酸序列之间的百分比序列同一性意味着，当比对时，在比较两个序列时该百分比的核苷酸是相同的。这种比对和百分比同源性或序列同一性可以使用本领域已知的软件程序来确定，例如参考文献[103]的第7.7.18节中描述的那些。优选的比对通过smith-waterman同源性搜索算法确定，使用仿射空位搜索，空位开放罚分为12，且空位延伸罚分为2，blosum矩阵为62。另一优选比对通过smith-waterman同源性搜索算法确定，使用仿射空位搜索，空位开放罚分为5，且空位扩展罚分为2，blosum矩阵为62。smith-waterman同源搜索算法在参考文献[104]中公开。
[0836]
除非明确说明，否则包括许多步骤的过程或方法可以包括在方法开始或结束时的附加步骤，或者可以包括额外的中间步骤。而且，如果合适，可以组合、省略或以替代顺序执行步骤。
[0837]
本文描述了本发明的各种实施方案。应当理解，每个实施方案中指定的特征可以与其他指定的特征组合，以提供其他的实施方案。特别地，在本文强调为合适的、典型的或优选的实施方案可以彼此组合(除非当它们是相互排斥的时)。
[0838]
本说明书中引用的所有专利和文献参考文献均在此通过引用整体并入本文。
[0839]
对包括向患者给予试剂的治疗方法的任何提及也涵盖用于所述治疗方法中的所述试剂，以及所述试剂在所述治疗方法中的用途，以及所述试剂在制造试剂中的用途。
[0840]
提供以下实施例仅用于说明目的，并不旨在以任何方式限制本发明的范围。
具体实施方式
[0841]
实施例1
–
anaerostipes hadrus对体外短链脂肪酸产生的影响
[0842]
摘要
[0843]
本研究调查了anaerostipes hadrus对体外短链脂肪酸(scfas)产生的影响。scfas，包括乙酸盐、丙酸盐、戊酸盐、异丁酸盐和异戊酸盐，是膳食纤维的微生物副产品。scfa的任何增加都表明微生物群的生产力增加，并且是一项理想的特征。
[0844]
材料和方法
[0845]
使anaerostipes hadrusdsm 3319的纯培养物在ycfa 肉汤中厌氧生长[每升：酪蛋白水解物10.0g、酵母提取物2.5g、碳酸氢钠4.0g、葡萄糖2.0g、纤维二糖2.0g、可溶性淀粉2.0g、磷酸氢二钾0.45g、磷酸二氢钾0.45g、刃天青0.001g、l-半胱氨酸hcl 1.0g、硫酸铵0.9g、氯化钠0.9g、硫酸镁0.09g、氯化钙0.09g、氯化血红素0.01g、scfa 3.1ml(乙酸2.026ml/l，丙酸0.715ml/l，正戊酸0.119ml/l，异戊酸0.119ml/l，异丁酸0.119ml/l)、维生
素混合物1:1ml(生物素1mg/100ml，氰钴胺1mg/100ml，对氨基苯甲酸3mg/100ml，吡哆醇15mg/100ml)、维生素混合物2:1ml(硫胺素5mg/100ml，核黄素5mg/100ml)、维生素混合物3:1ml(叶酸5mg/100ml)]，直到它们达到其稳定生长期。将培养物以5000x g离心10分钟，并使用0.45μm和随后0.2μm过滤器(millipore,uk)过滤无细胞上清液(cfs)，然后将1ml等分试样的cfs储存在-80℃直到使用。
[0846]
通过ms omics aps,denmark对来自细菌上清液的短链脂肪酸(scfas)和中链脂肪酸(mcfas)进行了分析和定量。使用盐酸酸化样品，并添加氘标记的内标。以随机顺序分析所有样品。使用安装在偶联四极杆检测器(5977b,agilent)的气相色谱仪(7890b,agilent)中的高极性色谱柱(zebron
tm
zb-ffap,gc cap.柱30m x 0.25mm x 0.25μm)进行分析。该系统通过chemstation(agilent)进行控制。使用chemstation(agilent)将原始数据转换为netcdf格式，然后使用参考文献[105]描述的paradise软件在matlab r2014b(mathworks,inc.)中导入和处理数据。
[0847]
结果
[0848]
对anaerostipes hadrus观察到以下模式：
[0849][0850]
这表明anaerostipes hadrus主要产生乙酸和丁酸，这与已知数据一致。
[0851]
实施例2
–
anaerostipes hadrus对体内短链脂肪酸产生的影响
[0852]
摘要
[0853]
本研究研究了anaerostipes hadrus对小鼠短链脂肪酸(scfas)产生的影响。scfas，包括乙酸盐、丙酸盐、戊酸盐、异丁酸盐和异戊酸盐，是膳食纤维的微生物副产物。scfa的任何增加都表明微生物群的生产力增加，并且是一个理想的特征。
[0854]
材料和方法
[0855]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x 109cfu的ncimb 43526口服管饲(200μl体积)。在第7天，动物被安乐死。将盲肠取出、称重并储存在-80℃下以用于scfas分析。将盲肠内容物与milliq水混合并涡旋，并在室温下孵育10min。通过离心(10000g,5min,4℃)以沉淀细菌和其他固体并通过0.2μm过滤来获得上清液。将其转移到透明的gc小瓶中，并使用2-乙基丁酸(sigma)作为内标。使用配备zb-ffap柱(30m x 0.32mm x 0.25mm；phenomenex)的varian 3500gc火焰离子化系统分析scfa的浓度。用不同浓度的包含乙酸盐、丙酸盐、异丁酸盐、正丁酸盐、异戊酸盐和戊酸盐(sigma)的标准混合物建立标准曲线。通过使用varian star chromatography workstation 6.0版软件对峰进行积分。所有scfa数据均以μmol/g表示。
[0856]
结果
[0857]
图1显示了用anaerostipes hadrus处理导致乙酸盐(a)、丙酸盐(b)、异丁酸盐(c)、异戊酸盐(d)和戊酸盐(e)的产生普遍增加。有趣的是，这种模式与体外发现的模式不同，并且偏离了scfa分泌的正常模式，这表明考虑到整个微生物群而不是分离菌株的体内结果不同。
[0858]
微生物群中的由细菌产生的scfas是由肠道微生物群引发的有益作用的关键介质。这些数据表明，来自厌氧棒杆菌属的细菌可用于提高微生物群的生产力，并因此可用于
治疗或预防与微生物群生产力降低相关的疾病。scfa可以调节免疫反应，因此这些数据表明来自厌氧棒杆菌属的细菌可用于治疗炎症病况。
[0859]
实施例3
–
anaerostipes hadrus对外周免疫标志物的影响
[0860]
摘要
[0861]
本研究研究了anaerostipes hadrus对由分离的小鼠脾细胞产生的数种免疫标志物的影响。白细胞介素-1β(il-1β)、肿瘤坏死因子-α(tnf-α)、干扰素-γ(ifn-γ)、白细胞介素-6(il-6)是促炎细胞因子；而白细胞介素10(il-10)具有抗炎特性。促炎和抗炎细胞因子都是维持健康的免疫和炎症系统所必需的，这些细胞因子的不平衡可能导致负面的生理结果。
[0862]
材料和方法
[0863]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x109个cfu的ncimb 43526的口服管饲(200μl体积)。在第7天，动物被安乐死。取出脾脏，收集在5ml rpmi培养基中(含l-谷氨酰胺和碳酸氢钠，r8758 sigma 10％fbs(f7524,sigma) 1％pen/strep(p4333,sigma))，并在剔除后立即处理以用于离体免疫刺激。将脾细胞首先在rpmi培养基中匀浆。匀浆步骤之后是rbc裂解步骤，其中将细胞在1ml rbc裂解缓冲液(11814389001roche,sigma)中孵育5分钟。加入10ml培养基以停止裂解，然后200g离心5分钟。这之后是最后一步，其中将细胞通过40um过滤器。然后将匀浆通过40um过滤器过滤，以200g离心5min并重新悬浮在培养基中。对细胞进行计数和接种(4,000,000个/ml培养基)。适应2.5h后，用脂多糖(lps-2μg/ml)或伴刀豆球蛋白a(cona-2.5μg/ml)刺激细胞24h。刺激后，收获上清液以使用促炎组1(小鼠)v-plex试剂盒(meso scale discovery,maryland,usa)评估tnfα、il-10、il-1β、干扰素γ、cxcl2和il6的细胞因子释放。使用meso quickplex sq 120、sector imager 2400、sector imager 6000、sector s 600进行分析。
[0864]
结果
[0865]
图2显示，与用媒介物处理的小鼠相比，用anaerostipes hadrus处理的小鼠产生较少的il-1β、tnfα、il-6，并显示出增加的il-10产生(当用lps刺激时)。这些结果表明，anaerostipes hadrus可能具有免疫调节作用，并因此可用于治疗或预防免疫和/或炎症性疾病。
[0866]
实施例4
–
anaerostipes hadrus对大脑中基因表达的影响
[0867]
摘要
[0868]
本研究研究了anaerostipes hadrus对大脑中某些目标基因表达的影响。评估了催产素系统(催产素受体和加压素受体)、内分泌系统(盐皮质激素(nr3c1)；糖皮质激素受体(nr3c2)；皮质酮释放因子(crf)和受体；脑源性神经营养因子(bdnf))、免疫系统(il-6、tnf-α、tlr-4)；和神经递质系统(nmda受体2a(grin2a)；nmda受体2b(grin2b)；gabaa受体亚基a2；gabab受体亚基b1；血清素2c)的标志物在杏仁核、海马体和前额叶皮层(pfc)中的mrna水平，这些区域是参与情绪反应的边缘系统的大脑关键区域。
[0869]
材料和方法
[0870]
方法
[0871]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x109个cfu的ncimb 43526的口服管饲(200μl体积)。在第7天，动物被安乐死。大脑被快速切除、解剖，并将每个大脑区域在干冰上快速冷冻
并储存在-80℃以供进一步分析。根据制造商的建议，使用mirvana
tm
mirna分离试剂盒(ambion/llife technologies,paisley,uk)和dna酶处理(turbo dna-free,ambion/life technologies)提取总rna。根据制造商的说明，使用nanodrop
tm
分光光度计(thermo fisher scientific inc.,wilmington,delaware,usa)对rna进行定量。根据制造商的程序，使用agilent bioanalyzer(agilent,stockport,uk)评估rna质量，并计算rna完整性数(rin)。rin值》7的rna用于后续实验。根据制造商的说明，使用applied biosystems high capacity cdna试剂盒(applied biosystems,warrington,uk)将rna逆转录为cdna。简言之，将multiscribe逆转录酶(50u/μl)作为rt master mix的一部分添加，25℃孵育10min，37℃孵育2h，85℃孵育5min，并在4℃储存。使用applied biosystems设计的针对小鼠特异性靶向基因的探针(6羧基荧光素-fam)进行定量pcr，同时使用β-肌动蛋白作为内源性对照。扩增反应包含1μl的cdna、5μl的2x pcr master mix(roche)、900nm的各种引物，并通过添加无rna酶的水达到总共10μl。所有反应均使用480系统上的96孔板以一式三份进行。热循环条件按照制造商(roche)的建议进行55个循环。为了检查扩增子污染，对于每种使用的探针，每次运行均不包含模板对照，一式三份。记录循环阈值(ct)。使用β-肌动蛋白对数据进行归一化，并使用2-δδct方法进行转换，并呈现为与对照组相比的倍数变化。
[0872]
结果
[0873]
如图3所示，从被测基因来看，相对于用载体对照进行处理，在用anaerostipes hadrus处理的小鼠的杏仁核中观察到crfr2(b)和5htr1a(d)的表达显著下降，且cd11b(c)、grin2a(e)和grin2b(f)的表达显著增加。在接受处理的动物的该脑区也观察到加压素受体(a)的表达增加。图3显示，在杏仁核中，用anaerostipes hadrus处理导致crfr2(b)、crfr1(c)和cd11b(d)的表达显著升高，以及盐皮质激素受体(a)表达增加的趋势。如图3所示，用anaerostipes hadrus处理的小鼠pfc中crfr2(a)、cd11b(b)和il-6(c)的表达也增加。这表明来自厌氧棒杆菌属的细菌能够调节大脑中蛋白质的表达水平，因此它们可用于治疗或预防cns疾病、病症或病况，如自闭症。
[0874]
实施例5
–
细菌对组蛋白脱乙酰酶活性的功效
[0875]
引言
[0876]
发明人试图研究anaerostipes hadrus菌株dsm 3319及其代谢物对hdac抑制的有效性。作为对照，根据登录号ncimb 42787(“ncimb42787”,参见wo2018/229216)保藏的megasphaera massiliensis菌株被包括在已知是有效的hdac抑制剂的实验中[106]。
[0877]
方法
[0878]
使用针对hdac的每种同种型的荧光测定试剂盒(bps bioscience,ca)分析i类hdacs(1、2、3)和ii类hdacs(4、5、6、9)的特定hdac抑制活性。将10％无细胞上清液或scfa、mcfa和bcfa的稀释液(在测定缓冲液中稀释)暴露于试剂盒中提供的特定hdac同种型。根据制造商的说明进行测定，并将未处理酶的荧光用于计算处理酶的抑制百分比。将丙戊酸(vpa)和曲古抑菌素a(tsa)、已知的hdac抑制剂，用作阳性对照。
[0879]
结果
[0880]
图4显示了dsm 3319高效抑制hdac1、hdac2和hdac 3的活性。特别地，该抑制作用与已知的hdac抑制剂ncimb 42787所见的抑制作用相当，后者已被证明在体外和体内具有
强大的神经保护作用[107]，发挥强大的抗炎作用[108]，并且也是一种很有前途的抗癌疗法[109]。
[0881]
实施例6
–
厌氧棒杆菌对肠道通透性的影响
[0882]
摘要
[0883]
本研究研究了厌氧棒杆菌对回肠和结肠肠道通透性的影响。肠道的过度渗透性或“渗漏”与许多肠道炎症性病症有关。
[0884]
材料和方法
[0885]
细菌菌株
[0886]
根据登录号ncimb 43457保藏的anaerostipes hadrus菌株。
[0887]
方法
[0888]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x109个cfu的anaerostipes hadrus的口服管饲(200μl体积)。在第7天，通过颈椎脱臼对动物实施安乐死，并取出远端回肠和结肠，置于冷冻的krebs溶液中，沿肠系膜线打开并仔细冲洗。然后如前所述(hyland和cox,2005)，将制剂放入ussing室(harvard apparatus,kent,uk,暴露面积为0.12cm2)中，含氧(95％o2,5％co2)krebs缓冲液保持在37℃。将4kda fitc-葡聚糖以2.5mg/ml的最终浓度添加到黏膜室中；在接下来的3h内，每30min从浆膜室收集200μl样品，并测量那些样品中的荧光。
[0889]
结果
[0890]
如图5所示，ncimb 43457降低了回肠和结肠的通透性，因此厌氧棒杆菌菌株可用于改变肠道通透性，例如用于治疗或预防与肠道通透性相关的疾病或病况。
[0891]
实施例7
–
厌氧棒杆菌对体内短链脂肪酸产生的影响
[0892]
摘要
[0893]
本研究研究了厌氧棒杆菌对小鼠短链脂肪酸(scfas)产生的影响。scfas，包括乙酸盐、丙酸盐、戊酸盐、丁酸盐、异丁酸盐和异戊酸盐，是膳食纤维的微生物副产物。scfa的任何增加都表明微生物群的生产力增加，并且是一个理想的特征。
[0894]
材料和方法
[0895]
细菌菌株
[0896]
anaerostipes hadrus菌株ncimb 43457。
[0897]
方法
[0898]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x109cfu的两种菌株中的任一种的口服管饲(200μl体积)。在第7天，动物被安乐死。将盲肠取出、称重并储存在-80℃以用于scfas分析。将盲肠内容物与milliq水混合并涡旋，并在室温孵育10min。通过离心(10000g,5min,4℃)以沉淀细菌和其他固体并通过0.2μm过滤来获得上清液。将其转移到透明的gc小瓶中，并使用2-乙基丁酸(sigma)作为内标。使用配备zb-ffap柱(30m x 0.32mm x 0.25mm；phenomenex)的varian 3500gc火焰离子化系统分析scfa的浓度。用不同浓度的包含乙酸盐、丙酸盐、异丁酸盐、正丁酸盐、异戊酸盐和戊酸盐(sigma)的标准混合物建立标准曲线。通过使用varian star chromatography workstation 6.0版软件对峰进行积分。所有scfa数据均以μmol/g表示。
[0899]
结果
[0900]
图6显示了用ncimb 43457处理能够增加乙酸盐、丙酸盐、丁酸盐、异戊酸和戊酸盐
的产生。
[0901]
微生物群中的由细菌产生的scfas是由肠道微生物群引起的有益作用的关键介质。这些数据表明，来自厌氧棒杆菌属的细菌可用于提高微生物群的生产力，并因此可用于治疗或预防与微生物群生产力降低相关的疾病。例如，scfas可以调节免疫反应，因此这些数据表明来自厌氧棒杆菌属的细菌可用于治疗炎症病况。
[0902]
微生物群-肠-脑轴的信号传导受共生代谢物水平的调节。这些数据表明，来自厌氧棒杆菌属的细菌可以调节共生代谢物的水平，例如通过增加scfas的产生。因此，在某些实施方案中，本文公开的组合物可以通过调节微生物群代谢物的全身水平来治疗或预防中枢神经系统障碍或病况。
[0903]
实施例8
–
厌氧棒杆菌对外周免疫标志物的影响
[0904]
摘要
[0905]
本研究研究了厌氧棒杆菌对由分离的小鼠脾细胞产生的数种免疫标志物的影响。白细胞介素-1β(il-1β)、肿瘤坏死因子-α(tnf-α)、干扰素-γ(ifn-γ)、白细胞介素-6(il-6)是促炎细胞因子；而白细胞介素10(il-10)具有抗炎特性。促炎和抗炎细胞因子都是维持健康的免疫和炎症系统所必需的，这些细胞因子的不平衡可能导致负面的生理结果。
[0906]
材料和方法
[0907]
细菌菌株
[0908]
anaerostipes hadrus菌株ncimb 43457。
[0909]
方法
[0910]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x109个cfu的相关菌株的口服管饲(200μl体积)。在第7天，动物被安乐死。取出脾脏，收集在5ml rpmi培养基中(含l-谷氨酰胺和碳酸氢钠，r8758 sigma 10％fbs(f7524,sigma) 1％pen/strep(p4333,sigma))，并在剔除后立即处理以用于离体免疫刺激。将脾细胞首先在rpmi培养基中匀浆。匀浆步骤之后是rbc裂解步骤，其中将细胞在1ml rbc裂解缓冲液(11814389001roche,sigma)中孵育5分钟。加入10ml培养基以停止裂解，然后200g离心5分钟。这之后是最后一步，其中将细胞通过40μm过滤器。然后将匀浆通过40μm过滤器过滤，以200g离心5min并重新悬浮在培养基中。对细胞进行计数和接种(4,000,000个/ml培养基)。适应2.5h后，用脂多糖(lps-2μg/ml)或伴刀豆球蛋白a(cona-2.5μg/ml)刺激细胞24h。刺激后，收获上清液以使用促炎组1(小鼠)v-plex试剂盒(meso scale discovery,maryland,usa)评估tnfα、il-10、il-1β、干扰素γ、cxcl2和il6的细胞因子释放。使用meso quickplex sq 120、sector imager 2400、sector imager 6000、sector s 600进行分析。
[0911]
结果
[0912]
图7表明，当用lps刺激时，anaerostipes hadrus菌株ncimb 43457能够降低tnf-α和il-1β的水平；并且当用cona刺激时，il-6的水平会增加。当用lps刺激时，anaerostipes hadrus菌株ncimb 43457显著增加了il-10的产生。
[0913]
实施例9
–
厌氧棒杆菌对大脑中基因表达的影响
[0914]
摘要
[0915]
本研究研究了厌氧棒杆菌对大脑中某些目标基因表达的影响。评估了催产素系统(催产素受体和加压素受体)、内分泌系统(盐皮质激素(nr3c1)；糖皮质激素受体(nr3c2)；
皮质酮释放因子(crf)和受体；脑源性神经营养因子(bdnf))、免疫系统(il-6、tnf-α、tlr-4、cd11b)；和神经递质系统(nmda受体2a(grin2a)；nmda受体2b(grin2b)；gabaa受体亚基a2；gabab受体亚基b1；血清素2c)在杏仁核、海马体和前额叶皮层(pfc)中的标志物的mrna水平，这些区域是参与情绪反应的边缘系统的大脑关键区域。
[0916]
材料和方法
[0917]
细菌菌株
[0918]
anaerostipes hadrus菌株ncimb 43457。
[0919]
方法
[0920]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x109个cfu的ncimb 43457的口服管饲(200μl体积)。在第7天，动物被安乐死。大脑被快速切除、解剖，并且将每个大脑区在干冰上快速冷冻并储存-80℃以供进一步分析。如实施例6中所述定量mrna表达。
[0921]
结果
[0922]
如图8所示，海马体tlr-4(d)表达发生明显变化；并且相对于仅用媒介物处理，在用rfa1处理的小鼠中观察到杏仁核中的盐皮质激素受体(e)、cd11b(f)、grin2b(g)、gaba a2(h)和gaba br1(i)。另外，相对于仅用媒介物处理时的表达，当用rfa1处理时，海马体、杏仁核和pfc中的糖皮质激素受体和cd11b表达增加。
[0923]
如图8所示，从被测基因来看，相对于用媒介物对照处理，在接受anaerostipes hadrus处理的小鼠中观察到crfr2(b)和5htr1a(d)的表达显著下降，且cd11b(c)、grin2a(e)和grin2b(f)的表达显著增加。对于处理的动物，在该脑区域中也观察到加压素受体(a)表达的增加。图8显示在杏仁核中，用anaerostipes hadrus处理导致crfr2(b)、crfr1(c)和cd11b(d)的表达显著升高，以及盐皮质激素受体(a)表达增加的趋势。用anaerostipes hadrus处理的小鼠在pfc中crfr2(a)、cd11b(b)和il-6(c)的表达也增加。这表明来自厌氧棒杆菌属的细菌能够调节大脑中蛋白质的表达水平，因此它们可用于治疗或预防cns疾病、病症或病况，如自闭症。
[0924]
因此，图7和图8中的数据表明，厌氧棒杆菌可用于治疗或预防可能受益于大脑中这些蛋白质表达水平的调节的病症或病况，例如，cns疾病和病症。
[0925]
实施例10
–
厌氧棒杆菌对自闭症谱系障碍模型中行为的影响
[0926]
摘要
[0927]
本研究在自闭症谱系障碍的环境动物模型(母体免疫激活模型)和/或遗传动物模型(btbr小鼠品系)中研究了厌氧棒杆菌对许多行为读数的影响，包括与焦虑相关的行为(大理石掩埋测试、梳毛测试、高架十字迷宫测试、旷场测试)、社交行为(3室社交互动测试)、认知表现(新物体识别)和抑郁/急性压力(强迫游泳测试)。
[0928]
材料和方法
[0929]
btrb小鼠模型
[0930]
btbr动物在室内饲养，兄弟姐妹交配。来自这些动物的雄性后代在3周龄时与它们的母亲分开，并且在8周龄时开始每日给予活的生物治疗剂或对照。行为症状开始于11周龄。包括一个年龄匹配的对照c57/bl6组作为参考对照组。
[0931]
mia小鼠模型
[0932]
雌性c57/bl6小鼠(8周龄)和年龄匹配的雄性小鼠购自harlan uk。1周习惯化后，
这些动物交配。在胚胎第12.5天，雌性接受注射病毒模拟poly-ic以激活母体免疫系统，或注射盐水媒介物。来自这些动物的雄性后代在3周龄时与它们的母亲分开，并且在8周龄时开始每日给予活的生物治疗剂或对照。行为症状开始于11周龄。
[0933]
方法
[0934]
动物接受每日口服管饲pbs或于pbs中制备成1x109个cfu/ml的活的生物治疗剂。在整个行为范式中每天持续给药。在开始给予细菌4-7周后进行行为测试。
[0935]
实施例10a-大理石掩埋试验
[0936]
将小鼠单独放置在一个新的有机玻璃笼子中(35
×
28
×
18.5cm,l
×w×
h)，里面装满锯末(5-10cm)且其顶部为20个大理石(五排或大理石规则间隔远离墙壁2cm，且相距2cm)。30分钟后，统计了其表面埋没2/3以上的大理石数量。埋藏的大理石数量越多，代表升高的刻板行为状态或更高水平的焦虑(新奇恐惧症)。大理石掩埋试验是新奇恐惧症、焦虑障碍和强迫行为的有用模型。
[0937]
结果
[0938]
如图9所示，用ncimb 43457处理的btbr和mia小鼠表现出刻板相关行为的减少，因为与给予媒介物的小鼠相比，它们埋藏的大理石更少。
[0939]
实施例10b-梳毛测试
[0940]
在一个覆盖有过滤器顶部的6.5cm直径
×
10cm高的透明玻璃烧杯中评估自我梳毛。实验动物在测试前1小时被带到测试室适应。测试持续时间约为20分钟，并记录了测试动物梳毛所花费的累积时间。在测试之间，烧杯被彻底清洁以备下次使用。该测试被用作刻板和重复行为的指标。花在梳毛上的时间增加表明刻板印象或重复行为的增加。
[0941]
结果
[0942]
如图10所示，用ncimb 43457处理的btbr小鼠表现出减少的刻板相关行为，因为相对于给予媒介物的小鼠，它们花更少的时间梳毛。
[0943]
实施例10c-高架十字迷宫
[0944]
该装置由一个灰色塑料十字形迷宫制成，距离地面1m，包括两个开放(恐惧)和两个封闭(安全)臂(50
×5×
15cm壁或1cm无壁)。实验在红光(～5lux)下进行。将小鼠单独放置在迷宫的中心，面对开放臂(以避免直接进入封闭的臂中)并允许5分钟的自由探索。使用天花板摄像机对实验进行录像，以便使用ethovision软件(3.1版,noldus,tracksys,nottingham,uk)进行进一步的参数分析。分别测量每个臂中花费的时间百分比、移动距离和进入次数，用于焦虑行为和运动活动(臂进入被定义为所有四只爪子进入臂内)。进入开放臂的时间或次数增加是焦虑减少的指标。
[0945]
结果
[0946]
如图11所示，用ncimb 43457处理的btbr小鼠表现出增加的焦虑相关行为，因为相对于给予媒介物的小鼠，它们在开放臂中花费的时间更少。
[0947]
实施例10d-社交行为
[0948]
社交测试仪器是一个长方形的三室盒子。每个室为20cm l
×
40cm w
×
22cm h。分隔墙由小圆形开口(直径5cm)制成，允许进入每个室。两个相同的铁丝杯状笼子，底部直径为10cm，高度为13cm，且条间距为1.2cm，允许条之间的鼻子接触，但防止打架，以双边对称的位置放置在每个侧室内。测试分为三个阶段，每个阶段10min：1)居住，2)小鼠相比于物
体，3)新的小鼠相比于熟悉的小鼠。使用天花板摄像机对实验进行录像，以便使用ethovision软件(3.1版,noldus,tracksys,nottingham,uk)进行进一步的参数分析。对于第一阶段，将测试小鼠放入中间室，并允许探索整个盒子，里面有空的小铁丝笼，进行10分钟的适应期。适应期结束后，将测试小鼠从测试箱中取出一小段时间，同时将一个物体放置在一个侧室中，并将一只不熟悉的同种雄性小鼠(未与测试物质事先接触)放在另一侧室中，两者都封闭在一个铁丝杯状的笼子里。在第二阶段，测试小鼠被放置在中间室中，并允许探索整个盒子10min。评估了在每个腔室中探索物体或小鼠所花费的时间量以及进入每个腔室的次数。左侧相比右侧室中不熟悉的小鼠的位置在试验之间系统地交替。进入被定义为所有四只爪子进入一个室中。在第三阶段，物体被替换为一只不熟悉的小鼠，作为新的小鼠，并且在另一个室中，第二阶段中使用的小鼠保持不变，现在充当熟悉的小鼠。每次试验后，用10％乙醇清洁所有腔室和杯状铁丝笼，干燥并通风数分钟，以防止嗅觉提示偏差并确保适当消毒。在适应整个活动场所的最初10min内，证实了缺乏先天的侧面偏好。对照动物对同种小鼠的兴趣天然超过对无生命物体(社交性)的兴趣。同样，对照动物与一只新的不熟悉的小鼠互动的时间比它们已经与之互动过的小鼠要多。这里使用的一些动物模型在这种社会范式中存在缺陷。
[0949]
结果
[0950]
图12和图13显示，用ncimb 43457处理导致更多的社会行为。相对于给予媒介物的小鼠，btbr和mia小鼠在动物室中花费的时间比例比非社交刺激室大得多(图13)，并且在新动物室中花费的时间也比熟悉的动物室更多(图14)。
[0951]
实施例10e-新物体识别
[0952]
将小鼠置于灰色塑料矩形盒(40
×
32
×
23cm,l
×w×
h)的中间，在昏暗的灯光下，60lux，以活动场水平，持续10min。将小鼠放入装有两个相同物体的盒子中24h后，总时间为10min(采集阶段)。24小时后，将两个相同物体中的一个替换为一个新的物体，并将小鼠置于与样品物体相对的墙壁中点处的盒子中间，总时间为10min(保留阶段)。每次实验前使动物适应测试室30min。用10％的酒精清洁盒子和物体，以避免每次试验之间出现任何提示气味。使用天花板摄像机对实验进行录像，以进行进一步的参数分析。与物体的直接接触，包括与嘴巴、鼻子或爪子的任何接触或最小定义距离都被计为互动。对照动物将区分他们已花时间探索的物体和新的物体。
[0953]
结果
[0954]
如图14所示，与给予媒介物的小鼠相比，用ncimb 43457处理的btbr和mia小鼠表现出提高的认知能力，因为相对于熟悉的物体，与新物体互动所花费的时间量显著增加。
[0955]
实施例10f-强迫游泳
[0956]
将小鼠单独放置在一个透明的玻璃圆筒中(24
×
21cm直径)，其中含有15厘米深的水(25
±
0.5℃)。在每只动物之间换水。测试持续6分钟，并使用数字三脚架固定相机对实验进行录像；使用视频(视频媒体播放器软件)进一步对数据进行两次评分，并由不了解条件的实验者进行平均。对不动的延迟进行评分。在测试的最后4分钟测量不动的时间(s)，不动定义为完全没有运动，除了保持头部在水面上方的轻微运动。静止不动的增加意味着当动物自己屈服于其处境(习得性无助)时，抑郁样行为增加。
[0957]
结果
[0958]
ncimb 43457处理减少了抑郁样行为，因为btbr和mia小鼠不动所花的时间显著减少(图15)。总之，结果表明厌氧棒杆菌可能在治疗中有用，例如用于治疗或预防cns病症，如自闭症、焦虑障碍和抑郁症。
[0959]
实施例11-厌氧棒杆菌对体内肠运动的影响
[0960]
本实验测试了肠道屏障功能的变化，以确定使用生物治疗剂的长期治疗是否会改变肠道运动。
[0961]
方法
[0962]
本实验涉及经口施用给定量的无毒、有色标记(胭脂红)以确定肠道的运动性。第一次有色粪便团的排泄时间被记录为“整个肠道运输的时间”，并用作整个肠道蠕动运动的指标。试验前将小鼠单独饲养3小时，以允许适应新笼子。胭脂红染料(每只小鼠100-200ul于0.5％甲基纤维素中的6％胭脂红)通过管饲法经口施用。每10分钟目视检查每个笼子。记录第一次彩色团(红色)的时间。在第一次彩色团出现后，小鼠恢复到正常的饲养条件。
[0963]
结果
[0964]
相对于媒介物处理的btbr对照，用ncimb 43457处理不会导致肠运动时间的显著差异(图16)。
[0965]
实施例12
–
厌氧棒杆菌对离体胃肠道通透性的影响
[0966]
自闭症谱系障碍的btbr和/或mia模型中回肠和结肠的通透性使用ussing室进行离体评估。fitc浓度的增加代表了不希望的效果，因为它表明肠道屏障的“渗漏”增加。
[0967]
方法
[0968]
btbr和mia模型按照实施例10中的描述产生和维持。通过颈椎脱臼对小鼠实施安乐死，并取出远端回肠和结肠，置于沿肠系膜线打开的冷冻krebs溶液中并仔细冲洗。然后如前所述[110]将制剂放入ussing室(harvard apparatus,kent,uk,暴露面积为0.12cm2)，含氧(95％o2、5％co2)krebs缓冲液保持在37℃。将4kda fitc-葡聚糖以2.5mg/ml的最终浓度添加到黏膜腔中；在接下来的3h内，每30min从浆膜室收集200μl样品。
[0969]
结果
[0970]
图17表明用anaerostipes hadrus处理导致回肠和结肠的通透性降低。
[0971]
这些结果表明厌氧棒杆菌菌株可用于改变肠道通透性，例如用于治疗或预防与肠道通透性相关的病症或病况。
[0972]
实施例13
–
厌氧棒杆菌对自闭症谱系障碍模型中脑干单胺水平的影响
[0973]
摘要
[0974]
本研究研究了厌氧棒杆菌菌株ncimb 43457对自闭症谱系障碍btbr和/或mia模型中脑干单胺水平的影响。脑干包含许多用于大脑所有主要神经递质系统的细胞体，包括血清素和去甲肾上腺素。
[0975]
材料和方法
[0976]
小鼠模型
[0977]
如实施例10中所述生成和维护btbr和mia模型。
[0978]
方法
[0979]
动物接受每日口服管饲pbs或于pbs中制备成1x109个cfu/ml的活生物治疗剂。8周后，对动物实施安乐死，并基于来自脑干样品通过hplc分析神经递质浓度。简言之，将脑干
组织在500μl冷冻流动相中进行超声处理，该流动相中加入4ng/40μl的n-甲基5-ht(sigma chemical co.,uk)作为内标。流动相含有0.1m柠檬酸、5.6mm辛烷-1-磺酸(sigma)、0.1m磷酸二氢钠、0.01mm edta(alkem/reagecon,cork)和9％(v/v)甲醇(alkem/reagecon)，并使用4n氢氧化钠(alkem/reagecon)将ph值调节至2.8。然后将匀浆在4℃以22,000
×
g离心15min，并将40μl上清液注入hplc系统，该系统由scl 10-avp系统控制器、lecd 6a电化学检测器(shimadzu)、lc-10as泵、cto-10a炉、sil-10a自动进样器(样品冷却器保持在40c)和在线gastorr degasser(iss,uk)组成。在分离中使用保持在30℃的反相柱(kinetex 2.6u c18 100
×
4.6mm,phenomenex)(流速0.9ml/min)。玻璃碳工作电极与ag/agcl参比电极(shimdazu)的组合在 0.8v下运行，并使用class-vp 5软件(shimadzu)分析生成的色谱图。神经递质通过标准注射确定的其特征保留时间来识别，标准注射在样品分析期间定期运行。测量分析物相比内标的峰高比，并与标准注射进行比较。结果表示为ng神经递质/g组织鲜重。
[0980]
结果
[0981]
如图18和图19所示，给予ncimb 43457的小鼠脑干中某些单胺的水平发生了变化。与给予媒介物的动物相比，btbr和mia小鼠的血清素水平较低(图18)，并且btbr小鼠中的5-hiaa/5-ht周转显著增加(图19)。这表明厌氧棒杆菌可用于治疗或预防与这些神经递质系统失调相关的病症，例如cns病症，如自闭症。
[0982]
实施例14
–
厌氧棒杆菌对自闭症谱系障碍模型杏仁核中基因表达的影响
[0983]
摘要
[0984]
本研究研究了厌氧棒杆菌菌株ncimb 43457对btbr和mia小鼠大脑中某些目标基因表达的影响。评估了催产素系统(催产素受体和加压素受体)、内分泌系统(盐皮质激素(nr3c1)；糖皮质激素受体(nr3c2)；皮质酮释放因子(crf)和受体；和脑源性神经营养因子(bdnf))、免疫系统(il-6、tnfα和tlr-4)；和神经递质系统(nmda受体2a(grin2a)；nmda受体2b(grin2b)；gabaa受体亚基a2；gabab受体亚基b1；血清素2c)在杏仁核中的标志物的mrna水平。
[0985]
材料和方法
[0986]
小鼠模型
[0987]
如实施例10中所述生成和维护btbr和mia模型。
[0988]
方法
[0989]
动物每日接受口服管饲pbs或于pbs中制备成1x109个cfu/ml的活生物治疗剂。8周后，动物被安乐死。大脑被快速切除、解剖，并将每个大脑区在干冰上快速冷冻并储存在-80℃以供进一步分析。如实施例6中所述定量mrna表达。
[0990]
结果
[0991]
如图20所示，相对于仅给予媒介物的小鼠，在给予ncimb 43457的mia小鼠中，杏仁核中所有测试标志物的表达水平都发生了改变。类似地，图19显示了在给予ncimb 43457的btbr小鼠的杏仁核中，所有测试基因(除了gaba b1r和糖皮质激素受体)的表达水平都发生了改变。
[0992]
结果表明，厌氧棒杆菌菌株可用于治疗或预防可能受益于大脑中这些蛋白质表达水平的调节的病症或病况，例如，cns疾病和病症。
[0993]
实施例15
–
真杆菌和faecalicatena对大脑中基因表达的影响
[0994]
摘要
[0995]
本研究研究了真杆菌和faecalicatena对大脑中某些目标基因表达的影响。评估了催产素系统(催产素受体和加压素受体)、内分泌系统(盐皮质激素受体(nr3c1)；糖皮质激素受体(nr3c2)；皮质酮释放因子(crf)和受体(crfr1和crfr2)；脑源性神经营养因子(bdnf))、免疫系统(il-6、tnfα、tlr-4)；和神经递质系统(nmda受体2a(grin2a)；nmda受体2b(grin2b)；gabaa受体亚基a2(gaba a2)；gaba b受体亚基b1(gaba b1r)；血清素2c)在杏仁核、海马体和前额叶皮层(pfc)中的标志物的mrna水平，它们是参与情绪反应的边缘系统的关键大脑区域。
[0996]
材料和方法
[0997]
细菌菌株
[0998]
本研究中研究了真杆菌属的5株菌株(ncimb 43455，挑剔真杆菌菌株ref.1、霍氏真杆菌菌株ref.1、直肠真杆菌菌株ref.2和直肠真杆菌菌株ref.1)和faecalicatena属的两株菌株(f.fissicatena菌株ref.1和f.contorta菌株ref.1)。
[0999]
方法
[1000]
雄性balb/c小鼠连续6天接受1x109个cfu的相关细菌菌株的口服管饲(200μl体积)。在第7天，动物被安乐死。大脑被快速切除、解剖，并将每个大脑区域在干冰上快速冷冻并储存在-80℃以供进一步分析。
[1001]
根据制造商的建议，使用mirvana
tm
mirna分离试剂盒(ambion/life technologies,paisley,uk)和dna酶处理(turbo dna-free,ambion/life technologies)提取总rna。根据制造商的说明，使用nanodrop
tm
分光光度计(thermo fisher scientific inc.,wilmington,delaware,usa)对rna进行定量。根据制造商的程序，使用agilent bioanalyzer(agilent,stockport,uk)评估rna质量，并计算rna完整性数(rin)。rin值》7的rna用于后续实验。根据制造商的说明，使用applied biosystems high capacity cdna试剂盒(applied biosystems,warrington,uk)将rna逆转录为cdna。简言之，将multiscribe逆转录酶(50u/μl)作为rt master mix的一部分添加，25℃下孵育10min，37℃下2h，85℃下5min，并在4℃下储存。使用applied biosystems设计的针对小鼠特异性靶向基因的探针(6羧基荧光素-fam)进行定量pcr，同时使用β-肌动蛋白作为内源性对照。扩增反应含有1μl cdna、5μl的2x pcr master mix(roche)和900nm的每种引物，并通过添加无rna酶的水达到总共10μl。所有反应均使用480系统上的96孔板以一式三份进行。热循环条件按照制造商(roche)的建议进行55个循环。为了检查扩增子污染，对于每种使用的探针，每次运行均不包含模板对照，一式三份。记录循环阈值(ct)。使用β-肌动蛋白对数据进行归一化，并使用2-δδct方法进行转换，并呈现为与对照组相比的倍数变化。
[1002]
结果
[1003]
如表1a至表1c和表2a至表2c所示，从测试的基因来看，相对于仅用媒介物处理，在用直肠真杆菌菌株ref.1处理的小鼠中观察到海马体中crfr1、crfr2和grin2b的表达增加；杏仁核中的crfr1和nr3c2；和pfc中的bdnf。用直肠真杆菌菌株ref.2处理的小鼠显示杏仁核中bdnf、nr3c2、gaba a2和gaba br1表达的增加。另外，在用f.fissicatena菌株ref.1菌株处理的小鼠中观察到杏仁核中il6表达的增加。此外，在用f.contorta菌株ref.1处理的
小鼠中观察到海马体中的催产素受体减少；杏仁核中nr3c2、cd11b、gaba a2和gaba br1的表达增加；以及pfc中的il6。用ncimb 43455处理的小鼠表现出杏仁核中grin2a和gaba br1以及pfc中nr3c1的表达增加。在用挑剔真杆菌菌株ref.1处理的小鼠中观察到海马体中的加压素受体减少；杏仁核中nr3c1和crfr2的表达增加；和pfc中的nr3c2、crfr2和grin2b。最后，在用f.contorta菌株处理的小鼠中观察到杏仁核中加压素受体、nr3c1、crfr2、cd11b、grin2b和gaba a2的表达增加。
[1004]
这表明真杆菌和faecalicatena可用于治疗或预防可能受益于大脑中这些蛋白质表达水平的调节的病症或病况，例如cns疾病和病症。
[1005]
实施例16
–
真杆菌对自闭症谱系障碍模型中行为的影响
[1006]
摘要
[1007]
本研究在自闭症谱系障碍的环境动物模型(母体免疫激活(mia)模型)和遗传动物模型(btbr小鼠品系)中研究了真细菌菌株ncimb 43455对许多行为读数的影响，包括的刻板行为(梳毛和大理石掩埋)、焦虑相关行为(旷场测试和高架十字迷宫测试)、社交行为(3室社交互动测试)、认知表现(新物体识别)和抑郁/急性压力(强迫游泳测试)。
[1008]
材料和方法
[1009]
btbr小鼠模型
[1010]
btbr动物在室内饲养，兄弟姐妹交配。来自这些动物的雄性后代在3周龄时与它们的母亲分开，并且在8周龄时开始每日给予活的生物治疗剂或对照。在动物11周龄时开始进行行为测定。包括一个年龄匹配的c57/bl6对照组作为参考对照组。
[1011]
mia小鼠模型
[1012]
雌性c57/bl6小鼠(8周龄)和年龄匹配的雄性小鼠购自harlan uk。1周习惯化后，这些动物交配。在胚胎第12.5天，雌性接受注射病毒模拟poly-ic以激活母体免疫系统，或注射盐水媒介物。来自这些动物的雄性后代在3周龄时与它们的母亲分开，并且在8周龄时开始每日给予活的生物治疗剂或对照。在动物11周龄时开始进行行为测定。
[1013]
行为测定的实验设计
[1014]
如上所述，当小鼠8周龄时开始给予活的生物治疗剂。初始给药在行为实验之前3周进行。在第11周(3周后)，动物开始进行行为测试。每组有10-12只动物。mia和btbr均在2个队列中运行
–
每个队列中的每只动物以完全相同的顺序在相同的时间长度内经历完全相同的程序。动物总是随机的，因此并非所有一组都在一天运行。
[1015]
行为组按以下顺序进行：第4周的大理石掩埋和梳毛测试；第5周的高架十字迷宫和三室测试；第6周的开放场和新物体识别测试；以及第7周的强迫游泳测试。
[1016]
刻板行为-大理石掩埋试验
[1017]
将小鼠单独放置在一个新的有机玻璃笼子中(35
×
28
×
18.5cm,l
×w×
h)，里面装满锯末(5-10cm)，且其上面为20个大理石(五排或大理石规则间隔远离墙壁2cm，且相距2cm)。30分钟后，统计了其表面埋没2/3以上的大理石数量。埋藏的大理石数量越多，代表高度的刻板行为状态或更高水平的焦虑(新奇恐惧症)。
[1018]
刻板行为-梳毛测试
[1019]
在一个覆盖有过滤器顶部的6.5cm直径
×
10cm高的透明玻璃烧杯中评估自我梳毛。实验动物在测试前多达1小时被带到测试室适应。测试持续时间约为20分钟。记录测试
动物梳毛所花费的累积时间。在测试之间，烧杯被彻底清洁以备下次使用。花更长的时间梳毛表明刻板行为增加；或响应新环境产生更高程度的焦虑。
[1020]
焦虑-高架十字迷宫
[1021]
该装置由一个灰色塑料十字形迷宫制成，距离地面1m，包括两个开放(恐惧)和两个封闭(安全)臂(50
×5×
15cm壁或1cm无壁)。实验在红光(～5lux)下进行。将小鼠单独放置在迷宫的中心，面对开放臂(以避免直接进入封闭的臂)并允许5分钟的自由探索。使用天花板摄像机对实验进行录像，以便使用ethovision软件(3.1版,noldus,tracksys,nottingham,uk)进行进一步的参数分析。分别测量每只臂花费的时间百分比、移动距离和进入次数，用于焦虑行为和运动活动(进入臂定义为所有四只爪子进入臂内)。进入开放臂的时间或次数增加是焦虑减少的指标。
[1022]
抑郁症-强迫游泳测试
[1023]
将小鼠单独放置在一个透明的玻璃圆筒(直径24
×
21cm)中，其中含有15厘米深的水(25
±
0.5℃)。在不同动物的连续测定之间更换水。测试持续6分钟，并使用数字三脚架固定相机对实验进行录像；使用视频(视频媒体播放器软件)进一步对数据进行两次评分，并由不了解条件的实验者进行平均。对不动的延迟进行评分。在测试的最后4分钟测量不动的时间(s)，不动定义为完全没有运动，除了保持头部在水面上方的轻微运动。不动的增加意味着当动物自己屈服于其处境(习得性无助)时，抑郁样行为的增加。
[1024]
社交互动
–
3室测试
[1025]
社交测试仪器是一个长方形的三室盒子。每个腔室为20cm(l)
×
40cm(w)
×
22cm(h)。分隔壁由小圆形开口(直径5cm)制成，允许进入每个腔室。两个相同的铁丝杯状笼子，底部直径为10cm，高度为13cm，且条间距为1.2cm，允许条之间的鼻子接触，但防止打架，以双边对称的位置放置在每个侧室内。该测试分为三个阶段，每个阶段10分钟：1)居住，2)小鼠相比于物体，3)新小鼠相比于熟悉的小鼠。使用天花板摄像机对实验进行录像，以便使用ethovision软件(3.1版,noldus,tracksys,nottingham,uk)进行进一步的参数分析。对于第一阶段，将测试小鼠放入中间室，并允许探索整个盒子，里面有空的小铁丝笼，进行10分钟的适应期。适应期结束后，将测试小鼠从测试箱中取出一小段时间，同时将一个物体放置在一个侧室中，并将一只不熟悉的同种雄性小鼠(未与测试对象事先接触)放在另一侧室中，两者都封闭在一个铁丝杯状的笼子里。在第二阶段，测试小鼠被放置在中间室中，并允许探索整个盒子10min。评估了在每个腔室中探索物体或小鼠所花费的时间量以及进入每个腔室的次数。左侧相比右侧室中不熟悉小鼠的位置在试验之间系统地交替。进入定义所有四个爪子进入腔室中。在第三阶段，一个物体被替换为一只不熟悉的小鼠作为新小鼠，且在另一个腔室中，第二阶段使用的小鼠保持不变，现在充当熟悉的小鼠。每次试验后，用10％乙醇清洁所有腔室和杯状铁丝笼，干燥并通风几分钟，以防止嗅觉提示偏差并确保适当消毒。在适应整个活动场所的最初10min内，证实了缺乏先天的侧面偏好。对照动物对同种小鼠的兴趣天然超过对无生命物体的兴趣(社交性)。同样，对照动物与一只新的不熟悉的小鼠互动所花的时间比它们已经与之互动过的小鼠要多。这里使用的一些动物模型在这种社会范式中存在缺陷。
[1026]
认知表现-新物体识别
[1027]
将小鼠置于灰色塑料矩形盒(40
×
32
×
23cm,l
×w×
h)中间，于运动场所水平的昏
暗灯光(60lux)下，持续10min。24小时后，将小鼠放入装有两个相同物体的盒子中，总时间为10min(采集阶段)。24小时后，将两个相同物体中的一个替换为一个新的物体，并将小鼠置于与样品物体相对的壁中点处的盒子中间，总时间为10min(保留阶段)。每次实验前使动物适应测试室30分钟。用10％的酒精清洁盒子和物体，以避免每次试验之间出现任何提示气味。使用天花板摄像机对实验进行录像，以进行进一步的参数分析。与物体的直接接触，包括与嘴巴、鼻子或爪子的任何接触或最小定义距离，都被计为互动。对照动物将区分它们已花时间探索的物体和新的物体。
[1028]
生物治疗剂的施用
[1029]
动物每日接受口服管饲pbs或于pbs中制备成1x109个cfu/ml的活的生物治疗细菌菌株。在8周龄时开始每日给予活的生物治疗剂，并且在整个行为范式中每天持续施用。
[1030]
结果
[1031]
如图21所示的刻板行为，用ncimb 43455处理的mia小鼠表现出刻板相关行为的减少，因为它们梳毛所花的时间显著减少。另外，用ncimb 43455处理的btbr和mia小鼠在大理石掩埋试验中显示出刻板相关行为的减少，这可以从掩埋的大理石数量减少中得到证明。
[1032]
通过高架十字迷宫评估的焦虑样行为也被发现在用ncimb 43455处理的mia小鼠中得到改善。这些小鼠进入迷宫的开放臂的次数显著增加(图22)，并且相对于给予媒介物的小鼠，在迷宫的开放臂中花费的持续时间更长。与对照小鼠相比，用ncimb 43455处理的btbr小鼠在开放臂中花费的时间非常少。
[1033]
通过新物体识别测试评估的认知表现也被发现在用ncimb 43455处理的btbr和mia小鼠中都有提高，因为相比熟悉物体，这些小鼠花费更多时间与新物体互动。
[1034]
图23显示，用细菌菌株处理也改善了社会行为缺陷，因为与对照组相比，与非社交刺激室相比，mia和btbr小鼠在动物室中花费的时间显著更多。此外，用ncimb 43455处理的mia小鼠在含有新的同种的腔室中的持续时间也明显高于容纳熟悉同种小鼠的腔室。
[1035]
最后，用ncimb 43455处理在自闭症的遗传和环境动物模型中也显示出抗抑郁样作用，因为当用这种菌株处理时，btbr和mia小鼠不动所花的时间明显减少(图24)。总之，结果表明真杆菌可能在治疗中有用，例如用于治疗或预防cns病症，如自闭症、焦虑障碍和抑郁症。
[1036]
实施例17
–
真杆菌自闭症动物模型中肠道功能的影响
[1037]
摘要
[1038]
本研究研究了真杆菌菌株ncimb 43455在自闭症谱系障碍的环境动物模型(母体免疫激活模型)和遗传动物模型(btbr小鼠品系)中对肠道运动和肠道通透性测定的影响。
[1039]
材料和方法
[1040]
小鼠模型
[1041]
btbr和mia模型的生成和维护如实施例2中所述。
[1042]
生物治疗剂的施用
[1043]
动物接受每日口服管饲pbs或在pbs中制备为1x109个cfu/ml的活生物治疗细菌菌株。从8周龄开始每日给予活的生物治疗剂。
[1044]
肠道功能
–
肠运动
[1045]
当小鼠13周大时(开始每日给予活的生物治疗剂后5周)，对肠运动进行测定。测定
前将小鼠单独饲养3h，以允许适应新笼子。通过管饲法经口施用胭脂红染料(每只小鼠，0.5％甲基纤维素中的100-200ul 6％胭脂红)。每10min目视检查每个笼子。记录第一次彩色团(红色)的时间。在第一次彩色团出现后，小鼠恢复到正常的饲养条件。
[1046]
肠道功能
–
肠道通透性
[1047]
对15周龄(开始每日给予活的生物治疗剂后7周)拣选的小鼠组织进行肠道通透性测定。通过颈椎脱臼对小鼠实施安乐死，并取出远端回肠和结肠，置于沿肠系膜线打开的冷冻krebs溶液中并仔细冲洗。然后如前所述(hyland和cox,2005)将制剂放入保持在37℃的具有含氧(95％o2,5％co2)krebs缓冲液的ussing室(harvard apparatus,kent,uk,暴露面积为0.12cm2)中。将4kda fitc-葡聚糖以2.5mg/ml的最终浓度添加到黏膜腔中；在接下来的3h内，每30min从浆膜室收集200μl样品，并测量那些样品中的荧光。
[1048]
结果
[1049]
如图25a所示，用ncimb 43455处理的mia小鼠的肠运动时间显著缩短，这表明整个肠的蠕动运动增加和整体肠功能得到改善。另外，ncimb 43455处理还恢复了mia小鼠回肠通透性的缺陷。这些结果表明，用真杆菌处理可用于治疗与自闭症谱系障碍相关的肠道功能受损，包括肠道运动降低和/或肠道通透性增加。
[1050]
实施例18
–
真杆菌对自闭症谱系障碍模型中脑干单胺水平的影响
[1051]
摘要
[1052]
本研究研究了真杆菌菌株ncimb 43455对自闭症谱系障碍btbr和mia模型中脑干单胺水平的影响。脑干包含大脑所有主要神经递质系统的许多细胞体，包括血清素和去甲肾上腺素。水平的增加表明响应于活生物治疗剂给药的神经递质释放增加。
[1053]
材料和方法
[1054]
小鼠模型
[1055]
btbr和mia模型的生成和维护如实施例2中所述。
[1056]
方法
[1057]
从8周龄开始，动物每天接受pbs或在pbs中制备为1x109个cfu/ml的活生物治疗剂的口服管饲。用生物治疗剂给药7周后，对动物实施安乐死，并通过hplc对来自脑干样品分析神经递质浓度。简言之，将脑干组织在500μl冷冻流动相中进行超声处理，该流动相中加入4ng/40μl的n-甲基5-ht(sigma chemical co.,uk)作为内标。流动相含有0.1m柠檬酸、5.6mm辛烷-1-磺酸(sigma)、0.1m磷酸二氢钠、0.01mm edta(alkem/reagecon,cork)和9％(v/v)甲醇(alkem/reagecon)，并使用4n氢氧化钠(alkem/reagecon)将ph值调节至2.8。然后将匀浆在4℃以22,000g离心15min，并将40μl上清液注入hplc系统，该系统由scl 10-avp系统控制器、lecd 6a电化学检测器(shimadzu)、lc-10as泵、cto-10a烤箱、sil-10a自动进样器(样品冷却器保持在40c)和在线gastorr degasser(iss,uk)组成。在分离中采用保持在30℃的反相柱(kinetex 2.6u c18 100
×
4.6mm,phenomenex)(流速0.9ml/min)。玻璃碳工作电极与ag/agcl参比电极(shimdazu)的组合在 0.8v下运行，并使用class-vp 5软件(shimadzu)分析生成的色谱图。神经递质通过利用标准注射确定的其特征保留时间来识别，标准注射在样品分析期间定期运行。测量分析物相比内标的峰高比，并与标准进样进行比较。结果表示为ng神经递质/g鲜重组织。
[1058]
结果
[1059]
如图26所示，给予ncimb 43455的小鼠脑干中某些单胺的水平发生了变化。与给予媒介物的动物相比，btbr小鼠的血清素水平显著降低，并且mia小鼠的血清素水平也降低。另外，在用ncimb 43455处理的mia小鼠中，5-hiaa/5-ht的比率显著增加，表明血清素周转和血清素活性增加[111]。这表明真细菌可用于治疗或预防与这些神经递质系统失调相关的病症，例如cns病症，如自闭症、婴儿猝死综合征(sids)和重性抑郁障碍(mdd)[111],[112]。
[1060]
实施例19
–
真杆菌对自闭症谱系障碍模型中杏仁核基因表达的影响
[1061]
摘要
[1062]
本研究研究了真杆菌菌株ncimb 43455对btbr和mia小鼠大脑中某些目标基因表达的影响。评估了杏仁核中催产素系统(催产素受体和加压素受体)、内分泌系统(盐皮质激素(nr3c1)；糖皮质激素受体(nr3c2)；皮质酮释放因子(crf)和受体(crf1r和crf2r)；脑源性神经营养因子(bdnf))的mrna水平))、免疫系统(il-6、tnf-α、tlr-4)；和神经递质系统(nmda受体2a(grin2a)；nmda受体2b(grin2b)；gabaa受体亚基a2；gabab受体亚基b1；血清素2c)的标志物的mrna水平。
[1063]
材料和方法
[1064]
小鼠模型
[1065]
btbr和mia模型的生成和维护如实施例2中所述。
[1066]
方法
[1067]
从8周龄开始，动物每天接受pbs或在pbs中制备为1x109个cfu/ml的活生物治疗剂的口服管饲。再用生物治疗剂给药7周后，对动物实施安乐死。大脑被快速切除、解剖，并将每个大脑区域在干冰上快速冷冻并储存在-80℃以供进一步分析。
[1068]
如实施例1中所述定量mrna表达。
[1069]
结果
[1070]
如图27a和图27b所示，给予ncimb 43455的btbr小鼠在杏仁核中表现出升高的crf2r水平。相对于给予媒介物的小鼠，用菌株处理还与mia小鼠杏仁核中grin2a表达水平的显著增加和5ht1ar表达增加有关。结果表明，真杆菌可用于治疗或预防可能受益于大脑中这些蛋白质表达水平的调节的病症或病况，例如，cns疾病和病症。
[1071]
实施例20
–
厌氧棒杆菌对结直肠癌细胞中h3/h4乙酰化的影响
[1072]
摘要
[1073]
本研究使用间接免疫荧光研究了四种厌氧棒杆菌属细菌菌株对两种结直肠癌细胞系(hct116和ht29)中组蛋白h3和h4乙酰化的影响。
[1074]
材料和方法
[1075]
细菌菌株
[1076]
测试了以下细菌菌株：anaerostipes hadrus ncimb 43526、anaerostipes hadrus ncimb 43457、粪厌氧棒杆菌菌株ref.1和anaerostipes hadrus菌株ref.1。
[1077]
厌氧棒杆菌上清液制剂
[1078]
上文所列四种厌氧棒杆菌细菌菌株分别按如下方式分别培养：100μl研究细胞库(research cell bank)小瓶用于接种10ml ycfa 肉汤。将培养物在厌氧工作站中于37℃孵育过夜。每个过夜培养物用于接种5个含有10ml具有10％继代培养物的新鲜生长培养基的
hungate管。将培养管温育直到它们达到早期稳定期，然后按如下收集无细胞上清液(cfs)。合并单个培养管并记录细菌密度(o.d.600nm)。通过离心(5000x g,15min)和通过0.45μm过滤，然后通过0.22μm过滤器获得两种菌株的无细胞上清液。
[1079]
处理和成像
[1080]
将结直肠癌细胞系hct116和ht29以10,000个细胞/孔的密度接种在黑色96孔板中过夜。用来自所示厌氧棒杆菌细菌菌株的10％细菌上清液处理细胞24h；或仅使用ycfa 肉汤、2mm丁酸盐或未经处理，作为对照。之后，将细胞在室温(rt)用于pbs(ph 7.3)中的4％多聚甲醛固定20min。将固定的细胞用pbs洗涤，并用于pbs中的0.5％triton x-100渗透10min。用pbs洗涤后，将板与封闭缓冲液(4％bsa/pbs)一起在rt孵育1h，然后加入一抗(抗ach3抗体(06-599,millipore)或抗ach4抗体(06-598,millipore)，二者均以1:500，在1％bsa/pbs中于4℃稀释1h)或1％bsa/pbs作为阴性对照，在4℃稀释12h。然后将它们用pbs洗涤两次，然后与alexa flour 488缀合的抗兔(molecular probes inc)和alexa flour 594(molecular probes inc)缀合的一起在rt孵育1h。用pbs洗涤3x后，用dapi标记板并用pbs洗涤3x。使用配备20x物镜和适用于检测所用荧光染料的滤光片组的imagexpress pico显微镜(molecular devices)观察板。存储的图像保存为tiff文件。使用graphpad prism 7软件绘制和分析pico分析模块生成的原始分析数据。选择有代表性的图像来说明所检查的组蛋白乙酰化的差异。hct116细胞的结果如图28所示，且ht29细胞的结果如图29所示。
[1081]
结果和讨论
[1082]
如图28和图29所示，在用厌氧棒杆菌细菌菌株的上清液处理后，在hct116和ht29细胞系中观察到乙酰化组蛋白h3和h4水平的增加。特别地，anaerostipes hadrus ncimb 43526的上清液导致两种结直肠癌细胞系中的h3和h4乙酰化增加。结合实施例5中针对anaerostipes hadrus菌株dsm 3319提供的直接hdac抑制数据，这为厌氧棒杆菌属细菌菌株抑制hdac活性的能力提供了进一步的支持。因此，结果表明厌氧棒杆菌属细菌菌株可用于治疗或预防由hdac活性介导的病症或病况，如癌症，如上文所解释(参见实施例5)。
[1083]
序列
[1084]
seq id no:1-anaerostipes hadrus菌株dsm 3319 16s核糖体rna，部分序列
[1085]
[1086][1087]
seq id no:2
–
anaerostipes hadrus菌株5/1/63faa 16s核糖体rna基因
[1088]
[1089][1090]
seq id no:3
–
丁酸厌氧棒杆菌(anaerostipes butyraticus)菌株35-7 16s核糖体rna基因，部分序列
[1091]
[1092][1093]
seq id no:4
–
anaerostipes rhamnosivorans菌株1y-2 16s核糖体rna基因，部分序列
[1094]
[1095][1096]
seq id no:5
–
粪厌氧棒杆菌菌株l1-92 16s核糖体rna基因
[1097][1098]
[1099]
seq id no:6
–
anaerostipes hadrus ncimb 43457 16s核糖体rna
[1100]
ttacggttgggtcactgacttcgggcgttactgactcccatggtgtgacgggcggtgtgtacaagacccgggaacgtattcaccgcgacattctgattcgcgattactagcgattccagcttcatgtagtcgagttgcagactacaatccgaactgagacgttatttttgggatttgctcgacctcgcggttctgcctccctttgtttacgccattgtagcacgtgtgtagccctgctcataaggggcatgatgatttgacgtcatccccaccttcctccaggttatccctggcagtctctctagagtgcccggccagaccgctggctactaaagataggggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtcatccctgtcccgaaggaaaggcaacattacttgccggtcagggagatgtcaagagcaggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggactacttattgcgtttgctgcggcaccgaacagctttgctgcccgacacctagtagtcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgagcctcaacgtcagttaccgtccagtaagccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccgcttacctctccggtactctagattgacagtttccaatgcagtcccggggttgagccccgggttttcacatcagacttgccactccgtctacgctccctttacacccagtaaatccggataacgcttgcaccatacgtattaccgcggctgctggcacgtatttagccggtgcttcttagtcaggtaccgtcattttcttccctgctgatagagctttacataccgaaatacttcatcgctcacgsggygtcgstgcatcagggtttcccccattgsacaatwttccccactgctgcctcctgtaggagtgggggccgtgtctcagtcacaatg
[1101]
》seq id no:7
–
anaerostipes hadrus ncimb 43526 16s核糖体rna
[1102]
ttcggcagctccctccttacggttgggtcactgacttcgggcgttactgactcccatggtgtgacgggcggtgtgtacaagacccgggaacgtattcaccgcgacattctgattcgcgattactagcgattccagcttcatgtagtcgagttgcagactacaatccgaactgagacgttatttttgggatttgctcactctcacgaggctgcttccctctgtttacgccattgtagcacgtgtgtagccctggtcataaggggcatgatgatttgacgtcgtccccaccttcctccaggttatccctggcagtctctctagagtgcccacctkawatgctggctactaaagataggggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtcwctcctgtcccgaaggaaaagtccggttaaggaccggtcagaaggatgtcaagaccaggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggaatacttactgcgttggctgcggcaccgaagcctctacggccccgacacctagtattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgtgcctcagtgtcagtttcagtccagtaagccgccttcgccactgatgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccgcttacctctcctgcactcyagtctgacagtttcaaaagcagtcccagagttaagccctgggttttcacttctgacttgccataccacctacgcaccctttacacccagtaattccggataacgcttgccccctacgtattaccgcggctgctggcacgtagttagccggggcttcttagtcaggtaccgtcattttcttccctgctgatagagctttacataccgagatacttcttcactcacgcggcgtcgctgcatcagggtttcccccattgtgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtttgggccgtgtctcagtcccaatgtggccgttcactctctcaagccggctactgatcgtcgccttggtgagccgttacctcaccaaccagctaatcagacgcgggtccatcctgtaccaccggagtttttacccctgcaccatgcggtgctgtggtcttatgcggtattagcagtcatttctgactgttatccccctgtacagggcaggttacccacgcgttactcacccgtccgccactcaatcaccaaatcttcagttccgaagaaaatcaaataaggtgtttcgttcgacttgcat
[1103]
seq id no:8(来自根据登录号ncimb 43455保藏的卡兰德真杆菌菌株的共有16s核糖体rna序列)
[1104]
ctgctgagtccttgcggttctctcacaggcttcgggtgttgccaactctcgtggtgtgacgggcggtgt
gtacaagacccgggaacgcattcaccgcggcattctgatccgcgattactagcaactccaacttcatgcaggcgagttgcagcctgcaatccgaactgggatctgttttaagggatttgcttcacctcgcggcttcgcggccctctgttcagaccattgtagcacgtgtgtagcccaggtcataaggggcatgatgatttgacgtcatccccaccttcctccgtattgtctacggcagtccctctagagtgcccaactgaatgctggcaactaaaggcaggggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtctctctgttcccgaaggaaacttcctatctctaggctcgtcagaggatgtcaagacctggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccgctgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcaaccttgcggtcgtactccccaggcggaatgcttattgtgttaactgcggcactgagtttccccaacacctagcattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgttcgctccccacgctttcgcacctcagcgtcagtatttgtccagcaagccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccacttgcctctccaatactcaagtctaccagtttccaatgcacttcaccggttgagccggtacctttcacatcagacttaatagaccgcctacgcgccctttacgcccagtcattccggacaacgcttgtcccctacgtattaccgcggctgctggcacgtagttagccgggacttcctcattgggtaccgtcatgttttcttccccaataacagagctttacgatccgaaaaccttcttcactcacgcggtattgctgcgtcagggttgcccccattgcgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtctggaccgtgtctcagttccagtgtgaccgttcgccctctcagaccggttacccatcgtcgccttggtgggctgttatctcaccaactagctaatgggacgcgggtccatcctatggcaccggagttttcatgatcttgccatgcgacaaaaccataatataaggctttactcccagtttcccgaggctattcctttccatagggcaggttacccacgcgttactcacccgttcgccactttccagttctaatttcacccgaaggatcattcaaaaccttctcgttcgactgcatg
[1105]
seq id no:9(来自挑剔真杆菌菌株挑剔真杆菌菌株ref.1的共有16s核糖体rna序列)
[1106]
ttcggcggctccttctttcgttaggtcaccgacttcgggcattttcgactcccatggtgtgacgggcggtgtgtacaagacccgggaacgtattcaccgcagcattctgatctgcgattactagcgattccagcttcatgtagtcgagttgcagactacaatccgaactgagacgttatttttgtgatttgcttggcctcacgacttcgcttcactttgtttacgccattgtagcacgtgtgtagcccaagtcataaggggcatgatgatttgacgtcatccccaccttcctccaggttatccctggcagtctccctagagtgcccatcttactgctggctactaaggataggggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtcaccactgtcccgaaggaaaggacacattactgtccggtcagtgggatgtcaagacttggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggaatacttattgcgtttgctgcggcaccgaagcccttatgggccccgacacctagtattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgagcctcagtgtcagttacagtccagtgagccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccactcacccctcctgcactctagccttacagtttcaaaagcagttccggggttgagccccggattttcacttctgacttgcatggccacctacactccctttacacccagtaaatccggataacgcttgctccatacgtattaccgcggctgctggcacgtatttagccggagcttcttagtcaggtaccgtcactatcttccctgctgatagagctttacataacgaattacttcttcactcacgcggcgtcgctgcatcagagtttcctccattgtgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtctgggccgtgtctcagtcccaatgtggccggtcaccctctcaggtcggctactgatcgtcgccttggtgggctgttatctcaccaactagctaatcagacgcgggtccatcttataccaccggagtttttcacaccatgtcatgcaacattgtgcgcttatgcggtattaccagccgtttccagctgctatcccccagtacaaggcaggttacccacgcgttactcacccgtccgccactcagtcataagcaacttca
[1107]
seq id no:10(来自直肠真杆菌菌株直肠真杆菌菌株ref.2的共有16s核糖体rna
序列)
[1108]
gctccttcctttcggttaggtcactggcttcgggcattcccaactcccatggtgtgacgggcggtgtgtacaagacccgggaacgtattcaccgcagcattctgatctgcgattactagcgattccagcttcgtgtagtcgggttgcagactacagtccgaactgagacgttatttttgagatttgctcggcttcacagctttgcttccctttgtttacgccattgtagcacgtgtgtagcccaagtcataaggggcatgatgatttgacgtcatccccgccttcctccaggttatccctggcagtctctctagagtgcccggccgaaccgctggctactaaagataagggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtcactcctgctccgaagagaaggtacggttaagtaccggtcagaaggatgtcaagacttggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggaatacttactgcgtttgcgacggcaccgagaagcaatgcttcccaacacctagtattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgagcctcagcgtcagttatcgtccagtaagccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccgcttacccctccgacactctagtacgacagtttccaatgcagtaccggggttgagccccgggctttcacatcagacttgccgcaccgcctgcgctccctttacacccagtaaatccggataacgcttgcaccatacgtattaccgcggctgctggcacgtatttagccggtgcttcttagtcaggtaccgtcattatcttccctgctgatagagctttacataccgaaatacttcttcgctcacgcggcgtcgctgcatcaggctttcgcccattgtgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtttgggccgtgtctcagtcccaatgtggccggtcaccctctcaggtcggctatggatcgtcgccttggtgggccgttacctcaccaactagctaatccaacgcgggtccatcttataccaccggagtttttcacactgcatcatgcgatgctgtgcgcttatgcggtattagcagccgtttccaactgttatccccctgtacaaggcaggttacccacgcgttactcacccgtccgccactcagtcacaaaataatcagtcccgaaggaaatcaaataaagtgcttcgtcgactgca
[1109]
seq id no:11(来自直肠真杆菌菌株直肠真杆菌菌株ref.1的共有16s核糖体rna序列)
[1110]
gctccttcctttcggttaggtcactggcttcgggcattcccaactcccatggtgtgacgggcggtgtgtacaagacccgggaacgtattcaccgcagcattctgatctgcgattactagcgattccagcttcgtgtagtcgggttgcagactacagtccgaactgagacgttatttttgagatttgctcggcttcacagctttgcttccctttgtttacgccattgtagcacgtgtgtagcccaagtcataaggggcatgatgatttgacgtcatccccgccttcctccaggttatccctggcagtctctctagagtgcccggccgaaccgctggctactaaagataagggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtcactcctgctccgaagagaaggtacggttaagtaccggtcagaaggatgtcaagacttggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggaatacttactgcgtttgcgacggcaccgagaagcaatgcttcccaacacctagtattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgagcctcagcgtcagttatcgtccagtaagccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccgcttacccctccgacactctagtacgacagtttccaatgcagtaccggggttgagccccgggctttcacatcagacttgccgcaccgcctgcgctccctttacacccagtaaatccggataacgcttgcaccatacgtattaccgcggctgctggcacgtatttagccggtgcttcttagtcaggtaccgtcattatcttccctgctgatagagctttacataccgaaatacttcttcgctcacgcggcgtcgctgcatcaggctttcgcccattgtgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtttgggccgtgtctcagtcccaatgtggccggtcaccctctcaggtcggctatggatcgtcgccttggtgggccgttacctcaccaactagctaatccaacgcgggtccatcttataccaccggagtttttcacactgcatcatgcgatgctgtgcgcttatgcggtattagcagccgtttccaactgttatccccctgtac
aaggcaggttacccacgcgttactcacccgtccgccactcagtcacaaaataatcagtcccgaaggaaatcaaataaagtgcttcgttcgactgca
[1111]
seq id no:12(来自faecalicatena fissicatena菌株f.fissicatena菌株ref.1的共有16s核糖体rna序列)
[1112]
ggcagctccctccttacggttgggtcactgacttcgggcgttaccaactcccatggtgtgacgggcggtgtgtacaagacccgggaacgtattcaccgcgacattctgattcgcgattactagcgattccagcttcatgtagtcgagttgcagactacaatccgaactgagacgttatttttgggatttgctcaacctcgcggtattgcctccctttgtttacgccattgtagcacgtgtgtagccctgctcataaggggcatgatgatttgacgtcatccccaccttcctccaggttatccctggcagtctctctagagtgcccggccaaaccgctggctactaaagataagggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtctccactgccccgaagggaaggcgccattacacgccggtcagtgggatgtcaagagcaggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggaatacttattgcgtttgctgcggcaccgaatggctttgccacccgacacctagtattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgagcctcaacgtcagtgatcgtccagtaagccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccacttacctctccgacactctagttacatagtttccaatgcagtcccggggttgagccccgggttttcacatcagacttacataaccgtctacgctccctttacacccagtaaatccggataacgcttgccccctacgtattaccgcggctgctggcacgtagttagccggggcttcttagtcaggtaccgtcattttcttccctgctgatagaagtttacataccgaaatacttcatccttcacgcggcgtcgctgcatcagggtttcccccattgtgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtttgggccgtgtctcagtcccaatgtggccggtcaccctctcaggtcggctactgatcgtcgccttggtaagccgttaccttaccaactagctaatcagacgcgggtccatctcataccaccggagtttttcccactgtaccatgcggtaccgtggtcttatgcggtattagcagtcatttctaactgttatccccctgtatgaggcaggttacccacgcgttactcacccgtccgccgctcagtcgcaaaactcttcaatccgaagaaatcaaagtaaagcgctccgctcgacttgc
[1113]
seq id no:13(来自faecalicatena contorta菌株f.contorta菌株ref.1的共有16s核糖体rna序列)
[1114]
tgcagtcgagcgaagcagctttacttagatttcttcggattgaaagagttttgcgactgagcggcggacgggtgagtaacgcgtgggtaacctgcctcatacagggggataacagttagaaatgactgctaataccgcataagaccacggtaccgcatggtacagtgggaaaaactccggtggtatgagatggacccgcgtctgattagctggttggtaaggtaacggcttaccaaggcgacgatcagtagccgacctgagagggtgaccggccacattgggactgagacacggcccaaactcctacgggaggcagcagtggggaatattgcacaatgggggaaaccctgatgcagcgacgccgcgtgaaggatgaagtatttcggtatgtaaacttctatcagcagggaagaaaatgacggtacctgactaagaagccccggctaactacgtgccagcagccgcggtaatacgtagggggcaagcgttatccggatttactgggtgtaaagggagcgtagacggttatgtaagtctgatgtgaaaacccggggctcaaccccgggactgcattggaaactatgtaactagagtgtcggagaggtaagtggaattcctagtgtagcggtgaaatgcgtagatattaggaggaacaccagtggcgaaggcggcttactggacgatgactgacgttgaggctcgaaagcgtggggagcaaacaggattagataccctggtagtccacgccgtaaacgatgaatactaggtgtcgggtggcaaagccattcggtgccgcagcaaacgcaataagtattccacctggggagtacgttcgcaagaatgaaactcaaaggaattgacggggacccgcacaagcggtggagcatgtggtttaattcgaagcaacgcgaagaaccttacctgctcttgacatccccctgaccggcgcgtaatggtgcctttccttcgggacaggggagacaggtggtgcatggttgtcgtcagctcgtgtcgtgagatgttgggttaagtcccgcaacgagcgcaacccttatctttagtagccagcg
gtatggccgggcactctagagagactgccagggataacctggaggaaggtggggatgacgtcaaatcatcatgccccttatgagcagggctacacacgtgctacaatggcgtaaacaaagggaggcgaagccgcgaggtggagcaaatcccaaaaataacgtctcagttcggattgtagtctgcaactcgactacatgaagctggaatcgctagtaatcgcgaatcagaatgtcgcggtgaatacgttcccgggtcttgtacacaccgcccgtcacaccatgggagttggtaacgcccgaagtcagtgacccaaccgcaaggagggagctgccgaag
[1115]
seq id no:14(来自霍氏真杆菌菌株ref.1的共有16s核糖体rna序列)
[1116]
aggttgggtcactggsttcnggcatttycnantcccatggtgtgrcsggcggtgtgkacaanamccgggaacgtattyaccgsgacattyygrwtygngattactagcgattccagcttcgtgtagtcgggttgcagaatacagtccgaactgggacggcctttttgtggtttgstccccctcgcgggttcgcctcactctgtgaccgccattgtagcacgtgtgtcgcccagatcataaggggcatgatgatttgacgtcgtccccaccttcctccaggttatccctggcagtctctccagagtgcccagccttacctgctggctactgaagataggggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtctcttctgtcccgaaggaaagcaccgattaaggtgcggtcagaaggatgtcaagacctggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggaatacttactgcgtttgcggcggcaccgaagcctatacggccccgacacctagtattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgtgcctcagtgtcagtaacagtccagcaggccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccgcctgcctctcctgtactctagccgagcagtttcaaatgcagctccggggttgagccccggcctttcacatctgacttgcactgccacctacgcaccctttacacccagtaaatccggataacgcttgctccatacgtattaccgcggctgctggcacgtatttagccggagcttcttagtcaggtaccgtcattatcttccctgctgatagagctttacataccgaaatacttcttcactcacgcggcgttgctgcatcagggtttcccccattgtgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtttggaccgtgtctcagttccaatgtggccgttcatcctctcagaccggctactgatcgttgccttggtaggccgttaccctgccaaccagctaatcagacgcgggcccatcctgtaccaccggagtttttcacacwaggagatgtctcctcgtgcgcttatgcggtattagcagccgtttccagctgttatccccctgtacagggcaggttacccacgcgttactcacccgtccgccactcagtcacca
[1117]
seq id no:15(来自粪厌氧棒杆菌菌株ref.1的共有16s核糖体rna序列)
[1118]
cggcagctccctccttgcggttgggtcactgacttcgggcgttactgactcccatggtgtgacgggcggtgtgtacaagacccgggaacgtattcaccgtgacattctgattcacgattactagcgattccagcttcatgtagtcgagttgcagactacaatccgaactgagacgttatttctgggatttgcttcgcctcacgacttcgcttccctttgtttacgccattgtagcacgtgtgtagccctggccataaggggcatgatgatttgacgtcgtccccaccttcctccaggttatccctggcagtctctctagagtgcccatccgtaatgctggctactaaagataggggttgcgctcgttgcgggacttaacccaacatctcacgacacgagctgacgacaaccatgcaccacctgtctccaatgtctcgaaagaaaaaaccggttaaggttcggtcattgggatgtcaagaccaggtaaggttcttcgcgttgcttcgaattaaaccacatgctccaccgcttgtgcgggtccccgtcaattcctttgagtttcattcttgcgaacgtactccccaggtggaatacttactgcgtttgctgcggcaccgaagcctctacggccccgacacctagtattcatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgtgcatcagtgtcagtgacagtccagtaagccgccttcgccactggtgttcctcctaatatctacgcatttcaccgctacactaggaattccgcttacctctcctgcactccagcatgacagtttcaaaagcagtcccggggttaagccccgggctttcacttctgacttaccatgccacctacgcaccctttacacccagtaattccggataacgcttgccccctacgtattaccgcggctgctggcacgtagttagccggggcttcttagtcaggtaccgtctgttttcttccctgctgatagagctttacataccgaaatacttcttcactcacgcggcgtcgctgcatcagggtttcccccat
tgtgcaatattccccactgctgcctcccgtaggagtttgggccgtgtctcagtcccaatgtggccgttcactctctcaagccggctactgatcgtcgccttggtgagccgttacctcaccaaccagctaatcagacgcgggaccatcctatactgccagggcttttcacactgaatcatgcgattctgtgcgcttatgcggtattagcagccgtttccagctgttatccccctgtatagggcaggttccccacgcgttactcacccgtccgccactcagtcatataggaaatccatccgaaaacttcaatcctaaatgcttcgttcgactgca
[1119]
seq id no:16：来自荷兰的anaerostipes rhamnosivorans菌株1y-2的16s核糖体rna基因，部分序列(dsm 26241)
[1120][1121][1122]
参考文献
[1123]
[1]spor et al.(2011)nat rev microbiol.9(4):279-90.
[1124]
[2]eckburg et al.(2005)science.10；308(5728):1635-8.
[1125]
[3]macpherson et al.(2001)microbes infect.3(12):1021-35
[1126]
[4]macpherson et al.(2002)cell mol life sci.59(12):2088-96.
[1127]
[5]mazmanian et al.(2005)cell 15；122(1):107-18.
[1128]
[6]frank et al.(2007)pnas 104(34):13780-5.
[1129]
[7]scanlan et al.(2006)j clin microbiol.44(11):3980-8.
[1130]
[8]kang et al.(2010)inflamm bowel dis.16(12):2034-42.
[1131]
[9]machiels et al.(2013)gut.63(8):1275-83.
[1132]
[10]wo 2013/050792
[1133]
[11]wo 03/046580
[1134]
[12]wo 2013/008039
[1135]
[13]wo 2014/167338
[1136]
[14]goldin and gorbach(2008)clin infect dis.46suppl 2:s96-100.
[1137]
[15]azad et al.(2013)bmj.347:f6471.
[1138]
[16]frank et al.(2007)pnas 104(34):13780-5.
[1139]
[17]scanlan et al.(2006)j clin microbiol.44(11):3980-8.
[1140]
[18]kang et al.(2010)inflamm bowel dis.16(12):2034-42.
[1141]
[19]machiels et al.(2013)gut.63(8):1275-83.
[1142]
[20]mayer et al(2014)the journal of neuroscience 34(46):15490
–
15496
[1143]
[21]cryan and dinan(2015)neuropsychopharmacology,40:241-2.
[1144]
[22]zhou and foster(2015)neuropsychiatric disease and treatment 11:715
–
723.
[1145]
[23]wang and kasper(2014)brain behav immun.38:1
–
12.
[1146]
[24]wo 2013/050792
[1147]
[25]wo 03/046580
[1148]
[26]wo 2013/008039
[1149]
[27]wo 2014/167338
[1150]
[28]goldin and gorbach(2008)clin infect dis.46 suppl 2:s96-100.
[1151]
[29]azad et al.(2013)bmj.347:f6471.
[1152]
[30]bravo et al.(2011)proc natl acad sci u s a,108:16050-5.
[1153]
[31]kantak et al.(2014)behav pharmacol.25:71-9.
[1154]
[32]savignac et al.(2014)neurogastroenterol motil.26:1615-27.
[1155]
[33]wo 2016/069795
[1156]
[34]us 2016/120920
[1157]
[35]us 2017/246220
[1158]
[36]wo 2004/085628
[1159]
[37]wo 2018/187272
[1160]
[38]us 5443826
[1161]
[39]wo 2019/089643
[1162]
[40]us 2019/070225
[1163]
[41]de theije et al.(2014)brain behav immun.37:197-206.
[1164]
[42]meyza and blanchard(2017)neurosci biobehav rev.
[1165]
[43]de theije et al.(2014)brain behav immun.37:197-206.
[1166]
[44]hsiao et al.(2013)cell,155:1451-63.
[1167]
[45]meyza and blanchard(2017)neurosci biobehav rev.
[1168]
[46]moore et al,(1976)int j syst evol microbiol；26(2):238-252
[1169]
[47]masco et al.(2003)systematic and applied microbiology,26:557-563.
[1170]
[48]et al.(2011)j.microbiol.methods,87(1):10-6.
[1171]
[49]et al.(2011)j.microbiol.methods,87(1):10-6.
[1172]
[50]varga et al.(2010)toxins(basel)；2(7):1718-1750
[1173]
[51]sakamoto et al.(2017)int j syst evol microbiol；67:1219
–
1227
[1174]
[52]taylor et al.(1972)j gen microbiol；71:457-463
[1175]
[53]holdeman et al.(1971)int j syst bacteriol；21,4:304-306
[1176]
[54]chun et al(2007).int j syst evol microbiol 57:2259
–
2261.
[1177]
[55]masco et al.(2003)systematic and applied microbiology,26:557-563.
[1178]
[56]et al.(2011)j.microbiol.methods,87(1):10-6.
[1179]
[57]wang et al.(2016)j neurogastroenterol motil 22:589-605.
[1180]
[58]cook et al(2014)hum mol genet 23:104-106
[1181]
[59]simoes-pires et al(2013)mol neurodegen 8:7
[1182]
[60]li和zhou(2016)neuroscience 324:131
–
139.
[1183]
[61]vorstman et al.(2009)neuropsychopharmacology；34(3):739-746.
[1184]
[62]carlson(2012)pharmacol.biochem.behav.；100(4):850-854.
[1185]
[63]kang and kim(2015)front.mol.neurosci.；8(17)1-9.
[1186]
[64]zheng et al.(2016)scientific reports；6(31241)1-8.
[1187]
[65]tang,et al.(2017)j am heart assoc,6(10).
[1188]
[66]wang et al.(2015)pnas 112(9):2583-2858
[1189]
[67]psaty et al.(2003)jama,289(19):2534
–
44
[1190]
[68]lancet.(1995)346(8991
–
8992):1647
–
53
[1191]
[69]leoni et al.(2005)mol.med.,11(1-12):1-15.
[1192]
[70]glauben,et al.(2006)journal of immunology,176(8):5015-5022
[1193]
[71]gasche et al 200inflammatory bowel diseases 6:8-15
[1194]
[72]fahy(2009)proc am thorac soc 6.256
–
259
[1195]
[73]reddy et al(2008)j clin.invest.118:2562-73
[1196]
[74]leng et al(2006)exp.hematol.34:776-787
[1197]
[75]tao et al(2007)nat.med.13:1299-1307
[1198]
[76]johansson and ekman(2004)blood 104:5075
[1199]
[77]song et al(2005)apmis 113:264-268
[1200]
[78]zimmerman et al(2007)cancer res 67:9074-54
[1201]
[79]zhang et al(2005)breast cancer res treat 94:11-16
[1202]
[80]abbas and gupta(2008)epigenetics 3:300-309
[1203]
[81]minamiya et al(2011)lung cancer 74:300-4
[1204]
[82]jung et al(2012)j cell biochem 113:2167-2177
[1205]
[83]quint et al 2011virchows arch 459:129-139
[1206]
[84]miyamoto-shinohara et al.(2008)j.gen.appl.microbiol.,54,9
–
24.
[1207]
[85]cryopreservation and freeze-drying protocols,由day和mclellan编辑,humana press.
[1208]
[86]leslie et al.(1995)appl.environ.microbiol.61,3592
–
3597.
[1209]
[87]mitropoulou et al.(2013)j nutr metab.(2013)716861.
[1210]
[88]kailasapathy et al.(2002)curr issues intest microbiol.3(2):39-48.
[1211]
[89]handbook of pharmaceutical excipients,第2版,(1994),由a wade和pj weller编辑
[1212]
[90]remington's pharmaceutical sciences,mack publishing co.(a.r.gennaro编辑1985)
[1213]
[91]us 2016/0067188
[1214]
[92]handbook of microbiological media,fourth edition(2010)ronald atlas,crc press.
[1215]
[93]maintaining cultures for biotechnology and industry(1996)jennie c.hunter-cevera,academic press
[1216]
[94]strobel(2009)methods mol biol.581:247-61.
[1217]
[95]gennaro(2000)remington:the science and practice of pharmacy.第20版,isbn:0683306472.
[1218]
[96]molecular biology techniques:an intensive laboratory course,(ream et al.,eds.,1998,academic press).
[1219]
[97]methods in enzymology(s.colowick和n.kaplan,eds.,academic press,inc.)
[1220]
[98]handbook of experimental immunology,vols.i iv(d.m.weir和c.c.blackwell,eds,1986,blackwell scientific publications)
[1221]
[99]sambrook et al.(2001)molecular cloning:a laboratory manual,第3版(cold spring harbor laboratory press).
[1222]
[100]handbook of surface and colloidal chemistry(birdi,k.s.ed.,crc press,1997)
[1223]
[101]ausubel et al.(eds)(2002)short protocols in molecular biology,第5版(current protocols).
[1224]
[102]pcr(introduction to biotechniques series),第2版(newton&graham eds.,1997,springer verlag)
[1225]
[103]current protocols in molecular biology(f.m.ausubel et al.,eds.,1987)增刊30
[1226]
[104]smith&waterman(1981)adv.appl.math.2:482-489
[1227]
[105]johnsen et al.gas chromatography—mass spectrometry data processing made easy.j chromatogr a.2017；1503:57
–
64.
[1228]
[106]yuille et al.(2018)human gut bacteria as potent class i histone deacetylase inhibitors in vitro through production of butyric acid and valeric acid.plos one.2018jul 27；13(7):
[1229]
[107]ettore et al.,poster presented at neurodegenerative diseases:new insights and therapeutic opportunities,keystone colorado,2019年6月16-20日
[1230]
[108]pct/ep2019/062236
[1231]
[109]pct/ep2019/062238
[1232]
[110]hyland&cox(2005)br j pharmacol.146(5):712-22.
[1233]
[111]barton et al.(2008)archives of general psychiatry,65,1:38
–
46
[1234]
[112]duncan et al.,jama 303,5:430
–
37
[1235]
本发明其他编号的实施方案提供如下：
[1236]
1.用于治疗用途的包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物。
[1237]
2.用于治疗用途的包含细菌菌株的组合物，所述细菌菌株与seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7、seq id no:15或seq id no:16的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％的同一性。
[1238]
3.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株与seq id no:1、seq id no:6或seq id no:7的序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％、至少99.5％或至少99.95％同一性。
[1239]
4.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，用于治疗或预防由组蛋白脱乙酰酶(hdac)活性介导的疾病或病况。
[1240]
5.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，用于治疗或预防由i类hdac活性介导的疾病或病况。
[1241]
6.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，用于在治疗由i类hdac活性介导的病况中选择性地抑制i类hdac活性的方法。
[1242]
7.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述组合物用于在由hdac1、hdac2或hdac3活性介导的疾病或病况中选择性地抑制hdac1、hdac2或hdac3。
[1243]
8.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，用于具有升高的hdac活性的患者。
[1244]
9.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，用于治疗或预防选自以下的疾病或病况：神经退行性疾病，如阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病；脑损伤，如中风；行为或精神障碍，如注意力缺陷多动障碍、强迫性障碍、焦虑障碍、双相障碍或创伤后应激障碍；炎症或自身免疫性疾病，如哮喘、关节炎、银屑病、多发性硬化、糖尿病、同种异体移植排斥、移植物抗宿主病或炎性肠病，如克罗恩病；或癌症，如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。
[1245]
10.用于实施方案9所述的用途的组合物，用于治疗或预防或癌症，如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。
[1246]
11.如实施方案1-9中任一项所述的用途的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统病症或病况的方法。
[1247]
12.用于实施方案11所述的用途的组合物，用于治疗或预防选自以下病症或病况的方法：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；痴呆；阿尔茨海默氏病；帕金森氏病；慢性疼痛；运动神经元疾病；亨廷顿病；格林巴利综合征和脑膜炎。
[1248]
13.包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防选自以下的疾病或病况：神经退行性疾病，如阿尔茨海默氏病、亨廷顿病或帕金森氏病、脑损伤，如中风、炎症或自身免疫性疾病，如哮喘、关节炎、银屑病、多发性硬化、糖尿病、同种异体移植排斥、移植物抗宿主病或炎性肠病，如克罗恩病或溃疡性结肠炎；或癌症，如前列腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌或胃癌。
[1249]
14.包含厌氧棒杆菌属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统病症或病况的方法，如自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；痴呆；阿尔茨海默氏病；帕金森氏病；慢性疼痛；运动神经元疾病；亨廷顿病；格林巴利综合征和脑膜炎。
[1250]
15.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株属于物种anaerostipes hadrus，例如保藏为dsm 3319的anaerostipes hadrus。
[1251]
16.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:1、seq id no:6或seq id no:7具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:1、seq id no:6或seq id no:7表示的16s rrna基因序列。
[1252]
17.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述组合物用于经口给药。
[1253]
18.用于任何前述实施方案所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株是冻干的。
[1254]
19.包含任何前述实施方案所述组合物的食品，用于任何前述实施方案所述的用途。
[1255]
20.包含真杆菌或faecalicatena属的细菌菌株的组合物，用于治疗或预防中枢神经系统病症或病况的方法。
[1256]
21.用于实施方案20所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防神经发育障碍或神经精神系统病况的方法的用途。
[1257]
22.用于实施方案20或21所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防选自以下的病症或病况的方法的用途：自闭症谱系障碍(asds)；儿童发育障碍；强迫性障碍(ocd)；重性抑郁障碍(mdd)；抑郁症；季节性情感障碍；焦虑障碍；慢性疲劳综合征(肌痛性脑脊髓炎)；应激障碍；创伤后应激障碍；精神分裂症谱障碍；精神分裂症；双相障碍；精神病；心境障碍；痴呆；阿尔茨海默；帕金森氏病；慢性疼痛；运动神经元疾病；亨廷顿病；格林巴利综合征和脑膜炎。
[1258]
23.用于实施方案22所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防自闭症谱系障碍的方法的用途。
[1259]
24.用于实施方案22所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防强迫性障碍的方法的用途。
[1260]
25.用于实施方案22所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防重性抑郁障碍的方法的用途。
[1261]
26.用于实施方案20或21所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防焦虑障碍的方法的用途，任选地，其中所述焦虑障碍是广泛性焦虑障碍(gad)；特定恐惧症；社交焦虑障碍；分离性焦虑障碍；广场恐怖症；惊恐障碍和/或选择性缄默症。
[1262]
27.用于实施方案20-26中任一项所述的用途的组合物，其中所述组合物用于预防、减少或减轻刻板、重复、强迫或焦虑行为的用途。
[1263]
28.用于实施方案20所述的用途的组合物，其中所述组合物用于治疗或预防神经认知障碍的方法的用途，任选地，其中所述神经认知障碍是血管性痴呆；混合型阿尔茨海默氏病和血管性痴呆；路易体病；额颞痴呆；帕金森病痴呆；creutzfeldt-jakob病；亨廷顿病；和wernicke-korsakoff综合征。
[1264]
29.用于实施方案20-28中任一项所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:8、9、10、11、12、13或14具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列。
[1265]
30.用于实施方案29所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株具有与seq id no:8具有至少95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或99.9％同一性的16s rrna基因序列，或者其中所述细菌菌株具有由seq id no:8表示的16s rrna基因序列。
[1266]
31.用于实施方案20-30中任一项所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株属于物种卡兰德真杆菌、粘液真杆菌、挑剔真杆菌、直肠真杆菌、霍氏真杆菌、faecalicatena fissicatena或faecalicatena contorta。
[1267]
32.用于实施方案31所述的用途的组合物，其中所述细菌菌株属于物种卡兰德真杆菌。
[1268]
33.根据登录号ncimb 43455保藏的细菌菌株的细胞，或其衍生物。
[1269]
34.用于治疗用途的实施方案33所述的细胞，任选地，其中所述细胞用于实施方案20-28中任一项所述的方法。