一种分析高良姜素抗白癜风作用机制的方法及其应用与流程

技术特征：
1.一种分析高良姜素抗白癜风作用机制的方法，采用基于网络药理学及分子对接分析，其特征在于，包括以下步骤：s1、活性成分作用靶点筛选pubchem数据库获取高良姜素的mol2结构，将其结果输入至swisstargetprediction数据库中获取高良姜素的作用靶点，并利用uniport数据库中z`-score值进行靶点蛋白筛选，将获取的靶点蛋白名称转化成相0应的基因名称；s2、疾病候选靶点识别在疾病靶标数据库genecard和omim中，以“vitiligo”作为关键词检索查找白癜风候选靶点，然后与s1所得的成分作用靶点进行交集映射，获得成分-疾病交集靶基因，即高良姜素抗白癜风的作用靶点；s3、构建成分靶点-疾病靶点网络及候选核心靶点借助string平台构建高良姜素的潜在抗白癜风靶点及靶点的ppi网络图；参数设置为>0.9作为评分条件，蛋白种类选择“homo sapiens”，并通过cytoscape3.7.2软件的“cytohubba”插件进行高良姜素抗白癜风核心靶点筛选；s4、对核心靶点富集分析以探讨药物成分作用机制借助r语言中的“ggplot2”、“clusterprofiler”、“enrichplot”和“org.hs.eg.db”包对交集基因进行go功能富集分析，并深入明确高良姜素中活性成分的靶点蛋白在基因功能中的作用；再次使用上述r包进行kegg功能富集分析，深入探讨高良姜素中活性成分的靶点在通路中的作用；s5、“成分-靶点-通路-疾病”网络构建与可视化运用cytoscape根据s4结果构建“药物-靶点-通路-疾病”可视化图形；具体应用r语言中“pathview”包将kegg富集通路的相关靶点映射到通路图，便于进行后续分析；s6、高良姜素抗白癜风关键靶点分子对接利用pdb数据库查找关键蛋白的三级结构，保存为pdb格式；将结构件载入autodocktools1.5.6程序，添加原子电荷，分配原子类型，所有柔性键均默认可旋转；将步骤s1得到的mol2格式的高良姜素与pdb格式的蛋白结构使用autodockvina在线分子对接网站进行分子对接。2.根据权利要求1所述的一种分析高良姜素抗白癜风作用机制的方法，其特征在于，s3中核心靶点筛选范围上限为拓扑数据中的最大degree值，下限为degree中位数。3.根据权利要求1所述的一种分析高良姜素抗白癜风作用机制的方法，其特征在于，步骤s6中分子对接的受体蛋白是步骤s3根据degree值筛选所获取，配体分子为步骤s1中高良姜素的mol2结构。4.根据权利要求1所述的一种分析高良姜素抗白癜风作用机制的方法，其特征在于，步骤s6中分子对接vina结合能<-4.5。5.根据权利要求1至权利要求4中任意一项所述的一种分析高良姜素抗白癜风作用机制的方法在高良姜素发挥抗白癜风作用研究机制中的应用。

技术总结
本发明属于医药技术领域，涉及一种基于网络药理学及分子对接分析高良姜素抗白癜风作用机制的方法。包括以下步骤：S1、活性成分活性靶点筛选；S2、疾病候选靶点识别；S3、构建成分靶点-疾病靶点网络及候选核心靶点；S4、对核心靶点富集分析以探讨药物成分作用机制；S5、“成分-靶点-通路-疾病”网络构建与可视化；S6、高良姜素抗白癜风关键靶点分子对接。本发明利用网络药理学技术首次构建了高良姜素抗白癜风的“药物成分-靶点-通路-疾病”网络图，揭示了活性成分高良姜素通过“多靶点、多通路、多途径”联合调控发挥其药效。筛选获得白癜风中未被研究的ARNT、GSTP1、NOS2、PTGS2、NLRP3等关键靶点，进一步为高良姜素用于白癜风防治提供了前期研究基础。前期研究基础。


技术研发人员：霍仕霞 闫明 祖力皮卡尔
受保护的技术使用者：新疆维吾尔自治区维吾尔医药研究所
技术研发日：2022.11.11
技术公布日：2023/2/3